Doublet Group distance statistics: 49541

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 6, 13, 11, 2, 3, 2, 1, 2, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.001, 0.004, 0.008, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.005
O2	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N9	B	0, 0.262, 0.405, 0.547, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.405 std_dev=0.142
C4	B	0, 0.222, 0.369, 0.516, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.369 std_dev=0.147
C1'	B	0, 0.256, 0.439, 0.622, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.439 std_dev=0.183
N3	B	0, 0.213, 0.399, 0.585, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.399 std_dev=0.186
C2'	A	0, -0.022, 0.174, 0.370, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.174 std_dev=0.196
O4'	A	0, -0.026, 0.173, 0.371, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.173 std_dev=0.198
C3'	B	0, 0.177, 0.424, 0.671, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.424 std_dev=0.247
C3'	A	0, -0.092, 0.180, 0.452, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.180 std_dev=0.272
O4'	B	0, 0.185, 0.476, 0.766, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.476 std_dev=0.290
C4'	A	0, -0.061, 0.232, 0.525, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.232 std_dev=0.293
C5	B	0, 0.182, 0.491, 0.799, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.491 std_dev=0.308
C8	B	0, 0.229, 0.545, 0.861, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.545 std_dev=0.316
C2	B	0, 0.139, 0.470, 0.802, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.470 std_dev=0.331
O2'	A	0, -0.052, 0.301, 0.654, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.301 std_dev=0.353
C2'	B	0, 0.161, 0.537, 0.914, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.537 std_dev=0.377
O3'	A	0, -0.248, 0.166, 0.580, 3.023 max_d=3.023 avg_d=0.166 std_dev=0.414
N1	B	0, 0.107, 0.522, 0.936, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.522 std_dev=0.414
O3'	B	0, 0.121, 0.536, 0.951, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.536 std_dev=0.415
N7	B	0, 0.176, 0.594, 1.012, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.594 std_dev=0.418
C6	B	0, 0.116, 0.557, 0.999, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.557 std_dev=0.441
C5'	A	0, -0.046, 0.409, 0.864, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.409 std_dev=0.455
C4'	B	0, 0.029, 0.525, 1.021, 2.373 max_d=2.373 avg_d=0.525 std_dev=0.496
N2	B	0, 0.055, 0.571, 1.087, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.571 std_dev=0.516
O5'	A	0, -0.062, 0.461, 0.984, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.461 std_dev=0.523
O6	B	0, 0.052, 0.686, 1.320, 2.468 max_d=2.468 avg_d=0.686 std_dev=0.634
O2'	B	0, 0.073, 0.717, 1.362, 2.629 max_d=2.629 avg_d=0.717 std_dev=0.644
C5'	B	0, -0.093, 0.718, 1.529, 3.483 max_d=3.483 avg_d=0.718 std_dev=0.811
P	B	0, -0.574, 0.396, 1.366, 7.097 max_d=7.097 avg_d=0.396 std_dev=0.970
O5'	B	0, -0.307, 0.741, 1.790, 5.802 max_d=5.802 avg_d=0.741 std_dev=1.049
OP2	B	0, -0.442, 0.613, 1.668, 6.619 max_d=6.619 avg_d=0.613 std_dev=1.055
OP1	B	0, -0.578, 0.532, 1.641, 8.180 max_d=8.180 avg_d=0.532 std_dev=1.110
P	A	0, -0.467, 0.975, 2.418, 4.436 max_d=4.436 avg_d=0.975 std_dev=1.443
OP2	A	0, -0.503, 1.143, 2.790, 4.971 max_d=4.971 avg_d=1.143 std_dev=1.647
OP1	A	0, -0.633, 1.207, 3.047, 5.534 max_d=5.534 avg_d=1.207 std_dev=1.840

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.00	0.10	0.13	0.12	0.18
