Doublet Group distance statistics: 49468

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 5, 6, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.012, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.012, 0.020, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.014, 0.024, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.023, 0.049, 0.076, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.049 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.034, 0.102, 0.171, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.102 std_dev=0.068
N1	B	0, 0.328, 0.486, 0.644, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.486 std_dev=0.158
C2'	A	0, 0.177, 0.359, 0.541, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.359 std_dev=0.182
N3	B	0, 0.283, 0.465, 0.648, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.465 std_dev=0.182
C2	B	0, 0.291, 0.482, 0.674, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.482 std_dev=0.191
C6	B	0, 0.284, 0.478, 0.672, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.478 std_dev=0.194
O4'	A	0, 0.079, 0.276, 0.474, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.276 std_dev=0.198
C4'	A	0, 0.299, 0.505, 0.710, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.505 std_dev=0.206
C2'	B	0, 0.418, 0.625, 0.831, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.625 std_dev=0.206
C4	B	0, 0.236, 0.443, 0.651, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.443 std_dev=0.208
O2'	A	0, 0.304, 0.517, 0.729, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.517 std_dev=0.212
C5	B	0, 0.227, 0.465, 0.702, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.465 std_dev=0.238
C3'	A	0, 0.349, 0.595, 0.841, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.595 std_dev=0.246
N9	B	0, 0.264, 0.514, 0.763, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.514 std_dev=0.249
O2'	B	0, 0.442, 0.692, 0.942, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.692 std_dev=0.250
N6	B	0, 0.336, 0.587, 0.839, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.587 std_dev=0.251
OP2	A	0, 0.403, 0.659, 0.914, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.659 std_dev=0.256
C1'	B	0, 0.307, 0.566, 0.824, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.566 std_dev=0.258
N7	B	0, 0.343, 0.607, 0.870, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.607 std_dev=0.263
C8	B	0, 0.341, 0.618, 0.894, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.618 std_dev=0.276
C3'	B	0, 0.597, 0.893, 1.189, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.893 std_dev=0.296
P	A	0, 0.400, 0.742, 1.084, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.742 std_dev=0.342
O3'	A	0, 0.515, 0.861, 1.207, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.861 std_dev=0.346
O3'	B	0, 0.762, 1.109, 1.456, 1.572 max_d=1.572 avg_d=1.109 std_dev=0.347
OP1	A	0, 0.418, 0.793, 1.169, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.793 std_dev=0.376
O4'	B	0, 0.424, 0.815, 1.205, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.815 std_dev=0.391
C5'	A	0, 0.519, 0.912, 1.305, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.912 std_dev=0.393
C4'	B	0, 0.569, 0.983, 1.398, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.983 std_dev=0.414
O5'	A	0, 0.436, 0.938, 1.440, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.938 std_dev=0.502
O5'	B	0, 0.670, 1.279, 1.889, 2.152 max_d=2.152 avg_d=1.279 std_dev=0.610
