Doublet Group distance statistics: 49569

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.018, 0.065, 0.112, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.065 std_dev=0.047
C6	B	0, 0.046, 0.167, 0.288, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.167 std_dev=0.121
C5	B	0, 0.095, 0.329, 0.562, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.329 std_dev=0.233
O6	B	0, 0.089, 0.341, 0.593, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.341 std_dev=0.252
C4	B	0, 0.128, 0.437, 0.746, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.437 std_dev=0.309
N1	B	0, 0.122, 0.441, 0.760, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.441 std_dev=0.319
N3	B	0, 0.141, 0.525, 0.909, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.525 std_dev=0.384
C2	B	0, 0.154, 0.575, 0.995, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.575 std_dev=0.421
N7	B	0, 0.193, 0.683, 1.173, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.683 std_dev=0.490
N9	B	0, 0.211, 0.744, 1.277, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.744 std_dev=0.533
C8	B	0, 0.246, 0.874, 1.502, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.874 std_dev=0.628
N2	B	0, 0.269, 0.939, 1.609, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.939 std_dev=0.670
C1'	B	0, 0.273, 0.964, 1.655, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.964 std_dev=0.691
O4'	B	0, 0.290, 1.034, 1.778, 1.718 max_d=1.718 avg_d=1.034 std_dev=0.744
O4'	A	0, 0.324, 1.116, 1.908, 1.751 max_d=1.751 avg_d=1.116 std_dev=0.792
C2'	B	0, 0.320, 1.129, 1.938, 1.855 max_d=1.855 avg_d=1.129 std_dev=0.809
C2'	A	0, 0.356, 1.222, 2.087, 1.903 max_d=1.903 avg_d=1.222 std_dev=0.866
C3'	B	0, 0.344, 1.220, 2.096, 2.015 max_d=2.015 avg_d=1.220 std_dev=0.876
C4'	B	0, 0.343, 1.232, 2.121, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.232 std_dev=0.889
O5'	B	0, 0.321, 1.249, 2.177, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.249 std_dev=0.928
OP2	B	0, 0.336, 1.266, 2.196, 2.207 max_d=2.207 avg_d=1.266 std_dev=0.930
C5'	B	0, 0.349, 1.290, 2.232, 2.219 max_d=2.219 avg_d=1.290 std_dev=0.941
O2'	B	0, 0.379, 1.329, 2.279, 2.162 max_d=2.162 avg_d=1.329 std_dev=0.950
P	B	0, 0.322, 1.304, 2.286, 2.370 max_d=2.370 avg_d=1.304 std_dev=0.982
O3'	B	0, 0.424, 1.493, 2.561, 2.442 max_d=2.442 avg_d=1.493 std_dev=1.068
C4'	A	0, 0.444, 1.536, 2.628, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.536 std_dev=1.092
O2'	A	0, 0.494, 1.689, 2.883, 2.562 max_d=2.562 avg_d=1.689 std_dev=1.194
OP1	B	0, 0.426, 1.675, 2.924, 2.998 max_d=2.998 avg_d=1.675 std_dev=1.249
C3'	A	0, 0.550, 1.889, 3.228, 2.950 max_d=2.950 avg_d=1.889 std_dev=1.339
C5'	A	0, 0.802, 2.764, 4.727, 4.364 max_d=4.364 avg_d=2.764 std_dev=1.963
O3'	A	0, 0.811, 2.780, 4.749, 4.307 max_d=4.307 avg_d=2.780 std_dev=1.969
O5'	A	0, 0.942, 3.237, 5.532, 5.061 max_d=5.061 avg_d=3.237 std_dev=2.295
OP1	A	0, 1.061, 3.874, 6.687, 6.595 max_d=6.595 avg_d=3.874 std_dev=2.813
P	A	0, 1.293, 4.486, 7.680, 7.182 max_d=7.182 avg_d=4.486 std_dev=3.194
OP2	A	0, 1.579, 5.434, 9.289, 8.533 max_d=8.533 avg_d=5.434 std_dev=3.855

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.08	0.16	0.38	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.13	0.22	0.24	0.43	0.18
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.02	0.01	0.06	0.12	0.34	0.06
