Doublet Group distance statistics: 49557

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C6	A	0, -0.002, 0.013, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.002, 0.019, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.002, 0.025, 0.049, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.002, 0.035, 0.069, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.035 std_dev=0.034
C2	B	0, 0.105, 0.267, 0.430, 0.389 max_d=0.389 avg_d=0.267 std_dev=0.162
N2	B	0, 0.078, 0.271, 0.464, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.271 std_dev=0.193
O4'	A	0, 0.004, 0.199, 0.394, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.199 std_dev=0.195
N1	B	0, 0.059, 0.263, 0.466, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.263 std_dev=0.204
C2'	A	0, 0.004, 0.277, 0.550, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.277 std_dev=0.273
N3	B	0, 0.148, 0.438, 0.729, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.438 std_dev=0.290
C6	B	0, 0.145, 0.455, 0.766, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.455 std_dev=0.310
C4'	A	0, -0.005, 0.342, 0.689, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.342 std_dev=0.347
C4	B	0, 0.181, 0.561, 0.941, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.561 std_dev=0.380
C5	B	0, 0.207, 0.589, 0.971, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.589 std_dev=0.382
O6	B	0, 0.158, 0.560, 0.962, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.560 std_dev=0.402
C3'	A	0, 0.008, 0.416, 0.824, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.416 std_dev=0.408
C5'	A	0, 0.007, 0.496, 0.984, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.496 std_dev=0.489
O2'	A	0, -0.019, 0.489, 0.996, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.489 std_dev=0.507
N7	B	0, 0.275, 0.817, 1.358, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.817 std_dev=0.541
N9	B	0, 0.221, 0.769, 1.317, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.769 std_dev=0.548
O2'	B	0, 0.318, 0.928, 1.538, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.928 std_dev=0.610
C8	B	0, 0.271, 0.896, 1.521, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.896 std_dev=0.625
C1'	B	0, 0.233, 0.896, 1.560, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.896 std_dev=0.664
C2'	B	0, 0.280, 0.960, 1.640, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.960 std_dev=0.680
P	A	0, 0.247, 0.956, 1.664, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.956 std_dev=0.708
OP1	A	0, 0.267, 0.991, 1.715, 2.021 max_d=2.021 avg_d=0.991 std_dev=0.724
O3'	A	0, -0.014, 0.711, 1.435, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.711 std_dev=0.724
OP2	A	0, 0.229, 0.970, 1.711, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.970 std_dev=0.741
O5'	A	0, 0.429, 1.242, 2.055, 2.072 max_d=2.072 avg_d=1.242 std_dev=0.813
O4'	B	0, 0.177, 1.024, 1.870, 1.991 max_d=1.991 avg_d=1.024 std_dev=0.846
C4'	B	0, 0.252, 1.305, 2.359, 2.488 max_d=2.488 avg_d=1.305 std_dev=1.054
C5'	B	0, 0.249, 1.312, 2.376, 2.786 max_d=2.786 avg_d=1.312 std_dev=1.064
C3'	B	0, 0.320, 1.547, 2.773, 3.039 max_d=3.039 avg_d=1.547 std_dev=1.226
O5'	B	0, 0.251, 1.530, 2.810, 3.355 max_d=3.355 avg_d=1.530 std_dev=1.280
P	B	0, 0.204, 1.654, 3.103, 3.849 max_d=3.849 avg_d=1.654 std_dev=1.450
OP2	B	0, 0.124, 1.759, 3.393, 4.033 max_d=4.033 avg_d=1.759 std_dev=1.634
OP1	B	0, 0.266, 1.970, 3.675, 4.459 max_d=4.459 avg_d=1.970 std_dev=1.704
O3'	B	0, 0.220, 1.996, 3.771, 4.506 max_d=4.506 avg_d=1.996 std_dev=1.776

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.17	0.00	0.19	0.21	0.31	0.08
C2	0.02	0.00	0.12	0.11	0.00	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.10	0.10	0.38	0.30	0.30	0.24
