Doublet Group distance statistics: 49558

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.013, 0.049, 0.086, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.049 std_dev=0.036
N4	A	0, 0.006, 0.059, 0.112, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.059 std_dev=0.053
C2'	A	0, 0.053, 0.184, 0.316, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.184 std_dev=0.131
O2'	A	0, 0.092, 0.227, 0.362, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.227 std_dev=0.135
C6	B	0, 0.134, 0.279, 0.423, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.279 std_dev=0.145
O4'	A	0, 0.045, 0.198, 0.352, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.198 std_dev=0.154
C5	B	0, 0.151, 0.309, 0.468, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.309 std_dev=0.158
N1	B	0, 0.126, 0.293, 0.459, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.293 std_dev=0.166
O6	B	0, 0.104, 0.274, 0.445, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.274 std_dev=0.171
N7	B	0, 0.170, 0.357, 0.543, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.357 std_dev=0.187
C4	B	0, 0.146, 0.333, 0.520, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.333 std_dev=0.187
C2	B	0, 0.127, 0.320, 0.514, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.320 std_dev=0.194
N3	B	0, 0.137, 0.338, 0.538, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.338 std_dev=0.200
N9	B	0, 0.170, 0.390, 0.610, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.390 std_dev=0.220
C8	B	0, 0.178, 0.400, 0.623, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.400 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.052, 0.285, 0.518, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.285 std_dev=0.233
C4'	A	0, 0.032, 0.266, 0.501, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.266 std_dev=0.235
N2	B	0, 0.116, 0.357, 0.599, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.357 std_dev=0.241
C1'	B	0, 0.195, 0.461, 0.727, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.461 std_dev=0.266
C2'	B	0, 0.212, 0.478, 0.744, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.478 std_dev=0.266
C3'	B	0, 0.239, 0.517, 0.795, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.517 std_dev=0.278
O3'	A	0, 0.065, 0.364, 0.663, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.364 std_dev=0.299
O4'	B	0, 0.218, 0.546, 0.874, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.546 std_dev=0.328
C4'	B	0, 0.247, 0.582, 0.918, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.582 std_dev=0.336
O2'	B	0, 0.255, 0.603, 0.952, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.603 std_dev=0.348
O3'	B	0, 0.285, 0.638, 0.990, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.638 std_dev=0.353
O5'	A	0, 0.103, 0.524, 0.945, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.524 std_dev=0.421
C5'	A	0, 0.073, 0.499, 0.925, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.499 std_dev=0.426
O5'	B	0, 0.372, 0.853, 1.334, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.853 std_dev=0.481
C5'	B	0, 0.384, 0.876, 1.368, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.876 std_dev=0.492
OP2	A	0, 0.150, 0.685, 1.219, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.685 std_dev=0.534
P	A	0, 0.116, 0.672, 1.229, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.672 std_dev=0.556
OP1	A	0, 0.095, 0.869, 1.643, 2.063 max_d=2.063 avg_d=0.869 std_dev=0.774
