Doublet Group distance statistics: 49545

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 9, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.007, 0.013, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.011, 0.017, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.022, 0.039, 0.056, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.039 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.029, 0.053, 0.076, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.053 std_dev=0.024
C4	B	0, 0.159, 0.277, 0.395, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.277 std_dev=0.118
N9	B	0, 0.200, 0.331, 0.462, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.331 std_dev=0.131
C5	B	0, 0.171, 0.305, 0.438, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.305 std_dev=0.134
N3	B	0, 0.193, 0.327, 0.462, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.327 std_dev=0.134
N7	B	0, 0.196, 0.357, 0.519, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.357 std_dev=0.162
C8	B	0, 0.207, 0.381, 0.554, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.381 std_dev=0.174
C1'	B	0, 0.185, 0.384, 0.584, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.384 std_dev=0.199
C4'	A	0, 0.005, 0.216, 0.427, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.216 std_dev=0.211
C2	B	0, 0.175, 0.388, 0.601, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.388 std_dev=0.213
C6	B	0, 0.124, 0.355, 0.585, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.355 std_dev=0.231
O4'	A	0, -0.020, 0.222, 0.465, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.222 std_dev=0.243
C2'	A	0, -0.029, 0.227, 0.483, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.227 std_dev=0.256
N1	B	0, 0.139, 0.399, 0.660, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.399 std_dev=0.260
C3'	A	0, -0.015, 0.270, 0.556, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.270 std_dev=0.285
N2	B	0, 0.167, 0.481, 0.796, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.481 std_dev=0.314
O4'	B	0, 0.079, 0.394, 0.710, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.394 std_dev=0.316
C2'	B	0, 0.232, 0.560, 0.887, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.560 std_dev=0.327
O6	B	0, 0.080, 0.415, 0.749, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.415 std_dev=0.335
O3'	A	0, 0.023, 0.360, 0.697, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.360 std_dev=0.337
C3'	B	0, 0.200, 0.561, 0.922, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.561 std_dev=0.361
O2'	B	0, 0.351, 0.728, 1.105, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.728 std_dev=0.377
O5'	A	0, -0.004, 0.383, 0.769, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.383 std_dev=0.387
C4'	B	0, 0.086, 0.476, 0.867, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.476 std_dev=0.390
O2'	A	0, 0.057, 0.465, 0.872, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.465 std_dev=0.407
C5'	A	0, -0.043, 0.372, 0.786, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.372 std_dev=0.414
C5'	B	0, 0.069, 0.523, 0.977, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.523 std_dev=0.454
O5'	B	0, 0.154, 0.615, 1.076, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.615 std_dev=0.461
OP2	A	0, 0.202, 0.663, 1.125, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.663 std_dev=0.461
O3'	B	0, 0.152, 0.641, 1.130, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.641 std_dev=0.489
P	A	0, 0.060, 0.555, 1.050, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.555 std_dev=0.495
OP2	B	0, 0.268, 0.764, 1.259, 2.266 max_d=2.266 avg_d=0.764 std_dev=0.495
P	B	0, 0.157, 0.680, 1.202, 2.127 max_d=2.127 avg_d=0.680 std_dev=0.522