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.16	0.01	0.24	0.03	0.23	0.11	0.07	0.17	0.16	0.01	0.02	0.01	0.04	0.19	0.32	0.08
C4	0.02	0.00	0.03	0.16	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.19	0.03	0.24	0.20	0.88	0.28
C4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.10	0.00	0.23	0.01	0.24	0.06	0.04	0.11	0.26	0.09	0.03	0.00	0.01	0.11	0.20	0.02
C5	0.02	0.00	0.01	0.24	0.00	0.23	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.23	0.14	0.45	0.41	1.18	0.58
C5'	0.02	0.14	0.02	0.03	0.18	0.01	0.40	0.00	0.40	0.11	0.05	0.19	0.41	0.09	0.08	0.01	0.01	0.19	0.22	0.04
C6	0.02	0.00	0.00	0.23	0.00	0.24	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.20	0.18	0.45	0.40	1.06	0.55
N1	0.02	0.01	0.02	0.11	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.17	0.17	0.61	0.16
N3	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.09	0.20	0.20	0.56	0.13
N4	0.02	0.00	0.03	0.17	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.21	0.03	0.25	0.21	0.94	0.30
O2	0.04	0.00	0.08	0.16	0.01	0.26	0.00	0.41	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.09	0.23	0.44	0.44	0.43	0.48
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.06	0.09	0.11	0.09	0.11	0.04	0.05	0.07	0.19	0.00	0.05	0.08	0.11	0.16	0.32	0.11
O3'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.19	0.03	0.23	0.08	0.20	0.10	0.11	0.21	0.09	0.05	0.00	0.02	0.04	0.30	0.30	0.10
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.03	0.00	0.14	0.01	0.18	0.02	0.09	0.03	0.23	0.08	0.02	0.00	0.08	0.17	0.29	0.03
O5'	0.08	0.22	0.06	0.04	0.24	0.01	0.45	0.01	0.45	0.17	0.20	0.25	0.44	0.11	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.24	0.12	0.19	0.20	0.11	0.41	0.19	0.40	0.17	0.20	0.21	0.44	0.16	0.30	0.17	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.38	0.43	0.34	0.32	0.88	0.20	1.18	0.22	1.06	0.61	0.56	0.94	0.43	0.32	0.30	0.29	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.18	0.06	0.08	0.28	0.02	0.58	0.04	0.55	0.16	0.13	0.30	0.48	0.11	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.08	0.42	0.41	0.16	0.38	0.09	0.34	0.05	0.25	0.14	0.24	0.11	0.16	0.27	0.48	0.47	0.33	0.33	0.11	0.35	0.25	0.28
C2	0.32	0.12	0.36	0.34	0.17	0.32	0.13	0.28	0.02	0.29	0.15	0.28	0.07	0.22	0.28	0.37	0.38	0.29	0.32	0.06	0.30	0.21	0.25
C2'	0.70	0.22	0.84	0.83	0.48	0.74	0.38	0.70	0.22	0.56	0.13	0.06	0.44	0.45	0.60	0.90	0.92	0.65	0.69	0.14	0.73	0.59	0.63
C3'	0.96	0.16	1.08	1.08	0.55	1.06	0.41	1.00	0.16	0.71	0.04	0.05	0.47	0.53	0.76	1.21	1.19	0.96	0.95	0.06	0.99	0.76	0.87
C4	0.22	0.03	0.26	0.23	0.14	0.20	0.12	0.18	0.07	0.21	0.10	0.09	0.09	0.17	0.20	0.27	0.27	0.19	0.22	0.10	0.18	0.16	0.18
C4'	0.74	0.02	0.80	0.81	0.36	0.84	0.24	0.80	0.03	0.54	0.15	0.23	0.27	0.37	0.57	0.92	0.89	0.78	0.74	0.12	0.77	0.56	0.67
C5	0.24	0.07	0.29	0.26	0.16	0.23	0.12	0.20	0.09	0.19	0.10	0.04	0.15	0.15	0.21	0.32	0.31	0.21	0.23	0.14	0.20	0.19	0.19
C5'	0.88	0.07	0.90	0.92	0.39	1.02	0.24	0.98	0.07	0.63	0.23	0.31	0.27	0.41	0.66	1.05	1.01	0.96	0.89	0.21	0.91	0.64	0.81
C6	0.29	0.06	0.35	0.32	0.17	0.29	0.11	0.25	0.07	0.21	0.11	0.06	0.16	0.15	0.24	0.38	0.37	0.25	0.26	0.13	0.25	0.21	0.22
N1	0.33	0.06	0.38	0.36	0.17	0.33	0.11	0.30	0.04	0.25	0.13	0.21	0.12	0.18	0.27	0.42	0.41	0.30	0.31	0.10	0.30	0.22	0.25
N3	0.26	0.10	0.29	0.27	0.14	0.24	0.12	0.21	0.02	0.26	0.13	0.20	0.05	0.21	0.24	0.29	0.30	0.22	0.26	0.06	0.23	0.16	0.20
