Doublet Group distance statistics: 49546

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 5, 3, 3, 1, 2, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.016, 0.024, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.019, 0.029, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.015, 0.027, 0.038, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.041, 0.065, 0.089, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.065 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.041, 0.086, 0.131, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.086 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.159, 0.301, 0.442, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.301 std_dev=0.141
O4'	A	0, 0.150, 0.302, 0.454, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.302 std_dev=0.152
C3'	A	0, 0.229, 0.382, 0.535, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.382 std_dev=0.153
C4'	A	0, 0.247, 0.424, 0.602, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.424 std_dev=0.178
O3'	A	0, 0.123, 0.310, 0.496, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.310 std_dev=0.186
C5	B	0, 0.186, 0.460, 0.735, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.460 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.200, 0.474, 0.749, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.474 std_dev=0.274
N7	B	0, 0.212, 0.487, 0.762, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.487 std_dev=0.275
O2'	A	0, 0.214, 0.491, 0.769, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.491 std_dev=0.278
C2	B	0, 0.201, 0.481, 0.760, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.481 std_dev=0.280
N1	B	0, 0.194, 0.475, 0.755, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.475 std_dev=0.281
C4	B	0, 0.186, 0.468, 0.751, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.468 std_dev=0.282
N3	B	0, 0.208, 0.491, 0.775, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.491 std_dev=0.283
C8	B	0, 0.226, 0.512, 0.799, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.512 std_dev=0.286
O6	B	0, 0.239, 0.526, 0.813, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.526 std_dev=0.287
N2	B	0, 0.233, 0.528, 0.823, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.528 std_dev=0.295
N9	B	0, 0.219, 0.515, 0.811, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.515 std_dev=0.296
C5'	A	0, 0.367, 0.700, 1.033, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.700 std_dev=0.333
C1'	B	0, 0.260, 0.609, 0.958, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.609 std_dev=0.349
O4'	B	0, 0.234, 0.597, 0.960, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.597 std_dev=0.363
O5'	A	0, 0.336, 0.712, 1.089, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.712 std_dev=0.376
O5'	B	0, 0.304, 0.694, 1.085, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.694 std_dev=0.390
P	B	0, 0.357, 0.749, 1.142, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.749 std_dev=0.392
OP2	B	0, 0.338, 0.739, 1.139, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.739 std_dev=0.400
C5'	B	0, 0.324, 0.748, 1.172, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.748 std_dev=0.424
C4'	B	0, 0.312, 0.762, 1.212, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.762 std_dev=0.450
C2'	B	0, 0.330, 0.804, 1.278, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.804 std_dev=0.474
OP1	B	0, 0.377, 0.866, 1.355, 2.017 max_d=2.017 avg_d=0.866 std_dev=0.489
OP1	A	0, 0.468, 0.978, 1.489, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.978 std_dev=0.511
