Doublet Group distance statistics: 49508

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.002, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.001
N3	A	0, 0.001, 0.002, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O4	A	0, -0.001, 0.027, 0.054, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.027
OP1	A	0, 0.117, 0.325, 0.533, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.325 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.156, 0.388, 0.619, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.388 std_dev=0.232
C6	B	0, 0.168, 0.423, 0.678, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.423 std_dev=0.255
O4'	A	0, -0.040, 0.224, 0.489, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.224 std_dev=0.264
C2'	A	0, -0.044, 0.250, 0.543, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.250 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.100, 0.397, 0.694, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.397 std_dev=0.297
C5	B	0, 0.220, 0.557, 0.894, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.557 std_dev=0.337
C2	B	0, 0.203, 0.541, 0.878, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.541 std_dev=0.338
C1'	B	0, 0.098, 0.443, 0.789, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.443 std_dev=0.346
O3'	B	0, 0.120, 0.470, 0.821, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.470 std_dev=0.351
C4'	A	0, -0.036, 0.331, 0.698, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.331 std_dev=0.367
N3	B	0, 0.222, 0.593, 0.965, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.593 std_dev=0.372
O2'	A	0, -0.047, 0.328, 0.704, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.328 std_dev=0.375
C4	B	0, 0.224, 0.600, 0.976, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.600 std_dev=0.376
C2'	B	0, 0.003, 0.397, 0.792, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.397 std_dev=0.394
P	A	0, 0.038, 0.432, 0.827, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.432 std_dev=0.395
O4'	B	0, 0.149, 0.554, 0.959, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.554 std_dev=0.405
C3'	A	0, -0.061, 0.384, 0.829, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.384 std_dev=0.445
C4'	B	0, 0.128, 0.604, 1.081, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.604 std_dev=0.476
O4	B	0, 0.245, 0.760, 1.275, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.760 std_dev=0.515
O2	B	0, 0.164, 0.700, 1.236, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.700 std_dev=0.536
OP2	A	0, -0.085, 0.510, 1.106, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.510 std_dev=0.596
O3'	A	0, -0.064, 0.551, 1.167, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.551 std_dev=0.615
O5'	A	0, -0.086, 0.543, 1.171, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.543 std_dev=0.629
O2'	B	0, -0.018, 0.630, 1.277, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.630 std_dev=0.648
C5'	B	0, 0.129, 0.778, 1.427, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.778 std_dev=0.649
O5'	B	0, 0.102, 0.756, 1.411, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.756 std_dev=0.655
C5'	A	0, -0.081, 0.593, 1.268, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.593 std_dev=0.675
P	B	0, 0.004, 1.007, 2.009, 2.672 max_d=2.672 avg_d=1.007 std_dev=1.002
OP2	B	0, -0.034, 1.061, 2.156, 2.894 max_d=2.894 avg_d=1.061 std_dev=1.095
OP1	B	0, -0.104, 1.103, 2.310, 3.133 max_d=3.133 avg_d=1.103 std_dev=1.207

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.51	0.15
C2	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.00	0.04	0.35	0.04	0.35	0.04
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.04	0.17	0.00	0.01	0.03	0.00	0.26	0.22	0.35	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.14	0.03	0.02	0.13	0.01	0.00	0.06	0.01	0.33	0.36	0.24	0.15
C4	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.01	0.51	0.06	0.17	0.09
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.11	0.46	0.10
C5	0.00	0.00	0.09	0.13	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.17	0.00	0.05	0.53	0.06	0.19	0.09
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.17	0.38	0.01
C6	0.00	0.00	0.11	0.14	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.16	0.00	0.06	0.47	0.04	0.36	0.03
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.34	0.03	0.42	0.06
N3	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.44	0.05	0.25	0.05
O2	0.01	0.00	0.17	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.17	0.00	0.08	0.28	0.03	0.38	0.06
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.05	0.08	0.00	0.05	0.17	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.18	0.40	0.06
O3'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.16	0.03	0.02	0.17	0.01	0.00	0.09	0.01	0.25	0.47	0.17	0.20
