Doublet Group distance statistics: 49470

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 1, 0, 3, 1, 4, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.012, 0.044, 0.077, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.044 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.049, 0.105, 0.162, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.105 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.039, 0.137, 0.236, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.137 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.021, 0.172, 0.323, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.172 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.039, 0.233, 0.426, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.233 std_dev=0.194
C2'	B	0, 0.188, 0.431, 0.675, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.431 std_dev=0.243
O2'	B	0, 0.206, 0.460, 0.714, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.460 std_dev=0.254
C4	B	0, 0.307, 0.584, 0.860, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.584 std_dev=0.277
N9	B	0, 0.237, 0.531, 0.825, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.531 std_dev=0.294
C5	B	0, 0.270, 0.566, 0.862, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.566 std_dev=0.296
O2'	A	0, -0.074, 0.231, 0.535, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.231 std_dev=0.305
C5'	A	0, 0.081, 0.393, 0.705, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.393 std_dev=0.312
C3'	A	0, -0.036, 0.277, 0.589, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.277 std_dev=0.313
C6	B	0, 0.305, 0.622, 0.939, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.622 std_dev=0.317
N3	B	0, 0.388, 0.705, 1.021, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.705 std_dev=0.317
C1'	B	0, 0.222, 0.541, 0.860, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.541 std_dev=0.319
C8	B	0, 0.237, 0.558, 0.879, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.558 std_dev=0.321
N1	B	0, 0.399, 0.729, 1.059, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.729 std_dev=0.330
N7	B	0, 0.240, 0.578, 0.915, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.578 std_dev=0.338
C2	B	0, 0.434, 0.775, 1.115, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.775 std_dev=0.341
C3'	B	0, 0.224, 0.568, 0.913, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.568 std_dev=0.345
O3'	B	0, 0.260, 0.616, 0.973, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.616 std_dev=0.356
N6	B	0, 0.267, 0.631, 0.994, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.631 std_dev=0.364
O4'	B	0, 0.263, 0.692, 1.122, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.692 std_dev=0.429
C4'	B	0, 0.252, 0.706, 1.159, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.706 std_dev=0.454
P	A	0, 0.190, 0.646, 1.102, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.646 std_dev=0.456
O5'	A	0, 0.091, 0.549, 1.007, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.549 std_dev=0.458
OP1	A	0, 0.213, 0.739, 1.265, 2.310 max_d=2.310 avg_d=0.739 std_dev=0.526
O3'	A	0, -0.062, 0.467, 0.995, 2.375 max_d=2.375 avg_d=0.467 std_dev=0.528
OP2	A	0, 0.162, 0.742, 1.321, 2.518 max_d=2.518 avg_d=0.742 std_dev=0.579
C5'	B	0, 0.299, 0.892, 1.486, 2.089 max_d=2.089 avg_d=0.892 std_dev=0.593
O5'	B	0, 0.249, 0.871, 1.494, 2.167 max_d=2.167 avg_d=0.871 std_dev=0.622
OP1	B	0, 0.362, 1.294, 2.226, 3.805 max_d=3.805 avg_d=1.294 std_dev=0.932
