Doublet Group distance statistics: 49543

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 14, 12, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.021, 0.047, 0.073, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.047 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.030, 0.068, 0.106, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.068 std_dev=0.038
C4	B	0, 0.143, 0.254, 0.365, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.254 std_dev=0.111
N9	B	0, 0.185, 0.297, 0.410, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.297 std_dev=0.112
C1'	B	0, 0.201, 0.340, 0.479, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.340 std_dev=0.139
N3	B	0, 0.133, 0.275, 0.418, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.275 std_dev=0.142
C5	B	0, 0.128, 0.282, 0.436, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.282 std_dev=0.154
C8	B	0, 0.186, 0.348, 0.510, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.348 std_dev=0.162
C2'	B	0, 0.219, 0.384, 0.549, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.384 std_dev=0.165
N7	B	0, 0.163, 0.348, 0.532, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.348 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.082, 0.291, 0.500, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.291 std_dev=0.209
C6	B	0, 0.113, 0.324, 0.534, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.324 std_dev=0.211
N1	B	0, 0.088, 0.315, 0.543, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.315 std_dev=0.227
O6	B	0, 0.136, 0.412, 0.688, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.412 std_dev=0.276
N2	B	0, 0.086, 0.370, 0.654, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.370 std_dev=0.284
O4'	B	0, 0.117, 0.435, 0.752, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.435 std_dev=0.317
O2'	B	0, 0.079, 0.416, 0.753, 2.178 max_d=2.178 avg_d=0.416 std_dev=0.337
C3'	B	0, 0.108, 0.469, 0.830, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.469 std_dev=0.361
O3'	A	0, -0.025, 0.368, 0.761, 2.518 max_d=2.518 avg_d=0.368 std_dev=0.393
O4'	A	0, -0.214, 0.208, 0.630, 2.554 max_d=2.554 avg_d=0.208 std_dev=0.422
C4'	A	0, -0.206, 0.237, 0.681, 2.777 max_d=2.777 avg_d=0.237 std_dev=0.444
C2'	A	0, -0.218, 0.227, 0.672, 2.699 max_d=2.699 avg_d=0.227 std_dev=0.445
C3'	A	0, -0.167, 0.280, 0.726, 2.840 max_d=2.840 avg_d=0.280 std_dev=0.447
C4'	B	0, 0.054, 0.505, 0.957, 2.863 max_d=2.863 avg_d=0.505 std_dev=0.451
O3'	B	0, 0.008, 0.488, 0.967, 3.107 max_d=3.107 avg_d=0.488 std_dev=0.480
C5'	B	0, -0.033, 0.588, 1.209, 3.908 max_d=3.908 avg_d=0.588 std_dev=0.621
O2'	A	0, -0.324, 0.395, 1.113, 4.324 max_d=4.324 avg_d=0.395 std_dev=0.718
C5'	A	0, -0.496, 0.423, 1.341, 5.717 max_d=5.717 avg_d=0.423 std_dev=0.918
O5'	B	0, -0.249, 0.673, 1.595, 5.874 max_d=5.874 avg_d=0.673 std_dev=0.922
O5'	A	0, -0.738, 0.451, 1.641, 7.378 max_d=7.378 avg_d=0.451 std_dev=1.190
OP2	B	0, -0.391, 0.858, 2.107, 8.021 max_d=8.021 avg_d=0.858 std_dev=1.249
P	B	0, -0.500, 0.807, 2.114, 8.314 max_d=8.314 avg_d=0.807 std_dev=1.307
OP1	B	0, -0.512, 0.995, 2.502, 9.519 max_d=9.519 avg_d=0.995 std_dev=1.507
P	A	0, -1.071, 0.622, 2.314, 10.523 max_d=10.523 avg_d=0.622 std_dev=1.693
OP1	A	0, -1.071, 0.718, 2.508, 11.140 max_d=11.140 avg_d=0.718 std_dev=1.790
OP2	A	0, -1.166, 0.717, 2.600, 11.725 max_d=11.725 avg_d=0.717 std_dev=1.883

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.10	0.00	0.06	0.06	0.11	0.06
C2	0.03	0.00	0.13	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.13	0.07	0.22	0.26	0.19	0.24
