Doublet Group distance statistics: 49521

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 3, 2, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.014, 0.023, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.032 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.023, 0.041, 0.060, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.041 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.028, 0.046, 0.065, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.046 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.022, 0.041, 0.060, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.041 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.030, 0.049, 0.068, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.049 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.006, 0.025, 0.045, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.019, 0.040, 0.060, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.040 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.163, 0.303, 0.443, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.303 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.191, 0.347, 0.503, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.347 std_dev=0.156
O4'	A	0, 0.159, 0.315, 0.471, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.315 std_dev=0.156
C4'	A	0, 0.259, 0.507, 0.756, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.507 std_dev=0.248
C3'	A	0, 0.241, 0.491, 0.741, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.491 std_dev=0.250
N3	B	0, 0.445, 0.785, 1.125, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.785 std_dev=0.340
C5	B	0, 0.513, 0.874, 1.236, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.874 std_dev=0.362
C6	B	0, 0.444, 0.815, 1.187, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.815 std_dev=0.371
C4	B	0, 0.511, 0.894, 1.277, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.894 std_dev=0.383
O3'	A	0, 0.380, 0.770, 1.160, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.770 std_dev=0.390
C5'	A	0, 0.397, 0.799, 1.202, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.799 std_dev=0.402
C2	B	0, 0.323, 0.742, 1.161, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.742 std_dev=0.419
O6	B	0, 0.480, 0.939, 1.397, 2.068 max_d=2.068 avg_d=0.939 std_dev=0.458
N1	B	0, 0.318, 0.791, 1.264, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.791 std_dev=0.473
O5'	A	0, 0.102, 0.596, 1.090, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.596 std_dev=0.494
P	A	0, 0.288, 0.791, 1.294, 2.158 max_d=2.158 avg_d=0.791 std_dev=0.503
N7	B	0, 0.617, 1.125, 1.633, 2.058 max_d=2.058 avg_d=1.125 std_dev=0.508
N2	B	0, 0.392, 0.921, 1.449, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.921 std_dev=0.528
OP2	A	0, 0.285, 0.840, 1.396, 2.536 max_d=2.536 avg_d=0.840 std_dev=0.555
N9	B	0, 0.602, 1.184, 1.765, 2.097 max_d=2.097 avg_d=1.184 std_dev=0.582
C8	B	0, 0.670, 1.321, 1.972, 2.419 max_d=2.419 avg_d=1.321 std_dev=0.651
