Doublet Group distance statistics: 49483

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N1	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C2	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O4	A	0, 0.000, 0.051, 0.102, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.051
O2	A	0, 0.000, 0.079, 0.158, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.079 std_dev=0.079
C1'	B	0, 0.000, 0.122, 0.244, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.122 std_dev=0.122
N9	B	0, 0.000, 0.172, 0.344, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.172 std_dev=0.172
C4	B	0, 0.000, 0.183, 0.365, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.183 std_dev=0.183
N3	B	0, 0.000, 0.183, 0.366, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.183 std_dev=0.183
C8	B	0, 0.000, 0.194, 0.387, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.194 std_dev=0.194
C2'	A	0, 0.000, 0.204, 0.407, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.204 std_dev=0.204
C5	B	0, 0.000, 0.204, 0.409, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.204 std_dev=0.204
N7	B	0, 0.000, 0.208, 0.416, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.208 std_dev=0.208
C2	B	0, 0.000, 0.216, 0.432, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.216 std_dev=0.216
C6	B	0, 0.000, 0.232, 0.463, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.232 std_dev=0.232
N1	B	0, 0.000, 0.237, 0.473, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.237 std_dev=0.237
N6	B	0, 0.000, 0.249, 0.498, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.249 std_dev=0.249
O2'	A	0, 0.000, 0.322, 0.643, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.322 std_dev=0.322
O4'	A	0, 0.000, 0.332, 0.664, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.332 std_dev=0.332
C3'	A	0, 0.000, 0.386, 0.771, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.386 std_dev=0.386
C4'	A	0, 0.000, 0.428, 0.856, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.428 std_dev=0.428
O3'	A	0, 0.000, 0.498, 0.997, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.498 std_dev=0.498
C5'	A	0, 0.000, 0.669, 1.338, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.669 std_dev=0.669
O5'	A	0, 0.000, 0.852, 1.704, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.852 std_dev=0.852
O4'	B	0, 0.000, 1.183, 2.365, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.183 std_dev=1.183
C2'	B	0, 0.000, 1.211, 2.421, 2.421 max_d=2.421 avg_d=1.211 std_dev=1.211
O2'	B	0, 0.000, 1.473, 2.945, 2.945 max_d=2.945 avg_d=1.473 std_dev=1.473
C4'	B	0, 0.000, 1.519, 3.038, 3.038 max_d=3.038 avg_d=1.519 std_dev=1.519
C3'	B	0, 0.000, 1.810, 3.621, 3.621 max_d=3.621 avg_d=1.810 std_dev=1.810
P	A	0, 0.000, 2.138, 4.275, 4.275 max_d=4.275 avg_d=2.138 std_dev=2.138
O3'	B	0, 0.000, 2.403, 4.806, 4.806 max_d=4.806 avg_d=2.403 std_dev=2.403
OP1	A	0, 0.000, 2.492, 4.983, 4.983 max_d=4.983 avg_d=2.492 std_dev=2.492
C5'	B	0, 0.000, 2.759, 5.518, 5.518 max_d=5.518 avg_d=2.759 std_dev=2.759
OP2	A	0, 0.000, 2.898, 5.795, 5.795 max_d=5.795 avg_d=2.898 std_dev=2.898
O5'	B	0, 0.000, 3.218, 6.437, 6.437 max_d=6.437 avg_d=3.218 std_dev=3.218
P	B	0, 0.000, 4.468, 8.936, 8.936 max_d=8.936 avg_d=4.468 std_dev=4.468
OP2	B	0, 0.000, 4.664, 9.329, 9.329 max_d=9.329 avg_d=4.664 std_dev=4.664
OP1	B	0, 0.000, 5.129, 10.259, 10.259 max_d=10.259 avg_d=5.129 std_dev=5.129

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.25	0.31	0.07