O4	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.01	0.53	0.06	0.08	0.13
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.03	0.08	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.61	0.27
O5'	0.15	0.35	0.26	0.33	0.51	0.01	0.53	0.01	0.47	0.34	0.44	0.28	0.11	0.25	0.53	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.01	0.04	0.22	0.36	0.06	0.11	0.06	0.17	0.04	0.03	0.05	0.03	0.18	0.47	0.06	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.51	0.35	0.35	0.24	0.17	0.46	0.19	0.38	0.36	0.42	0.25	0.38	0.40	0.17	0.08	0.61	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.04	0.03	0.15	0.09	0.10	0.09	0.01	0.03	0.06	0.05	0.06	0.06	0.20	0.13	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.40	0.37	0.15	0.22	0.21	0.28	0.09	0.18	0.25	0.26	0.66	0.58	0.13	0.27	0.28	0.15	0.22	0.37	0.24
C2	0.28	0.46	0.30	0.07	0.08	0.09	0.24	0.13	0.11	0.22	0.36	0.66	0.45	0.06	0.14	0.17	0.31	0.47	0.64	0.47
C2'	0.32	0.46	0.29	0.04	0.20	0.11	0.25	0.08	0.17	0.24	0.34	0.74	0.53	0.03	0.22	0.22	0.24	0.35	0.48	0.35
C3'	0.10	0.26	0.08	0.16	0.19	0.11	0.33	0.26	0.27	0.10	0.20	0.50	0.31	0.20	0.22	0.06	0.37	0.45	0.50	0.44
C4	0.22	0.43	0.26	0.07	0.25	0.09	0.15	0.28	0.10	0.24	0.43	0.53	0.33	0.06	0.25	0.10	0.42	0.68	0.77	0.63
C4'	0.10	0.17	0.08	0.09	0.28	0.05	0.36	0.13	0.30	0.16	0.18	0.29	0.26	0.06	0.31	0.08	0.21	0.18	0.27	0.22
C5	0.21	0.38	0.26	0.06	0.17	0.06	0.14	0.25	0.09	0.21	0.35	0.50	0.32	0.05	0.16	0.08	0.36	0.59	0.59	0.52
C5'	0.28	0.20	0.27	0.32	0.33	0.31	0.43	0.34	0.43	0.31	0.23	0.13	0.14	0.30	0.32	0.30	0.32	0.22	0.21	0.26
C6	0.25	0.37	0.30	0.08	0.04	0.05	0.15	0.14	0.08	0.20	0.28	0.53	0.40	0.04	0.03	0.14	0.26	0.42	0.45	0.38
N1	0.30	0.42	0.33	0.10	0.10	0.11	0.23	0.09	0.12	0.22	0.28	0.63	0.48	0.07	0.14	0.19	0.25	0.37	0.50	0.37
N3	0.25	0.46	0.28	0.07	0.14	0.06	0.16	0.21	0.07	0.23	0.44	0.60	0.39	0.05	0.10	0.12	0.39	0.61	0.75	0.58
O2	0.29	0.43	0.29	0.08	0.18	0.12	0.28	0.10	0.14	0.22	0.32	0.68	0.47	0.07	0.29	0.19	0.29	0.43	0.64	0.46
O2'	0.44	0.54	0.36	0.13	0.28	0.25	0.26	0.11	0.21	0.35	0.42	0.84	0.63	0.08	0.30	0.36	0.15	0.22	0.39	0.24
O3'	0.13	0.30	0.09	0.16	0.20	0.10	0.31	0.26	0.26	0.13	0.24	0.56	0.32	0.22	0.22	0.05	0.37	0.46	0.50	0.44
O4	0.21	0.43	0.25	0.08	0.36	0.12	0.20	0.33	0.14	0.26	0.48	0.51	0.29	0.08	0.40	0.11	0.46	0.79	0.87	0.71
O4'	0.17	0.17	0.23	0.11	0.30	0.15	0.35	0.08	0.27	0.15	0.19	0.30	0.44	0.15	0.34	0.16	0.13	0.13	0.24	0.16
O5'	0.06	0.11	0.06	0.14	0.44	0.07	0.57	0.21	0.48	0.23	0.24	0.17	0.38	0.00	0.49	0.09	0.35	0.29	0.43	0.36
OP1	0.03	0.07	0.05	0.03	0.06	0.03	0.13	0.06	0.11	0.02	0.04	0.15	0.06	0.01	0.08	0.03	0.14	0.25	0.33	0.24
OP2	0.20	0.38	0.34	0.07	0.19	0.15	0.10	0.42	0.09	0.20	0.34	0.52	0.37	0.00	0.18	0.04	0.39	0.64	0.32	0.47
P	0.06	0.11	0.13	0.00	0.09	0.06	0.20	0.17	0.18	0.01	0.05	0.25	0.22	0.00	0.10	0.01	0.14	0.14	0.06	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.13	0.10
C2	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.02	0.00	0.02	0.16	0.16	0.30	0.23
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.03	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01
C3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.03	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.06	0.05	0.04
C4	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.00	0.01	0.26	0.34	0.49	0.37
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.00	0.01	0.28	0.38	0.51	0.39
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.08	0.10	0.03	0.02	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01
C6	0.00	0.00	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.00	0.02	0.25	0.29	0.39	0.31
N1	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.00	0.17	0.17	0.28	0.22
N3	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.21	0.25	0.40	0.30
O2	0.00	0.00	0.09	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.10	0.00	0.03	0.12	0.08	0.24	0.17
O2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.14	0.00	0.03	0.03	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.01	0.14	0.00	0.13	0.04	0.02	0.10	0.03	0.00	0.09	0.01	0.05	0.13	0.13	0.10
O4	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.01	0.27	0.39	0.54	0.41
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.10	0.08
O5'	0.08	0.16	0.02	0.01	0.26	0.00	0.28	0.01	0.25	0.17	0.21	0.12	0.02	0.05	0.27	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.04	0.16	0.04	0.06	0.34	0.04	0.38	0.02	0.29	0.17	0.25	0.08	0.07	0.13	0.39	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.30	0.02	0.05	0.49	0.00	0.51	0.00	0.39	0.28	0.40	0.24	0.01	0.13	0.54	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.23	0.01	0.04	0.37	0.01	0.39	0.01	0.31	0.22	0.30	0.17	0.01	0.10	0.41	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00