Doublet Group distance statistics: 49568

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.001, 0.012, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C2	A	0, -0.004, 0.019, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.023
C1'	A	0, -0.006, 0.020, 0.046, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.012, 0.039, 0.067, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.039 std_dev=0.028
O2	A	0, -0.004, 0.053, 0.109, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.053 std_dev=0.056
N1	B	0, 0.093, 0.325, 0.558, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.325 std_dev=0.233
C2	B	0, 0.095, 0.354, 0.613, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.354 std_dev=0.259
O4'	A	0, 0.112, 0.400, 0.688, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.400 std_dev=0.288
N3	B	0, 0.117, 0.425, 0.733, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.425 std_dev=0.308
C6	B	0, 0.122, 0.433, 0.743, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.433 std_dev=0.310
C2'	A	0, 0.108, 0.425, 0.741, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.425 std_dev=0.317
C4	B	0, 0.132, 0.449, 0.767, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.449 std_dev=0.318
C5	B	0, 0.126, 0.477, 0.829, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.477 std_dev=0.352
N2	B	0, 0.140, 0.560, 0.981, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.560 std_dev=0.421
O6	B	0, 0.153, 0.637, 1.121, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.637 std_dev=0.484
N9	B	0, 0.158, 0.681, 1.204, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.681 std_dev=0.523
N7	B	0, 0.109, 0.715, 1.320, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.715 std_dev=0.605
C4'	A	0, 0.260, 0.903, 1.546, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.903 std_dev=0.643
C2'	B	0, 0.271, 0.927, 1.582, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.927 std_dev=0.655
O5'	A	0, 0.271, 0.934, 1.598, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.934 std_dev=0.664
C8	B	0, 0.109, 0.775, 1.441, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.775 std_dev=0.666
C1'	B	0, 0.211, 0.911, 1.612, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.911 std_dev=0.700
C5'	A	0, 0.253, 0.956, 1.659, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.956 std_dev=0.703
O2'	B	0, 0.235, 0.963, 1.691, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.963 std_dev=0.728
C3'	A	0, 0.338, 1.153, 1.969, 1.742 max_d=1.742 avg_d=1.153 std_dev=0.815
O2'	A	0, 0.362, 1.244, 2.127, 1.943 max_d=1.943 avg_d=1.244 std_dev=0.882
OP1	A	0, 0.299, 1.278, 2.257, 2.378 max_d=2.378 avg_d=1.278 std_dev=0.979
P	A	0, 0.391, 1.467, 2.544, 2.553 max_d=2.553 avg_d=1.467 std_dev=1.077
O4'	B	0, 0.444, 1.539, 2.634, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.539 std_dev=1.095
C3'	B	0, 0.439, 1.536, 2.633, 2.494 max_d=2.494 avg_d=1.536 std_dev=1.097
C4'	B	0, 0.538, 1.838, 3.138, 2.771 max_d=2.771 avg_d=1.838 std_dev=1.300
OP2	A	0, 0.546, 1.934, 3.322, 3.190 max_d=3.190 avg_d=1.934 std_dev=1.388
O3'	A	0, 0.578, 1.998, 3.417, 3.166 max_d=3.166 avg_d=1.998 std_dev=1.419
O3'	B	0, 0.568, 1.990, 3.412, 3.238 max_d=3.238 avg_d=1.990 std_dev=1.422
C5'	B	0, 0.661, 2.293, 3.924, 3.662 max_d=3.662 avg_d=2.293 std_dev=1.631
O5'	B	0, 0.691, 2.361, 4.031, 3.590 max_d=3.590 avg_d=2.361 std_dev=1.670
P	B	0, 1.062, 3.626, 6.190, 5.487 max_d=5.487 avg_d=3.626 std_dev=2.564
OP1	B	0, 1.100, 3.804, 6.507, 6.043 max_d=6.043 avg_d=3.804 std_dev=2.704
OP2	B	0, 1.256, 4.310, 7.365, 6.714 max_d=6.714 avg_d=4.310 std_dev=3.054

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.19	0.00	0.05	0.03	0.17	0.11
