Doublet Group distance statistics: 49537

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 1, 3, 2, 3, 3, 5, 3, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.011, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.011 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.009, 0.012, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.012 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.009, 0.013, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.013, 0.018, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.014, 0.019, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.019 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.011, 0.017, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.016, 0.022, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.025, 0.037, 0.049, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.029, 0.045, 0.061, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.016
O2'	A	0, 0.099, 0.215, 0.332, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.215 std_dev=0.117
C2'	A	0, 0.075, 0.222, 0.369, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.222 std_dev=0.147
O4'	A	0, 0.090, 0.247, 0.404, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.247 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.134, 0.373, 0.613, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.373 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.139, 0.384, 0.629, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.384 std_dev=0.245
C4	B	0, 0.228, 0.479, 0.731, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.479 std_dev=0.252
N3	B	0, 0.186, 0.438, 0.691, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.438 std_dev=0.253
C6	B	0, 0.193, 0.478, 0.762, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.478 std_dev=0.285
C5	B	0, 0.271, 0.567, 0.863, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.567 std_dev=0.296
N1	B	0, 0.178, 0.511, 0.845, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.511 std_dev=0.333
C2	B	0, 0.238, 0.574, 0.910, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.574 std_dev=0.336
O3'	A	0, 0.207, 0.553, 0.899, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.553 std_dev=0.346
N4	B	0, 0.316, 0.677, 1.038, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.677 std_dev=0.361
P	B	0, 0.268, 0.645, 1.023, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.645 std_dev=0.378
O5'	B	0, 0.247, 0.635, 1.023, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.635 std_dev=0.388
OP2	B	0, 0.308, 0.699, 1.091, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.699 std_dev=0.391
C5'	A	0, 0.209, 0.623, 1.037, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.623 std_dev=0.414
OP1	B	0, 0.316, 0.735, 1.155, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.735 std_dev=0.419
O4'	B	0, 0.247, 0.700, 1.152, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.700 std_dev=0.452
C1'	B	0, 0.256, 0.730, 1.204, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.730 std_dev=0.474
C5'	B	0, 0.252, 0.736, 1.220, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.736 std_dev=0.484
O2	B	0, 0.362, 0.874, 1.386, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.874 std_dev=0.512
O5'	A	0, 0.247, 0.775, 1.302, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.775 std_dev=0.527
C4'	B	0, 0.289, 0.836, 1.384, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.836 std_dev=0.548
C3'	B	0, 0.336, 0.956, 1.576, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.956 std_dev=0.620
C2'	B	0, 0.320, 0.940, 1.560, 2.035 max_d=2.035 avg_d=0.940 std_dev=0.620
P	A	0, 0.411, 1.108, 1.806, 2.123 max_d=2.123 avg_d=1.108 std_dev=0.698
OP2	A	0, 0.517, 1.234, 1.950, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.234 std_dev=0.716
O2'	B	0, 0.396, 1.154, 1.912, 2.430 max_d=2.430 avg_d=1.154 std_dev=0.758
O3'	B	0, 0.458, 1.225, 1.992, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.225 std_dev=0.767
OP1	A	0, 0.460, 1.244, 2.027, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.244 std_dev=0.783

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.11	0.07
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.13	0.13	0.18	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.11	0.00	0.01	0.00	0.10	0.11	0.10	0.09
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.12	0.02	0.00	0.01	0.15	0.16	0.08	0.13
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.19	0.20	0.24	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.20	0.21	0.24	0.22
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.15	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.17	0.17	0.20	0.18
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.13	0.12	0.16	0.13
