Doublet Group distance statistics: 49552

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 2, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.004, 0.006, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.006, 0.023, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.007, 0.032, 0.056, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N1	B	0, 0.057, 0.243, 0.429, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.243 std_dev=0.186
O4'	A	0, -0.029, 0.161, 0.351, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.161 std_dev=0.190
C6	B	0, 0.099, 0.291, 0.483, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.291 std_dev=0.192
C2	B	0, 0.054, 0.252, 0.449, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.252 std_dev=0.198
C2'	A	0, -0.023, 0.176, 0.374, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.176 std_dev=0.198
N3	B	0, 0.063, 0.270, 0.477, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.270 std_dev=0.207
C5	B	0, 0.091, 0.299, 0.506, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.299 std_dev=0.208
N2	B	0, 0.109, 0.317, 0.525, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.317 std_dev=0.208
C4	B	0, 0.038, 0.259, 0.480, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.259 std_dev=0.221
O6	B	0, 0.108, 0.338, 0.567, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.338 std_dev=0.230
N9	B	0, 0.030, 0.286, 0.542, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.286 std_dev=0.256
N7	B	0, 0.103, 0.364, 0.625, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.364 std_dev=0.261
C8	B	0, 0.083, 0.350, 0.616, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.350 std_dev=0.267
C1'	B	0, 0.059, 0.340, 0.622, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.340 std_dev=0.281
O5'	A	0, 0.065, 0.354, 0.643, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.354 std_dev=0.289
OP2	A	0, 0.203, 0.497, 0.791, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.497 std_dev=0.294
O4'	B	0, 0.032, 0.361, 0.690, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.361 std_dev=0.329
C5'	A	0, 0.005, 0.358, 0.710, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.358 std_dev=0.353
C4'	A	0, -0.117, 0.294, 0.705, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.294 std_dev=0.411
C4'	B	0, -0.031, 0.404, 0.839, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.404 std_dev=0.435
P	A	0, 0.062, 0.520, 0.978, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.520 std_dev=0.458
C2'	B	0, 0.052, 0.557, 1.062, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.557 std_dev=0.505
O2'	A	0, -0.131, 0.393, 0.918, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.393 std_dev=0.525
C3'	B	0, -0.024, 0.501, 1.026, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.501 std_dev=0.525
C3'	A	0, -0.184, 0.384, 0.952, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.384 std_dev=0.568
O3'	B	0, -0.012, 0.618, 1.247, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.618 std_dev=0.630
C5'	B	0, -0.135, 0.527, 1.189, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.527 std_dev=0.662
O2'	B	0, -0.091, 0.735, 1.561, 2.883 max_d=2.883 avg_d=0.735 std_dev=0.826
OP1	A	0, -0.168, 0.821, 1.810, 2.763 max_d=2.763 avg_d=0.821 std_dev=0.989
O3'	A	0, -0.416, 0.677, 1.770, 2.858 max_d=2.858 avg_d=0.677 std_dev=1.093
O5'	B	0, -0.598, 0.927, 2.452, 4.030 max_d=4.030 avg_d=0.927 std_dev=1.525
P	B	0, -0.849, 1.238, 3.325, 5.436 max_d=5.436 avg_d=1.238 std_dev=2.087
OP1	B	0, -0.822, 1.367, 3.556, 5.796 max_d=5.796 avg_d=1.367 std_dev=2.189
OP2	B	0, -0.844, 1.370, 3.584, 5.897 max_d=5.897 avg_d=1.370 std_dev=2.214

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.00	0.14	0.12	0.37	0.33
