Doublet Group distance statistics: 49556

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.019, 0.039, 0.060, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.039 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.017, 0.042, 0.067, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.042 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.068, 0.145, 0.223, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.145 std_dev=0.077
O4'	A	0, 0.039, 0.124, 0.210, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.124 std_dev=0.086
N1	B	0, 0.107, 0.195, 0.282, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.195 std_dev=0.087
C2	B	0, 0.129, 0.238, 0.347, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.238 std_dev=0.109
C6	B	0, 0.111, 0.229, 0.346, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.229 std_dev=0.117
N2	B	0, 0.134, 0.257, 0.379, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.257 std_dev=0.122
O6	B	0, 0.106, 0.242, 0.378, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.242 std_dev=0.136
C3'	A	0, 0.132, 0.281, 0.431, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.281 std_dev=0.150
N3	B	0, 0.157, 0.310, 0.464, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.310 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.172, 0.327, 0.481, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.327 std_dev=0.155
C4'	A	0, 0.160, 0.316, 0.471, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.316 std_dev=0.156
C5	B	0, 0.134, 0.293, 0.451, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.293 std_dev=0.158
C4	B	0, 0.150, 0.317, 0.484, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.317 std_dev=0.167
C5'	A	0, 0.237, 0.434, 0.631, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.434 std_dev=0.197
N7	B	0, 0.151, 0.353, 0.556, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.353 std_dev=0.203
P	A	0, 0.242, 0.447, 0.651, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.447 std_dev=0.204
N9	B	0, 0.166, 0.374, 0.583, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.374 std_dev=0.208
C8	B	0, 0.167, 0.391, 0.614, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.391 std_dev=0.223
C1'	B	0, 0.177, 0.410, 0.642, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.410 std_dev=0.233
O3'	A	0, 0.174, 0.416, 0.657, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.416 std_dev=0.241
P	B	0, 0.211, 0.454, 0.697, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.454 std_dev=0.243
O4'	B	0, 0.209, 0.461, 0.714, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.461 std_dev=0.253
O5'	A	0, 0.328, 0.616, 0.903, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.616 std_dev=0.288
O5'	B	0, 0.285, 0.580, 0.875, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.580 std_dev=0.295
C2'	B	0, 0.314, 0.625, 0.936, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.625 std_dev=0.311
O2'	B	0, 0.350, 0.693, 1.035, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.693 std_dev=0.343
OP2	B	0, 0.237, 0.586, 0.935, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.586 std_dev=0.349
OP1	B	0, 0.297, 0.648, 0.999, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.648 std_dev=0.351
OP1	A	0, 0.391, 0.774, 1.157, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.774 std_dev=0.383
C3'	B	0, 0.409, 0.792, 1.176, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.792 std_dev=0.383
OP2	A	0, 0.117, 0.520, 0.922, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.520 std_dev=0.403
C4'	B	0, 0.306, 0.728, 1.149, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.728 std_dev=0.422
O3'	B	0, 0.542, 1.032, 1.521, 1.468 max_d=1.468 avg_d=1.032 std_dev=0.490
