Doublet Group distance statistics: 49504

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 4, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, -0.001, 0.008, 0.016, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C5	A	0, -0.003, 0.008, 0.020, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.008 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.020, 0.048, 0.076, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.048 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.007, 0.041, 0.076, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.041 std_dev=0.035
O4'	A	0, -0.030, 0.088, 0.207, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.088 std_dev=0.118
C2'	A	0, -0.016, 0.111, 0.238, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.111 std_dev=0.127
O2'	A	0, 0.024, 0.163, 0.302, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.163 std_dev=0.139
C2'	B	0, 0.074, 0.228, 0.382, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.228 std_dev=0.154
N1	B	0, 0.090, 0.247, 0.404, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.247 std_dev=0.157
C4'	A	0, -0.030, 0.135, 0.300, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.135 std_dev=0.165
C1'	B	0, 0.086, 0.252, 0.418, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.252 std_dev=0.166
O2'	B	0, 0.085, 0.261, 0.438, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.261 std_dev=0.177
OP2	A	0, 0.105, 0.286, 0.468, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.286 std_dev=0.181
C3'	A	0, -0.024, 0.162, 0.347, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.162 std_dev=0.185
C3'	B	0, 0.027, 0.230, 0.432, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.230 std_dev=0.203
N3	B	0, 0.048, 0.271, 0.495, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.271 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.023, 0.246, 0.470, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.246 std_dev=0.223
C6	B	0, 0.094, 0.325, 0.557, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.325 std_dev=0.232
O4'	B	0, 0.075, 0.317, 0.559, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.317 std_dev=0.242
O5'	B	0, 0.047, 0.292, 0.537, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.292 std_dev=0.245
O3'	A	0, 0.005, 0.252, 0.498, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.252 std_dev=0.247
P	A	0, -0.008, 0.246, 0.501, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.246 std_dev=0.254
C4'	B	0, 0.030, 0.298, 0.565, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.298 std_dev=0.267
C4	B	0, 0.071, 0.340, 0.610, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.340 std_dev=0.270
P	B	0, 0.061, 0.333, 0.604, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.333 std_dev=0.272
O3'	B	0, -0.018, 0.259, 0.537, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.259 std_dev=0.278
O5'	A	0, -0.050, 0.228, 0.507, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.228 std_dev=0.278
OP2	B	0, 0.093, 0.374, 0.655, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.374 std_dev=0.281
C5'	A	0, -0.058, 0.245, 0.548, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.245 std_dev=0.303
C5	B	0, 0.069, 0.380, 0.692, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.380 std_dev=0.312
OP1	B	0, 0.095, 0.416, 0.737, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.416 std_dev=0.321
C5'	B	0, -0.005, 0.317, 0.639, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.317 std_dev=0.322
OP1	A	0, 0.041, 0.375, 0.709, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.375 std_dev=0.334
O4	B	0, 0.063, 0.422, 0.782, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.422 std_dev=0.360
O2	B	0, -0.086, 0.280, 0.647, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.280 std_dev=0.367

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.04	0.05	0.10	0.07
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.03	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.06	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.10	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.08	0.12	0.08
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.01	0.01	0.06	0.08	0.11	0.08
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.06	0.01	0.01	0.05	0.02	0.03
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.10	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.09	0.06
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.02	0.04	0.06	0.11	0.07
O2	0.04	0.01	0.08	0.08	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.06	0.06	0.07	0.10	0.08
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.04	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.10	0.06	0.06