P	A	0, 0.393, 0.912, 1.432, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.912 std_dev=0.519
C3'	B	0, 0.338, 0.861, 1.383, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.861 std_dev=0.522
O2'	B	0, 0.408, 0.947, 1.486, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.947 std_dev=0.539
O3'	B	0, 0.410, 1.054, 1.698, 2.096 max_d=2.096 avg_d=1.054 std_dev=0.644
OP2	A	0, 0.386, 1.031, 1.675, 2.426 max_d=2.426 avg_d=1.031 std_dev=0.645

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.13	0.01	0.07	0.07	0.17	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.17	0.05	0.11	0.09	0.30	0.14
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.07	0.02	0.04	0.04	0.09	0.00	0.02	0.02	0.11	0.12	0.13	0.12
C3'	0.03	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.04	0.09	0.02	0.01	0.01	0.07	0.10	0.09	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.11	0.13	0.04	0.15	0.16	0.43	0.20
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.10	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.05	0.16	0.17	0.45	0.21
C5'	0.03	0.07	0.07	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.08	0.06	0.08	0.10	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.13	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.05	0.14	0.13	0.38	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.11	0.09	0.29	0.13
N3	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.16	0.05	0.13	0.12	0.37	0.17
N4	0.03	0.02	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.12	0.13	0.04	0.15	0.18	0.47	0.22
O2	0.03	0.01	0.09	0.09	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.17	0.22	0.08	0.08	0.07	0.25	0.10
O2'	0.03	0.11	0.00	0.02	0.11	0.05	0.13	0.04	0.11	0.06	0.11	0.12	0.17	0.00	0.08	0.04	0.13	0.16	0.21	0.16
O3'	0.13	0.17	0.02	0.01	0.13	0.03	0.09	0.03	0.08	0.12	0.16	0.13	0.22	0.08	0.00	0.10	0.07	0.11	0.10	0.07
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.05	0.04	0.08	0.04	0.10	0.00	0.08	0.12	0.18	0.09
O5'	0.07	0.11	0.11	0.07	0.15	0.02	0.16	0.01	0.14	0.11	0.13	0.15	0.08	0.13	0.07	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.09	0.12	0.10	0.16	0.10	0.17	0.13	0.13	0.09	0.12	0.18	0.07	0.16	0.11	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.30	0.13	0.09	0.43	0.05	0.45	0.04	0.38	0.29	0.37	0.47	0.25	0.21	0.10	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.12	0.08	0.20	0.02	0.21	0.02	0.17	0.13	0.17	0.22	0.10	0.16	0.07	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.10	0.17	0.16	0.10	0.21	0.11	0.25	0.14	0.11	0.11	0.12	0.13	0.14	0.12	0.21	0.17	0.21	0.15	0.22	0.15	0.24	0.16
C2	0.19	0.13	0.19	0.16	0.14	0.17	0.07	0.18	0.11	0.11	0.09	0.16	0.18	0.09	0.15	0.21	0.17	0.18	0.11	0.19	0.13	0.20	0.13
C2'	0.22	0.11	0.20	0.18	0.10	0.24	0.11	0.28	0.16	0.11	0.11	0.14	0.14	0.15	0.13	0.27	0.20	0.24	0.16	0.25	0.15	0.26	0.16
C3'	0.23	0.12	0.22	0.23	0.13	0.28	0.12	0.33	0.14	0.14	0.11	0.14	0.15	0.15	0.16	0.28	0.25	0.26	0.20	0.21	0.18	0.26	0.19
C4	0.13	0.13	0.18	0.15	0.09	0.12	0.12	0.11	0.18	0.09	0.16	0.17	0.14	0.13	0.09	0.21	0.16	0.13	0.08	0.23	0.11	0.20	0.12
C4'	0.23	0.13	0.23	0.22	0.14	0.27	0.12	0.30	0.13	0.13	0.11	0.15	0.16	0.14	0.16	0.28	0.24	0.26	0.18	0.18	0.14	0.22	0.14
C5	0.15	0.19	0.20	0.16	0.16	0.13	0.18	0.14	0.21	0.14	0.21	0.20	0.18	0.18	0.14	0.24	0.17	0.13	0.12	0.24	0.13	0.21	0.14
C5'	0.26	0.17	0.26	0.23	0.17	0.25	0.16	0.27	0.16	0.18	0.15	0.19	0.20	0.18	0.19	0.32	0.24	0.25	0.22	0.19	0.19	0.25	0.19
C6	0.17	0.17	0.19	0.15	0.15	0.15	0.18	0.17	0.20	0.15	0.18	0.18	0.17	0.19	0.14	0.24	0.16	0.16	0.12	0.24	0.13	0.21	0.14