C5'	B	0, 0.780, 1.405, 2.030, 2.306 max_d=2.306 avg_d=1.405 std_dev=0.625
P	B	0, 0.650, 1.360, 2.069, 2.534 max_d=2.534 avg_d=1.360 std_dev=0.710
OP2	B	0, 0.541, 1.289, 2.037, 2.660 max_d=2.660 avg_d=1.289 std_dev=0.748
OP1	B	0, 0.569, 1.510, 2.451, 2.988 max_d=2.988 avg_d=1.510 std_dev=0.941

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.18	0.11	0.13
C2	0.01	0.00	0.07	0.16	0.02	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.16	0.03	0.02	0.35	0.32	0.24	0.29
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.06	0.13	0.01	0.02	0.05	0.01	0.23	0.26	0.11	0.19
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.17	0.00	0.14	0.03	0.11	0.09	0.18	0.18	0.01	0.00	0.19	0.01	0.33	0.36	0.13	0.26
C4	0.02	0.02	0.04	0.17	0.00	0.13	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.20	0.01	0.02	0.48	0.45	0.41	0.44
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.13	0.00	0.12	0.01	0.10	0.07	0.11	0.07	0.05	0.02	0.14	0.00	0.02	0.11	0.25	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.12	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.02	0.50	0.45	0.39	0.44
C5'	0.04	0.16	0.03	0.03	0.26	0.01	0.25	0.00	0.20	0.14	0.22	0.12	0.05	0.04	0.29	0.02	0.01	0.17	0.40	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.02	0.43	0.37	0.26	0.35
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.01	0.33	0.29	0.19	0.26
N3	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.02	0.02	0.42	0.39	0.34	0.37
O2	0.02	0.00	0.13	0.18	0.02	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.18	0.04	0.03	0.29	0.27	0.21	0.25
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.11	0.00	0.05	0.05	0.07	0.05	0.11	0.15	0.05
O3'	0.01	0.16	0.02	0.00	0.20	0.02	0.16	0.04	0.12	0.08	0.20	0.18	0.05	0.00	0.24	0.01	0.26	0.36	0.18	0.24
O4	0.02	0.03	0.05	0.19	0.01	0.14	0.01	0.29	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.24	0.00	0.03	0.51	0.49	0.47	0.48
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.09	0.13	0.21	0.12
O5'	0.16	0.35	0.23	0.33	0.48	0.02	0.50	0.01	0.43	0.33	0.42	0.29	0.05	0.26	0.51	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.32	0.26	0.36	0.45	0.11	0.45	0.17	0.37	0.29	0.39	0.27	0.11	0.36	0.49	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.24	0.11	0.13	0.41	0.25	0.39	0.40	0.26	0.19	0.34	0.21	0.15	0.18	0.47	0.21	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.29	0.19	0.26	0.44	0.03	0.44	0.01	0.35	0.26	0.37	0.25	0.05	0.24	0.48	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.23	0.20	0.20	0.19	0.19	0.19	0.20	0.16	0.24	0.18	0.23	0.18	0.23	0.21	0.27	0.25	0.20	0.21	0.34	0.32	0.26
C2	0.19	0.26	0.22	0.30	0.19	0.26	0.21	0.34	0.18	0.26	0.21	0.22	0.20	0.27	0.21	0.22	0.33	0.22	0.42	0.57	0.57	0.50
C2'	0.18	0.27	0.14	0.19	0.18	0.14	0.18	0.20	0.18	0.22	0.22	0.24	0.20	0.22	0.18	0.23	0.26	0.14	0.25	0.46	0.42	0.35
C3'	0.11	0.22	0.13	0.24	0.12	0.21	0.19	0.27	0.21	0.22	0.21	0.17	0.27	0.25	0.13	0.18	0.35	0.12	0.28	0.52	0.42	0.39
C4	0.29	0.19	0.30	0.43	0.22	0.44	0.23	0.56	0.16	0.38	0.20	0.18	0.22	0.36	0.30	0.25	0.44	0.38	0.64	0.81	0.80	0.74
C4'	0.13	0.19	0.12	0.13	0.12	0.12	0.18	0.14	0.18	0.23	0.16	0.17	0.23	0.25	0.15	0.19	0.21	0.10	0.13	0.27	0.22	0.18
C5	0.29	0.18	0.31	0.44	0.17	0.45	0.18	0.55	0.20	0.35	0.22	0.16	0.29	0.31	0.28	0.27	0.45	0.38	0.59	0.74	0.68	0.66
C5'	0.23	0.23	0.25	0.22	0.19	0.26	0.26	0.22	0.27	0.29	0.22	0.23	0.34	0.34	0.20	0.37	0.32	0.23	0.15	0.28	0.21	0.18
C6	0.23	0.20	0.26	0.36	0.16	0.34	0.20	0.41	0.21	0.28	0.21	0.17	0.26	0.27	0.23	0.24	0.39	0.28	0.43	0.57	0.49	0.48