OP1	A	0, 0.563, 1.250, 1.937, 2.938 max_d=2.938 avg_d=1.250 std_dev=0.687
C1'	B	0, 0.588, 1.334, 2.080, 2.453 max_d=2.453 avg_d=1.334 std_dev=0.746
C2'	B	0, 0.650, 1.412, 2.174, 2.576 max_d=2.576 avg_d=1.412 std_dev=0.762
C3'	B	0, 0.649, 1.449, 2.248, 3.007 max_d=3.007 avg_d=1.449 std_dev=0.799
O4'	B	0, 0.571, 1.426, 2.281, 2.923 max_d=2.923 avg_d=1.426 std_dev=0.855
O3'	B	0, 0.670, 1.572, 2.473, 3.404 max_d=3.404 avg_d=1.572 std_dev=0.902
C4'	B	0, 0.561, 1.502, 2.442, 3.322 max_d=3.322 avg_d=1.502 std_dev=0.940
O2'	B	0, 0.660, 1.607, 2.555, 3.387 max_d=3.387 avg_d=1.607 std_dev=0.947
C5'	B	0, 0.570, 1.609, 2.649, 3.756 max_d=3.756 avg_d=1.609 std_dev=1.040
O5'	B	0, 0.634, 1.755, 2.877, 3.907 max_d=3.907 avg_d=1.755 std_dev=1.122
OP2	B	0, 0.639, 1.808, 2.976, 4.259 max_d=4.259 avg_d=1.808 std_dev=1.168
P	B	0, 0.673, 1.983, 3.293, 4.491 max_d=4.491 avg_d=1.983 std_dev=1.310
OP1	B	0, 0.731, 2.413, 4.094, 5.405 max_d=5.405 avg_d=2.413 std_dev=1.681

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.27	0.02	0.42	0.38	0.30
C2	0.04	0.00	0.12	0.16	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.03	0.43	0.02	0.60	0.59	0.55
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.05	0.10	0.13	0.12	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.19	0.07	0.29	0.46	0.26
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.11	0.10	0.14	0.19	0.15	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.21	0.11	0.29	0.47	0.24
C4	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.45	0.01	0.61	0.56	0.54
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.08	0.10	0.07	0.12	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.10	0.28	0.27	0.07
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.04	0.52	0.01	0.74	0.62	0.64
C5'	0.03	0.14	0.03	0.04	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.20	0.16	0.14	0.12	0.22	0.11	0.03	0.03	0.02	0.01	0.21	0.28	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.53	0.00	0.78	0.67	0.68
C8	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.06	0.54	0.01	0.71	0.55	0.58
N1	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.02	0.49	0.01	0.70	0.64	0.63
N2	0.05	0.00	0.13	0.19	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.25	0.04	0.40	0.02	0.55	0.58	0.52
N3	0.04	0.01	0.12	0.15	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.18	0.03	0.40	0.02	0.54	0.54	0.49
N7	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.06	0.56	0.01	0.82	0.62	0.67
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.43	0.01	0.56	0.50	0.48
O2'	0.03	0.13	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.09	0.04	0.12	0.16	0.12	0.03	0.02	0.00	0.08	0.04	0.06	0.09	0.29	0.38	0.15
O3'	0.02	0.20	0.03	0.01	0.10	0.02	0.10	0.03	0.13	0.11	0.17	0.25	0.18	0.11	0.04	0.08	0.00	0.02	0.25	0.13	0.42	0.50	0.28
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.03	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.25	0.04	0.44	0.30	0.24
