Doublet Group distance statistics: 49553

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.024 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.015, 0.026, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.021, 0.033, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.018, 0.031, 0.043, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.031 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.017, 0.031, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.031 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.040, 0.068, 0.097, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.068 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.032, 0.071, 0.111, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.071 std_dev=0.040
O6	B	0, 0.228, 0.388, 0.548, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.388 std_dev=0.160
C6	B	0, 0.264, 0.442, 0.619, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.442 std_dev=0.177
C5	B	0, 0.270, 0.455, 0.640, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.455 std_dev=0.185
C4	B	0, 0.327, 0.534, 0.740, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.534 std_dev=0.207
N9	B	0, 0.319, 0.541, 0.763, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.541 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.342, 0.581, 0.821, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.581 std_dev=0.240
N7	B	0, 0.280, 0.520, 0.760, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.520 std_dev=0.240
N3	B	0, 0.422, 0.679, 0.935, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.679 std_dev=0.256
C8	B	0, 0.283, 0.549, 0.816, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.549 std_dev=0.267
O4'	A	0, 0.297, 0.568, 0.839, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.568 std_dev=0.271
C2	B	0, 0.430, 0.709, 0.987, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.709 std_dev=0.278
C1'	B	0, 0.386, 0.665, 0.944, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.665 std_dev=0.279
C2'	A	0, 0.246, 0.530, 0.813, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.530 std_dev=0.284
O2'	A	0, 0.280, 0.571, 0.862, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.571 std_dev=0.291
C3'	B	0, 0.374, 0.672, 0.969, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.672 std_dev=0.297
O4'	B	0, 0.180, 0.492, 0.804, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.492 std_dev=0.312
C4'	A	0, 0.497, 0.842, 1.187, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.842 std_dev=0.345
N2	B	0, 0.535, 0.884, 1.234, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.884 std_dev=0.349
C3'	A	0, 0.456, 0.851, 1.246, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.851 std_dev=0.395
C4'	B	0, 0.179, 0.603, 1.027, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.603 std_dev=0.424
O5'	B	0, 0.557, 1.023, 1.489, 1.933 max_d=1.933 avg_d=1.023 std_dev=0.466
C2'	B	0, 0.837, 1.374, 1.910, 1.997 max_d=1.997 avg_d=1.374 std_dev=0.537
O3'	A	0, 0.533, 1.076, 1.618, 1.597 max_d=1.597 avg_d=1.076 std_dev=0.543
C5'	B	0, 0.386, 0.965, 1.545, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.965 std_dev=0.580
C5'	A	0, 0.917, 1.544, 2.171, 2.029 max_d=2.029 avg_d=1.544 std_dev=0.627
P	B	0, 0.282, 0.916, 1.550, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.916 std_dev=0.634
O3'	B	0, 0.352, 1.009, 1.665, 2.672 max_d=2.672 avg_d=1.009 std_dev=0.657
OP1	B	0, 0.622, 1.353, 2.083, 2.472 max_d=2.472 avg_d=1.353 std_dev=0.730
OP2	B	0, 0.955, 1.758, 2.562, 2.726 max_d=2.726 avg_d=1.758 std_dev=0.804
O5'	A	0, 0.486, 1.333, 2.179, 3.390 max_d=3.390 avg_d=1.333 std_dev=0.847
O2'	B	0, 1.613, 2.587, 3.561, 3.393 max_d=3.393 avg_d=2.587 std_dev=0.974
P	A	0, 0.316, 1.610, 2.903, 4.934 max_d=4.934 avg_d=1.610 std_dev=1.294
OP2	A	0, 0.738, 2.378, 4.017, 6.498 max_d=6.498 avg_d=2.378 std_dev=1.639
OP1	A	0, 0.427, 2.145, 3.864, 6.666 max_d=6.666 avg_d=2.145 std_dev=1.718

