Doublet Group distance statistics: 49551

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.024, 0.050, 0.076, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.050 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.023, 0.054, 0.086, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.054 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.182, 0.303, 0.423, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.303 std_dev=0.120
C2'	A	0, 0.185, 0.318, 0.451, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.318 std_dev=0.133
O2'	A	0, 0.187, 0.366, 0.545, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.366 std_dev=0.179
C4'	A	0, 0.296, 0.478, 0.660, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.478 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.306, 0.509, 0.712, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.509 std_dev=0.203
C2	B	0, 0.259, 0.536, 0.813, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.536 std_dev=0.277
N2	B	0, 0.354, 0.643, 0.932, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.643 std_dev=0.289
N3	B	0, 0.232, 0.527, 0.822, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.527 std_dev=0.295
O3'	A	0, 0.441, 0.737, 1.033, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.737 std_dev=0.296
N1	B	0, 0.204, 0.506, 0.809, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.506 std_dev=0.303
O6	B	0, 0.243, 0.561, 0.879, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.561 std_dev=0.318
C5'	A	0, 0.499, 0.821, 1.143, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.821 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.157, 0.483, 0.809, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.483 std_dev=0.326
C4	B	0, 0.142, 0.486, 0.830, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.486 std_dev=0.344
C5	B	0, 0.130, 0.479, 0.828, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.479 std_dev=0.349
O4'	B	0, 0.435, 0.791, 1.146, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.791 std_dev=0.356
C4'	B	0, 0.495, 0.858, 1.222, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.858 std_dev=0.364
C3'	B	0, 0.429, 0.806, 1.184, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.806 std_dev=0.378
N7	B	0, 0.216, 0.595, 0.974, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.595 std_dev=0.379
N9	B	0, 0.174, 0.568, 0.961, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.568 std_dev=0.394
C1'	B	0, 0.242, 0.660, 1.079, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.660 std_dev=0.418
C5'	B	0, 0.596, 1.026, 1.456, 1.542 max_d=1.542 avg_d=1.026 std_dev=0.430
C8	B	0, 0.185, 0.621, 1.057, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.621 std_dev=0.436
O3'	B	0, 0.503, 0.942, 1.380, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.942 std_dev=0.438
C2'	B	0, 0.249, 0.713, 1.177, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.713 std_dev=0.464
O2'	B	0, 0.317, 0.835, 1.354, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.835 std_dev=0.518
O5'	B	0, 0.592, 1.251, 1.910, 2.637 max_d=2.637 avg_d=1.251 std_dev=0.659
O5'	A	0, 1.128, 1.787, 2.447, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.787 std_dev=0.660
P	A	0, 2.452, 3.729, 5.005, 4.702 max_d=4.702 avg_d=3.729 std_dev=1.277
P	B	0, 0.543, 1.895, 3.247, 4.472 max_d=4.472 avg_d=1.895 std_dev=1.352
OP1	A	0, 2.544, 3.919, 5.294, 5.193 max_d=5.193 avg_d=3.919 std_dev=1.375
OP1	B	0, 0.722, 2.102, 3.482, 4.965 max_d=4.965 avg_d=2.102 std_dev=1.380
OP2	A	0, 3.859, 5.837, 7.816, 7.007 max_d=7.007 avg_d=5.837 std_dev=1.979
