Doublet Group distance statistics: 49517

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.013, 0.033, 0.052, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.033 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.004, 0.024, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.003, 0.027, 0.050, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.008, 0.032, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.024
O5'	A	0, 0.016, 0.081, 0.146, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.081 std_dev=0.065
O4'	A	0, 0.006, 0.111, 0.216, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.111 std_dev=0.105
P	A	0, 0.017, 0.129, 0.242, 0.290 max_d=0.290 avg_d=0.129 std_dev=0.113
C3'	B	0, 0.019, 0.139, 0.258, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.139 std_dev=0.120
C2'	B	0, 0.024, 0.151, 0.278, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.151 std_dev=0.127
OP1	A	0, 0.027, 0.165, 0.303, 0.312 max_d=0.312 avg_d=0.165 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.010, 0.173, 0.337, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.173 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.006, 0.171, 0.336, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.171 std_dev=0.165
OP2	A	0, 0.023, 0.192, 0.361, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.192 std_dev=0.169
C3'	A	0, 0.008, 0.203, 0.399, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.203 std_dev=0.195
N9	B	0, 0.005, 0.201, 0.397, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.201 std_dev=0.196
P	B	0, 0.017, 0.215, 0.414, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.215 std_dev=0.199
C4	B	0, 0.009, 0.214, 0.418, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.214 std_dev=0.205
O2'	A	0, 0.017, 0.240, 0.464, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.240 std_dev=0.223
N3	B	0, 0.013, 0.243, 0.474, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.243 std_dev=0.230
C1'	B	0, 0.010, 0.249, 0.488, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.249 std_dev=0.239
C8	B	0, 0.006, 0.253, 0.501, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.253 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.011, 0.271, 0.532, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.271 std_dev=0.260
O3'	A	0, 0.009, 0.273, 0.537, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.273 std_dev=0.264
C2	B	0, 0.010, 0.288, 0.567, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.288 std_dev=0.278
C5'	A	0, 0.014, 0.302, 0.590, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.302 std_dev=0.288
N7	B	0, 0.006, 0.303, 0.601, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.303 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.008, 0.332, 0.657, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.332 std_dev=0.324
C6	B	0, 0.018, 0.343, 0.668, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.343 std_dev=0.325
C4'	B	0, 0.005, 0.345, 0.685, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.345 std_dev=0.340
O3'	B	0, 0.023, 0.372, 0.721, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.372 std_dev=0.349
O2'	B	0, 0.053, 0.471, 0.890, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.471 std_dev=0.419
N6	B	0, 0.037, 0.457, 0.876, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.457 std_dev=0.419
C5'	B	0, 0.012, 0.474, 0.935, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.474 std_dev=0.461
O4'	B	0, 0.016, 0.499, 0.981, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.499 std_dev=0.482
OP2	B	0, 0.033, 0.750, 1.466, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.750 std_dev=0.716
O5'	B	0, 0.022, 0.770, 1.517, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.770 std_dev=0.748
OP1	B	0, 0.015, 0.829, 1.642, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.829 std_dev=0.813

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.04	0.04
C2	0.01	0.00	0.02	0.11	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.07	0.07	0.06
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.08	0.12	0.11	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.10	0.03	0.14	0.08	0.10
C4	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.04
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02
C5	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.03
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.17	0.12	0.03
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.09	0.04	0.03
C8	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.04
N1	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.03	0.03
N2	0.02	0.00	0.04	0.12	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.04	0.00	0.06	0.02	0.04
N3	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04
N7	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.04	0.03
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.05	0.07	0.03	0.07	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.07	0.06	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.10	0.14	0.12	0.01	0.04	0.07	0.00	0.01	0.12	0.05	0.19	0.09	0.12
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.10	0.01	0.04	0.10	0.07
O5'	0.05	0.04	0.05	0.10	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.12	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02