C2	0.04	0.00	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.11	0.00	0.02	0.41	0.03	0.84	0.46
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.31	0.47	0.36	0.00
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.09	0.10	0.04	0.01	0.08	0.01	0.33	0.49	0.28	0.03
C4	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.02	0.48	0.50	1.23	0.86
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.04	0.00	0.00	0.45	0.10	0.25
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.48	0.64	1.20	0.91
C5'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.02	0.03	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.44	0.46	0.97	0.73
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.38	0.10	0.75	0.45
N3	0.02	0.00	0.03	0.09	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.00	0.00	0.46	0.24	1.07	0.66
O2	0.07	0.00	0.04	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.13	0.01	0.05	0.38	0.19	0.71	0.30
O2'	0.01	0.09	0.00	0.04	0.06	0.10	0.03	0.09	0.01	0.03	0.09	0.14	0.00	0.10	0.07	0.05	0.05	0.88	0.08	0.42
O3'	0.02	0.11	0.04	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.12	0.13	0.10	0.00	0.10	0.02	0.18	0.87	0.03	0.35
O4	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.00	0.02	0.49	0.60	1.35	0.94
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.02	0.00	0.04	0.17	0.09	0.02
O5'	0.20	0.41	0.31	0.33	0.48	0.00	0.48	0.00	0.44	0.38	0.46	0.38	0.05	0.18	0.49	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.03	0.47	0.49	0.50	0.45	0.64	0.04	0.46	0.10	0.24	0.19	0.88	0.87	0.60	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.84	0.36	0.28	1.23	0.10	1.20	0.02	0.97	0.75	1.07	0.71	0.08	0.03	1.35	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.46	0.00	0.03	0.86	0.25	0.91	0.01	0.73	0.45	0.66	0.30	0.42	0.35	0.94	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.65	0.46	0.01	0.25	0.04	0.60	0.06	0.03	0.04	0.01	0.07	0.05	0.00	0.68	0.74	0.56	1.10	1.10	1.02	1.28
C2	0.03	0.02	0.48	0.30	0.02	0.28	0.05	0.60	0.05	0.05	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.55	0.56	0.50	1.01	1.01	0.94	1.17
C2'	0.02	0.06	0.70	0.41	0.00	0.43	0.02	0.95	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.83	0.79	0.71	1.60	1.85	1.81	2.02
C3'	0.21	0.05	0.61	0.48	0.13	0.47	0.12	0.90	0.08	0.18	0.05	0.09	0.08	0.16	0.17	0.66	0.93	0.86	1.73	1.94	1.70	2.12
C4	0.01	0.07	0.43	0.47	0.04	0.01	0.02	0.09	0.03	0.00	0.06	0.06	0.00	0.01	0.02	0.38	0.68	0.25	0.45	0.20	0.03	0.40
C4'	0.28	0.15	0.55	0.61	0.23	0.32	0.21	0.55	0.18	0.26	0.15	0.19	0.16	0.23	0.26	0.50	1.02	0.83	1.30	1.21	0.96	1.41
C5	0.03	0.10	0.48	0.60	0.07	0.14	0.06	0.13	0.07	0.03	0.09	0.09	0.04	0.03	0.05	0.35	0.79	0.16	0.25	0.08	0.32	0.13
C5'	0.38	0.18	0.44	0.77	0.28	0.10	0.27	0.07	0.22	0.36	0.18	0.22	0.21	0.32	0.34	0.28	1.20	0.72	0.88	0.71	0.38	0.89
C6	0.03	0.10	0.54	0.63	0.07	0.08	0.05	0.01	0.05	0.02	0.08	0.09	0.02	0.01	0.05	0.43	0.83	0.25	0.43	0.19	0.06	0.37
N1	0.01	0.04	0.55	0.45	0.00	0.16	0.03	0.40	0.03	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.01	0.55	0.71	0.45	0.86	0.77	0.64	0.95
N3	0.01	0.03	0.44	0.33	0.00	0.17	0.03	0.40	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.05	0.01	0.47	0.58	0.39	0.78	0.68	0.58	0.86
O2	0.06	0.03	0.44	0.13	0.06	0.46	0.08	0.90	0.09	0.08	0.06	0.04	0.10	0.09	0.07	0.61	0.42	0.62	1.31	1.45	1.46	1.59
O2'	0.15	0.06	0.83	0.34	0.09	0.44	0.03	1.14	0.01	0.07	0.00	0.12	0.05	0.03	0.12	1.11	0.71	0.60	1.69	2.12	2.29	2.25