C2	0.01	0.00	0.08	0.21	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.10	0.03	0.09	0.13	0.36	0.29
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.09	0.01	0.06	0.02	0.16	0.00	0.02	0.02	0.36	0.10	0.54	0.41
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.29	0.00	0.25	0.01	0.19	0.17	0.26	0.31	0.15	0.01	0.00	0.01	0.03	0.37	0.05	0.10
C4	0.01	0.00	0.01	0.29	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.07	0.01	0.17	0.20	0.34	0.30
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.07	0.06	0.09	0.11	0.05	0.23	0.03	0.00	0.01	0.07	0.07	0.06
C5	0.01	0.00	0.07	0.25	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.07	0.01	0.16	0.27	0.36	0.35
C5'	0.06	0.05	0.17	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.06	0.04	0.08	0.12	0.03	0.06	0.17	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.09	0.19	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.03	0.02	0.11	0.27	0.39	0.39
N1	0.01	0.00	0.01	0.17	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.11	0.01	0.08	0.15	0.38	0.34
N3	0.01	0.00	0.06	0.26	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.04	0.02	0.13	0.17	0.34	0.28
N4	0.01	0.00	0.02	0.31	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.33	0.11	0.01	0.20	0.21	0.32	0.27
O2	0.01	0.00	0.16	0.15	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.19	0.04	0.07	0.13	0.35	0.26
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.31	0.23	0.26	0.06	0.20	0.19	0.31	0.33	0.25	0.00	0.03	0.16	0.26	0.07	0.59	0.33
O3'	0.28	0.10	0.02	0.00	0.07	0.03	0.07	0.17	0.03	0.11	0.04	0.11	0.19	0.03	0.00	0.21	0.19	0.76	0.24	0.35
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.16	0.21	0.00	0.04	0.15	0.22	0.25
O5'	0.14	0.09	0.36	0.03	0.17	0.01	0.16	0.00	0.11	0.08	0.13	0.20	0.07	0.26	0.19	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.12	0.13	0.10	0.37	0.20	0.07	0.27	0.03	0.27	0.15	0.17	0.21	0.13	0.07	0.76	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.36	0.54	0.05	0.34	0.07	0.36	0.01	0.39	0.38	0.34	0.32	0.35	0.59	0.24	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.33	0.29	0.41	0.10	0.30	0.06	0.35	0.01	0.39	0.34	0.28	0.27	0.26	0.33	0.35	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.18	0.12	0.21	0.07	0.30	0.13	0.42	0.16	0.18	0.16	0.23	0.15	0.21	0.06	0.21	0.23	0.25	0.63	0.20	0.76	1.30	1.15
C2	0.16	0.12	0.15	0.12	0.08	0.21	0.15	0.31	0.16	0.20	0.12	0.18	0.11	0.24	0.13	0.19	0.14	0.22	0.29	0.23	0.48	1.11	0.83
C2'	0.15	0.15	0.14	0.28	0.07	0.38	0.19	0.54	0.21	0.25	0.15	0.23	0.14	0.32	0.08	0.21	0.33	0.29	0.86	0.29	1.09	1.62	1.47
C3'	0.42	0.18	0.52	0.80	0.19	0.92	0.13	1.19	0.15	0.20	0.15	0.21	0.23	0.14	0.27	0.46	0.86	0.71	1.72	0.20	1.98	2.35	2.34
C4	0.14	0.12	0.24	0.13	0.13	0.14	0.20	0.24	0.22	0.20	0.17	0.18	0.09	0.23	0.15	0.30	0.17	0.14	0.28	0.26	0.57	0.96	0.79
C4'	0.42	0.30	0.49	0.71	0.27	0.82	0.19	0.97	0.19	0.17	0.23	0.34	0.34	0.16	0.28	0.52	0.76	0.64	1.54	0.19	1.59	1.82	1.91
C5	0.17	0.17	0.29	0.15	0.15	0.13	0.21	0.24	0.22	0.22	0.20	0.24	0.13	0.24	0.17	0.41	0.17	0.12	0.41	0.25	0.74	0.98	0.91
C5'	0.34	0.28	0.41	0.61	0.23	0.74	0.17	0.91	0.18	0.14	0.21	0.34	0.31	0.15	0.22	0.57	0.68	0.55	1.61	0.18	1.86	1.78	1.96
C6	0.17	0.18	0.24	0.11	0.13	0.17	0.20	0.28	0.20	0.22	0.19	0.25	0.13	0.24	0.16	0.39	0.12	0.13	0.51	0.24	0.81	1.06	1.01
N1	0.15	0.15	0.14	0.12	0.06	0.22	0.16	0.33	0.18	0.20	0.16	0.22	0.11	0.24	0.11	0.24	0.14	0.20	0.47	0.22	0.68	1.15	0.99
N3	0.14	0.09	0.18	0.10	0.11	0.17	0.18	0.26	0.19	0.20	0.12	0.16	0.09	0.24	0.14	0.23	0.14	0.18	0.22	0.26	0.45	1.01	0.75
N4	0.14	0.12	0.27	0.17	0.15	0.12	0.20	0.21	0.22	0.20	0.18	0.15	0.11	0.23	0.15	0.31	0.22	0.13	0.22	0.27	0.53	0.89	0.73
