Doublet Group distance statistics: 49570

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.006, 0.028, 0.049, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.008, 0.034, 0.061, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.034 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.010, 0.039, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.039 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.011, 0.059, 0.106, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.059 std_dev=0.048
N4	A	0, -0.009, 0.063, 0.135, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.063 std_dev=0.072
O4'	A	0, 0.045, 0.200, 0.355, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.200 std_dev=0.155
C2'	A	0, 0.056, 0.213, 0.370, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.213 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.079, 0.271, 0.463, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.271 std_dev=0.192
N1	B	0, 0.066, 0.297, 0.529, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.297 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.097, 0.332, 0.566, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.332 std_dev=0.235
O2'	A	0, 0.095, 0.337, 0.579, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.337 std_dev=0.242
C4'	A	0, -0.008, 0.241, 0.490, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.241 std_dev=0.249
C3'	A	0, 0.073, 0.341, 0.608, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.341 std_dev=0.268
C4	B	0, 0.108, 0.405, 0.702, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.405 std_dev=0.297
C2	B	0, 0.068, 0.414, 0.760, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.414 std_dev=0.346
N3	B	0, 0.089, 0.479, 0.869, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.479 std_dev=0.390
O6	B	0, 0.063, 0.472, 0.881, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.472 std_dev=0.409
C5'	A	0, 0.076, 0.487, 0.899, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.487 std_dev=0.411
O3'	A	0, 0.114, 0.554, 0.995, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.554 std_dev=0.441
N7	B	0, 0.110, 0.571, 1.033, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.571 std_dev=0.462
N9	B	0, 0.100, 0.602, 1.104, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.602 std_dev=0.502
C8	B	0, 0.099, 0.662, 1.225, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.662 std_dev=0.563
O4'	B	0, 0.171, 0.745, 1.320, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.745 std_dev=0.574
N2	B	0, 0.010, 0.596, 1.183, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.596 std_dev=0.587
OP2	A	0, 0.219, 0.855, 1.490, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.855 std_dev=0.636
P	A	0, 0.099, 0.818, 1.537, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.818 std_dev=0.719
C1'	B	0, 0.053, 0.800, 1.546, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.800 std_dev=0.746
OP1	A	0, 0.188, 0.939, 1.689, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.939 std_dev=0.750
O5'	A	0, 0.047, 0.800, 1.554, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.800 std_dev=0.754
C4'	B	0, 0.129, 1.145, 2.160, 2.469 max_d=2.469 avg_d=1.145 std_dev=1.016
C2'	B	0, -0.044, 1.212, 2.468, 2.943 max_d=2.943 avg_d=1.212 std_dev=1.256
C5'	B	0, 0.144, 1.402, 2.661, 3.052 max_d=3.052 avg_d=1.402 std_dev=1.258
O5'	B	0, -0.005, 1.330, 2.665, 3.155 max_d=3.155 avg_d=1.330 std_dev=1.335
OP1	B	0, -0.004, 1.412, 2.828, 3.348 max_d=3.348 avg_d=1.412 std_dev=1.416
O2'	B	0, -0.090, 1.385, 2.861, 3.429 max_d=3.429 avg_d=1.385 std_dev=1.475
C3'	B	0, -0.035, 1.463, 2.961, 3.521 max_d=3.521 avg_d=1.463 std_dev=1.498
O3'	B	0, -0.172, 1.578, 3.329, 4.019 max_d=4.019 avg_d=1.578 std_dev=1.750
P	B	0, -0.127, 1.644, 3.416, 4.104 max_d=4.104 avg_d=1.644 std_dev=1.772