P	B	0, 0.384, 1.495, 2.606, 2.945 max_d=2.945 avg_d=1.495 std_dev=1.111
OP1	B	0, 0.433, 1.723, 3.013, 3.360 max_d=3.360 avg_d=1.723 std_dev=1.290
OP2	B	0, 0.237, 2.628, 5.019, 5.661 max_d=5.661 avg_d=2.628 std_dev=2.391

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.05	0.10	0.06
C2	0.04	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.04	0.14	0.16	0.25	0.17
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.06	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.09	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.12	0.09
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.21	0.30	0.39	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.03	0.20	0.27	0.36	0.26
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.11	0.01	0.11	0.00	0.08	0.05	0.09	0.14	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.15	0.17	0.24	0.18
N1	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.12	0.13	0.20	0.14
N3	0.03	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.18	0.25	0.34	0.23
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.02	0.24	0.37	0.46	0.33
O2	0.06	0.00	0.08	0.09	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.07	0.10	0.08	0.10	0.12	0.20	0.12
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.00	0.04	0.02	0.04	0.13	0.07	0.06
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.08	0.07	0.10	0.04	0.00	0.02	0.09	0.20	0.21	0.15
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.08	0.05
O5'	0.05	0.14	0.03	0.06	0.21	0.02	0.20	0.01	0.15	0.12	0.18	0.24	0.10	0.04	0.09	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.05	0.16	0.11	0.13	0.30	0.08	0.27	0.06	0.17	0.13	0.25	0.37	0.12	0.13	0.20	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.10	0.25	0.06	0.12	0.39	0.03	0.36	0.03	0.24	0.20	0.34	0.46	0.20	0.07	0.21	0.08	0.01	0.03	0.00	0.02
P	0.06	0.17	0.05	0.09	0.28	0.03	0.26	0.02	0.18	0.14	0.23	0.33	0.12	0.06	0.15	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.25	0.34	0.30	0.23	0.21	0.23	0.20	0.24	0.22	0.25	0.26	0.23	0.22	0.22	0.36	0.37	0.21	0.28	0.24	0.15	0.30	0.22
C2	0.22	0.15	0.32	0.26	0.20	0.18	0.20	0.16	0.18	0.22	0.15	0.14	0.17	0.21	0.21	0.34	0.30	0.16	0.26	0.18	0.11	0.31	0.30
C2'	0.31	0.27	0.45	0.39	0.29	0.27	0.27	0.24	0.26	0.29	0.26	0.27	0.29	0.27	0.30	0.50	0.47	0.24	0.21	0.25	0.37	0.51	0.25
C3'	0.28	0.25	0.40	0.35	0.26	0.25	0.26	0.23	0.25	0.28	0.25	0.27	0.26	0.27	0.27	0.43	0.43	0.24	0.22	0.25	0.34	0.46	0.24
C4	0.17	0.13	0.23	0.19	0.14	0.14	0.14	0.13	0.12	0.19	0.12	0.15	0.13	0.18	0.17	0.25	0.21	0.13	0.37	0.14	0.19	0.78	0.56
C4'	0.22	0.24	0.29	0.27	0.22	0.21	0.21	0.21	0.22	0.20	0.23	0.28	0.23	0.21	0.21	0.30	0.33	0.24	0.30	0.23	0.17	0.35	0.22
C5	0.17	0.15	0.24	0.22	0.16	0.15	0.16	0.15	0.16	0.18	0.15	0.17	0.15	0.18	0.17	0.25	0.25	0.13	0.39	0.18	0.22	0.69	0.53
C5'	0.22	0.24	0.26	0.25	0.21	0.22	0.20	0.21	0.21	0.20	0.22	0.30	0.24	0.21	0.21	0.27	0.30	0.25	0.35	0.23	0.16	0.28	0.26
C6	0.18	0.18	0.28	0.26	0.18	0.17	0.19	0.16	0.20	0.20	0.19	0.19	0.18	0.20	0.19	0.29	0.31	0.16	0.35	0.22	0.16	0.45	0.41
N1	0.20	0.20	0.31	0.28	0.20	0.18	0.21	0.17	0.22	0.21	0.21	0.19	0.20	0.21	0.21	0.33	0.33	0.17	0.30	0.22	0.11	0.30	0.30
N3	0.20	0.12	0.27	0.21	0.17	0.15	0.16	0.13	0.13	0.21	0.12	0.14	0.14	0.20	0.20	0.29	0.24	0.14	0.31	0.14	0.11	0.58	0.45
N4	0.14	0.12	0.17	0.13	0.11	0.10	0.10	0.09	0.09	0.16	0.13	0.15	0.11	0.15	0.13	0.19	0.14	0.10	0.42	0.11	0.28	1.06	0.71