C2	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.03	0.02	0.13	0.10	0.19	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.06	0.08	0.01	0.06	0.02	0.16	0.00	0.01	0.00	0.21	0.44	0.45	0.30
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.01	0.10	0.08	0.14	0.15	0.12	0.01	0.01	0.00	0.11	0.59	0.47	0.31
C4	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.06	0.02	0.12	0.42	0.59	0.50
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.05	0.09	0.01	0.00	0.01	0.25	0.14	0.04
C5	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.03	0.18	0.63	0.88	0.72
C5'	0.02	0.08	0.06	0.01	0.12	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.11	0.13	0.09	0.03	0.06	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.03	0.04	0.20	0.51	0.74	0.66
N1	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01	0.12	0.15	0.29	0.33
N3	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.05	0.01	0.13	0.17	0.29	0.29
N4	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.08	0.02	0.12	0.50	0.67	0.53
O2	0.02	0.00	0.16	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.05	0.04	0.17	0.30	0.33	0.19
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.12	0.09	0.11	0.03	0.10	0.07	0.13	0.13	0.21	0.00	0.03	0.07	0.12	0.54	0.54	0.31
O3'	0.10	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.03	0.03	0.05	0.08	0.05	0.03	0.00	0.07	0.04	0.63	0.46	0.27
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.07	0.00	0.06	0.09	0.17	0.27
O5'	0.10	0.13	0.21	0.11	0.12	0.01	0.18	0.00	0.20	0.12	0.13	0.12	0.17	0.12	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.10	0.44	0.59	0.42	0.25	0.63	0.10	0.51	0.15	0.17	0.50	0.30	0.54	0.63	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.19	0.45	0.47	0.59	0.14	0.88	0.07	0.74	0.29	0.29	0.67	0.33	0.54	0.46	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.21	0.30	0.31	0.50	0.04	0.72	0.01	0.66	0.33	0.29	0.53	0.19	0.31	0.27	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.20	0.13	0.12	0.11	0.22	0.18	0.24	0.16	0.26	0.13	0.30	0.20	0.29	0.15	0.24	0.46	0.16	0.39	0.22	0.42	0.57	0.53
C2	0.12	0.13	0.14	0.11	0.11	0.22	0.14	0.29	0.15	0.16	0.14	0.16	0.11	0.17	0.13	0.19	0.38	0.18	0.18	0.18	0.21	0.46	0.33
C2'	0.17	0.22	0.19	0.21	0.14	0.30	0.15	0.30	0.16	0.19	0.16	0.29	0.23	0.22	0.14	0.23	0.50	0.19	0.36	0.21	0.51	0.71	0.60
C3'	0.16	0.19	0.16	0.32	0.12	0.41	0.21	0.50	0.19	0.34	0.13	0.30	0.18	0.35	0.18	0.20	0.54	0.30	0.75	0.26	0.88	0.99	0.96
C4	0.15	0.16	0.19	0.11	0.13	0.15	0.17	0.21	0.20	0.16	0.21	0.18	0.12	0.17	0.14	0.29	0.37	0.15	0.30	0.23	0.26	0.43	0.34
C4'	0.35	0.16	0.30	0.31	0.22	0.42	0.31	0.60	0.23	0.51	0.12	0.30	0.13	0.47	0.37	0.51	0.44	0.45	0.94	0.27	0.83	0.85	0.90
C5	0.18	0.25	0.23	0.11	0.13	0.16	0.15	0.22	0.21	0.15	0.27	0.36	0.15	0.15	0.14	0.37	0.41	0.18	0.44	0.22	0.38	0.47	0.44
C5'	0.48	0.16	0.48	0.39	0.26	0.54	0.31	0.72	0.20	0.53	0.13	0.30	0.15	0.46	0.43	0.78	0.39	0.55	1.06	0.23	0.95	0.89	0.95
C6	0.17	0.28	0.20	0.10	0.11	0.17	0.11	0.23	0.14	0.18	0.23	0.40	0.18	0.15	0.14	0.36	0.44	0.18	0.48	0.13	0.43	0.51	0.49
N1	0.13	0.20	0.14	0.09	0.10	0.18	0.13	0.23	0.11	0.19	0.14	0.28	0.16	0.19	0.13	0.26	0.43	0.16	0.35	0.14	0.35	0.51	0.45
N3	0.13	0.12	0.15	0.11	0.12	0.18	0.15	0.27	0.15	0.17	0.14	0.15	0.11	0.17	0.14	0.20	0.36	0.17	0.18	0.16	0.18	0.42	0.29
N4	0.17	0.15	0.21	0.12	0.15	0.15	0.20	0.21	0.25	0.17	0.23	0.17	0.13	0.21	0.15	0.30	0.35	0.16	0.29	0.32	0.23	0.41	0.31
O2	0.16	0.15	0.18	0.13	0.13	0.29	0.20	0.38	0.27	0.17	0.23	0.16	0.12	0.21	0.15	0.18	0.36	0.25	0.10	0.34	0.12	0.44	0.27
