Doublet Group distance statistics: 49519

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 18, 22, 6, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.006, 0.026, 0.047, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.005, 0.028, 0.050, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.028 std_dev=0.022
O4'	A	0, -0.021, 0.068, 0.156, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.068 std_dev=0.089
C4'	A	0, -0.016, 0.108, 0.233, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.108 std_dev=0.124
C2'	A	0, -0.033, 0.091, 0.216, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.091 std_dev=0.124
O2'	A	0, -0.026, 0.136, 0.299, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.136 std_dev=0.163
C3'	A	0, -0.051, 0.134, 0.318, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.134 std_dev=0.184
C5	B	0, 0.077, 0.307, 0.537, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.307 std_dev=0.230
C6	B	0, 0.069, 0.316, 0.563, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.316 std_dev=0.247
C5'	A	0, -0.066, 0.181, 0.428, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.181 std_dev=0.247
C4	B	0, 0.038, 0.294, 0.550, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.294 std_dev=0.256
O6	B	0, 0.087, 0.344, 0.600, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.344 std_dev=0.256
N7	B	0, 0.084, 0.343, 0.601, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.343 std_dev=0.258
O3'	A	0, -0.081, 0.193, 0.466, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.193 std_dev=0.273
N9	B	0, 0.028, 0.317, 0.606, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.317 std_dev=0.289
C8	B	0, 0.053, 0.351, 0.649, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.351 std_dev=0.298
N3	B	0, -0.018, 0.290, 0.597, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.290 std_dev=0.307
N1	B	0, 0.003, 0.316, 0.628, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.316 std_dev=0.313
C2	B	0, -0.039, 0.303, 0.645, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.303 std_dev=0.342
O5'	A	0, -0.148, 0.200, 0.548, 2.039 max_d=2.039 avg_d=0.200 std_dev=0.348
C1'	B	0, -0.027, 0.330, 0.687, 2.003 max_d=2.003 avg_d=0.330 std_dev=0.357
C2'	B	0, -0.030, 0.337, 0.703, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.337 std_dev=0.367
O4'	B	0, -0.028, 0.355, 0.738, 2.133 max_d=2.133 avg_d=0.355 std_dev=0.383
N2	B	0, -0.105, 0.337, 0.778, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.337 std_dev=0.441
C4'	B	0, -0.119, 0.382, 0.883, 2.450 max_d=2.450 avg_d=0.382 std_dev=0.501
P	A	0, -0.218, 0.303, 0.825, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.303 std_dev=0.522
OP2	A	0, -0.181, 0.364, 0.909, 2.765 max_d=2.765 avg_d=0.364 std_dev=0.545
C5'	B	0, -0.163, 0.416, 0.995, 3.002 max_d=3.002 avg_d=0.416 std_dev=0.579
C3'	B	0, -0.191, 0.397, 0.986, 2.760 max_d=2.760 avg_d=0.397 std_dev=0.588
O5'	B	0, -0.226, 0.463, 1.152, 3.212 max_d=3.212 avg_d=0.463 std_dev=0.689
OP1	A	0, -0.300, 0.422, 1.145, 3.380 max_d=3.380 avg_d=0.422 std_dev=0.722
OP2	B	0, -0.218, 0.517, 1.253, 3.418 max_d=3.418 avg_d=0.517 std_dev=0.736
P	B	0, -0.239, 0.502, 1.243, 3.477 max_d=3.477 avg_d=0.502 std_dev=0.741
O2'	B	0, -0.303, 0.456, 1.216, 3.551 max_d=3.551 avg_d=0.456 std_dev=0.759
OP1	B	0, -0.239, 0.540, 1.319, 3.607 max_d=3.607 avg_d=0.540 std_dev=0.779
O3'	B	0, -0.489, 0.496, 1.482, 4.218 max_d=4.218 avg_d=0.496 std_dev=0.986

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.23	0.18	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.11	0.01	0.39	0.25	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.17	0.23	0.12
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.05	0.11	0.08	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.11	0.25	0.13