N3	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.17	0.16	0.21	0.18
N4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.21	0.22	0.27	0.23
O2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.14	0.03	0.11	0.10	0.16	0.12
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.04	0.02	0.03	0.07	0.09	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.05	0.14	0.04	0.00	0.01	0.14	0.18	0.06	0.13
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.13	0.05
O5'	0.06	0.13	0.10	0.15	0.19	0.01	0.20	0.00	0.17	0.13	0.17	0.21	0.11	0.03	0.14	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.13	0.11	0.16	0.20	0.06	0.21	0.07	0.17	0.12	0.16	0.22	0.10	0.07	0.18	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.18	0.10	0.08	0.24	0.10	0.24	0.15	0.20	0.16	0.21	0.27	0.16	0.09	0.06	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.09	0.13	0.21	0.01	0.22	0.01	0.18	0.13	0.18	0.23	0.12	0.04	0.13	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.17	0.12	0.12	0.20	0.13	0.17	0.13	0.15	0.14	0.21	0.24	0.18	0.14	0.13	0.15	0.16	0.18	0.25	0.18
C2	0.17	0.17	0.14	0.14	0.22	0.16	0.21	0.17	0.19	0.17	0.20	0.26	0.15	0.16	0.14	0.18	0.19	0.22	0.27	0.20
C2'	0.14	0.16	0.14	0.14	0.18	0.13	0.16	0.15	0.15	0.14	0.20	0.21	0.19	0.16	0.16	0.15	0.18	0.22	0.29	0.21
C3'	0.13	0.16	0.13	0.14	0.16	0.12	0.14	0.13	0.14	0.12	0.20	0.20	0.21	0.15	0.17	0.13	0.17	0.20	0.26	0.20
C4	0.18	0.17	0.15	0.15	0.22	0.17	0.21	0.18	0.19	0.18	0.20	0.26	0.16	0.17	0.14	0.19	0.20	0.22	0.27	0.21
C4'	0.10	0.17	0.11	0.12	0.18	0.10	0.13	0.10	0.12	0.12	0.22	0.22	0.22	0.12	0.16	0.12	0.12	0.14	0.21	0.15
C5	0.15	0.16	0.13	0.13	0.20	0.14	0.17	0.15	0.15	0.15	0.21	0.24	0.16	0.16	0.13	0.17	0.17	0.19	0.25	0.18
C5'	0.10	0.20	0.13	0.14	0.19	0.10	0.14	0.10	0.11	0.12	0.24	0.22	0.25	0.12	0.18	0.10	0.11	0.11	0.17	0.12
C6	0.14	0.17	0.12	0.12	0.20	0.13	0.16	0.14	0.14	0.14	0.21	0.23	0.17	0.15	0.13	0.16	0.16	0.18	0.25	0.17
N1	0.15	0.17	0.12	0.12	0.21	0.14	0.18	0.15	0.16	0.15	0.21	0.24	0.16	0.15	0.13	0.16	0.17	0.19	0.26	0.18
N3	0.18	0.17	0.16	0.16	0.23	0.18	0.23	0.19	0.20	0.18	0.20	0.27	0.16	0.17	0.15	0.19	0.21	0.23	0.28	0.22
N4	0.19	0.18	0.18	0.17	0.24	0.19	0.23	0.20	0.21	0.19	0.19	0.28	0.18	0.19	0.17	0.20	0.22	0.24	0.28	0.22
O2	0.17	0.17	0.15	0.15	0.23	0.16	0.22	0.18	0.20	0.17	0.20	0.27	0.15	0.16	0.14	0.18	0.20	0.23	0.28	0.21
O2'	0.14	0.17	0.13	0.14	0.19	0.13	0.17	0.14	0.16	0.14	0.20	0.23	0.19	0.15	0.16	0.15	0.18	0.22	0.30	0.21
O3'	0.13	0.16	0.13	0.15	0.16	0.13	0.14	0.14	0.15	0.13	0.20	0.19	0.22	0.15	0.18	0.14	0.18	0.22	0.28	0.21
O4'	0.12	0.18	0.11	0.12	0.20	0.12	0.16	0.12	0.14	0.14	0.22	0.24	0.19	0.13	0.14	0.14	0.14	0.15	0.22	0.15
O5'	0.28	0.30	0.28	0.28	0.31	0.27	0.31	0.28	0.30	0.29	0.31	0.32	0.30	0.27	0.29	0.28	0.32	0.34	0.40	0.33
OP1	0.34	0.31	0.38	0.39	0.31	0.36	0.33	0.36	0.35	0.33	0.31	0.30	0.31	0.38	0.41	0.35	0.38	0.41	0.44	0.39
OP2	0.33	0.31	0.34	0.34	0.32	0.32	0.34	0.32	0.35	0.33	0.31	0.31	0.30	0.32	0.34	0.32	0.36	0.38	0.42	0.37
P	0.32	0.30	0.34	0.34	0.31	0.32	0.32	0.32	0.33	0.31	0.31	0.30	0.30	0.33	0.35	0.32	0.35	0.37	0.41	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.11	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.04	0.12	0.14	0.24	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.11	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.08	0.05
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.05	0.05	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.14	0.21	0.31	0.22
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.14	0.21	0.29	0.21
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.06	0.08	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.04	0.12	0.16	0.22	0.17
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.11	0.19	0.14
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.03	0.14	0.18	0.29	0.21
N4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.15	0.24	0.34	0.24
O2	0.01	0.00	0.11	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.07	0.11	0.12	0.22	0.16
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.05	0.03	0.11	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.06	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.03	0.07	0.07	0.10	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.08	0.05
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.07	0.06
O5'	0.06	0.12	0.04	0.03	0.14	0.01	0.14	0.00	0.12	0.10	0.14	0.15	0.11	0.02	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.14	0.08	0.10	0.21	0.06	0.21	0.05	0.16	0.11	0.18	0.24	0.12	0.08	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.24	0.08	0.06	0.31	0.02	0.29	0.01	0.22	0.19	0.29	0.34	0.22	0.06	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.17	0.05	0.04	0.22	0.01	0.21	0.01	0.17	0.14	0.21	0.24	0.16	0.03	0.05	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00