O2'	0.40	0.27	0.47	0.41	0.26	0.53	0.19	0.52	0.22	0.21	0.21	0.30	0.32	0.20	0.29	0.42	0.61	0.44	0.21	0.28	0.33	0.63	0.44
O3'	0.34	0.23	0.44	0.58	0.26	0.68	0.34	0.72	0.31	0.46	0.20	0.30	0.28	0.50	0.31	0.22	0.73	0.50	0.86	0.40	0.95	1.16	1.14
O4'	0.34	0.16	0.30	0.20	0.23	0.28	0.31	0.41	0.22	0.48	0.12	0.29	0.13	0.44	0.37	0.49	0.38	0.35	0.70	0.26	0.58	0.64	0.66
O5'	0.44	0.15	0.45	0.24	0.26	0.35	0.27	0.50	0.18	0.44	0.12	0.25	0.17	0.38	0.38	0.80	0.23	0.42	0.86	0.20	0.88	0.84	0.84
OP1	0.52	0.39	0.52	0.31	0.37	0.43	0.30	0.54	0.27	0.34	0.32	0.44	0.43	0.28	0.41	1.05	0.36	0.44	0.76	0.23	1.28	1.51	1.20
OP2	0.48	0.52	0.49	0.14	0.41	0.18	0.31	0.34	0.32	0.28	0.42	0.62	0.53	0.24	0.39	0.98	0.21	0.28	0.51	0.26	0.94	1.33	0.94
P	0.71	0.53	0.71	0.39	0.57	0.44	0.50	0.48	0.45	0.56	0.46	0.53	0.59	0.50	0.62	1.19	0.18	0.56	0.74	0.40	0.98	1.13	0.92

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.23	0.00	0.15	0.01	0.24	0.27	0.08
C2	0.01	0.00	0.17	0.09	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.33	0.15	0.17	0.00	0.24	0.22	0.14
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.03	0.18	0.06	0.10	0.12	0.20	0.16	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.04	0.41	0.18	0.16
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.18	0.26	0.13	0.09	0.08	0.26	0.15	0.01	0.00	0.01	0.16	0.21	0.52	0.28	0.19
C4	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.17	0.08	0.22	0.01	0.15	0.33	0.14
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.11	0.07	0.12	0.09	0.10	0.04	0.23	0.01	0.00	0.01	0.07	0.44	0.09	0.23
C5	0.01	0.00	0.03	0.19	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.06	0.04	0.29	0.01	0.25	0.49	0.29
C5'	0.09	0.19	0.18	0.01	0.16	0.00	0.17	0.00	0.19	0.15	0.19	0.20	0.18	0.17	0.13	0.06	0.19	0.01	0.01	0.19	0.11	0.24	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.18	0.00	0.06	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.10	0.06	0.29	0.00	0.25	0.46	0.28
C8	0.00	0.01	0.10	0.26	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.14	0.08	0.34	0.01	0.37	0.66	0.40
N1	0.01	0.00	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.23	0.11	0.23	0.00	0.15	0.31	0.16
N2	0.02	0.00	0.20	0.09	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.43	0.18	0.13	0.01	0.37	0.20	0.21
N3	0.01	0.00	0.16	0.08	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.34	0.15	0.15	0.01	0.28	0.20	0.13
N7	0.00	0.00	0.06	0.26	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.12	0.05	0.36	0.01	0.44	0.68	0.45
N9	0.00	0.01	0.01	0.15	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.01	0.24	0.01	0.16	0.41	0.18
O2'	0.03	0.12	0.00	0.01	0.09	0.23	0.18	0.06	0.16	0.26	0.10	0.19	0.12	0.27	0.13	0.00	0.03	0.16	0.19	0.20	0.21	0.32	0.07
O3'	0.23	0.33	0.01	0.00	0.17	0.01	0.06	0.19	0.10	0.14	0.23	0.43	0.34	0.12	0.08	0.03	0.00	0.19	0.10	0.06	0.72	0.27	0.29
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.06	0.08	0.11	0.18	0.15	0.05	0.01	0.16	0.19	0.00	0.23	0.04	0.20	0.24	0.11
O5'	0.15	0.17	0.12	0.16	0.22	0.01	0.29	0.01	0.29	0.34	0.23	0.13	0.15	0.36	0.24	0.19	0.10	0.23	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.04	0.21	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.06	0.04	0.33	0.00	0.36	0.54	0.37
OP1	0.24	0.24	0.41	0.52	0.15	0.44	0.25	0.11	0.25	0.37	0.15	0.37	0.28	0.44	0.16	0.21	0.72	0.20	0.01	0.36	0.00	0.00	0.00
OP2	0.27	0.22	0.18	0.28	0.33	0.09	0.49	0.24	0.46	0.66	0.31	0.20	0.20	0.68	0.41	0.32	0.27	0.24	0.01	0.54	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.16	0.19	0.14	0.23	0.29	0.01	0.28	0.40	0.16	0.21	0.13	0.45	0.18	0.07	0.29	0.11	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00