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.12	0.09	0.15	0.01	0.08	0.02	0.22	0.00	0.03	0.03	0.25	0.39	0.66	0.39
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.17	0.00	0.18	0.00	0.17	0.12	0.14	0.18	0.09	0.01	0.00	0.01	0.37	0.35	0.49	0.37
C4	0.01	0.00	0.02	0.17	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.06	0.05	0.54	0.45	0.42	0.42
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.09	0.03	0.03	0.03	0.07	0.19	0.03	0.00	0.01	0.25	0.31	0.05
C5	0.02	0.01	0.12	0.18	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.13	0.02	0.59	0.49	0.45	0.47
C5'	0.03	0.09	0.09	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.09	0.06	0.12	0.11	0.12	0.02	0.01	0.33	0.30	0.02
C6	0.02	0.00	0.15	0.17	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.11	0.05	0.53	0.41	0.37	0.38
N1	0.00	0.00	0.01	0.12	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.03	0.02	0.39	0.30	0.29	0.24
N3	0.01	0.00	0.08	0.14	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.06	0.09	0.46	0.37	0.35	0.33
N4	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.09	0.05	0.58	0.50	0.47	0.47
O2	0.04	0.00	0.22	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.20	0.13	0.29	0.25	0.27	0.16
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.23	0.19	0.32	0.11	0.31	0.14	0.13	0.25	0.21	0.00	0.03	0.11	0.14	0.34	0.61	0.29
O3'	0.17	0.10	0.03	0.00	0.06	0.03	0.13	0.12	0.11	0.03	0.06	0.09	0.20	0.03	0.00	0.10	0.44	0.36	0.40	0.36
O4'	0.00	0.10	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.02	0.09	0.05	0.13	0.11	0.10	0.00	0.30	0.29	0.24	0.12
O5'	0.19	0.38	0.25	0.37	0.54	0.01	0.59	0.01	0.53	0.39	0.46	0.58	0.29	0.14	0.44	0.30	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.30	0.39	0.35	0.45	0.25	0.49	0.33	0.41	0.30	0.37	0.50	0.25	0.34	0.36	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.30	0.66	0.49	0.42	0.31	0.45	0.30	0.37	0.29	0.35	0.47	0.27	0.61	0.40	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.24	0.39	0.37	0.42	0.05	0.47	0.02	0.38	0.24	0.33	0.47	0.16	0.29	0.36	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.12	0.16	0.16	0.16	0.27	0.18	0.34	0.18	0.21	0.16	0.14	0.13	0.21	0.18	0.18	0.53	0.23	0.49	0.22	0.78	0.40	0.34
C2	0.18	0.05	0.15	0.20	0.12	0.27	0.11	0.32	0.14	0.15	0.09	0.11	0.13	0.14	0.15	0.24	0.49	0.22	0.49	0.21	0.84	0.37	0.35
C2'	0.19	0.09	0.19	0.21	0.17	0.29	0.22	0.37	0.22	0.27	0.13	0.15	0.13	0.28	0.21	0.20	0.45	0.24	0.54	0.31	0.71	0.25	0.23
C3'	0.13	0.09	0.13	0.15	0.13	0.28	0.18	0.41	0.22	0.19	0.18	0.08	0.07	0.20	0.15	0.16	0.44	0.22	0.45	0.31	0.71	0.32	0.23
C4	0.37	0.10	0.30	0.43	0.21	0.43	0.15	0.47	0.16	0.26	0.09	0.12	0.23	0.20	0.30	0.32	0.39	0.40	0.72	0.27	0.47	0.14	0.17
C4'	0.16	0.21	0.18	0.14	0.18	0.11	0.20	0.26	0.22	0.20	0.24	0.23	0.17	0.21	0.18	0.22	0.36	0.08	0.55	0.26	0.69	0.40	0.30
C5	0.38	0.09	0.34	0.47	0.25	0.46	0.20	0.53	0.17	0.33	0.08	0.09	0.23	0.27	0.34	0.30	0.37	0.42	0.77	0.29	0.34	0.18	0.20
C5'	0.26	0.37	0.30	0.30	0.30	0.09	0.30	0.21	0.35	0.27	0.40	0.40	0.32	0.27	0.27	0.31	0.24	0.09	0.64	0.36	0.57	0.36	0.27
C6	0.31	0.08	0.29	0.36	0.23	0.37	0.21	0.45	0.18	0.30	0.10	0.07	0.19	0.27	0.29	0.27	0.34	0.33	0.67	0.28	0.47	0.06	0.12
N1	0.22	0.08	0.20	0.23	0.17	0.29	0.17	0.36	0.17	0.22	0.11	0.09	0.15	0.20	0.21	0.22	0.42	0.25	0.56	0.23	0.69	0.26	0.24
N3	0.26	0.08	0.20	0.27	0.14	0.31	0.11	0.34	0.15	0.17	0.08	0.13	0.18	0.14	0.20	0.30	0.41	0.26	0.56	0.24	0.75	0.20	0.25
N4	0.46	0.13	0.36	0.56	0.24	0.56	0.17	0.57	0.18	0.29	0.11	0.15	0.25	0.22	0.34	0.38	0.51	0.52	0.85	0.29	0.31	0.43	0.35
O2	0.09	0.06	0.08	0.19	0.06	0.29	0.09	0.31	0.12	0.09	0.09	0.12	0.08	0.11	0.08	0.23	0.63	0.20	0.43	0.17	1.02	0.58	0.53