P	B	0, 0.431, 1.387, 2.343, 3.173 max_d=3.173 avg_d=1.387 std_dev=0.956
OP2	B	0, 0.437, 2.106, 3.775, 5.366 max_d=5.366 avg_d=2.106 std_dev=1.669

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.09	0.05	0.24	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.06	0.02	0.02	0.23	0.18	0.22	0.18
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.10	0.00	0.02	0.08	0.01	0.15	0.12	0.17	0.06
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.19	0.00	0.23	0.01	0.21	0.11	0.13	0.07	0.02	0.01	0.21	0.01	0.21	0.19	0.10	0.12
C4	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.19	0.01	0.02	0.38	0.34	0.36	0.33
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.06	0.04	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.21	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.23	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.24	0.01	0.03	0.41	0.35	0.35	0.34
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.18	0.00	0.21	0.00	0.18	0.10	0.13	0.04	0.08	0.04	0.20	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.21	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.21	0.01	0.03	0.35	0.26	0.23	0.25
N1	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.01	0.23	0.16	0.20	0.16
N3	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.02	0.01	0.31	0.26	0.29	0.26
O2	0.03	0.01	0.10	0.07	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.21	0.14	0.02	0.05	0.16	0.12	0.21	0.14
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.08	0.09	0.04	0.08	0.03	0.04	0.12	0.21	0.00	0.07	0.09	0.08	0.13	0.16	0.15	0.07
O3'	0.03	0.06	0.02	0.01	0.19	0.01	0.24	0.04	0.21	0.08	0.10	0.14	0.07	0.00	0.22	0.01	0.21	0.31	0.11	0.20
O4	0.02	0.02	0.08	0.21	0.01	0.10	0.01	0.20	0.01	0.02	0.02	0.02	0.09	0.22	0.00	0.03	0.40	0.38	0.42	0.37
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.00	0.07	0.07	0.31	0.13
O5'	0.09	0.23	0.15	0.21	0.38	0.01	0.41	0.01	0.35	0.23	0.31	0.16	0.13	0.21	0.40	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.05	0.18	0.12	0.19	0.34	0.06	0.35	0.06	0.26	0.16	0.26	0.12	0.16	0.31	0.38	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.22	0.17	0.10	0.36	0.21	0.35	0.20	0.23	0.20	0.29	0.21	0.15	0.11	0.42	0.31	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.06	0.12	0.33	0.03	0.34	0.01	0.25	0.16	0.26	0.14	0.07	0.20	0.37	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.36	0.15	0.17	0.15	0.18	0.15	0.22	0.17	0.29	0.30	0.28	0.16	0.26	0.18	0.15	0.13	0.18	0.28	0.30	0.63	0.30
C2	0.19	0.38	0.17	0.23	0.20	0.26	0.18	0.33	0.25	0.31	0.39	0.29	0.23	0.29	0.21	0.16	0.20	0.24	0.40	0.59	0.96	0.46
C2'	0.14	0.35	0.12	0.13	0.15	0.14	0.15	0.17	0.18	0.26	0.30	0.27	0.19	0.25	0.16	0.14	0.13	0.14	0.23	0.23	0.54	0.23
C3'	0.13	0.34	0.13	0.16	0.12	0.16	0.11	0.19	0.17	0.23	0.29	0.27	0.17	0.21	0.13	0.15	0.20	0.14	0.20	0.32	0.37	0.18
C4	0.26	0.39	0.23	0.30	0.27	0.36	0.27	0.45	0.36	0.29	0.42	0.32	0.39	0.24	0.24	0.22	0.29	0.33	0.50	0.74	1.05	0.56
C4'	0.13	0.32	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.16	0.22	0.26	0.25	0.16	0.19	0.13	0.15	0.12	0.11	0.15	0.23	0.32	0.13
C5	0.26	0.40	0.24	0.30	0.28	0.35	0.26	0.42	0.35	0.25	0.41	0.34	0.36	0.20	0.24	0.23	0.30	0.32	0.44	0.55	0.76	0.45
C5'	0.19	0.31	0.20	0.19	0.18	0.20	0.16	0.20	0.19	0.25	0.26	0.27	0.17	0.22	0.18	0.21	0.21	0.20	0.17	0.41	0.19	0.14
C6	0.21	0.39	0.21	0.26	0.24	0.28	0.20	0.32	0.29	0.23	0.38	0.33	0.28	0.17	0.19	0.20	0.25	0.25	0.35	0.38	0.62	0.35
N1	0.18	0.39	0.17	0.21	0.19	0.23	0.15	0.29	0.24	0.28	0.37	0.31	0.21	0.24	0.18	0.17	0.19	0.22	0.34	0.43	0.75	0.36