C5'	B	0, 0.371, 1.142, 1.913, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.142 std_dev=0.771

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.23	0.15	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.03	0.28	0.24	0.05
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.04	0.07	0.08	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.15	0.24	0.08
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.02	0.10	0.06	0.10	0.12	0.08	0.03	0.01	0.01	0.10	0.12	0.26	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.14	0.02	0.06	0.38	0.26	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.05	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.19	0.15	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.09	0.39	0.22	0.11
C5'	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.04	0.06	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.19	0.13	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.10	0.33	0.18	0.08
N1	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.27	0.20	0.05
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.03	0.33	0.26	0.08
N4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.16	0.03	0.06	0.41	0.29	0.11
O2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.03	0.03	0.25	0.23	0.04
O2'	0.01	0.05	0.00	0.03	0.06	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.06	0.06	0.00	0.08	0.02	0.06	0.18	0.24	0.07
O3'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.14	0.02	0.14	0.05	0.11	0.07	0.12	0.16	0.07	0.08	0.00	0.02	0.17	0.19	0.30	0.12
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.06	0.25	0.07	0.07
O5'	0.06	0.03	0.06	0.10	0.06	0.02	0.09	0.02	0.10	0.06	0.03	0.06	0.03	0.06	0.17	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.23	0.28	0.15	0.12	0.38	0.19	0.39	0.19	0.33	0.27	0.33	0.41	0.25	0.18	0.19	0.25	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.15	0.24	0.24	0.26	0.26	0.15	0.22	0.13	0.18	0.20	0.26	0.29	0.23	0.24	0.30	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.05	0.08	0.10	0.10	0.02	0.11	0.02	0.08	0.05	0.08	0.11	0.04	0.07	0.12	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.09	0.17	0.20	0.10	0.15	0.09	0.24	0.09	0.13	0.09	0.10	0.10	0.10	0.13	0.16	0.22	0.16	0.29	0.10	0.21	0.24	0.10
C2	0.10	0.07	0.12	0.25	0.08	0.20	0.08	0.40	0.07	0.11	0.08	0.08	0.07	0.10	0.10	0.11	0.23	0.11	0.25	0.08	0.14	0.23	0.05
C2'	0.15	0.08	0.19	0.22	0.09	0.16	0.10	0.23	0.10	0.15	0.09	0.09	0.08	0.13	0.13	0.17	0.26	0.17	0.29	0.13	0.23	0.24	0.11
C3'	0.15	0.09	0.23	0.26	0.07	0.16	0.06	0.22	0.07	0.11	0.09	0.12	0.08	0.08	0.11	0.19	0.31	0.17	0.22	0.10	0.24	0.23	0.08
C4	0.05	0.11	0.07	0.29	0.07	0.27	0.07	0.52	0.08	0.06	0.12	0.14	0.09	0.06	0.06	0.08	0.27	0.12	0.21	0.08	0.11	0.29	0.07
C4'	0.16	0.06	0.22	0.23	0.06	0.17	0.05	0.20	0.06	0.12	0.06	0.07	0.06	0.08	0.12	0.20	0.29	0.19	0.23	0.07	0.28	0.20	0.11
C5	0.05	0.14	0.07	0.28	0.09	0.24	0.08	0.45	0.10	0.06	0.13	0.15	0.12	0.06	0.06	0.09	0.27	0.11	0.20	0.08	0.14	0.32	0.09
C5'	0.19	0.08	0.27	0.28	0.10	0.19	0.09	0.21	0.08	0.13	0.08	0.08	0.09	0.10	0.14	0.24	0.35	0.21	0.17	0.08	0.31	0.18	0.15
C6	0.08	0.13	0.11	0.25	0.10	0.18	0.09	0.35	0.11	0.07	0.12	0.13	0.11	0.07	0.08	0.11	0.25	0.09	0.23	0.10	0.18	0.30	0.09
N1	0.10	0.09	0.13	0.23	0.08	0.17	0.08	0.33	0.09	0.09	0.09	0.10	0.08	0.07	0.09	0.12	0.23	0.11	0.25	0.09	0.17	0.25	0.07
N3	0.07	0.09	0.09	0.27	0.07	0.24	0.08	0.48	0.08	0.09	0.10	0.10	0.07	0.09	0.08	0.08	0.25	0.11	0.23	0.08	0.11	0.25	0.05
N4	0.05	0.11	0.07	0.31	0.07	0.32	0.07	0.59	0.08	0.06	0.11	0.15	0.09	0.06	0.06	0.09	0.28	0.16	0.21	0.08	0.09	0.31	0.09
O2	0.13	0.06	0.14	0.24	0.09	0.20	0.10	0.38	0.07	0.15	0.06	0.07	0.07	0.14	0.12	0.12	0.23	0.13	0.27	0.08	0.14	0.20	0.07