O2	0.25	0.15	0.36	0.29	0.22	0.19	0.20	0.17	0.17	0.24	0.15	0.13	0.19	0.22	0.24	0.40	0.34	0.18	0.19	0.17	0.23	0.24	0.18
O2'	0.31	0.29	0.48	0.41	0.28	0.27	0.26	0.24	0.25	0.27	0.26	0.30	0.30	0.25	0.29	0.54	0.51	0.24	0.20	0.24	0.46	0.75	0.33
O3'	0.31	0.27	0.44	0.38	0.28	0.29	0.27	0.27	0.25	0.30	0.25	0.28	0.28	0.28	0.30	0.49	0.46	0.27	0.24	0.25	0.48	0.64	0.32
O4'	0.21	0.24	0.27	0.26	0.21	0.21	0.20	0.20	0.21	0.19	0.22	0.28	0.23	0.19	0.20	0.28	0.32	0.24	0.36	0.22	0.16	0.26	0.27
O5'	0.22	0.21	0.31	0.30	0.22	0.22	0.24	0.21	0.24	0.25	0.21	0.25	0.21	0.27	0.23	0.31	0.35	0.21	0.29	0.27	0.16	0.29	0.27
OP1	0.21	0.21	0.26	0.25	0.21	0.21	0.23	0.20	0.24	0.25	0.20	0.27	0.21	0.27	0.22	0.26	0.29	0.21	0.29	0.29	0.16	0.26	0.26
OP2	0.31	0.25	0.38	0.39	0.32	0.31	0.38	0.34	0.38	0.41	0.29	0.22	0.26	0.43	0.34	0.36	0.42	0.28	0.24	0.44	0.18	0.38	0.29
P	0.21	0.20	0.27	0.28	0.22	0.21	0.26	0.22	0.26	0.27	0.22	0.24	0.20	0.29	0.23	0.26	0.31	0.20	0.30	0.32	0.13	0.31	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.01	0.06	0.46	0.06
C2	0.02	0.00	0.18	0.21	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.27	0.05	0.37	0.01	0.28	0.21	0.31
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.11	0.13	0.22	0.19	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.31	0.03	0.35	0.50	0.04
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.14	0.17	0.26	0.20	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.45	0.06	0.64	0.32	0.19
C4	0.00	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.02	0.40	0.01	0.32	0.33	0.39
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.08	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.82	0.25
C5	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.54	0.01	0.51	0.84	0.68
C5'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.11	0.11	0.09	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.39	0.37	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.56	0.00	0.56	0.95	0.73
C8	0.01	0.01	0.11	0.14	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.17	0.03	0.55	0.02	0.50	0.84	0.69
N1	0.01	0.01	0.13	0.17	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.04	0.48	0.01	0.44	0.60	0.54
N2	0.03	0.01	0.22	0.26	0.02	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.35	0.06	0.32	0.03	0.21	0.11	0.20
N3	0.01	0.01	0.19	0.20	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.25	0.04	0.31	0.01	0.20	0.09	0.20
N7	0.00	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.02	0.62	0.02	0.62	1.19	0.87
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.37	0.01	0.28	0.23	0.34
O2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.03	0.04	0.08	0.10	0.19	0.14	0.06	0.02	0.00	0.03	0.02	0.10	0.02	0.09	1.09	0.34
O3'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.12	0.01	0.07	0.02	0.11	0.17	0.21	0.35	0.25	0.13	0.04	0.03	0.00	0.01	0.41	0.08	0.80	0.57	0.12
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.02	0.17	0.62	0.22
O5'	0.15	0.37	0.31	0.45	0.40	0.01	0.54	0.01	0.56	0.55	0.48	0.32	0.31	0.62	0.37	0.10	0.41	0.08	0.00	0.63	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.02	0.63	0.00	0.68	1.28	0.91
OP1	0.06	0.28	0.35	0.64	0.32	0.13	0.51	0.39	0.56	0.50	0.44	0.21	0.20	0.62	0.28	0.09	0.80	0.17	0.01	0.68	0.00	0.01	0.01
OP2	0.46	0.21	0.50	0.32	0.33	0.82	0.84	0.37	0.95	0.84	0.60	0.11	0.09	1.19	0.23	1.09	0.57	0.62	0.02	1.28	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.31	0.04	0.19	0.39	0.25	0.68	0.01	0.73	0.69	0.54	0.20	0.20	0.87	0.34	0.34	0.12	0.22	0.00	0.91	0.01	0.01	0.00