O2	0.19	0.13	0.19	0.17	0.12	0.24	0.13	0.33	0.11	0.21	0.10	0.17	0.14	0.24	0.16	0.22	0.19	0.26	0.22	0.19	0.33	1.16	0.76
O2'	0.25	0.18	0.21	0.12	0.11	0.12	0.17	0.12	0.15	0.39	0.18	0.26	0.11	0.34	0.23	0.24	0.11	0.21	0.28	0.20	0.46	1.24	0.94
O3'	0.92	0.56	1.09	1.39	0.69	1.41	0.60	1.72	0.48	0.79	0.48	0.53	0.66	0.64	0.82	0.90	1.42	1.18	2.18	0.40	2.17	2.97	2.85
O4'	0.25	0.31	0.25	0.37	0.22	0.46	0.17	0.55	0.20	0.10	0.25	0.35	0.31	0.14	0.15	0.35	0.40	0.39	0.91	0.20	0.97	1.30	1.30
O5'	0.23	0.16	0.24	0.43	0.10	0.60	0.09	0.81	0.12	0.09	0.12	0.22	0.18	0.13	0.10	0.49	0.47	0.46	1.47	0.15	1.91	1.81	1.96
OP1	0.54	0.51	0.64	0.80	0.39	0.91	0.23	1.00	0.22	0.20	0.34	0.65	0.56	0.16	0.37	0.83	0.93	0.71	1.68	0.15	1.98	1.82	2.00
OP2	0.27	0.28	0.25	0.39	0.24	0.58	0.24	0.78	0.24	0.23	0.25	0.34	0.28	0.25	0.22	0.50	0.40	0.50	1.39	0.25	1.91	1.78	1.92
P	0.44	0.50	0.45	0.61	0.40	0.75	0.33	0.89	0.33	0.28	0.41	0.58	0.51	0.27	0.36	0.61	0.66	0.64	1.54	0.29	1.92	1.79	1.96

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.14	0.27	0.14
C2	0.02	0.00	0.20	0.19	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.22	0.13	0.22	0.00	0.12	0.34	0.19
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.11	0.08	0.16	0.15	0.25	0.21	0.12	0.04	0.00	0.02	0.00	0.25	0.07	0.23	0.07	0.11
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.13	0.00	0.13	0.01	0.15	0.14	0.17	0.21	0.17	0.13	0.09	0.01	0.00	0.03	0.35	0.15	0.34	0.21	0.26
C4	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.10	0.06	0.32	0.00	0.24	0.31	0.09
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.03	0.03	0.02	0.08	0.04	0.18	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.10	0.08
C5	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.07	0.03	0.47	0.00	0.44	0.33	0.14
C5'	0.05	0.11	0.11	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.16	0.17	0.13	0.10	0.10	0.18	0.11	0.07	0.12	0.01	0.00	0.18	0.23	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.15	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.11	0.05	0.45	0.00	0.40	0.36	0.15
C8	0.01	0.00	0.16	0.14	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.12	0.09	0.57	0.00	0.63	0.28	0.22
N1	0.02	0.00	0.15	0.17	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.18	0.10	0.33	0.00	0.23	0.36	0.15
N2	0.03	0.00	0.25	0.21	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.28	0.16	0.14	0.01	0.16	0.34	0.25
N3	0.02	0.00	0.21	0.17	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.20	0.13	0.18	0.00	0.10	0.32	0.18
N7	0.00	0.00	0.12	0.13	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.10	0.06	0.61	0.00	0.67	0.31	0.26
N9	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.04	0.01	0.35	0.01	0.32	0.29	0.05
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.13	0.18	0.21	0.07	0.21	0.24	0.17	0.20	0.15	0.27	0.13	0.00	0.04	0.11	0.20	0.25	0.22	0.11	0.16
O3'	0.12	0.22	0.02	0.00	0.10	0.01	0.07	0.12	0.11	0.12	0.18	0.28	0.20	0.10	0.04	0.04	0.00	0.08	0.28	0.10	0.31	0.47	0.36
O4'	0.00	0.13	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.09	0.10	0.16	0.13	0.06	0.01	0.11	0.08	0.00	0.05	0.04	0.07	0.40	0.30
O5'	0.14	0.22	0.25	0.35	0.32	0.01	0.47	0.00	0.45	0.57	0.33	0.14	0.18	0.61	0.35	0.20	0.28	0.05	0.00	0.52	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.10	0.04	0.52	0.00	0.51	0.37	0.21
OP1	0.14	0.12	0.23	0.34	0.24	0.10	0.44	0.23	0.40	0.63	0.23	0.16	0.10	0.67	0.32	0.22	0.31	0.07	0.01	0.51	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.34	0.07	0.21	0.31	0.10	0.33	0.10	0.36	0.28	0.36	0.34	0.32	0.31	0.29	0.11	0.47	0.40	0.02	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.19	0.11	0.26	0.09	0.08	0.14	0.01	0.15	0.22	0.15	0.25	0.18	0.26	0.05	0.16	0.36	0.30	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00