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.00	0.17	0.23	0.18	0.13
C2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.10	0.03	0.38	0.38	0.59	0.42
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.04	0.14	0.01	0.01	0.00	0.21	0.26	0.16	0.16
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.14	0.04	0.06	0.06	0.13	0.01	0.00	0.01	0.27	0.41	0.17	0.24
C4	0.02	0.02	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.02	0.58	0.74	1.09	0.78
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.03	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.00	0.01	0.19	0.33	0.14
C5	0.02	0.02	0.06	0.12	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.03	0.63	0.79	1.16	0.84
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.14	0.00	0.19	0.00	0.18	0.08	0.09	0.16	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.30	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.54	0.61	0.87	0.65
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.38	0.38	0.55	0.41
N3	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.09	0.03	0.49	0.56	0.85	0.60
N4	0.03	0.02	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.08	0.03	0.63	0.85	1.26	0.89
O2	0.05	0.00	0.14	0.13	0.02	0.06	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.11	0.18	0.06	0.29	0.24	0.38	0.27
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.05	0.11	0.00	0.02	0.02	0.08	0.32	0.36	0.19
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.03	0.13	0.03	0.14	0.04	0.09	0.08	0.18	0.02	0.00	0.02	0.22	0.43	0.38	0.19
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.06	0.02	0.02	0.00	0.09	0.27	0.13	0.10
O5'	0.17	0.38	0.21	0.27	0.58	0.01	0.63	0.01	0.54	0.38	0.49	0.63	0.29	0.08	0.22	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.23	0.38	0.26	0.41	0.74	0.19	0.79	0.12	0.61	0.38	0.56	0.85	0.24	0.32	0.43	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.59	0.16	0.17	1.09	0.33	1.16	0.30	0.87	0.55	0.85	1.26	0.38	0.36	0.38	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.42	0.16	0.24	0.78	0.14	0.84	0.01	0.65	0.41	0.60	0.89	0.27	0.19	0.19	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.23	0.20	0.35	0.25	0.41	0.27	0.50	0.25	0.30	0.23	0.22	0.24	0.31	0.26	0.20	0.41	0.28	0.19	0.25	0.15	0.39	0.15
C2	0.19	0.16	0.20	0.34	0.16	0.42	0.18	0.63	0.20	0.17	0.18	0.16	0.16	0.21	0.16	0.13	0.34	0.26	0.21	0.22	0.17	0.37	0.21
C2'	0.20	0.17	0.16	0.31	0.20	0.35	0.25	0.41	0.24	0.30	0.19	0.15	0.17	0.33	0.22	0.20	0.39	0.21	0.19	0.26	0.24	0.48	0.22
C3'	0.11	0.09	0.12	0.26	0.10	0.27	0.16	0.27	0.15	0.20	0.10	0.11	0.09	0.23	0.11	0.23	0.37	0.12	0.26	0.19	0.31	0.49	0.23
C4	0.18	0.12	0.19	0.28	0.11	0.37	0.10	0.55	0.14	0.11	0.14	0.12	0.12	0.10	0.13	0.11	0.29	0.29	0.19	0.16	0.29	0.24	0.16
C4'	0.14	0.15	0.12	0.26	0.13	0.25	0.16	0.20	0.16	0.19	0.14	0.17	0.15	0.21	0.13	0.22	0.41	0.13	0.32	0.18	0.44	0.58	0.34
C5	0.14	0.17	0.14	0.24	0.13	0.32	0.16	0.46	0.19	0.12	0.19	0.18	0.15	0.16	0.11	0.13	0.26	0.26	0.20	0.20	0.25	0.22	0.12
C5'	0.20	0.21	0.27	0.32	0.17	0.29	0.15	0.42	0.16	0.17	0.18	0.26	0.21	0.17	0.16	0.35	0.43	0.18	0.52	0.16	0.62	0.82	0.58
C6	0.17	0.21	0.14	0.24	0.21	0.31	0.23	0.43	0.23	0.22	0.22	0.21	0.21	0.24	0.19	0.17	0.29	0.21	0.17	0.23	0.18	0.28	0.11
N1	0.20	0.21	0.17	0.31	0.21	0.39	0.24	0.54	0.23	0.24	0.22	0.20	0.20	0.27	0.20	0.16	0.35	0.24	0.17	0.24	0.10	0.30	0.11
N3	0.19	0.11	0.21	0.32	0.12	0.41	0.12	0.63	0.15	0.12	0.13	0.12	0.12	0.12	0.14	0.12	0.31	0.27	0.20	0.18	0.26	0.34	0.22
N4	0.22	0.10	0.21	0.29	0.15	0.37	0.10	0.55	0.07	0.16	0.09	0.10	0.14	0.11	0.19	0.12	0.30	0.32	0.20	0.09	0.36	0.24	0.19
O2	0.20	0.16	0.22	0.38	0.16	0.46	0.19	0.68	0.20	0.19	0.18	0.15	0.16	0.22	0.17	0.15	0.38	0.26	0.27	0.23	0.19	0.49	0.29
O2'	0.28	0.21	0.25	0.38	0.27	0.42	0.31	0.46	0.28	0.38	0.23	0.19	0.23	0.39	0.30	0.25	0.45	0.29	0.27	0.30	0.40	0.64	0.39
