Doublet Group distance statistics: 49550

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 4, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.016, 0.034, 0.051, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.017, 0.052, 0.087, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.052 std_dev=0.035
O2	A	0, 0.010, 0.048, 0.086, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.048 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.085, 0.168, 0.252, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.168 std_dev=0.084
O4'	A	0, 0.061, 0.149, 0.237, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.149 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.107, 0.212, 0.316, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.212 std_dev=0.105
C3'	A	0, 0.123, 0.265, 0.407, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.265 std_dev=0.142
C4'	A	0, 0.108, 0.263, 0.418, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.263 std_dev=0.155
O3'	A	0, 0.160, 0.358, 0.556, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.358 std_dev=0.198
N9	B	0, 0.262, 0.502, 0.741, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.502 std_dev=0.240
C4	B	0, 0.313, 0.562, 0.810, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.562 std_dev=0.248
C5'	A	0, 0.255, 0.519, 0.784, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.519 std_dev=0.264
C8	B	0, 0.338, 0.618, 0.897, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.618 std_dev=0.280
N3	B	0, 0.372, 0.659, 0.947, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.659 std_dev=0.287
C1'	B	0, 0.278, 0.571, 0.865, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.571 std_dev=0.294
C5	B	0, 0.405, 0.729, 1.053, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.729 std_dev=0.324
N7	B	0, 0.391, 0.726, 1.060, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.726 std_dev=0.334
C2	B	0, 0.520, 0.919, 1.318, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.919 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.488, 0.928, 1.367, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.928 std_dev=0.439
C6	B	0, 0.562, 1.003, 1.444, 1.458 max_d=1.458 avg_d=1.003 std_dev=0.441
N1	B	0, 0.606, 1.074, 1.543, 1.575 max_d=1.575 avg_d=1.074 std_dev=0.468
N2	B	0, 0.638, 1.132, 1.627, 1.692 max_d=1.692 avg_d=1.132 std_dev=0.494
O4'	B	0, 0.520, 1.029, 1.539, 1.793 max_d=1.793 avg_d=1.029 std_dev=0.510
O6	B	0, 0.692, 1.241, 1.789, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.241 std_dev=0.549
C4'	B	0, 0.680, 1.253, 1.825, 1.855 max_d=1.855 avg_d=1.253 std_dev=0.572
O2'	B	0, 1.014, 1.739, 2.464, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.739 std_dev=0.725
C3'	B	0, 1.089, 1.876, 2.663, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.876 std_dev=0.787
C5'	B	0, 1.207, 2.116, 3.025, 2.852 max_d=2.852 avg_d=2.116 std_dev=0.909
O5'	B	0, 1.338, 2.313, 3.288, 3.117 max_d=3.117 avg_d=2.313 std_dev=0.975
O5'	A	0, 1.579, 2.679, 3.779, 3.432 max_d=3.432 avg_d=2.679 std_dev=1.100
O3'	B	0, 1.720, 2.927, 4.134, 3.744 max_d=3.744 avg_d=2.927 std_dev=1.207
P	B	0, 2.066, 3.542, 5.019, 4.596 max_d=4.596 avg_d=3.542 std_dev=1.476
OP1	B	0, 2.259, 3.860, 5.462, 4.931 max_d=4.931 avg_d=3.860 std_dev=1.601
OP2	B	0, 2.324, 3.981, 5.638, 5.212 max_d=5.212 avg_d=3.981 std_dev=1.657
P	A	0, 2.446, 4.147, 5.848, 5.195 max_d=5.195 avg_d=4.147 std_dev=1.701
OP2	A	0, 2.603, 4.412, 6.222, 5.369 max_d=5.369 avg_d=4.412 std_dev=1.810
OP1	A	0, 2.854, 4.831, 6.808, 5.944 max_d=5.944 avg_d=4.831 std_dev=1.977