N4	0.16	0.02	0.19	0.16	0.11	0.14	0.11	0.13	0.08	0.17	0.07	0.05	0.06	0.15	0.15	0.21	0.19	0.13	0.18	0.11	0.15	0.17	0.16
O2	0.37	0.18	0.39	0.38	0.17	0.37	0.14	0.34	0.03	0.34	0.16	0.35	0.07	0.25	0.32	0.39	0.42	0.35	0.38	0.04	0.37	0.26	0.31
O2'	0.61	0.32	0.81	0.81	0.48	0.67	0.41	0.64	0.31	0.52	0.25	0.22	0.47	0.45	0.55	0.85	0.92	0.55	0.64	0.25	0.72	0.60	0.61
O3'	1.11	0.28	1.31	1.33	0.66	1.28	0.51	1.22	0.25	0.83	0.14	0.09	0.59	0.63	0.89	1.48	1.50	1.12	1.14	0.13	1.22	0.94	1.06
O4'	0.46	0.16	0.48	0.48	0.17	0.51	0.08	0.48	0.13	0.32	0.25	0.37	0.09	0.19	0.34	0.57	0.53	0.49	0.44	0.21	0.45	0.31	0.39
O5'	0.67	0.27	0.65	0.67	0.24	0.79	0.18	0.77	0.31	0.46	0.44	0.47	0.14	0.29	0.47	0.80	0.74	0.77	0.67	0.45	0.68	0.45	0.59
OP1	0.71	0.21	0.68	0.69	0.27	0.83	0.15	0.81	0.19	0.50	0.34	0.40	0.19	0.30	0.51	0.82	0.76	0.81	0.72	0.33	0.71	0.46	0.63
OP2	0.64	0.75	0.61	0.65	0.42	0.83	0.57	0.82	0.89	0.47	1.00	0.90	0.43	0.49	0.45	0.80	0.75	0.79	0.66	1.09	0.66	0.49	0.59
P	0.70	0.33	0.65	0.68	0.21	0.85	0.15	0.84	0.38	0.46	0.53	0.54	0.10	0.26	0.47	0.82	0.75	0.84	0.72	0.55	0.71	0.45	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01
C2	0.02	0.00	0.12	0.15	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.20	0.03	0.09	0.01	0.13	0.16	0.11
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.10	0.14	0.12	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.04	0.08	0.04
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.10	0.06	0.13	0.17	0.14	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.09	0.03	0.06	0.03
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.08	0.11	0.08
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.07	0.02	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.08	0.12	0.10
C5'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.09	0.04	0.04
C6	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.10	0.00	0.10	0.16	0.13
C8	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.03	0.05	0.01	0.04	0.08	0.07
N1	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.17	0.02	0.10	0.00	0.12	0.17	0.12
N2	0.03	0.00	0.14	0.17	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.23	0.04	0.08	0.00	0.15	0.18	0.11
N3	0.02	0.01	0.12	0.14	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.18	0.03	0.07	0.01	0.12	0.13	0.09
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.07	0.01	0.06	0.09	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.07	0.05
O2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.03	0.08	0.12	0.09	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.05	0.01
O3'	0.03	0.20	0.02	0.02	0.10	0.02	0.08	0.03	0.12	0.06	0.17	0.23	0.18	0.05	0.02	0.03	0.00	0.03	0.10	0.11	0.02	0.05	0.03
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.04
O5'	0.02	0.09	0.05	0.08	0.07	0.02	0.08	0.02	0.10	0.05	0.10	0.08	0.07	0.07	0.05	0.03	0.10	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01
O6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.00	0.11	0.16	0.14
OP1	0.05	0.13	0.04	0.03	0.08	0.07	0.08	0.09	0.10	0.04	0.12	0.15	0.12	0.06	0.04	0.04	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.16	0.08	0.06	0.11	0.02	0.12	0.04	0.16	0.08	0.17	0.18	0.13	0.09	0.07	0.05	0.05	0.02	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.11	0.04	0.03	0.08	0.03	0.10	0.04	0.13	0.07	0.12	0.11	0.09	0.09	0.05	0.01	0.03	0.04	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00