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.07	0.01	0.36	0.19	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.16	0.05
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.41	0.15	0.17
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.05	0.05	0.07	0.09	0.07	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.11	0.10	0.01
C6	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.08	0.00	0.43	0.17	0.19
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.07	0.01	0.35	0.13	0.11
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.10	0.00	0.42	0.21	0.22
N2	0.03	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.13	0.01	0.38	0.29	0.24
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.10	0.01	0.35	0.25	0.20
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.06	0.01	0.41	0.12	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.32	0.16	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.05	0.14	0.24	0.11
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.06	0.11	0.05	0.13	0.09	0.11	0.05	0.03	0.00	0.01	0.06	0.08	0.10	0.32	0.15
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.20	0.17	0.09
O5'	0.03	0.11	0.03	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.07	0.10	0.13	0.10	0.06	0.04	0.04	0.06	0.04	0.00	0.07	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.07	0.00	0.45	0.14	0.18
OP1	0.23	0.39	0.17	0.11	0.36	0.10	0.41	0.11	0.43	0.35	0.42	0.38	0.35	0.41	0.32	0.14	0.10	0.20	0.02	0.45	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.25	0.23	0.25	0.19	0.16	0.15	0.10	0.17	0.13	0.21	0.29	0.25	0.12	0.16	0.24	0.32	0.17	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.22	0.12	0.13	0.18	0.05	0.17	0.01	0.19	0.11	0.22	0.24	0.20	0.13	0.13	0.11	0.15	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.25	0.14	0.57	0.12	0.47	0.14	0.47	0.21	0.11	0.27	0.34	0.16	0.11	0.11	0.12	1.00	0.29	0.43	0.23	0.42	0.47	0.42
C2	0.25	0.13	0.22	0.50	0.11	0.43	0.11	0.40	0.18	0.13	0.20	0.17	0.10	0.11	0.16	0.39	0.94	0.32	0.26	0.22	0.26	0.32	0.26
C2'	0.28	0.22	0.27	0.69	0.13	0.57	0.13	0.59	0.17	0.20	0.24	0.33	0.14	0.15	0.19	0.26	1.07	0.38	0.50	0.19	0.51	0.55	0.50
C3'	0.36	0.24	0.34	0.77	0.17	0.66	0.16	0.71	0.17	0.28	0.23	0.36	0.17	0.21	0.26	0.29	1.10	0.47	0.60	0.17	0.62	0.65	0.61
C4	0.23	0.20	0.19	0.52	0.10	0.45	0.13	0.42	0.20	0.12	0.24	0.28	0.11	0.11	0.13	0.30	0.97	0.32	0.31	0.23	0.31	0.37	0.31
C4'	0.22	0.29	0.17	0.65	0.14	0.55	0.14	0.61	0.20	0.17	0.28	0.40	0.20	0.13	0.15	0.09	1.00	0.35	0.57	0.21	0.57	0.60	0.57
C5	0.25	0.18	0.21	0.48	0.10	0.42	0.12	0.39	0.19	0.12	0.24	0.26	0.09	0.11	0.15	0.37	0.92	0.32	0.25	0.23	0.26	0.33	0.27
C5'	0.23	0.33	0.17	0.65	0.17	0.58	0.16	0.66	0.22	0.18	0.31	0.44	0.25	0.14	0.16	0.17	0.94	0.38	0.62	0.22	0.63	0.64	0.63
C6	0.27	0.12	0.23	0.44	0.11	0.40	0.11	0.35	0.17	0.13	0.20	0.15	0.12	0.10	0.17	0.45	0.86	0.32	0.19	0.22	0.20	0.28	0.21
C8	0.20	0.26	0.16	0.53	0.12	0.46	0.14	0.44	0.22	0.11	0.28	0.36	0.16	0.11	0.11	0.20	0.98	0.31	0.35	0.24	0.35	0.42	0.36
N1	0.27	0.11	0.24	0.46	0.12	0.41	0.11	0.36	0.17	0.13	0.18	0.13	0.12	0.11	0.17	0.45	0.89	0.32	0.21	0.22	0.22	0.28	0.22
N2	0.25	0.12	0.23	0.50	0.11	0.43	0.11	0.40	0.17	0.13	0.19	0.15	0.11	0.11	0.16	0.40	0.94	0.32	0.26	0.22	0.26	0.31	0.26
N3	0.23	0.17	0.20	0.53	0.10	0.45	0.12	0.43	0.19	0.13	0.23	0.24	0.10	0.11	0.14	0.32	0.97	0.32	0.31	0.23	0.31	0.37	0.31
N7	0.24	0.23	0.19	0.47	0.10	0.43	0.13	0.39	0.21	0.12	0.26	0.33	0.11	0.11	0.13	0.32	0.91	0.32	0.27	0.24	0.28	0.36	0.29
N9	0.20	0.24	0.16	0.55	0.11	0.46	0.14	0.45	0.21	0.12	0.26	0.33	0.14	0.11	0.12	0.20	1.00	0.31	0.37	0.23	0.36	0.43	0.37
O2'	0.24	0.22	0.24	0.67	0.12	0.54	0.13	0.57	0.18	0.17	0.24	0.32	0.14	0.13	0.16	0.20	1.05	0.34	0.51	0.19	0.52	0.55	0.51