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.29	0.24	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.04	0.03	0.25	0.55	0.14	0.36
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.06	0.01	0.01	0.01	0.15	0.24	0.29	0.09
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.05	0.02	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.22	0.24	0.21	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.40	0.91	0.43	0.67
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.15	0.33	0.14
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.42	0.98	0.49	0.72
C5'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.10	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.15	0.09	0.03
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.35	0.79	0.32	0.55
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.24	0.54	0.13	0.34
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.03	0.33	0.73	0.26	0.52
N4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.03	0.44	1.01	0.53	0.76
O2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.04	0.18	0.40	0.17	0.23
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.07	0.06	0.08	0.00	0.04	0.04	0.05	0.24	0.54	0.22
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.05	0.02	0.05	0.07	0.07	0.04	0.00	0.01	0.16	0.12	0.36	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.08	0.22	0.26	0.11
O5'	0.08	0.25	0.15	0.22	0.40	0.03	0.42	0.01	0.35	0.24	0.33	0.44	0.18	0.05	0.16	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.29	0.55	0.24	0.24	0.91	0.15	0.98	0.15	0.79	0.54	0.73	1.01	0.40	0.24	0.12	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.14	0.29	0.21	0.43	0.33	0.49	0.09	0.32	0.13	0.26	0.53	0.17	0.54	0.36	0.26	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.36	0.09	0.11	0.67	0.14	0.72	0.03	0.55	0.34	0.52	0.76	0.23	0.22	0.08	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.23	0.18	0.12	0.10	0.13	0.13	0.17	0.24	0.15	0.28	0.26	0.15	0.09	0.09	0.44	0.17	0.15	0.07	0.27	0.27	0.19	0.25
C2	0.14	0.25	0.10	0.16	0.11	0.09	0.11	0.18	0.15	0.21	0.27	0.32	0.16	0.19	0.14	0.38	0.17	0.22	0.10	0.14	0.26	0.30	0.31
C2'	0.15	0.22	0.24	0.17	0.09	0.18	0.13	0.21	0.25	0.14	0.28	0.26	0.13	0.09	0.10	0.51	0.24	0.18	0.11	0.30	0.23	0.18	0.19
C3'	0.20	0.18	0.33	0.29	0.08	0.27	0.11	0.31	0.20	0.16	0.23	0.20	0.10	0.09	0.14	0.57	0.36	0.24	0.21	0.26	0.12	0.27	0.09
C4	0.18	0.15	0.11	0.24	0.15	0.12	0.18	0.21	0.13	0.23	0.09	0.24	0.13	0.23	0.19	0.37	0.37	0.31	0.21	0.14	0.18	0.27	0.20
C4'	0.18	0.18	0.33	0.29	0.09	0.25	0.12	0.26	0.20	0.15	0.22	0.19	0.11	0.10	0.12	0.55	0.41	0.20	0.17	0.24	0.16	0.30	0.11
C5	0.19	0.12	0.11	0.17	0.14	0.14	0.14	0.24	0.08	0.22	0.08	0.17	0.11	0.19	0.19	0.39	0.28	0.32	0.24	0.08	0.16	0.15	0.11
C5'	0.22	0.15	0.39	0.39	0.11	0.33	0.12	0.34	0.17	0.18	0.18	0.17	0.12	0.12	0.16	0.58	0.51	0.24	0.26	0.20	0.14	0.44	0.17
C6	0.17	0.16	0.13	0.11	0.10	0.15	0.10	0.22	0.10	0.20	0.16	0.20	0.12	0.16	0.16	0.41	0.12	0.26	0.18	0.10	0.13	0.15	0.12
N1	0.14	0.22	0.13	0.11	0.09	0.11	0.09	0.18	0.17	0.19	0.24	0.26	0.14	0.15	0.13	0.40	0.11	0.21	0.10	0.17	0.21	0.20	0.23
N3	0.16	0.22	0.10	0.23	0.13	0.10	0.15	0.19	0.11	0.23	0.19	0.32	0.15	0.23	0.17	0.37	0.30	0.26	0.14	0.11	0.22	0.35	0.30
N4	0.18	0.13	0.15	0.30	0.18	0.14	0.22	0.22	0.21	0.23	0.14	0.20	0.15	0.25	0.20	0.37	0.51	0.34	0.26	0.25	0.23	0.33	0.19
O2	0.13	0.28	0.11	0.16	0.11	0.09	0.12	0.18	0.21	0.20	0.31	0.35	0.18	0.18	0.13	0.38	0.14	0.19	0.10	0.22	0.35	0.35	0.39
O2'	0.15	0.25	0.26	0.18	0.11	0.17	0.17	0.17	0.29	0.14	0.31	0.28	0.15	0.11	0.10	0.52	0.29	0.15	0.07	0.36	0.33	0.19	0.27
O3'	0.22	0.18	0.37	0.36	0.09	0.31	0.12	0.34	0.23	0.15	0.24	0.21	0.10	0.10	0.14	0.60	0.45	0.24	0.23	0.29	0.13	0.32	0.10