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.02	0.06	0.10	0.01	0.00	0.05	0.02	0.07	0.13	0.10	0.08
O4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.01	0.07	0.11	0.13	0.10
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.10	0.07
O5'	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.06	0.05	0.07	0.07	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.03	0.05	0.08	0.10	0.08	0.05	0.08	0.05	0.06	0.04	0.06	0.07	0.10	0.13	0.11	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.10	0.06	0.07	0.12	0.04	0.11	0.02	0.10	0.09	0.11	0.10	0.06	0.10	0.13	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.07	0.04	0.06	0.08	0.03	0.08	0.03	0.07	0.06	0.07	0.08	0.06	0.08	0.10	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.21	0.10	0.11	0.18	0.10	0.24	0.12	0.16	0.06	0.16	0.41	0.12	0.13	0.24	0.07	0.11	0.12	0.23	0.15
C2	0.07	0.18	0.10	0.11	0.18	0.11	0.27	0.13	0.19	0.04	0.17	0.33	0.11	0.11	0.27	0.11	0.07	0.14	0.23	0.15
C2'	0.06	0.21	0.06	0.08	0.17	0.08	0.25	0.11	0.18	0.07	0.18	0.41	0.09	0.10	0.23	0.06	0.13	0.16	0.25	0.17
C3'	0.05	0.17	0.04	0.06	0.19	0.07	0.27	0.10	0.23	0.09	0.16	0.34	0.06	0.08	0.24	0.05	0.16	0.16	0.23	0.18
C4	0.07	0.21	0.08	0.09	0.19	0.11	0.22	0.13	0.14	0.07	0.24	0.30	0.08	0.09	0.29	0.12	0.10	0.18	0.26	0.18
C4'	0.06	0.13	0.03	0.06	0.22	0.06	0.28	0.09	0.24	0.11	0.14	0.27	0.06	0.10	0.25	0.03	0.14	0.12	0.20	0.15
C5	0.09	0.25	0.09	0.10	0.22	0.11	0.24	0.13	0.15	0.11	0.26	0.34	0.09	0.10	0.29	0.11	0.12	0.17	0.27	0.19
C5'	0.13	0.11	0.12	0.05	0.24	0.05	0.31	0.08	0.29	0.17	0.15	0.17	0.12	0.06	0.26	0.08	0.17	0.12	0.19	0.15
C6	0.10	0.27	0.10	0.12	0.21	0.12	0.25	0.13	0.17	0.12	0.25	0.38	0.10	0.12	0.27	0.11	0.13	0.15	0.25	0.17
N1	0.07	0.23	0.09	0.11	0.19	0.11	0.25	0.12	0.17	0.07	0.21	0.38	0.10	0.11	0.26	0.09	0.09	0.13	0.23	0.15
N3	0.06	0.18	0.09	0.09	0.16	0.11	0.25	0.12	0.17	0.04	0.20	0.30	0.09	0.10	0.27	0.12	0.09	0.17	0.26	0.17
O2	0.08	0.13	0.12	0.13	0.18	0.13	0.28	0.14	0.21	0.07	0.11	0.29	0.13	0.13	0.28	0.13	0.07	0.13	0.23	0.14
O2'	0.06	0.19	0.08	0.10	0.17	0.09	0.23	0.11	0.16	0.06	0.14	0.39	0.13	0.12	0.23	0.06	0.11	0.13	0.24	0.15
O3'	0.05	0.17	0.04	0.06	0.19	0.07	0.27	0.12	0.22	0.09	0.16	0.34	0.05	0.08	0.23	0.04	0.17	0.16	0.22	0.18
O4	0.08	0.20	0.09	0.10	0.19	0.13	0.17	0.15	0.12	0.06	0.24	0.27	0.09	0.10	0.30	0.14	0.10	0.20	0.25	0.18
O4'	0.05	0.14	0.07	0.11	0.22	0.09	0.27	0.11	0.21	0.09	0.14	0.30	0.10	0.14	0.25	0.05	0.11	0.11	0.20	0.14
O5'	0.11	0.13	0.12	0.06	0.22	0.05	0.31	0.08	0.29	0.16	0.15	0.21	0.12	0.02	0.24	0.08	0.20	0.15	0.20	0.18
OP1	0.06	0.10	0.10	0.02	0.15	0.04	0.21	0.13	0.19	0.10	0.11	0.16	0.14	0.02	0.18	0.02	0.15	0.11	0.11	0.11
OP2	0.06	0.19	0.02	0.05	0.17	0.10	0.18	0.17	0.14	0.09	0.20	0.27	0.04	0.02	0.21	0.10	0.15	0.15	0.13	0.14
P	0.04	0.12	0.07	0.02	0.15	0.04	0.22	0.10	0.20	0.09	0.13	0.20	0.09	0.01	0.18	0.02	0.17	0.12	0.13	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.10	0.04	0.05
C2	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.03	0.12	0.13	0.17	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.10	0.03	0.02	0.11	0.00	0.03	0.06	0.01	0.06	0.06	0.08	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.01	0.14	0.02	0.15	0.05	0.07	0.14	0.02	0.01	0.09	0.01	0.12	0.07	0.10	0.10
C4	0.03	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.15	0.20	0.28	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.09	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.02	0.15	0.21	0.28	0.22
C5'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.10	0.04	0.07	0.06	0.01	0.04	0.10	0.01	0.01	0.12	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.01	0.12	0.14	0.19	0.16
N1	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.09	0.10	0.13	0.10
N3	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.02	0.03	0.13	0.16	0.23	0.17
O2	0.04	0.01	0.11	0.14	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.17	0.04	0.05	0.12	0.13	0.15	0.11
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.07	0.00	0.05	0.06	0.04	0.04	0.06	0.06	0.03
O3'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.10	0.01	0.16	0.04	0.16	0.06	0.08	0.17	0.05	0.00	0.11	0.01	0.16	0.09	0.11	0.12
O4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.11	0.00	0.02	0.17	0.25	0.34	0.25
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.02	0.00	0.13	0.14	0.08	0.09
O5'	0.07	0.12	0.06	0.12	0.15	0.01	0.15	0.01	0.12	0.09	0.13	0.12	0.04	0.16	0.17	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.10	0.13	0.06	0.07	0.20	0.09	0.21	0.12	0.14	0.10	0.16	0.13	0.06	0.09	0.25	0.14	0.01	0.00	0.03	0.00
OP2	0.04	0.17	0.08	0.10	0.28	0.03	0.28	0.06	0.19	0.13	0.23	0.15	0.06	0.11	0.34	0.08	0.02	0.03	0.00	0.03
P	0.05	0.12	0.06	0.10	0.21	0.02	0.22	0.02	0.16	0.10	0.17	0.11	0.03	0.12	0.25	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00