O2'	0.21	0.26	0.20	0.22	0.19	0.29	0.19	0.33	0.18	0.26	0.21	0.40	0.23	0.26	0.21	0.22	0.56	0.25	0.63	0.22	0.70	0.24	0.29
O3'	0.20	0.20	0.20	0.20	0.19	0.23	0.20	0.37	0.23	0.21	0.22	0.23	0.20	0.21	0.20	0.25	0.35	0.18	0.58	0.30	0.63	0.17	0.16
O4'	0.14	0.15	0.15	0.11	0.15	0.12	0.18	0.24	0.19	0.20	0.18	0.19	0.13	0.21	0.16	0.20	0.39	0.09	0.57	0.22	0.71	0.45	0.35
O5'	0.40	0.36	0.39	0.37	0.39	0.54	0.39	0.65	0.38	0.40	0.36	0.34	0.38	0.40	0.40	0.43	0.62	0.53	0.44	0.37	0.89	0.73	0.55
OP1	0.18	0.19	0.17	0.06	0.17	0.25	0.18	0.36	0.16	0.20	0.17	0.24	0.18	0.21	0.18	0.39	0.34	0.26	0.39	0.18	0.76	0.53	0.39
OP2	0.18	0.14	0.20	0.18	0.17	0.14	0.19	0.23	0.18	0.23	0.15	0.15	0.14	0.24	0.19	0.39	0.25	0.16	0.47	0.21	0.69	0.42	0.35
P	0.18	0.12	0.17	0.07	0.16	0.25	0.18	0.37	0.16	0.21	0.12	0.12	0.14	0.22	0.18	0.37	0.35	0.26	0.38	0.18	0.74	0.55	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.35	0.00	0.30	0.01	0.28	0.71	0.22
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.20	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.59	0.22	0.40	0.01	0.77	0.92	0.53
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.22	0.05	0.04	0.06	0.09	0.07	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.10	0.04	0.10	0.74	0.21
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.17	0.02	0.14	0.31	0.03	0.16	0.09	0.29	0.14	0.00	0.01	0.01	0.17	0.19	0.12	0.73	0.22
C4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.35	0.11	0.41	0.01	0.53	0.77	0.36
C4'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.06	0.14	0.14	0.26	0.19	0.10	0.03	0.25	0.04	0.00	0.02	0.03	0.12	0.74	0.20
C5	0.00	0.01	0.03	0.17	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.18	0.06	0.47	0.01	0.53	0.66	0.33
C5'	0.08	0.25	0.22	0.02	0.16	0.00	0.13	0.00	0.16	0.07	0.22	0.29	0.23	0.07	0.09	0.04	0.19	0.01	0.00	0.13	0.25	0.42	0.00
C6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.26	0.10	0.48	0.00	0.65	0.71	0.40
C8	0.01	0.01	0.04	0.31	0.01	0.14	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.11	0.09	0.46	0.02	0.36	0.51	0.21
N1	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.14	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.45	0.17	0.44	0.01	0.76	0.82	0.49
N2	0.03	0.00	0.09	0.16	0.00	0.26	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.74	0.26	0.38	0.01	0.87	0.99	0.61
N3	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.19	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.59	0.21	0.37	0.01	0.65	0.91	0.47
N7	0.01	0.01	0.02	0.29	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.34	0.08	0.04	0.49	0.02	0.43	0.52	0.25
N9	0.00	0.00	0.01	0.14	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.19	0.01	0.40	0.01	0.38	0.67	0.25
O2'	0.03	0.13	0.00	0.00	0.07	0.25	0.19	0.04	0.14	0.36	0.06	0.22	0.14	0.34	0.16	0.00	0.04	0.16	0.22	0.19	0.24	0.47	0.13
O3'	0.35	0.59	0.05	0.01	0.35	0.04	0.18	0.19	0.26	0.11	0.45	0.74	0.59	0.08	0.19	0.04	0.00	0.26	0.17	0.17	0.24	0.87	0.22
O4'	0.00	0.22	0.02	0.01	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.09	0.17	0.26	0.21	0.04	0.01	0.16	0.26	0.00	0.42	0.07	0.37	0.73	0.28
O5'	0.30	0.40	0.10	0.17	0.41	0.02	0.47	0.00	0.48	0.46	0.44	0.38	0.37	0.49	0.40	0.22	0.17	0.42	0.00	0.51	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.19	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.17	0.07	0.51	0.00	0.66	0.64	0.40
OP1	0.28	0.77	0.10	0.12	0.53	0.12	0.53	0.25	0.65	0.36	0.76	0.87	0.65	0.43	0.38	0.24	0.24	0.37	0.01	0.66	0.00	0.01	0.00
OP2	0.71	0.92	0.74	0.73	0.77	0.74	0.66	0.42	0.71	0.51	0.82	0.99	0.91	0.52	0.67	0.47	0.87	0.73	0.01	0.64	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.53	0.21	0.22	0.36	0.20	0.33	0.00	0.40	0.21	0.49	0.61	0.47	0.25	0.25	0.13	0.22	0.28	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00