N3	0.22	0.39	0.20	0.27	0.23	0.31	0.22	0.40	0.32	0.31	0.41	0.30	0.33	0.28	0.23	0.19	0.25	0.29	0.47	0.73	1.09	0.54
O2	0.18	0.37	0.15	0.20	0.18	0.23	0.20	0.30	0.22	0.33	0.36	0.26	0.20	0.33	0.21	0.15	0.17	0.23	0.38	0.60	1.01	0.46
O2'	0.17	0.36	0.14	0.14	0.20	0.14	0.24	0.17	0.27	0.29	0.33	0.28	0.30	0.31	0.21	0.16	0.15	0.16	0.22	0.21	0.57	0.23
O3'	0.10	0.39	0.11	0.16	0.14	0.16	0.14	0.20	0.22	0.21	0.34	0.29	0.22	0.19	0.11	0.15	0.24	0.10	0.20	0.41	0.32	0.21
O4	0.29	0.39	0.25	0.33	0.29	0.40	0.30	0.50	0.39	0.31	0.43	0.33	0.43	0.27	0.27	0.24	0.32	0.37	0.55	0.89	1.19	0.64
O4'	0.14	0.34	0.13	0.14	0.13	0.14	0.12	0.17	0.17	0.25	0.28	0.28	0.16	0.21	0.15	0.15	0.11	0.14	0.22	0.18	0.47	0.23
O5'	0.10	0.35	0.14	0.03	0.17	0.03	0.14	0.10	0.19	0.19	0.28	0.32	0.18	0.19	0.08	0.27	0.01	0.05	0.15	0.46	0.20	0.17
OP1	0.05	0.28	0.07	0.02	0.13	0.05	0.11	0.12	0.16	0.16	0.24	0.25	0.15	0.16	0.06	0.15	0.02	0.03	0.11	0.78	0.40	0.16
OP2	0.06	0.27	0.09	0.04	0.15	0.13	0.15	0.24	0.18	0.22	0.24	0.24	0.18	0.21	0.11	0.12	0.02	0.11	0.23	0.75	0.27	0.23
P	0.04	0.27	0.08	0.01	0.13	0.05	0.11	0.13	0.15	0.17	0.23	0.24	0.14	0.16	0.06	0.15	0.01	0.03	0.13	0.63	0.27	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.26	0.23	0.10
C2	0.04	0.00	0.15	0.14	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.19	0.04	0.11	0.50	0.70	0.21
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.12	0.14	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.12	0.05
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.07	0.11	0.11	0.13	0.07	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.20	0.14	0.06
C4	0.02	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.09	0.03	0.13	0.50	0.67	0.21
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.04	0.06	0.06	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.13	0.24	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.17	0.63	0.91	0.28
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.13	0.07	0.05	0.13	0.14	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.24	0.43	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.03	0.18	0.66	0.98	0.30
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.19	0.59	0.79	0.27
N1	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.03	0.15	0.59	0.87	0.26
N3	0.04	0.00	0.14	0.13	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.05	0.10	0.43	0.57	0.17
N6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.09	0.05	0.21	0.75	1.13	0.36
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.21	0.70	1.01	0.32
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.45	0.55	0.18
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.06	0.10	0.05	0.15	0.16	0.09	0.04	0.03	0.00	0.05	0.04	0.05	0.16	0.12	0.05
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.10	0.13	0.16	0.17	0.09	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.04	0.46	0.34	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.23	0.12	0.09
O5'	0.05	0.11	0.04	0.04	0.13	0.01	0.17	0.01	0.18	0.19	0.15	0.10	0.21	0.21	0.12	0.05	0.04	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.26	0.50	0.09	0.20	0.50	0.13	0.63	0.24	0.66	0.59	0.59	0.43	0.75	0.70	0.45	0.16	0.46	0.23	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.70	0.12	0.14	0.67	0.24	0.91	0.43	0.98	0.79	0.87	0.57	1.13	1.01	0.55	0.12	0.34	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.21	0.05	0.06	0.21	0.02	0.28	0.02	0.30	0.27	0.26	0.17	0.36	0.32	0.18	0.05	0.10	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00