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.04	0.01	0.11	0.06	0.14	0.02	0.10	0.04	0.24	0.00	0.02	0.02	0.13	0.17	0.17	0.14
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.12	0.02	0.14	0.03	0.08	0.05	0.22	0.01	0.00	0.03	0.05	0.20	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.03	0.10	0.16	0.26	0.14
C4'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.12	0.08	0.02	0.01	0.02	0.08	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.11	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.06	0.05	0.17	0.15	0.44	0.22
C5'	0.02	0.14	0.06	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.10	0.04	0.13	0.09	0.23	0.04	0.08	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.14	0.14	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.06	0.07	0.19	0.15	0.41	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.07	0.09	0.16	0.08
N3	0.03	0.01	0.10	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.06	0.20	0.27	0.19	0.24
N4	0.03	0.02	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.08	0.04	0.11	0.19	0.29	0.16
O2	0.05	0.01	0.24	0.22	0.02	0.12	0.02	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.18	0.13	0.37	0.40	0.40	0.42
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.11	0.08	0.16	0.04	0.16	0.07	0.10	0.12	0.18	0.00	0.04	0.04	0.11	0.21	0.19	0.14
O3'	0.10	0.13	0.02	0.00	0.08	0.02	0.06	0.08	0.06	0.08	0.11	0.08	0.18	0.04	0.00	0.06	0.10	0.32	0.18	0.18
O4'	0.00	0.07	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.06	0.04	0.13	0.04	0.06	0.00	0.11	0.08	0.17	0.11
O5'	0.06	0.22	0.13	0.05	0.10	0.02	0.17	0.01	0.19	0.07	0.20	0.11	0.37	0.11	0.10	0.11	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.26	0.17	0.20	0.16	0.08	0.15	0.05	0.15	0.09	0.27	0.19	0.40	0.21	0.32	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.19	0.17	0.11	0.26	0.08	0.44	0.11	0.41	0.16	0.19	0.29	0.40	0.19	0.18	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.24	0.14	0.09	0.14	0.02	0.22	0.02	0.23	0.08	0.24	0.16	0.42	0.14	0.18	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.21	0.10	0.14	0.14	0.14	0.16	0.11	0.22	0.08	0.23	0.23	0.18	0.10	0.11	0.11	0.16	0.17	0.39	0.26	0.95	0.28	0.51
C2	0.11	0.22	0.10	0.12	0.13	0.09	0.12	0.09	0.19	0.12	0.23	0.25	0.18	0.10	0.10	0.11	0.17	0.09	0.34	0.21	0.79	0.22	0.41
C2'	0.20	0.17	0.20	0.21	0.16	0.22	0.14	0.21	0.13	0.19	0.14	0.18	0.18	0.18	0.18	0.18	0.25	0.23	0.36	0.15	0.89	0.32	0.47
C3'	0.24	0.21	0.31	0.25	0.20	0.28	0.16	0.28	0.16	0.18	0.18	0.22	0.23	0.14	0.22	0.29	0.30	0.28	0.26	0.17	0.81	0.30	0.39
C4	0.10	0.18	0.11	0.10	0.08	0.17	0.07	0.21	0.10	0.14	0.15	0.23	0.15	0.12	0.09	0.14	0.23	0.15	0.19	0.12	0.46	0.15	0.17
C4'	0.24	0.33	0.38	0.25	0.32	0.22	0.36	0.24	0.38	0.32	0.36	0.32	0.31	0.37	0.29	0.35	0.29	0.22	0.16	0.42	0.75	0.20	0.31
C5	0.11	0.19	0.10	0.10	0.10	0.17	0.08	0.24	0.12	0.11	0.16	0.22	0.17	0.10	0.07	0.17	0.24	0.14	0.14	0.13	0.38	0.21	0.10
C5'	0.45	0.44	0.66	0.53	0.48	0.45	0.52	0.49	0.50	0.56	0.46	0.42	0.45	0.57	0.50	0.64	0.54	0.39	0.25	0.52	0.45	0.35	0.12
C6	0.13	0.20	0.10	0.11	0.14	0.12	0.12	0.15	0.16	0.08	0.19	0.22	0.19	0.10	0.10	0.14	0.20	0.12	0.17	0.18	0.54	0.18	0.18
N1	0.13	0.21	0.10	0.12	0.14	0.10	0.13	0.09	0.19	0.08	0.22	0.23	0.18	0.09	0.10	0.11	0.18	0.12	0.31	0.22	0.76	0.20	0.37
N3	0.10	0.21	0.11	0.10	0.11	0.12	0.10	0.14	0.14	0.14	0.20	0.25	0.17	0.13	0.10	0.11	0.20	0.11	0.28	0.15	0.64	0.16	0.31
N4	0.12	0.15	0.15	0.13	0.08	0.23	0.10	0.27	0.10	0.16	0.12	0.22	0.12	0.15	0.12	0.18	0.28	0.22	0.19	0.12	0.36	0.19	0.15
O2	0.12	0.24	0.11	0.14	0.14	0.10	0.14	0.10	0.22	0.13	0.26	0.27	0.19	0.12	0.11	0.13	0.16	0.10	0.42	0.25	0.92	0.31	0.53