OP2	B	0, 0.118, 2.619, 5.119, 6.966 max_d=6.966 avg_d=2.619 std_dev=2.501

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.13	0.11	0.37	0.11
C2	0.01	0.00	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.27	0.20	0.36	0.18
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.08	0.03	0.08	0.03	0.07	0.06	0.17	0.01	0.06	0.01	0.19	0.27	0.30	0.11
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.04	0.12	0.05	0.12	0.10	0.21	0.01	0.03	0.02	0.24	0.35	0.26	0.18
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.11	0.02	0.40	0.31	0.44	0.31
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.06	0.06	0.09	0.06	0.06	0.00	0.02	0.14	0.36	0.09
C5	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.03	0.44	0.31	0.45	0.33
C5'	0.02	0.09	0.03	0.04	0.11	0.01	0.14	0.00	0.13	0.06	0.10	0.13	0.11	0.06	0.09	0.02	0.01	0.13	0.29	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.03	0.38	0.24	0.38	0.25
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.27	0.17	0.35	0.16
N3	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.14	0.02	0.33	0.26	0.39	0.24
N4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.14	0.03	0.43	0.36	0.48	0.36
O2	0.02	0.01	0.17	0.21	0.02	0.09	0.02	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.25	0.02	0.19	0.16	0.37	0.15
O2'	0.03	0.05	0.01	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.02	0.04	0.04	0.11	0.00	0.08	0.05	0.06	0.23	0.39	0.12
O3'	0.06	0.15	0.06	0.03	0.11	0.06	0.14	0.09	0.13	0.07	0.14	0.14	0.25	0.08	0.00	0.06	0.17	0.45	0.33	0.24
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.00	0.07	0.10	0.46	0.20
O5'	0.13	0.27	0.19	0.24	0.40	0.02	0.44	0.01	0.38	0.27	0.33	0.43	0.19	0.06	0.17	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.11	0.20	0.27	0.35	0.31	0.14	0.31	0.13	0.24	0.17	0.26	0.36	0.16	0.23	0.45	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.36	0.30	0.26	0.44	0.36	0.45	0.29	0.38	0.35	0.39	0.48	0.37	0.39	0.33	0.46	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.11	0.18	0.11	0.18	0.31	0.09	0.33	0.02	0.25	0.16	0.24	0.36	0.15	0.12	0.24	0.20	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.15	0.14	0.13	0.20	0.15	0.21	0.17	0.16	0.19	0.31	0.15	0.16	0.14	0.18	0.17	0.26	0.35	0.20	0.18	0.29	0.21
C2	0.20	0.18	0.13	0.13	0.12	0.25	0.13	0.26	0.13	0.18	0.12	0.29	0.17	0.19	0.16	0.17	0.13	0.30	0.46	0.18	0.22	0.40	0.42
C2'	0.24	0.32	0.25	0.23	0.21	0.28	0.18	0.29	0.19	0.17	0.25	0.45	0.29	0.17	0.19	0.27	0.26	0.31	0.36	0.20	0.28	0.38	0.21
C3'	0.22	0.23	0.20	0.19	0.17	0.27	0.14	0.28	0.14	0.15	0.17	0.32	0.23	0.15	0.17	0.23	0.22	0.31	0.37	0.16	0.24	0.31	0.22
C4	0.23	0.20	0.14	0.15	0.18	0.25	0.17	0.24	0.16	0.20	0.15	0.24	0.20	0.21	0.20	0.18	0.14	0.31	0.61	0.21	0.40	0.93	0.75
C4'	0.16	0.14	0.17	0.17	0.13	0.19	0.15	0.19	0.16	0.16	0.15	0.19	0.13	0.16	0.14	0.18	0.22	0.25	0.33	0.19	0.19	0.34	0.17
C5	0.22	0.21	0.15	0.14	0.19	0.22	0.18	0.21	0.19	0.19	0.19	0.25	0.20	0.20	0.19	0.19	0.14	0.29	0.57	0.23	0.37	0.81	0.68
C5'	0.17	0.15	0.19	0.20	0.15	0.19	0.16	0.19	0.17	0.17	0.16	0.17	0.15	0.18	0.16	0.21	0.26	0.24	0.35	0.20	0.16	0.27	0.21
C6	0.20	0.18	0.14	0.13	0.16	0.21	0.16	0.20	0.17	0.17	0.17	0.25	0.18	0.18	0.17	0.18	0.15	0.28	0.49	0.21	0.25	0.52	0.50
N1	0.19	0.17	0.13	0.12	0.12	0.21	0.13	0.21	0.14	0.16	0.15	0.28	0.16	0.17	0.15	0.17	0.13	0.28	0.43	0.18	0.18	0.34	0.37
N3	0.22	0.18	0.13	0.15	0.15	0.26	0.14	0.27	0.12	0.19	0.11	0.25	0.19	0.20	0.18	0.17	0.13	0.32	0.56	0.19	0.31	0.72	0.63
N4	0.25	0.21	0.17	0.19	0.21	0.27	0.21	0.26	0.21	0.23	0.19	0.24	0.22	0.24	0.22	0.19	0.18	0.32	0.69	0.26	0.54	1.25	0.94