OP2	B	0, -0.357, 2.031, 4.419, 5.383 max_d=5.383 avg_d=2.031 std_dev=2.388

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.02	0.01	0.22	0.12	0.48	0.23
C2	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.05	0.43	0.40	0.69	0.47
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.27	0.09	0.41	0.21
C3'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.02	0.11	0.04	0.03	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.34	0.01	0.40	0.21
C4	0.04	0.01	0.03	0.07	0.00	0.11	0.01	0.22	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.10	0.56	0.60	0.85	0.65
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.14	0.06	0.05	0.13	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.28	0.25	0.04
C5	0.05	0.01	0.04	0.11	0.01	0.15	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.11	0.10	0.57	0.58	0.88	0.66
C5'	0.04	0.11	0.02	0.02	0.22	0.01	0.25	0.00	0.22	0.11	0.14	0.26	0.09	0.02	0.02	0.02	0.01	0.45	0.32	0.03
C6	0.05	0.01	0.05	0.11	0.01	0.14	0.01	0.22	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.11	0.09	0.51	0.41	0.80	0.56
N1	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.06	0.02	0.11	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.42	0.32	0.69	0.45
N3	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.14	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.07	0.06	0.06	0.52	0.54	0.79	0.59
N4	0.05	0.01	0.03	0.07	0.00	0.13	0.03	0.26	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.11	0.56	0.66	0.85	0.67
O2	0.05	0.00	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.06	0.07	0.07	0.33	0.30	0.57	0.36
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.07	0.03	0.06	0.00	0.07	0.05	0.05	0.11	0.18	0.06
O3'	0.02	0.06	0.04	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.11	0.02	0.06	0.07	0.07	0.07	0.00	0.01	0.20	0.19	0.23	0.14
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.02	0.09	0.04	0.06	0.11	0.07	0.05	0.01	0.00	0.09	0.15	0.42	0.14
O5'	0.22	0.43	0.27	0.34	0.56	0.02	0.57	0.01	0.51	0.42	0.52	0.56	0.33	0.05	0.20	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.12	0.40	0.09	0.01	0.60	0.28	0.58	0.45	0.41	0.32	0.54	0.66	0.30	0.11	0.19	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	0.69	0.41	0.40	0.85	0.25	0.88	0.32	0.80	0.69	0.79	0.85	0.57	0.18	0.23	0.42	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.47	0.21	0.21	0.65	0.04	0.66	0.03	0.56	0.45	0.59	0.67	0.36	0.06	0.14	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.07	0.08	0.19	0.04	0.37	0.02	0.72	0.04	0.03	0.06	0.08	0.07	0.03	0.02	0.19	0.06	0.26	0.47	0.05	0.17	0.94	0.62
C2	0.08	0.21	0.16	0.25	0.06	0.41	0.07	0.78	0.03	0.21	0.17	0.28	0.15	0.22	0.10	0.21	0.05	0.27	0.62	0.03	0.09	1.42	0.85
C2'	0.10	0.07	0.08	0.20	0.06	0.38	0.05	0.82	0.05	0.04	0.05	0.08	0.09	0.05	0.06	0.21	0.09	0.20	0.52	0.08	0.13	0.84	0.73
C3'	0.22	0.10	0.17	0.05	0.11	0.23	0.05	0.64	0.01	0.12	0.05	0.12	0.14	0.07	0.15	0.44	0.34	0.13	0.33	0.05	0.16	0.54	0.53
C4	0.14	0.34	0.18	0.07	0.12	0.21	0.06	0.57	0.04	0.13	0.21	0.47	0.29	0.21	0.06	0.52	0.37	0.15	0.44	0.21	0.22	1.30	0.68
C4'	0.28	0.11	0.28	0.16	0.15	0.16	0.10	0.47	0.05	0.19	0.07	0.12	0.15	0.14	0.21	0.52	0.40	0.14	0.19	0.01	0.22	0.35	0.32
C5	0.23	0.30	0.31	0.22	0.14	0.09	0.04	0.43	0.10	0.04	0.10	0.41	0.30	0.14	0.11	0.68	0.53	0.10	0.29	0.28	0.31	1.03	0.50
C5'	0.38	0.18	0.50	0.41	0.20	0.16	0.13	0.30	0.10	0.23	0.15	0.21	0.22	0.15	0.26	0.78	0.67	0.15	0.13	0.08	0.27	0.23	0.19
C6	0.21	0.19	0.26	0.16	0.11	0.12	0.05	0.45	0.11	0.02	0.04	0.25	0.22	0.11	0.10	0.59	0.45	0.12	0.28	0.23	0.31	0.92	0.47
N1	0.06	0.13	0.06	0.11	0.03	0.32	0.07	0.66	0.06	0.12	0.06	0.18	0.12	0.16	0.04	0.31	0.17	0.23	0.48	0.12	0.19	1.12	0.66
N3	0.06	0.28	0.11	0.17	0.08	0.36	0.09	0.73	0.04	0.22	0.22	0.39	0.21	0.26	0.08	0.30	0.14	0.24	0.59	0.10	0.11	1.49	0.84
N4	0.18	0.41	0.23	0.13	0.15	0.17	0.06	0.54	0.04	0.14	0.26	0.59	0.35	0.22	0.08	0.61	0.45	0.13	0.43	0.22	0.22	1.36	0.69