O3'	0.22	0.04	0.59	0.38	0.13	0.62	0.11	1.19	0.07	0.18	0.03	0.09	0.06	0.15	0.17	0.73	0.88	0.93	2.11	2.66	2.23	2.75
O4	0.01	0.07	0.39	0.46	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.00	0.02	0.33	0.66	0.20	0.34	0.03	0.13	0.25
O4'	0.18	0.16	0.54	0.59	0.21	0.16	0.21	0.32	0.19	0.20	0.17	0.18	0.18	0.20	0.20	0.45	0.86	0.62	0.87	0.70	0.51	0.89
O5'	0.26	0.06	1.06	1.54	0.01	0.76	0.11	0.81	0.20	0.02	0.16	0.04	0.28	0.11	0.11	0.94	2.01	0.05	0.04	0.06	0.17	0.24
OP1	0.18	0.29	1.14	1.61	0.05	0.79	0.22	0.82	0.18	0.39	0.07	0.33	0.36	0.48	0.04	1.10	2.36	0.00	0.01	0.13	0.16	0.22
OP2	0.75	0.04	1.58	2.17	0.15	1.63	0.17	1.77	0.35	0.09	0.23	0.26	0.60	0.22	0.35	1.62	2.88	0.74	0.96	0.78	0.73	0.57
P	0.51	0.14	1.42	1.98	0.11	1.24	0.19	1.28	0.27	0.12	0.10	0.29	0.47	0.33	0.19	1.39	2.72	0.40	0.45	0.31	0.46	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.12	0.44	0.20
C2	0.00	0.00	0.06	0.39	0.00	0.53	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.27	0.43	0.87	0.84	0.81	0.88
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.08	0.30	0.14
C3'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.10	0.27	0.26	0.39	0.03	0.20	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.10
C4	0.00	0.00	0.04	0.13	0.00	0.23	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.23	0.34	0.15	0.07	0.17
C4'	0.00	0.53	0.00	0.00	0.23	0.00	0.08	0.00	0.20	0.29	0.39	0.51	0.12	0.19	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.15	0.08
C5	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.10	0.12	0.17	0.43	0.12
C5'	0.00	0.88	0.01	0.01	0.35	0.00	0.11	0.00	0.33	0.47	0.67	0.81	0.19	0.32	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01
C6	0.02	0.00	0.03	0.10	0.01	0.20	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.03	0.20	0.35	0.10	0.08	0.17
C8	0.01	0.00	0.00	0.27	0.00	0.29	0.01	0.47	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.18	0.21	0.23	0.48	0.84	1.30	0.86
N1	0.01	0.00	0.05	0.26	0.01	0.39	0.00	0.67	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.17	0.34	0.68	0.57	0.50	0.63
N3	0.00	0.00	0.06	0.39	0.00	0.51	0.00	0.81	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.27	0.43	0.78	0.71	0.62	0.73
N6	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.12	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.14	0.21	0.11	0.30	0.01
N7	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.19	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.19	0.12	0.33	0.75	1.14	0.70
N9	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.26	0.60	0.29
O2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.13	0.04	0.03	0.04	0.10	0.18	0.24	0.33	0.04	0.13	0.02	0.00	0.06	0.03	0.04	0.02	0.29	0.14
O3'	0.03	0.27	0.02	0.00	0.08	0.02	0.03	0.01	0.03	0.21	0.17	0.27	0.03	0.19	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03
O4'	0.00	0.43	0.00	0.01	0.23	0.00	0.10	0.00	0.20	0.23	0.34	0.43	0.14	0.12	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.10	0.38	0.18
O5'	0.01	0.87	0.01	0.01	0.34	0.00	0.12	0.01	0.35	0.48	0.68	0.78	0.21	0.33	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.12	0.84	0.08	0.08	0.15	0.01	0.17	0.04	0.10	0.84	0.57	0.71	0.11	0.75	0.26	0.02	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.44	0.81	0.30	0.16	0.07	0.15	0.43	0.06	0.08	1.30	0.50	0.62	0.30	1.14	0.60	0.29	0.05	0.38	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.88	0.14	0.10	0.17	0.08	0.12	0.01	0.17	0.86	0.63	0.73	0.01	0.70	0.29	0.14	0.03	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00