C2	0.04	0.00	0.08	0.18	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.15	0.04	0.08	0.13	0.12	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.13	0.08	0.01	0.06	0.03	0.15	0.00	0.01	0.00	0.29	0.27	0.35	0.35
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.25	0.00	0.26	0.01	0.22	0.16	0.22	0.27	0.17	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.18	0.09
C4	0.02	0.01	0.02	0.25	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.14	0.02	0.22	0.28	0.35	0.32
C4'	0.01	0.06	0.03	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.06	0.08	0.11	0.08	0.26	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.04
C5	0.01	0.00	0.06	0.26	0.00	0.12	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.15	0.03	0.27	0.32	0.40	0.38
C5'	0.05	0.08	0.13	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.08	0.06	0.08	0.11	0.11	0.15	0.15	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.22	0.01	0.11	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.09	0.03	0.20	0.23	0.30	0.27
N1	0.01	0.01	0.01	0.16	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.08	0.01	0.07	0.12	0.16	0.11
N3	0.03	0.00	0.06	0.22	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.30	0.14	0.03	0.14	0.20	0.23	0.21
N4	0.02	0.01	0.03	0.27	0.00	0.11	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.31	0.17	0.02	0.26	0.34	0.42	0.39
O2	0.08	0.01	0.15	0.17	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.27	0.28	0.07	0.11	0.12	0.03	0.03
O2'	0.02	0.25	0.00	0.02	0.28	0.26	0.22	0.15	0.16	0.15	0.30	0.31	0.27	0.00	0.03	0.19	0.22	0.18	0.29	0.30
O3'	0.19	0.15	0.01	0.01	0.14	0.01	0.15	0.15	0.09	0.08	0.14	0.17	0.28	0.03	0.00	0.14	0.16	0.17	0.20	0.13
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.19	0.14	0.00	0.07	0.12	0.12	0.10
O5'	0.05	0.08	0.29	0.08	0.22	0.01	0.27	0.00	0.20	0.07	0.14	0.26	0.11	0.22	0.16	0.07	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.03	0.13	0.27	0.02	0.28	0.07	0.32	0.08	0.23	0.12	0.20	0.34	0.12	0.18	0.17	0.12	0.03	0.00	0.02	0.00
OP2	0.17	0.12	0.35	0.18	0.35	0.09	0.40	0.05	0.30	0.16	0.23	0.42	0.03	0.29	0.20	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.11	0.10	0.35	0.09	0.32	0.04	0.38	0.01	0.27	0.11	0.21	0.39	0.03	0.30	0.13	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.07	0.55	0.39	0.11	0.30	0.17	0.12	0.36	0.10	0.23	0.08	0.15	0.16	0.23	0.75	0.47	0.29	0.31	0.58	0.29	0.26	0.24
C2	0.34	0.04	0.44	0.31	0.18	0.23	0.08	0.20	0.13	0.24	0.13	0.04	0.15	0.13	0.27	0.55	0.36	0.25	0.36	0.29	0.20	0.08	0.10
C2'	0.33	0.01	0.55	0.51	0.03	0.38	0.22	0.26	0.35	0.07	0.20	0.07	0.12	0.29	0.13	0.74	0.65	0.28	0.40	0.56	0.29	0.21	0.22
C3'	0.29	0.19	0.50	0.40	0.06	0.33	0.31	0.17	0.42	0.24	0.29	0.25	0.16	0.45	0.07	0.78	0.54	0.25	0.32	0.63	0.31	0.23	0.24
C4	0.21	0.14	0.22	0.29	0.17	0.32	0.14	0.40	0.10	0.17	0.10	0.11	0.17	0.14	0.19	0.26	0.33	0.29	0.52	0.07	0.45	0.22	0.37
C4'	0.33	0.12	0.57	0.44	0.10	0.37	0.43	0.20	0.52	0.33	0.33	0.13	0.06	0.61	0.11	0.87	0.58	0.27	0.34	0.73	0.33	0.26	0.27
C5	0.22	0.19	0.24	0.33	0.16	0.35	0.07	0.39	0.02	0.12	0.07	0.22	0.22	0.08	0.17	0.26	0.34	0.33	0.54	0.08	0.46	0.27	0.39
C5'	0.22	0.12	0.52	0.47	0.23	0.40	0.54	0.28	0.55	0.63	0.32	0.14	0.04	0.80	0.25	0.85	0.66	0.24	0.37	0.71	0.32	0.31	0.27
C6	0.31	0.12	0.41	0.38	0.14	0.34	0.08	0.29	0.19	0.10	0.08	0.16	0.22	0.12	0.20	0.48	0.40	0.32	0.47	0.31	0.35	0.20	0.28
N1	0.36	0.06	0.49	0.37	0.15	0.29	0.05	0.19	0.24	0.15	0.16	0.08	0.18	0.03	0.25	0.61	0.42	0.29	0.39	0.43	0.25	0.14	0.17
N3	0.26	0.06	0.32	0.27	0.18	0.26	0.14	0.32	0.05	0.23	0.03	0.02	0.14	0.18	0.23	0.39	0.32	0.24	0.43	0.08	0.33	0.09	0.23
N4	0.16	0.16	0.11	0.32	0.16	0.40	0.18	0.53	0.21	0.16	0.21	0.13	0.15	0.17	0.16	0.09	0.41	0.33	0.60	0.24	0.62	0.39	0.54
O2	0.38	0.05	0.50	0.32	0.18	0.22	0.10	0.14	0.16	0.30	0.17	0.07	0.14	0.18	0.31	0.65	0.38	0.25	0.30	0.35	0.12	0.19	0.05