O2'	0.20	0.11	0.21	0.21	0.14	0.22	0.16	0.24	0.15	0.21	0.12	0.11	0.12	0.20	0.18	0.21	0.26	0.24	0.38	0.17	0.29	0.27	0.20
O3'	0.15	0.10	0.23	0.25	0.06	0.16	0.06	0.20	0.07	0.12	0.09	0.13	0.08	0.10	0.10	0.20	0.31	0.18	0.22	0.10	0.27	0.21	0.09
O4'	0.15	0.06	0.19	0.20	0.07	0.16	0.05	0.21	0.06	0.11	0.06	0.07	0.07	0.07	0.11	0.17	0.24	0.16	0.26	0.07	0.23	0.21	0.09
O5'	0.25	0.15	0.30	0.34	0.18	0.24	0.16	0.27	0.14	0.19	0.14	0.13	0.17	0.16	0.21	0.29	0.40	0.25	0.28	0.13	0.39	0.20	0.24
OP1	0.37	0.51	0.43	0.43	0.43	0.33	0.39	0.34	0.41	0.31	0.46	0.55	0.50	0.33	0.38	0.30	0.43	0.36	0.34	0.38	0.37	0.53	0.37
OP2	0.22	0.17	0.19	0.21	0.11	0.25	0.10	0.26	0.14	0.11	0.17	0.20	0.14	0.08	0.13	0.18	0.23	0.26	0.23	0.16	0.34	0.39	0.23
P	0.14	0.16	0.12	0.18	0.12	0.11	0.10	0.12	0.12	0.08	0.14	0.18	0.15	0.08	0.11	0.09	0.24	0.15	0.17	0.11	0.29	0.32	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.22	0.01	0.30	0.21	0.11
C2	0.04	0.00	0.08	0.24	0.01	0.32	0.01	0.60	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.20	0.16	0.30	0.01	0.16	0.28	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.11	0.08	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.25	0.03	0.33	0.33	0.17
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.13	0.00	0.12	0.02	0.16	0.03	0.21	0.28	0.21	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.30	0.15	0.42	0.40	0.26
C4	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.18	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.08	0.29	0.01	0.20	0.18	0.08
C4'	0.02	0.32	0.04	0.00	0.18	0.00	0.14	0.00	0.20	0.05	0.28	0.38	0.29	0.05	0.06	0.09	0.02	0.00	0.03	0.18	0.28	0.25	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.14	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.04	0.34	0.01	0.19	0.14	0.10
C5'	0.03	0.60	0.03	0.02	0.36	0.00	0.33	0.00	0.44	0.09	0.56	0.69	0.52	0.17	0.16	0.10	0.08	0.02	0.01	0.41	0.41	0.32	0.03
C6	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.20	0.01	0.44	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.07	0.33	0.00	0.16	0.17	0.11
C8	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.08	0.37	0.01	0.30	0.14	0.16
N1	0.03	0.00	0.06	0.21	0.01	0.28	0.01	0.56	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.13	0.32	0.01	0.16	0.24	0.14
N2	0.06	0.00	0.11	0.28	0.02	0.38	0.02	0.69	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.15	0.25	0.19	0.30	0.01	0.17	0.34	0.19
N3	0.04	0.01	0.08	0.21	0.01	0.29	0.01	0.52	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.16	0.16	0.27	0.01	0.16	0.25	0.11
N7	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.37	0.01	0.25	0.10	0.15
N9	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.30	0.01	0.27	0.17	0.11
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.07	0.09	0.06	0.10	0.08	0.05	0.10	0.15	0.11	0.05	0.04	0.00	0.07	0.06	0.12	0.07	0.28	0.31	0.10
O3'	0.03	0.20	0.04	0.01	0.09	0.02	0.09	0.08	0.13	0.02	0.18	0.25	0.16	0.04	0.03	0.07	0.00	0.02	0.22	0.13	0.42	0.49	0.29
O4'	0.00	0.16	0.02	0.02	0.08	0.00	0.04	0.02	0.07	0.08	0.13	0.19	0.16	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.21	0.05	0.31	0.23	0.16
O5'	0.22	0.30	0.25	0.30	0.29	0.03	0.34	0.01	0.33	0.37	0.32	0.30	0.27	0.37	0.30	0.12	0.22	0.21	0.00	0.35	0.03	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.18	0.01	0.41	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.05	0.35	0.00	0.15	0.15	0.12
OP1	0.30	0.16	0.33	0.42	0.20	0.28	0.19	0.41	0.16	0.30	0.16	0.17	0.16	0.25	0.27	0.28	0.42	0.31	0.03	0.15	0.00	0.02	0.00
OP2	0.21	0.28	0.33	0.40	0.18	0.25	0.14	0.32	0.17	0.14	0.24	0.34	0.25	0.10	0.17	0.31	0.49	0.23	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.17	0.26	0.08	0.05	0.10	0.03	0.11	0.16	0.14	0.19	0.11	0.15	0.11	0.10	0.29	0.16	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00