O2	0.16	0.19	0.32	0.42	0.09	0.51	0.08	0.90	0.09	0.26	0.19	0.24	0.13	0.23	0.16	0.16	0.15	0.30	0.75	0.08	0.02	1.57	1.00
O2'	0.11	0.09	0.18	0.34	0.10	0.45	0.12	0.90	0.13	0.11	0.10	0.08	0.10	0.14	0.09	0.12	0.14	0.17	0.56	0.16	0.17	0.72	0.76
O3'	0.26	0.11	0.19	0.08	0.12	0.20	0.08	0.65	0.02	0.17	0.05	0.14	0.15	0.12	0.17	0.44	0.38	0.10	0.32	0.06	0.26	0.39	0.55
O4'	0.17	0.07	0.17	0.04	0.12	0.21	0.08	0.47	0.04	0.12	0.04	0.06	0.11	0.09	0.14	0.40	0.25	0.19	0.22	0.01	0.29	0.57	0.32
O5'	1.12	0.05	1.38	1.42	0.45	0.96	0.19	0.61	0.11	0.57	0.17	0.06	0.43	0.30	0.73	1.67	1.77	0.75	0.70	0.26	0.80	0.43	0.51
OP1	1.05	0.07	1.43	1.53	0.39	1.00	0.11	0.66	0.25	0.46	0.27	0.01	0.46	0.18	0.64	1.84	1.98	0.69	0.68	0.47	0.79	0.34	0.48
OP2	0.80	0.63	1.39	1.59	0.20	0.98	0.33	0.77	0.63	0.27	0.79	0.83	0.25	0.19	0.37	1.75	2.03	0.50	0.72	0.76	0.79	0.49	0.61
P	1.02	0.20	1.44	1.57	0.29	1.05	0.12	0.74	0.33	0.46	0.42	0.33	0.26	0.19	0.59	1.77	2.01	0.69	0.76	0.49	0.83	0.52	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.27	0.23	0.09
C2	0.03	0.00	0.29	0.20	0.02	0.06	0.02	0.10	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.54	0.28	0.19	0.04	0.03	0.61	0.58	0.07
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.13	0.01	0.05	0.05	0.11	0.17	0.21	0.37	0.28	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.08	0.23	0.42	0.21
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.13	0.28	0.19	0.11	0.03	0.02	0.01	0.01	0.23	0.02	0.49	0.15	0.21
C4	0.00	0.02	0.13	0.06	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.26	0.13	0.11	0.06	0.02	0.60	0.59	0.08
C4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.05	0.08	0.05	0.05	0.07	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.19	0.22	0.01
C5	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.17	0.08	0.07	0.07	0.00	0.74	0.79	0.10
C5'	0.02	0.10	0.05	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.16	0.09	0.14	0.08	0.08	0.14	0.06	0.04	0.02	0.02	0.01	0.18	0.31	0.38	0.00
C6	0.01	0.03	0.11	0.05	0.02	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.28	0.14	0.10	0.07	0.00	0.78	0.85	0.11
C8	0.01	0.01	0.17	0.15	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.09	0.05	0.01	0.70	0.70	0.08
N1	0.02	0.01	0.21	0.13	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.43	0.22	0.16	0.05	0.02	0.71	0.75	0.09
N2	0.04	0.01	0.37	0.28	0.02	0.05	0.03	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.67	0.37	0.21	0.05	0.03	0.57	0.52	0.07
N3	0.03	0.00	0.28	0.19	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.50	0.25	0.18	0.05	0.02	0.53	0.49	0.07
N7	0.01	0.02	0.10	0.11	0.02	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.07	0.01	0.81	0.88	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.06	0.00	0.53	0.49	0.08
O2'	0.00	0.54	0.00	0.02	0.26	0.02	0.17	0.04	0.28	0.14	0.43	0.67	0.50	0.03	0.04	0.00	0.04	0.02	0.23	0.23	0.28	0.50	0.25
O3'	0.05	0.28	0.01	0.01	0.13	0.02	0.08	0.02	0.14	0.08	0.22	0.37	0.25	0.05	0.05	0.04	0.00	0.04	0.18	0.11	0.52	0.06	0.19
O4'	0.00	0.19	0.01	0.01	0.11	0.00	0.07	0.02	0.10	0.09	0.16	0.21	0.18	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.19	0.09	0.31	0.14	0.17
O5'	0.08	0.04	0.21	0.23	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.23	0.18	0.19	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.03	0.08	0.02	0.02	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.23	0.11	0.09	0.08	0.00	0.85	0.96	0.13
OP1	0.27	0.61	0.23	0.49	0.60	0.19	0.74	0.31	0.78	0.70	0.71	0.57	0.53	0.81	0.53	0.28	0.52	0.31	0.01	0.85	0.00	0.00	0.01
OP2	0.23	0.58	0.42	0.15	0.59	0.22	0.79	0.38	0.85	0.70	0.75	0.52	0.49	0.88	0.49	0.50	0.06	0.14	0.02	0.96	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.07	0.21	0.21	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.08	0.09	0.07	0.07	0.11	0.08	0.25	0.19	0.17	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00