O2'	0.40	0.28	0.35	0.46	0.35	0.41	0.36	0.41	0.31	0.47	0.27	0.26	0.31	0.46	0.40	0.34	0.43	0.39	0.73	0.31	1.24	0.60	0.85
O3'	0.25	0.16	0.22	0.28	0.17	0.32	0.14	0.32	0.14	0.19	0.14	0.17	0.18	0.15	0.21	0.20	0.31	0.32	0.52	0.16	1.14	0.51	0.70
O4'	0.21	0.37	0.33	0.22	0.35	0.18	0.42	0.19	0.45	0.33	0.42	0.36	0.33	0.42	0.29	0.29	0.26	0.18	0.17	0.50	0.74	0.15	0.30
O5'	0.64	0.44	0.88	0.80	0.55	0.73	0.52	0.81	0.44	0.68	0.41	0.41	0.50	0.60	0.63	0.85	0.81	0.62	0.55	0.41	0.15	0.66	0.36
OP1	0.70	0.42	1.02	0.99	0.55	0.87	0.53	1.01	0.43	0.71	0.39	0.37	0.49	0.62	0.66	0.97	0.97	0.68	0.86	0.41	0.34	1.03	0.71
OP2	1.12	0.68	1.46	1.41	0.83	1.28	0.69	1.37	0.54	0.95	0.56	0.66	0.81	0.74	0.98	1.44	1.40	1.08	1.15	0.41	0.51	1.15	0.89
P	0.83	0.50	1.14	1.08	0.64	0.97	0.59	1.07	0.47	0.81	0.44	0.46	0.59	0.68	0.77	1.12	1.08	0.80	0.86	0.41	0.28	0.96	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.15	0.00	0.15	0.05	0.28	0.11	0.14
C2	0.03	0.00	0.17	0.14	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.10	0.29	0.03	0.44	0.22	0.31
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.09	0.09	0.08	0.13	0.20	0.16	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.10	0.06	0.04
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.01	0.17	0.10	0.16	0.14	0.12	0.14	0.09	0.02	0.01	0.01	0.05	0.18	0.13	0.06	0.05
C4	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.05	0.33	0.01	0.52	0.24	0.36
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.02	0.06	0.04	0.09	0.04	0.12	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.08	0.05
C5	0.03	0.01	0.06	0.15	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.10	0.03	0.44	0.02	0.70	0.33	0.51
C5'	0.03	0.03	0.09	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.11	0.06	0.05	0.03	0.13	0.05	0.05	0.08	0.01	0.01	0.12	0.08	0.07	0.01
C6	0.03	0.01	0.09	0.17	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.11	0.05	0.45	0.01	0.72	0.36	0.53
C8	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.06	0.07	0.45	0.05	0.73	0.31	0.52
N1	0.03	0.01	0.13	0.16	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.13	0.08	0.38	0.03	0.59	0.29	0.43
N2	0.04	0.00	0.20	0.14	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.13	0.24	0.04	0.35	0.19	0.24
N3	0.03	0.00	0.16	0.12	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.10	0.25	0.02	0.38	0.19	0.26
N7	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.09	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.18	0.07	0.04	0.50	0.06	0.83	0.38	0.61
N9	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.32	0.04	0.51	0.22	0.34
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.09	0.12	0.14	0.05	0.13	0.17	0.09	0.13	0.10	0.18	0.09	0.00	0.03	0.08	0.06	0.16	0.13	0.06	0.05
O3'	0.15	0.16	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.08	0.11	0.06	0.13	0.19	0.16	0.07	0.08	0.03	0.00	0.09	0.07	0.12	0.20	0.13	0.06
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.08	0.13	0.10	0.04	0.01	0.08	0.09	0.00	0.15	0.05	0.29	0.15	0.13
O5'	0.15	0.29	0.05	0.05	0.33	0.01	0.44	0.01	0.45	0.45	0.38	0.24	0.25	0.50	0.32	0.06	0.07	0.15	0.00	0.50	0.02	0.02	0.01
O6	0.05	0.03	0.08	0.18	0.01	0.07	0.02	0.12	0.01	0.05	0.03	0.04	0.02	0.06	0.04	0.16	0.12	0.05	0.50	0.00	0.82	0.42	0.62
OP1	0.28	0.44	0.10	0.13	0.52	0.07	0.70	0.08	0.72	0.73	0.59	0.35	0.38	0.83	0.51	0.13	0.20	0.29	0.02	0.82	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.22	0.06	0.06	0.24	0.08	0.33	0.07	0.36	0.31	0.29	0.19	0.19	0.38	0.22	0.06	0.13	0.15	0.02	0.42	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.31	0.04	0.05	0.36	0.05	0.51	0.01	0.53	0.52	0.43	0.24	0.26	0.61	0.34	0.05	0.06	0.13	0.01	0.62	0.01	0.01	0.00