O5'	0.27	0.43	0.19	0.21	0.45	0.02	0.52	0.01	0.53	0.54	0.49	0.40	0.40	0.56	0.43	0.06	0.25	0.25	0.00	0.55	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.07	0.11	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.13	0.04	0.55	0.00	0.87	0.70	0.73
OP1	0.42	0.60	0.29	0.29	0.61	0.28	0.74	0.28	0.78	0.71	0.70	0.55	0.54	0.82	0.56	0.29	0.42	0.44	0.02	0.87	0.00	0.04	0.01
OP2	0.38	0.59	0.46	0.47	0.56	0.27	0.62	0.27	0.67	0.55	0.64	0.58	0.54	0.62	0.50	0.38	0.50	0.30	0.02	0.70	0.04	0.00	0.01
P	0.30	0.55	0.26	0.24	0.54	0.07	0.64	0.02	0.68	0.58	0.63	0.52	0.49	0.67	0.48	0.15	0.28	0.24	0.00	0.73	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.58	0.26	0.64	0.71	0.26	0.77	0.22	0.78	0.25	0.39	0.31	0.40	0.22	0.27	0.41	0.74	0.80	0.70	0.67	0.29	0.76	0.67	0.68
C2	0.49	0.19	0.57	0.57	0.22	0.58	0.18	0.56	0.27	0.26	0.30	0.24	0.23	0.18	0.33	0.67	0.65	0.55	0.47	0.38	0.56	0.52	0.50
C2'	0.60	0.26	0.64	0.70	0.30	0.77	0.26	0.78	0.27	0.42	0.32	0.36	0.26	0.31	0.43	0.73	0.79	0.71	0.67	0.31	0.76	0.66	0.67
C3'	0.65	0.22	0.67	0.74	0.33	0.82	0.29	0.83	0.23	0.49	0.25	0.32	0.27	0.37	0.49	0.76	0.82	0.77	0.73	0.25	0.84	0.75	0.75
C4	0.53	0.23	0.60	0.63	0.24	0.65	0.20	0.64	0.26	0.32	0.32	0.34	0.23	0.22	0.37	0.70	0.70	0.61	0.54	0.33	0.62	0.57	0.55
C4'	0.61	0.20	0.65	0.73	0.27	0.82	0.23	0.85	0.18	0.46	0.23	0.35	0.19	0.34	0.45	0.72	0.82	0.75	0.75	0.20	0.86	0.77	0.77
C5	0.52	0.22	0.58	0.59	0.24	0.60	0.19	0.59	0.26	0.31	0.31	0.34	0.23	0.21	0.36	0.67	0.65	0.58	0.50	0.33	0.57	0.55	0.52
C5'	0.65	0.26	0.65	0.74	0.32	0.85	0.29	0.88	0.23	0.52	0.27	0.40	0.25	0.41	0.49	0.74	0.82	0.80	0.80	0.24	0.92	0.84	0.83
C6	0.48	0.18	0.55	0.54	0.23	0.53	0.18	0.51	0.27	0.27	0.30	0.23	0.25	0.19	0.33	0.63	0.59	0.51	0.45	0.36	0.53	0.51	0.48
C8	0.58	0.29	0.63	0.67	0.28	0.72	0.25	0.72	0.26	0.40	0.33	0.44	0.25	0.29	0.42	0.72	0.74	0.69	0.62	0.29	0.69	0.64	0.64
N1	0.47	0.18	0.55	0.54	0.23	0.53	0.18	0.51	0.28	0.25	0.30	0.21	0.25	0.18	0.32	0.64	0.60	0.51	0.44	0.39	0.53	0.51	0.48
N2	0.48	0.19	0.56	0.56	0.22	0.57	0.18	0.54	0.28	0.25	0.30	0.22	0.24	0.18	0.32	0.67	0.64	0.53	0.46	0.40	0.56	0.51	0.49
N3	0.52	0.21	0.60	0.62	0.23	0.64	0.18	0.62	0.27	0.30	0.31	0.29	0.22	0.20	0.35	0.70	0.69	0.59	0.52	0.35	0.60	0.55	0.53
N7	0.55	0.27	0.60	0.62	0.27	0.64	0.23	0.63	0.27	0.36	0.33	0.43	0.24	0.26	0.40	0.68	0.67	0.63	0.55	0.31	0.61	0.58	0.56
N9	0.57	0.26	0.63	0.67	0.26	0.72	0.22	0.72	0.26	0.37	0.32	0.39	0.23	0.26	0.40	0.72	0.75	0.67	0.61	0.30	0.69	0.62	0.62
O2'	0.59	0.27	0.65	0.72	0.27	0.79	0.23	0.80	0.27	0.40	0.33	0.38	0.24	0.28	0.42	0.75	0.82	0.71	0.68	0.33	0.79	0.67	0.69
O3'	0.67	0.21	0.70	0.77	0.35	0.85	0.31	0.86	0.23	0.52	0.23	0.28	0.28	0.40	0.52	0.79	0.85	0.78	0.76	0.25	0.88	0.78	0.78
O4'	0.58	0.25	0.64	0.73	0.25	0.79	0.21	0.82	0.21	0.42	0.28	0.41	0.20	0.30	0.41	0.72	0.82	0.72	0.72	0.24	0.82	0.72	0.73
O5'	0.79	0.64	0.70	0.74	0.61	0.87	0.57	0.87	0.56	0.66	0.61	0.75	0.63	0.59	0.68	0.83	0.81	0.87	0.79	0.55	0.86	0.78	0.81
O6	0.46	0.16	0.51	0.50	0.24	0.48	0.19	0.46	0.27	0.26	0.29	0.18	0.28	0.20	0.33	0.58	0.54	0.47	0.43	0.37	0.51	0.51	0.48