O2	0.22	0.23	0.17	0.18	0.16	0.27	0.18	0.30	0.18	0.21	0.18	0.34	0.21	0.22	0.18	0.19	0.17	0.32	0.40	0.20	0.26	0.29	0.30
O2'	0.23	0.37	0.31	0.27	0.25	0.25	0.23	0.25	0.25	0.21	0.31	0.51	0.33	0.22	0.22	0.32	0.32	0.26	0.28	0.25	0.40	0.67	0.25
O3'	0.28	0.26	0.28	0.27	0.21	0.34	0.17	0.36	0.16	0.19	0.20	0.35	0.27	0.17	0.22	0.31	0.29	0.37	0.39	0.17	0.33	0.43	0.24
O4'	0.22	0.14	0.22	0.22	0.17	0.23	0.18	0.23	0.18	0.20	0.16	0.15	0.16	0.20	0.19	0.25	0.26	0.27	0.36	0.21	0.20	0.30	0.23
O5'	0.27	0.19	0.25	0.26	0.27	0.28	0.32	0.31	0.31	0.34	0.24	0.16	0.21	0.36	0.29	0.25	0.28	0.33	0.44	0.35	0.32	0.41	0.40
OP1	0.22	0.17	0.23	0.22	0.18	0.25	0.20	0.25	0.21	0.21	0.18	0.20	0.18	0.23	0.19	0.29	0.26	0.28	0.40	0.27	0.21	0.31	0.33
OP2	0.31	0.33	0.33	0.32	0.30	0.32	0.32	0.30	0.35	0.30	0.33	0.38	0.32	0.33	0.29	0.37	0.35	0.34	0.53	0.40	0.34	0.65	0.58
P	0.19	0.16	0.17	0.17	0.18	0.20	0.23	0.20	0.25	0.23	0.20	0.17	0.15	0.26	0.19	0.21	0.21	0.25	0.45	0.32	0.24	0.44	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.18	0.01	0.09	0.46	0.10
C2	0.02	0.00	0.15	0.22	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.24	0.03	0.43	0.02	0.36	0.40	0.39
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.09	0.11	0.18	0.15	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.05	0.25	0.56	0.06
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.11	0.00	0.08	0.02	0.13	0.13	0.18	0.26	0.19	0.10	0.04	0.02	0.01	0.02	0.39	0.12	0.54	0.40	0.12
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.45	0.01	0.37	0.46	0.45
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.10	0.12	0.09	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.10	0.09	0.84	0.28
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.57	0.01	0.57	0.94	0.74
C5'	0.02	0.17	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.18	0.11	0.19	0.17	0.14	0.15	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.20	0.38	0.37	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.02	0.59	0.00	0.63	1.04	0.79
C8	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.15	0.04	0.57	0.01	0.49	0.89	0.73
N1	0.02	0.01	0.11	0.18	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.20	0.02	0.52	0.01	0.52	0.73	0.61
N2	0.03	0.01	0.18	0.26	0.02	0.12	0.02	0.17	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.31	0.04	0.38	0.03	0.30	0.33	0.29
N3	0.02	0.01	0.15	0.19	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.21	0.03	0.37	0.01	0.26	0.28	0.28
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.03	0.64	0.01	0.66	1.26	0.92
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.41	0.01	0.29	0.33	0.38
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.06	0.04	0.07	0.07	0.14	0.09	0.06	0.03	0.00	0.02	0.05	0.09	0.03	0.11	1.15	0.41
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.10	0.02	0.08	0.04	0.12	0.15	0.20	0.31	0.21	0.12	0.04	0.02	0.00	0.02	0.31	0.12	0.63	0.71	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.02	0.20	0.61	0.22
O5'	0.18	0.43	0.28	0.39	0.45	0.01	0.57	0.01	0.59	0.57	0.52	0.38	0.37	0.64	0.41	0.09	0.31	0.06	0.00	0.64	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.02	0.64	0.00	0.75	1.34	0.95
OP1	0.09	0.36	0.25	0.54	0.37	0.09	0.57	0.38	0.63	0.49	0.52	0.30	0.26	0.66	0.29	0.11	0.63	0.20	0.01	0.75	0.00	0.01	0.01
OP2	0.46	0.40	0.56	0.40	0.46	0.84	0.94	0.37	1.04	0.89	0.73	0.33	0.28	1.26	0.33	1.15	0.71	0.61	0.02	1.34	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.39	0.06	0.12	0.45	0.28	0.74	0.01	0.79	0.73	0.61	0.29	0.28	0.92	0.38	0.41	0.12	0.22	0.00	0.95	0.01	0.01	0.00