O2'	0.41	0.06	0.51	0.42	0.15	0.31	0.18	0.15	0.27	0.26	0.14	0.12	0.18	0.28	0.26	0.74	0.57	0.34	0.30	0.47	0.40	0.30	0.33
O3'	0.39	0.01	0.56	0.43	0.12	0.37	0.31	0.21	0.41	0.32	0.22	0.12	0.13	0.47	0.23	0.85	0.54	0.32	0.39	0.64	0.36	0.27	0.28
O4'	0.41	0.10	0.58	0.40	0.01	0.32	0.35	0.13	0.50	0.10	0.32	0.08	0.08	0.43	0.17	0.81	0.48	0.30	0.31	0.71	0.32	0.26	0.26
O5'	0.14	0.34	0.18	0.24	0.41	0.17	0.64	0.12	0.62	0.74	0.45	0.35	0.27	0.84	0.43	0.48	0.45	0.12	0.18	0.73	0.07	0.13	0.03
OP1	0.26	0.47	0.11	0.18	0.43	0.18	0.57	0.20	0.55	0.71	0.47	0.56	0.43	0.74	0.46	0.28	0.49	0.11	0.16	0.63	0.27	0.20	0.20
OP2	0.09	0.39	0.13	0.21	0.37	0.20	0.61	0.14	0.63	0.70	0.48	0.48	0.31	0.83	0.37	0.49	0.46	0.04	0.16	0.78	0.22	0.21	0.14
P	0.18	0.44	0.03	0.15	0.43	0.13	0.62	0.08	0.62	0.74	0.49	0.51	0.37	0.82	0.44	0.37	0.42	0.08	0.10	0.73	0.15	0.15	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.14	0.01	0.22	0.05	0.17
C2	0.02	0.00	0.17	0.06	0.01	0.21	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.19	0.10	0.23	0.45	0.01	0.46	0.07	0.32
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.10	0.01	0.05	0.04	0.08	0.06	0.13	0.19	0.18	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.14	0.11	0.10
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.03	0.10	0.08	0.08	0.05	0.06	0.10	0.07	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.11	0.14	0.08
C4	0.00	0.01	0.10	0.08	0.00	0.12	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.09	0.12	0.25	0.01	0.19	0.19	0.10
C4'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.12	0.00	0.10	0.01	0.13	0.07	0.17	0.26	0.20	0.07	0.05	0.07	0.01	0.00	0.01	0.12	0.13	0.13	0.09
C5	0.00	0.00	0.05	0.10	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.06	0.20	0.01	0.24	0.38	0.22
C5'	0.04	0.34	0.04	0.03	0.18	0.01	0.18	0.00	0.22	0.17	0.27	0.45	0.31	0.19	0.12	0.05	0.01	0.01	0.01	0.22	0.04	0.09	0.02
C6	0.00	0.01	0.08	0.10	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.13	0.10	0.25	0.00	0.23	0.36	0.12
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.08	0.16	0.01	0.44	0.45	0.43
N1	0.02	0.00	0.13	0.08	0.01	0.17	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.11	0.17	0.36	0.00	0.35	0.16	0.16
N2	0.03	0.00	0.19	0.05	0.01	0.26	0.00	0.45	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.22	0.10	0.28	0.57	0.01	0.70	0.30	0.57
N3	0.02	0.00	0.18	0.06	0.00	0.20	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.09	0.23	0.41	0.01	0.34	0.07	0.23
N7	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.03	0.16	0.02	0.39	0.52	0.41
N9	0.00	0.02	0.02	0.07	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.16	0.01	0.27	0.24	0.25
O2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.11	0.07	0.08	0.05	0.11	0.06	0.16	0.22	0.18	0.05	0.04	0.00	0.03	0.06	0.09	0.10	0.08	0.32	0.13
O3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.13	0.08	0.11	0.10	0.09	0.11	0.06	0.03	0.00	0.02	0.11	0.14	0.15	0.35	0.16
O4'	0.01	0.23	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.08	0.17	0.28	0.23	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.15	0.07	0.22	0.05	0.17
O5'	0.14	0.45	0.05	0.04	0.25	0.01	0.20	0.01	0.25	0.16	0.36	0.57	0.41	0.16	0.16	0.09	0.11	0.15	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.12	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.14	0.07	0.22	0.00	0.23	0.46	0.18
OP1	0.22	0.46	0.14	0.11	0.19	0.13	0.24	0.04	0.23	0.44	0.35	0.70	0.34	0.39	0.27	0.08	0.15	0.22	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.07	0.11	0.14	0.19	0.13	0.38	0.09	0.36	0.45	0.16	0.30	0.07	0.52	0.24	0.32	0.35	0.05	0.01	0.46	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.32	0.10	0.08	0.10	0.09	0.22	0.02	0.12	0.43	0.16	0.57	0.23	0.41	0.25	0.13	0.16	0.17	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00