O4'	0.16	0.18	0.25	0.19	0.09	0.19	0.13	0.20	0.20	0.15	0.22	0.19	0.11	0.10	0.11	0.48	0.30	0.16	0.11	0.23	0.22	0.23	0.17
O5'	0.35	0.21	0.36	0.33	0.09	0.37	0.12	0.35	0.13	0.43	0.21	0.29	0.11	0.29	0.28	0.63	0.48	0.36	0.33	0.15	0.22	0.56	0.26
OP1	0.36	0.75	0.71	0.59	0.50	0.48	0.37	0.48	0.46	0.18	0.64	0.88	0.71	0.23	0.31	0.67	0.40	0.36	0.43	0.40	0.40	0.20	0.39
OP2	0.13	0.37	0.36	0.25	0.17	0.25	0.11	0.21	0.15	0.24	0.28	0.49	0.34	0.24	0.08	0.36	0.16	0.15	0.23	0.15	0.24	0.24	0.20
P	0.09	0.49	0.35	0.23	0.23	0.19	0.16	0.16	0.26	0.25	0.42	0.61	0.41	0.19	0.08	0.42	0.16	0.10	0.17	0.24	0.16	0.31	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.09	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.20	0.02	0.05	0.03	0.16	0.28	0.14
C2	0.04	0.00	0.24	0.32	0.01	0.07	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.30	0.38	0.21	0.27	0.01	0.16	0.34	0.24
C2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.15	0.04	0.11	0.22	0.14	0.06	0.20	0.28	0.24	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.13	0.13	0.17	0.31	0.20
C3'	0.03	0.32	0.01	0.00	0.21	0.01	0.18	0.03	0.23	0.03	0.29	0.36	0.31	0.09	0.10	0.02	0.01	0.02	0.03	0.21	0.10	0.26	0.13
C4	0.02	0.01	0.15	0.21	0.00	0.05	0.01	0.25	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.17	0.11	0.13	0.01	0.23	0.28	0.30
C4'	0.03	0.07	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.09	0.07	0.03	0.02	0.16	0.03	0.01	0.02	0.06	0.09	0.33	0.15
C5	0.02	0.01	0.11	0.18	0.01	0.05	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.14	0.07	0.15	0.01	0.34	0.33	0.39
C5'	0.09	0.32	0.22	0.03	0.25	0.01	0.25	0.00	0.29	0.16	0.31	0.35	0.30	0.21	0.17	0.16	0.13	0.01	0.01	0.29	0.02	0.05	0.03
C6	0.03	0.01	0.14	0.23	0.01	0.06	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.24	0.20	0.11	0.18	0.01	0.31	0.38	0.40
C8	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.20	0.04	0.17	0.02	0.41	0.27	0.36
N1	0.04	0.00	0.20	0.29	0.02	0.07	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.31	0.17	0.23	0.01	0.20	0.39	0.33
N2	0.05	0.01	0.28	0.36	0.01	0.09	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.36	0.50	0.24	0.37	0.01	0.26	0.34	0.17
N3	0.04	0.01	0.24	0.31	0.01	0.07	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.28	0.33	0.21	0.22	0.01	0.12	0.27	0.21
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.03	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.14	0.02	0.17	0.01	0.44	0.30	0.42
N9	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.02	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.13	0.03	0.10	0.02	0.27	0.25	0.28
O2'	0.01	0.30	0.01	0.02	0.20	0.16	0.20	0.16	0.24	0.23	0.28	0.36	0.28	0.22	0.12	0.00	0.12	0.10	0.15	0.24	0.19	0.19	0.16
O3'	0.20	0.38	0.04	0.01	0.17	0.03	0.14	0.13	0.20	0.20	0.31	0.50	0.33	0.14	0.13	0.12	0.00	0.15	0.08	0.18	0.07	0.29	0.10
O4'	0.02	0.21	0.02	0.02	0.11	0.01	0.07	0.01	0.11	0.04	0.17	0.24	0.21	0.02	0.03	0.10	0.15	0.00	0.09	0.09	0.13	0.32	0.13
O5'	0.05	0.27	0.13	0.03	0.13	0.02	0.15	0.01	0.18	0.17	0.23	0.37	0.22	0.17	0.10	0.15	0.08	0.09	0.00	0.19	0.01	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.13	0.21	0.01	0.06	0.01	0.29	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.24	0.18	0.09	0.19	0.00	0.37	0.41	0.45
OP1	0.16	0.16	0.17	0.10	0.23	0.09	0.34	0.02	0.31	0.41	0.20	0.26	0.12	0.44	0.27	0.19	0.07	0.13	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.34	0.31	0.26	0.28	0.33	0.33	0.05	0.38	0.27	0.39	0.34	0.27	0.30	0.25	0.19	0.29	0.32	0.03	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.24	0.20	0.13	0.30	0.15	0.39	0.03	0.40	0.36	0.33	0.17	0.21	0.42	0.28	0.16	0.10	0.13	0.01	0.45	0.00	0.01	0.00