N1	0.16	0.11	0.16	0.13	0.10	0.16	0.11	0.19	0.15	0.10	0.12	0.13	0.14	0.14	0.11	0.21	0.14	0.17	0.11	0.22	0.12	0.21	0.13
N3	0.17	0.14	0.20	0.16	0.12	0.15	0.07	0.14	0.12	0.09	0.09	0.18	0.19	0.09	0.13	0.22	0.18	0.16	0.09	0.20	0.12	0.19	0.11
N4	0.14	0.15	0.21	0.18	0.10	0.14	0.13	0.11	0.19	0.10	0.18	0.19	0.14	0.13	0.11	0.24	0.21	0.13	0.10	0.23	0.13	0.21	0.14
O2	0.23	0.19	0.23	0.22	0.22	0.22	0.16	0.23	0.13	0.19	0.15	0.20	0.23	0.15	0.22	0.24	0.22	0.23	0.18	0.18	0.19	0.23	0.17
O2'	0.16	0.11	0.14	0.14	0.09	0.20	0.17	0.28	0.22	0.14	0.15	0.13	0.12	0.23	0.10	0.22	0.15	0.20	0.22	0.34	0.26	0.37	0.26
O3'	0.32	0.23	0.31	0.33	0.25	0.37	0.24	0.42	0.23	0.27	0.22	0.23	0.26	0.26	0.28	0.34	0.35	0.34	0.32	0.26	0.30	0.36	0.31
O4'	0.21	0.12	0.20	0.19	0.13	0.23	0.12	0.24	0.14	0.12	0.12	0.14	0.15	0.15	0.15	0.25	0.20	0.23	0.12	0.18	0.10	0.21	0.12
O5'	0.22	0.14	0.24	0.21	0.14	0.22	0.14	0.26	0.15	0.16	0.13	0.17	0.17	0.18	0.17	0.31	0.21	0.21	0.21	0.19	0.19	0.23	0.18
OP1	0.22	0.14	0.25	0.28	0.15	0.31	0.16	0.37	0.16	0.19	0.13	0.15	0.16	0.19	0.17	0.33	0.33	0.25	0.25	0.19	0.29	0.22	0.23
OP2	0.37	0.39	0.40	0.32	0.36	0.27	0.34	0.27	0.36	0.32	0.37	0.42	0.40	0.33	0.35	0.47	0.29	0.27	0.30	0.37	0.27	0.31	0.26
P	0.22	0.16	0.24	0.20	0.17	0.20	0.18	0.25	0.19	0.20	0.16	0.17	0.18	0.21	0.19	0.32	0.19	0.18	0.25	0.22	0.23	0.26	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.10	0.13	0.08
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.12	0.03	0.10	0.03	0.14	0.20	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.06	0.09	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.18	0.16	0.10
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.05	0.08	0.11	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.08	0.20	0.19	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.09	0.01	0.13	0.18	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.10	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.12	0.01	0.15	0.20	0.15
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.09	0.07	0.05	0.05	0.09	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.10	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.11	0.03	0.13	0.01	0.16	0.22	0.16
C8	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.10	0.04	0.13	0.17	0.13
N1	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.12	0.02	0.15	0.21	0.15
N2	0.04	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.14	0.05	0.09	0.03	0.14	0.20	0.13
N3	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.10	0.04	0.08	0.02	0.13	0.18	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.12	0.04	0.15	0.20	0.15
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.11	0.16	0.11
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.08	0.10	0.07	0.04	0.01	0.00	0.06	0.03	0.03	0.07	0.18	0.14	0.08
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.11	0.05	0.12	0.14	0.10	0.07	0.03	0.06	0.00	0.03	0.08	0.13	0.25	0.22	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.09	0.04	0.08	0.13	0.09
O5'	0.05	0.10	0.06	0.08	0.09	0.02	0.12	0.01	0.13	0.10	0.12	0.09	0.08	0.12	0.08	0.03	0.08	0.09	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.13	0.04	0.15	0.00	0.19	0.24	0.19
OP1	0.10	0.14	0.18	0.20	0.13	0.10	0.15	0.06	0.16	0.13	0.15	0.14	0.13	0.15	0.11	0.18	0.25	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.20	0.16	0.19	0.18	0.07	0.20	0.02	0.22	0.17	0.21	0.20	0.18	0.20	0.16	0.14	0.22	0.13	0.02	0.24	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.10	0.13	0.13	0.03	0.15	0.01	0.16	0.13	0.15	0.13	0.12	0.15	0.11	0.08	0.16	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00