OP1	1.22	1.06	1.11	1.12	1.02	1.34	0.96	1.33	0.95	1.04	1.01	1.13	1.06	0.96	1.08	1.28	1.13	1.33	1.26	0.92	1.35	1.10	1.26
OP2	1.07	0.73	1.09	1.18	0.77	1.28	0.71	1.29	0.66	0.90	0.70	0.82	0.75	0.78	0.91	1.25	1.33	1.18	1.21	0.64	1.40	1.10	1.22
P	1.05	0.79	0.99	1.03	0.78	1.19	0.72	1.18	0.68	0.86	0.74	0.90	0.80	0.75	0.89	1.18	1.11	1.15	1.10	0.65	1.21	0.99	1.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.10	0.03	0.12	0.29	0.11
C2	0.05	0.00	0.17	0.15	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.20	0.11	0.16	0.01	0.19	0.46	0.24
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.03	0.09	0.09	0.14	0.20	0.17	0.06	0.02	0.00	0.05	0.01	0.09	0.08	0.15	0.32	0.14
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.11	0.01	0.13	0.04	0.14	0.16	0.15	0.17	0.13	0.16	0.08	0.03	0.01	0.01	0.17	0.15	0.24	0.33	0.21
C4	0.03	0.01	0.09	0.11	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.05	0.16	0.01	0.19	0.44	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.12	0.04	0.07	0.05	0.12	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.08	0.13	0.18	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.04	0.19	0.01	0.28	0.50	0.31
C5'	0.02	0.07	0.03	0.04	0.09	0.00	0.14	0.00	0.14	0.17	0.10	0.08	0.06	0.19	0.09	0.06	0.05	0.02	0.01	0.16	0.17	0.14	0.01
C6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.19	0.05	0.20	0.01	0.31	0.52	0.33
C8	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.12	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.20	0.10	0.19	0.01	0.25	0.45	0.28
N1	0.04	0.01	0.14	0.15	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.08	0.18	0.01	0.26	0.50	0.29
N2	0.07	0.00	0.20	0.17	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.24	0.14	0.15	0.01	0.17	0.45	0.22
N3	0.05	0.01	0.17	0.13	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.18	0.11	0.15	0.02	0.15	0.42	0.20
N7	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.22	0.08	0.22	0.01	0.33	0.52	0.34
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.15	0.01	0.16	0.39	0.20
O2'	0.01	0.19	0.00	0.03	0.10	0.06	0.07	0.06	0.11	0.06	0.16	0.23	0.18	0.05	0.02	0.00	0.13	0.06	0.10	0.09	0.16	0.30	0.13
O3'	0.04	0.20	0.05	0.01	0.13	0.03	0.17	0.05	0.19	0.20	0.19	0.24	0.18	0.22	0.08	0.13	0.00	0.03	0.30	0.21	0.38	0.43	0.32
O4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.10	0.08	0.14	0.11	0.08	0.03	0.06	0.03	0.00	0.15	0.05	0.23	0.21	0.15
O5'	0.10	0.16	0.09	0.17	0.16	0.02	0.19	0.01	0.20	0.19	0.18	0.15	0.15	0.22	0.15	0.10	0.30	0.15	0.00	0.21	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.21	0.05	0.21	0.00	0.37	0.54	0.36
OP1	0.12	0.19	0.15	0.24	0.19	0.13	0.28	0.17	0.31	0.25	0.26	0.17	0.15	0.33	0.16	0.16	0.38	0.23	0.02	0.37	0.00	0.03	0.01
OP2	0.29	0.46	0.32	0.33	0.44	0.18	0.50	0.14	0.52	0.45	0.50	0.45	0.42	0.52	0.39	0.30	0.43	0.21	0.02	0.54	0.03	0.00	0.00
P	0.11	0.24	0.14	0.21	0.23	0.05	0.31	0.01	0.33	0.28	0.29	0.22	0.20	0.34	0.20	0.13	0.32	0.15	0.01	0.36	0.01	0.00	0.00