O3'	0.42	0.22	0.42	0.84	0.22	0.71	0.21	0.79	0.17	0.36	0.21	0.34	0.19	0.28	0.33	0.37	1.11	0.52	0.67	0.17	0.71	0.73	0.69
O4'	0.14	0.29	0.08	0.55	0.14	0.46	0.16	0.49	0.23	0.10	0.29	0.38	0.21	0.11	0.10	0.13	0.97	0.27	0.48	0.24	0.47	0.51	0.47
O5'	0.34	0.33	0.26	0.75	0.18	0.70	0.16	0.76	0.21	0.25	0.30	0.45	0.25	0.18	0.23	0.16	1.07	0.51	0.66	0.21	0.68	0.69	0.67
O6	0.28	0.09	0.25	0.38	0.13	0.36	0.10	0.31	0.16	0.13	0.16	0.09	0.16	0.10	0.18	0.50	0.78	0.31	0.14	0.21	0.16	0.23	0.16
OP1	0.11	0.65	0.25	0.41	0.40	0.54	0.38	0.68	0.49	0.14	0.61	0.77	0.55	0.23	0.21	0.61	0.56	0.29	0.64	0.48	0.67	0.58	0.63
OP2	0.42	0.27	0.40	0.90	0.11	0.84	0.13	1.00	0.10	0.40	0.23	0.45	0.16	0.29	0.30	0.25	0.93	0.61	0.82	0.10	0.88	0.87	0.86
P	0.30	0.38	0.21	0.79	0.10	0.79	0.09	0.89	0.21	0.23	0.34	0.54	0.26	0.12	0.16	0.09	1.01	0.55	0.75	0.21	0.78	0.76	0.76

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.19	0.00	0.10	0.01	0.06	0.24	0.05
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.18	0.06	0.25	0.01	0.18	0.12	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.12	0.04	0.06	0.07	0.12	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.03	0.06	0.24	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.16	0.00	0.22	0.01	0.23	0.23	0.18	0.10	0.10	0.26	0.15	0.01	0.01	0.01	0.24	0.25	0.24	0.09	0.19
C4	0.01	0.00	0.05	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.10	0.03	0.28	0.01	0.17	0.11	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.14	0.06	0.05	0.03	0.14	0.07	0.18	0.02	0.00	0.01	0.12	0.08	0.19	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.22	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.09	0.01	0.38	0.01	0.24	0.15	0.25
C5'	0.04	0.06	0.12	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.13	0.15	0.09	0.05	0.04	0.17	0.07	0.06	0.12	0.01	0.01	0.17	0.08	0.20	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.23	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.09	0.02	0.39	0.00	0.27	0.20	0.29
C8	0.01	0.01	0.06	0.23	0.00	0.14	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.12	0.05	0.39	0.01	0.21	0.11	0.22
N1	0.02	0.00	0.07	0.18	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.11	0.04	0.33	0.01	0.23	0.16	0.23
N2	0.03	0.00	0.12	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.24	0.08	0.21	0.01	0.16	0.12	0.14
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.20	0.06	0.21	0.01	0.14	0.12	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.26	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.15	0.04	0.44	0.01	0.27	0.16	0.30
N9	0.00	0.01	0.02	0.15	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.06	0.01	0.25	0.01	0.14	0.14	0.12
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.18	0.18	0.23	0.06	0.26	0.18	0.23	0.17	0.16	0.23	0.14	0.00	0.04	0.14	0.19	0.28	0.16	0.21	0.08
O3'	0.19	0.18	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.12	0.09	0.12	0.11	0.24	0.20	0.15	0.06	0.04	0.00	0.14	0.27	0.12	0.46	0.22	0.31
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.08	0.06	0.04	0.01	0.14	0.14	0.00	0.05	0.02	0.05	0.32	0.12
O5'	0.10	0.25	0.10	0.24	0.28	0.01	0.38	0.01	0.39	0.39	0.33	0.21	0.21	0.44	0.25	0.19	0.27	0.05	0.00	0.44	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.25	0.01	0.12	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.12	0.02	0.44	0.00	0.32	0.27	0.35
OP1	0.06	0.18	0.06	0.24	0.17	0.08	0.24	0.08	0.27	0.21	0.23	0.16	0.14	0.27	0.14	0.16	0.46	0.05	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.12	0.24	0.09	0.11	0.19	0.15	0.20	0.20	0.11	0.16	0.12	0.12	0.16	0.14	0.21	0.22	0.32	0.02	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.16	0.05	0.19	0.16	0.02	0.25	0.01	0.29	0.22	0.23	0.14	0.12	0.30	0.12	0.08	0.31	0.12	0.00	0.35	0.01	0.01	0.00