O3'	0.11	0.07	0.13	0.27	0.09	0.25	0.16	0.21	0.16	0.21	0.09	0.11	0.08	0.25	0.11	0.25	0.40	0.11	0.28	0.21	0.35	0.54	0.25
O4'	0.20	0.22	0.12	0.30	0.20	0.35	0.21	0.33	0.21	0.21	0.21	0.23	0.22	0.23	0.19	0.17	0.42	0.22	0.29	0.21	0.39	0.38	0.23
O5'	0.24	0.45	0.21	0.27	0.40	0.18	0.44	0.23	0.49	0.35	0.48	0.45	0.41	0.41	0.33	0.24	0.43	0.24	0.31	0.51	0.32	0.53	0.22
OP1	0.23	0.63	0.32	0.48	0.42	0.36	0.45	0.48	0.57	0.27	0.65	0.72	0.52	0.34	0.28	0.39	0.55	0.24	0.68	0.60	0.50	0.69	0.62
OP2	0.86	1.35	0.70	0.54	1.15	0.56	1.12	0.46	1.23	0.85	1.33	1.43	1.27	0.95	0.97	0.74	0.58	0.78	0.38	1.21	0.27	0.51	0.21
P	0.37	0.77	0.25	0.22	0.62	0.18	0.63	0.27	0.72	0.42	0.78	0.83	0.70	0.52	0.48	0.32	0.34	0.36	0.31	0.73	0.14	0.49	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.10	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.00	0.28	0.04	0.45	0.22	0.17
C2	0.04	0.00	0.10	0.07	0.02	0.07	0.02	0.21	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.18	0.19	0.10	0.30	0.02	0.43	0.27	0.19
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.10	0.04	0.07	0.08	0.13	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.25	0.03	0.60	0.20	0.25
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.04	0.10	0.05	0.10	0.06	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.56	0.13	0.23
C4	0.02	0.02	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.24	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.06	0.32	0.02	0.43	0.29	0.22
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.14	0.08	0.10	0.07	0.14	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.11	0.40	0.15	0.08
C5	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.09	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.09	0.05	0.35	0.02	0.43	0.36	0.27
C5'	0.10	0.21	0.10	0.02	0.24	0.01	0.32	0.00	0.32	0.36	0.27	0.18	0.18	0.38	0.24	0.07	0.06	0.03	0.01	0.35	0.34	0.19	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.09	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.13	0.12	0.07	0.34	0.01	0.43	0.37	0.28
C8	0.02	0.02	0.07	0.10	0.01	0.14	0.01	0.36	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.06	0.06	0.37	0.03	0.43	0.37	0.28
N1	0.04	0.01	0.08	0.05	0.02	0.08	0.01	0.27	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.16	0.09	0.32	0.01	0.43	0.32	0.23
N2	0.06	0.01	0.13	0.10	0.02	0.10	0.02	0.18	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.22	0.23	0.12	0.27	0.02	0.43	0.25	0.17
N3	0.04	0.01	0.10	0.06	0.01	0.07	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.17	0.18	0.10	0.29	0.02	0.44	0.25	0.18
N7	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.14	0.00	0.38	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.06	0.05	0.37	0.03	0.42	0.42	0.31
N9	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.24	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.33	0.03	0.44	0.28	0.21
O2'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.11	0.05	0.11	0.07	0.13	0.12	0.16	0.22	0.17	0.12	0.07	0.00	0.03	0.04	0.19	0.13	0.64	0.17	0.27
O3'	0.09	0.19	0.02	0.01	0.12	0.01	0.09	0.06	0.12	0.06	0.16	0.23	0.18	0.06	0.07	0.03	0.00	0.09	0.16	0.11	0.56	0.11	0.24
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.09	0.12	0.10	0.05	0.02	0.04	0.09	0.00	0.30	0.08	0.30	0.34	0.20
O5'	0.28	0.30	0.25	0.13	0.32	0.02	0.35	0.01	0.34	0.37	0.32	0.27	0.29	0.37	0.33	0.19	0.16	0.30	0.00	0.35	0.01	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.11	0.02	0.35	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.13	0.11	0.08	0.35	0.00	0.43	0.41	0.31
OP1	0.45	0.43	0.60	0.56	0.43	0.40	0.43	0.34	0.43	0.43	0.43	0.43	0.44	0.42	0.44	0.64	0.56	0.30	0.01	0.43	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.27	0.20	0.13	0.29	0.15	0.36	0.19	0.37	0.37	0.32	0.25	0.25	0.42	0.28	0.17	0.11	0.34	0.02	0.41	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.19	0.25	0.23	0.22	0.08	0.27	0.01	0.28	0.28	0.23	0.17	0.18	0.31	0.21	0.27	0.24	0.20	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00