OP1	0.04	0.06	0.07	0.14	0.07	0.10	0.08	0.17	0.09	0.08	0.08	0.06	0.06	0.09	0.06	0.01	0.19	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00
OP2	0.04	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.02	0.12	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.09	0.10	0.02	0.06	0.02	0.00	0.00
P	0.04	0.04	0.06	0.10	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.01	0.12	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.13	0.09	0.06	0.02	0.28	0.01	0.26	0.06	0.14	0.13	0.06	0.06	0.08	0.11	0.32	0.08	0.38	0.26	0.48	0.55	0.09
C2	0.19	0.03	0.04	0.09	0.08	0.27	0.05	0.27	0.03	0.14	0.07	0.06	0.06	0.09	0.15	0.24	0.13	0.38	0.44	0.33	0.55	0.09
C2'	0.05	0.23	0.20	0.05	0.09	0.16	0.10	0.11	0.17	0.02	0.23	0.15	0.18	0.04	0.01	0.42	0.02	0.25	0.16	0.35	0.68	0.03
C3'	0.05	0.18	0.19	0.07	0.08	0.10	0.09	0.03	0.14	0.01	0.19	0.13	0.15	0.04	0.01	0.35	0.03	0.20	0.09	0.30	0.70	0.08
C4	0.19	0.09	0.05	0.09	0.06	0.28	0.03	0.27	0.04	0.14	0.10	0.01	0.06	0.08	0.13	0.28	0.12	0.39	0.39	0.37	0.56	0.08
C4'	0.06	0.17	0.13	0.02	0.05	0.15	0.05	0.10	0.11	0.06	0.16	0.12	0.11	0.01	0.02	0.30	0.03	0.23	0.06	0.42	0.62	0.03
C5	0.20	0.09	0.04	0.09	0.07	0.27	0.03	0.27	0.04	0.14	0.10	0.02	0.06	0.08	0.14	0.25	0.12	0.38	0.45	0.32	0.56	0.08
C5'	0.03	0.16	0.11	0.03	0.07	0.09	0.06	0.04	0.10	0.04	0.15	0.13	0.10	0.01	0.01	0.23	0.01	0.15	0.03	0.39	0.63	0.07
C6	0.20	0.03	0.03	0.09	0.10	0.26	0.05	0.26	0.03	0.14	0.07	0.08	0.06	0.08	0.15	0.21	0.13	0.36	0.51	0.26	0.54	0.08
C8	0.17	0.14	0.06	0.09	0.02	0.28	0.01	0.27	0.06	0.13	0.12	0.07	0.06	0.08	0.11	0.31	0.10	0.38	0.35	0.40	0.57	0.08
N1	0.20	0.01	0.03	0.09	0.10	0.26	0.05	0.27	0.02	0.14	0.06	0.08	0.06	0.08	0.15	0.22	0.13	0.37	0.49	0.28	0.54	0.09
N2	0.20	0.01	0.04	0.09	0.09	0.28	0.05	0.27	0.02	0.14	0.05	0.07	0.05	0.09	0.15	0.24	0.13	0.39	0.45	0.33	0.54	0.09
N3	0.18	0.07	0.06	0.08	0.06	0.28	0.03	0.27	0.04	0.14	0.09	0.02	0.06	0.08	0.13	0.27	0.12	0.39	0.39	0.37	0.56	0.08
N7	0.19	0.13	0.04	0.10	0.04	0.27	0.02	0.27	0.05	0.14	0.12	0.04	0.06	0.08	0.13	0.28	0.12	0.38	0.44	0.33	0.56	0.08
N9	0.17	0.13	0.07	0.08	0.03	0.28	0.02	0.27	0.05	0.14	0.12	0.05	0.06	0.08	0.12	0.31	0.10	0.38	0.33	0.43	0.56	0.08
O2'	0.10	0.22	0.16	0.01	0.06	0.23	0.07	0.19	0.16	0.06	0.23	0.14	0.17	0.00	0.04	0.39	0.07	0.32	0.19	0.47	0.60	0.06
O3'	0.04	0.18	0.20	0.10	0.09	0.06	0.10	0.05	0.16	0.02	0.19	0.13	0.17	0.06	0.02	0.32	0.03	0.15	0.05	0.27	0.72	0.12
O4'	0.13	0.14	0.07	0.07	0.01	0.27	0.02	0.25	0.05	0.13	0.12	0.07	0.05	0.09	0.10	0.29	0.07	0.35	0.18	0.52	0.53	0.08
O5'	0.05	0.20	0.14	0.02	0.08	0.16	0.07	0.10	0.12	0.05	0.18	0.16	0.12	0.01	0.01	0.31	0.04	0.20	0.09	0.42	0.60	0.01
O6	0.19	0.01	0.01	0.09	0.11	0.23	0.06	0.25	0.02	0.13	0.06	0.12	0.06	0.08	0.16	0.16	0.12	0.33	0.56	0.20	0.52	0.08
OP1	0.09	0.08	0.01	0.06	0.03	0.22	0.07	0.20	0.03	0.18	0.04	0.06	0.06	0.15	0.10	0.12	0.04	0.23	0.00	0.62	0.38	0.12
OP2	0.12	0.32	0.23	0.15	0.24	0.09	0.23	0.17	0.27	0.13	0.31	0.29	0.27	0.17	0.17	0.23	0.01	0.08	0.09	0.24	0.69	0.16
P	0.01	0.19	0.11	0.03	0.09	0.09	0.07	0.04	0.11	0.03	0.16	0.16	0.10	0.01	0.02	0.19	0.01	0.10	0.01	0.40	0.58	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.34	0.03	0.78	0.16
C2	0.01	0.00	0.16	0.10	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.08	0.07	0.51	0.05	0.58	0.04
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.03	0.06	0.07	0.08	0.12	0.16	0.05	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.46	0.22	0.56	0.03
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.08	0.09	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.27	0.60	0.05
C4	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.03	0.04	0.53	0.06	0.61	0.05
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.71	0.17
C5	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.62	0.10	0.45	0.03
C5'	0.03	0.04	0.06	0.00	0.07	0.01	0.11	0.00	0.10	0.14	0.07	0.03	0.12	0.14	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.29	0.45	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.04	0.62	0.11	0.39	0.04
C8	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.03	0.64	0.09	0.54	0.02
N1	0.01	0.00	0.12	0.08	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.06	0.05	0.57	0.09	0.47	0.01
N3	0.00	0.00	0.16	0.09	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.07	0.07	0.47	0.04	0.65	0.07
N6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.03	0.03	0.66	0.13	0.25	0.09
N7	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.67	0.12	0.35	0.07
N9	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.52	0.05	0.68	0.08
O2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.11	0.01	0.05	0.05	0.11	0.08	0.18	0.24	0.08	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.44	0.24	0.53	0.04
O3'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.23	0.69	0.14
O4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.06	0.92	0.30
O5'	0.34	0.51	0.46	0.18	0.53	0.01	0.62	0.01	0.62	0.64	0.57	0.47	0.66	0.67	0.52	0.44	0.02	0.11	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.03	0.05	0.22	0.27	0.06	0.17	0.10	0.29	0.11	0.09	0.09	0.04	0.13	0.12	0.05	0.24	0.23	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.78	0.58	0.56	0.60	0.61	0.71	0.45	0.45	0.39	0.54	0.47	0.65	0.25	0.35	0.68	0.53	0.69	0.92	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.04	0.03	0.05	0.05	0.17	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.09	0.07	0.08	0.04	0.14	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00