OP1	B	0, 0.146, 0.777, 1.407, 2.283 max_d=2.283 avg_d=0.777 std_dev=0.631
OP1	A	0, 0.001, 0.672, 1.344, 2.636 max_d=2.636 avg_d=0.672 std_dev=0.671

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.12	0.16	0.19	0.13
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.07	0.11	0.09	0.12	0.16	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.01	0.11	0.04	0.12	0.04	0.04	0.07	0.08	0.00	0.03	0.03	0.11	0.20	0.16	0.13
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.09	0.04	0.05	0.08	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.18	0.11	0.10
C4	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.06	0.04	0.14	0.20	0.27	0.17
C4'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.08	0.07	0.11	0.10	0.03	0.01	0.03	0.11	0.05	0.04
C5	0.02	0.01	0.11	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.06	0.18	0.28	0.35	0.25
C5'	0.02	0.13	0.04	0.02	0.12	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.15	0.14	0.18	0.07	0.08	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.08	0.20	0.28	0.34	0.25
N1	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02	0.13	0.18	0.23	0.15
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	0.09	0.10	0.14	0.19	0.11
N4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.06	0.05	0.15	0.21	0.28	0.19
O2	0.02	0.00	0.08	0.03	0.01	0.11	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.11	0.19	0.09	0.13	0.10	0.09
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.15	0.10	0.21	0.07	0.21	0.08	0.12	0.16	0.20	0.00	0.07	0.06	0.09	0.20	0.16	0.13
O3'	0.06	0.07	0.03	0.01	0.06	0.03	0.09	0.08	0.09	0.05	0.06	0.06	0.11	0.07	0.00	0.03	0.10	0.27	0.20	0.18
O4'	0.01	0.11	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.09	0.05	0.19	0.06	0.03	0.00	0.18	0.16	0.24	0.17
O5'	0.12	0.09	0.11	0.05	0.14	0.03	0.18	0.01	0.20	0.13	0.10	0.15	0.09	0.09	0.10	0.18	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.16	0.12	0.20	0.18	0.20	0.11	0.28	0.07	0.28	0.18	0.14	0.21	0.13	0.20	0.27	0.16	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.16	0.16	0.11	0.27	0.05	0.35	0.02	0.34	0.23	0.19	0.28	0.10	0.16	0.20	0.24	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.08	0.13	0.10	0.17	0.04	0.25	0.02	0.25	0.15	0.11	0.19	0.09	0.13	0.18	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.24	0.21	0.14	0.14	0.17	0.16	0.15	0.27	0.16	0.29	0.26	0.18	0.12	0.14	0.25	0.27	0.19	0.15	0.33	0.15	0.24	0.15
C2	0.09	0.27	0.09	0.10	0.11	0.15	0.10	0.16	0.22	0.12	0.29	0.30	0.18	0.09	0.08	0.11	0.33	0.15	0.15	0.22	0.12	0.19	0.12
C2'	0.20	0.30	0.18	0.20	0.24	0.21	0.26	0.21	0.32	0.17	0.32	0.31	0.26	0.21	0.20	0.19	0.23	0.23	0.23	0.36	0.32	0.40	0.31
C3'	0.16	0.31	0.13	0.18	0.25	0.18	0.30	0.19	0.38	0.18	0.37	0.32	0.26	0.27	0.19	0.17	0.17	0.20	0.21	0.45	0.31	0.36	0.28
C4	0.12	0.23	0.12	0.19	0.09	0.24	0.07	0.27	0.12	0.12	0.20	0.28	0.17	0.09	0.09	0.11	0.43	0.22	0.25	0.11	0.23	0.21	0.21
C4'	0.14	0.31	0.17	0.14	0.21	0.15	0.28	0.15	0.39	0.13	0.38	0.31	0.23	0.21	0.14	0.25	0.15	0.17	0.16	0.48	0.22	0.28	0.20
C5	0.14	0.20	0.18	0.22	0.10	0.26	0.08	0.29	0.13	0.12	0.19	0.24	0.17	0.08	0.10	0.12	0.42	0.23	0.26	0.13	0.21	0.20	0.19
C5'	0.12	0.37	0.15	0.16	0.27	0.14	0.37	0.15	0.49	0.16	0.45	0.37	0.28	0.32	0.16	0.24	0.14	0.14	0.17	0.59	0.20	0.24	0.19
C6	0.17	0.21	0.21	0.20	0.13	0.23	0.12	0.23	0.18	0.14	0.22	0.24	0.17	0.10	0.13	0.19	0.37	0.22	0.21	0.20	0.14	0.17	0.13
N1	0.14	0.24	0.17	0.14	0.13	0.18	0.14	0.17	0.23	0.14	0.27	0.26	0.18	0.10	0.12	0.18	0.32	0.18	0.16	0.25	0.12	0.19	0.11
N3	0.09	0.27	0.09	0.13	0.10	0.19	0.07	0.21	0.15	0.11	0.26	0.32	0.19	0.09	0.07	0.10	0.38	0.17	0.20	0.13	0.18	0.19	0.16
N4	0.18	0.22	0.18	0.24	0.12	0.30	0.10	0.33	0.12	0.15	0.18	0.29	0.18	0.12	0.14	0.21	0.48	0.27	0.31	0.13	0.31	0.25	0.27