N1	0.20	0.24	0.21	0.28	0.18	0.25	0.19	0.31	0.17	0.25	0.20	0.21	0.20	0.24	0.21	0.23	0.32	0.21	0.35	0.49	0.46	0.41
N3	0.23	0.23	0.26	0.37	0.21	0.35	0.24	0.46	0.18	0.33	0.21	0.20	0.21	0.33	0.26	0.22	0.38	0.29	0.54	0.71	0.72	0.64
O2	0.18	0.27	0.19	0.25	0.19	0.21	0.21	0.28	0.20	0.24	0.23	0.23	0.23	0.25	0.20	0.23	0.29	0.19	0.37	0.52	0.54	0.45
O2'	0.29	0.27	0.22	0.14	0.22	0.19	0.19	0.15	0.17	0.25	0.20	0.28	0.17	0.23	0.25	0.36	0.15	0.25	0.16	0.30	0.32	0.22
O3'	0.11	0.22	0.12	0.22	0.11	0.19	0.18	0.26	0.21	0.23	0.21	0.18	0.27	0.26	0.13	0.18	0.32	0.12	0.27	0.54	0.43	0.39
O4	0.34	0.20	0.33	0.47	0.26	0.51	0.28	0.65	0.19	0.45	0.22	0.20	0.25	0.43	0.35	0.27	0.47	0.45	0.74	0.92	0.93	0.86
O4'	0.16	0.20	0.15	0.17	0.12	0.16	0.15	0.17	0.15	0.22	0.16	0.16	0.18	0.22	0.16	0.22	0.23	0.14	0.15	0.23	0.20	0.16
O5'	0.22	0.27	0.25	0.07	0.19	0.09	0.20	0.08	0.22	0.23	0.25	0.23	0.22	0.22	0.19	0.39	0.02	0.14	0.12	0.34	0.29	0.23
OP1	0.07	0.22	0.11	0.01	0.12	0.06	0.15	0.14	0.18	0.17	0.21	0.19	0.20	0.18	0.09	0.18	0.01	0.03	0.15	0.28	0.17	0.18
OP2	0.08	0.28	0.13	0.07	0.20	0.18	0.24	0.33	0.28	0.21	0.30	0.24	0.31	0.25	0.14	0.15	0.02	0.13	0.27	0.55	0.34	0.39
P	0.08	0.23	0.13	0.01	0.14	0.05	0.16	0.13	0.19	0.18	0.22	0.19	0.21	0.19	0.11	0.19	0.00	0.02	0.12	0.32	0.20	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.08	0.06
C2	0.04	0.00	0.15	0.16	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.21	0.04	0.18	0.22	0.24	0.18
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.11	0.15	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.10	0.05
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.08	0.00	0.07	0.02	0.09	0.12	0.13	0.15	0.09	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.07	0.14	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.02	0.16	0.18	0.20	0.16
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.06	0.08	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.08	0.05	0.02
C5	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.02	0.20	0.23	0.26	0.22
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.13	0.14	0.11	0.07	0.16	0.16	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.11	0.02	0.22	0.26	0.30	0.25
C8	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.19	0.19	0.19	0.19
N1	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.17	0.03	0.20	0.25	0.29	0.22
N3	0.04	0.01	0.15	0.15	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.04	0.15	0.19	0.20	0.15
N6	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.08	0.12	0.04	0.24	0.30	0.35	0.29
N7	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.23	0.25	0.27	0.25
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.14	0.14	0.14	0.13
O2'	0.01	0.17	0.00	0.03	0.09	0.07	0.07	0.07	0.10	0.05	0.14	0.16	0.08	0.05	0.03	0.00	0.06	0.04	0.05	0.13	0.08	0.06
O3'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.04	0.11	0.14	0.17	0.19	0.12	0.13	0.05	0.06	0.00	0.01	0.12	0.18	0.15	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.08	0.09	0.08
O5'	0.07	0.18	0.04	0.07	0.16	0.02	0.20	0.01	0.22	0.19	0.20	0.15	0.24	0.23	0.14	0.05	0.12	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.22	0.12	0.14	0.18	0.08	0.23	0.07	0.26	0.19	0.25	0.19	0.30	0.25	0.14	0.13	0.18	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.24	0.10	0.11	0.20	0.05	0.26	0.03	0.30	0.19	0.29	0.20	0.35	0.27	0.14	0.08	0.15	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.18	0.05	0.07	0.16	0.02	0.22	0.01	0.25	0.19	0.22	0.15	0.29	0.25	0.13	0.06	0.11	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00