O2	0.08	0.28	0.08	0.07	0.12	0.12	0.12	0.12	0.25	0.12	0.33	0.33	0.19	0.11	0.08	0.12	0.29	0.13	0.13	0.27	0.11	0.21	0.11
O2'	0.22	0.25	0.20	0.24	0.20	0.28	0.20	0.29	0.26	0.15	0.27	0.27	0.23	0.16	0.19	0.20	0.28	0.27	0.33	0.31	0.47	0.54	0.45
O3'	0.16	0.29	0.14	0.20	0.23	0.20	0.27	0.23	0.35	0.17	0.34	0.30	0.24	0.24	0.18	0.17	0.18	0.20	0.27	0.42	0.40	0.44	0.35
O4'	0.22	0.27	0.29	0.22	0.15	0.25	0.21	0.24	0.37	0.21	0.36	0.29	0.18	0.13	0.17	0.35	0.31	0.26	0.24	0.48	0.20	0.22	0.20
O5'	0.13	0.22	0.20	0.12	0.17	0.13	0.27	0.15	0.35	0.13	0.30	0.21	0.16	0.27	0.11	0.30	0.13	0.15	0.16	0.43	0.19	0.23	0.18
OP1	0.20	0.21	0.29	0.18	0.14	0.21	0.26	0.23	0.37	0.12	0.31	0.19	0.13	0.27	0.11	0.41	0.21	0.21	0.26	0.50	0.25	0.27	0.26
OP2	0.24	0.13	0.32	0.18	0.12	0.21	0.18	0.21	0.23	0.13	0.18	0.13	0.13	0.23	0.14	0.43	0.21	0.23	0.22	0.32	0.18	0.18	0.19
P	0.17	0.19	0.26	0.15	0.14	0.17	0.25	0.18	0.34	0.12	0.28	0.18	0.13	0.26	0.10	0.39	0.18	0.18	0.20	0.44	0.18	0.19	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.26	0.01	0.06	0.02	0.09	0.10	0.03
C2	0.04	0.00	0.05	0.09	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.50	0.09	0.07	0.03	0.11	0.18	0.05
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.03	0.04	0.10	0.04	0.04	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.07	0.02	0.16	0.04	0.20	0.12	0.14
C3'	0.03	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.04	0.16	0.04	0.14	0.10	0.15	0.05	0.02	0.02	0.01	0.08	0.07	0.17	0.05	0.09
C4	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.34	0.04	0.06	0.02	0.07	0.22	0.09
C4'	0.01	0.09	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.03	0.13	0.05	0.13	0.09	0.12	0.04	0.05	0.05	0.01	0.02	0.06	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.25	0.03	0.13	0.01	0.14	0.32	0.18
C5'	0.03	0.06	0.10	0.02	0.07	0.01	0.14	0.00	0.13	0.19	0.08	0.08	0.06	0.21	0.09	0.06	0.08	0.02	0.01	0.17	0.01	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.13	0.31	0.04	0.12	0.01	0.14	0.34	0.18
C8	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.13	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.08	0.07	0.19	0.01	0.21	0.33	0.23
N1	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.42	0.07	0.07	0.02	0.07	0.27	0.10
N2	0.04	0.00	0.07	0.14	0.01	0.13	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.58	0.11	0.11	0.04	0.18	0.14	0.08
N3	0.04	0.00	0.05	0.10	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.48	0.09	0.08	0.03	0.12	0.15	0.05
N7	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.12	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.11	0.05	0.21	0.02	0.24	0.40	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.22	0.02	0.08	0.02	0.08	0.21	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.08	0.05	0.12	0.06	0.13	0.15	0.10	0.12	0.09	0.16	0.08	0.00	0.06	0.04	0.13	0.15	0.19	0.11	0.11
O3'	0.26	0.50	0.07	0.02	0.34	0.05	0.25	0.08	0.31	0.08	0.42	0.58	0.48	0.11	0.22	0.06	0.00	0.18	0.18	0.27	0.24	0.17	0.17
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.11	0.09	0.05	0.02	0.04	0.18	0.00	0.02	0.04	0.04	0.14	0.05
O5'	0.06	0.07	0.16	0.08	0.06	0.02	0.13	0.01	0.12	0.19	0.07	0.11	0.08	0.21	0.08	0.13	0.18	0.02	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.04	0.07	0.02	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.15	0.27	0.04	0.17	0.00	0.20	0.42	0.25
OP1	0.09	0.11	0.20	0.17	0.07	0.07	0.14	0.01	0.14	0.21	0.07	0.18	0.12	0.24	0.08	0.19	0.24	0.04	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.18	0.12	0.05	0.22	0.06	0.32	0.07	0.34	0.33	0.27	0.14	0.15	0.40	0.21	0.11	0.17	0.14	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.05	0.14	0.09	0.09	0.03	0.18	0.01	0.18	0.23	0.10	0.08	0.05	0.27	0.10	0.11	0.17	0.05	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00