Doublet Group distance statistics: 49571

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.018, 0.069, 0.120, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.069 std_dev=0.051
N4	A	0, 0.024, 0.083, 0.142, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.083 std_dev=0.059
N1	B	0, 0.001, 0.220, 0.439, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.220 std_dev=0.219
O4'	A	0, 0.079, 0.326, 0.573, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.326 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.060, 0.308, 0.557, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.308 std_dev=0.248
C4	B	0, 0.016, 0.272, 0.529, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.272 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.077, 0.340, 0.604, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.340 std_dev=0.263
C2	B	0, 0.037, 0.306, 0.575, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.306 std_dev=0.269
N3	B	0, -0.001, 0.292, 0.586, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.292 std_dev=0.294
N9	B	0, 0.066, 0.360, 0.654, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.360 std_dev=0.294
O6	B	0, 0.105, 0.426, 0.748, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.426 std_dev=0.321
C2'	A	0, 0.104, 0.433, 0.762, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.433 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.122, 0.462, 0.802, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.462 std_dev=0.340
N7	B	0, 0.128, 0.477, 0.825, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.477 std_dev=0.348
N2	B	0, 0.113, 0.461, 0.810, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.461 std_dev=0.349
C1'	B	0, 0.082, 0.464, 0.846, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.464 std_dev=0.382
C4'	A	0, 0.161, 0.620, 1.078, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.620 std_dev=0.459
C2'	B	0, 0.182, 0.643, 1.103, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.643 std_dev=0.461
C5'	A	0, 0.121, 0.635, 1.148, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.635 std_dev=0.514
O5'	A	0, 0.206, 0.762, 1.318, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.762 std_dev=0.556
C3'	A	0, 0.239, 0.829, 1.419, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.829 std_dev=0.590
OP1	A	0, 0.205, 0.867, 1.528, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.867 std_dev=0.661
O2'	B	0, 0.266, 0.948, 1.629, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.948 std_dev=0.681
O2'	A	0, 0.310, 1.075, 1.841, 1.718 max_d=1.718 avg_d=1.075 std_dev=0.765
C3'	B	0, 0.300, 1.181, 2.062, 2.115 max_d=2.115 avg_d=1.181 std_dev=0.881
O3'	B	0, 0.307, 1.223, 2.139, 2.205 max_d=2.205 avg_d=1.223 std_dev=0.916
O4'	B	0, 0.318, 1.251, 2.185, 2.241 max_d=2.241 avg_d=1.251 std_dev=0.933
P	A	0, 0.447, 1.529, 2.611, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.529 std_dev=1.082
O3'	A	0, 0.454, 1.549, 2.645, 2.341 max_d=2.341 avg_d=1.549 std_dev=1.096
C4'	B	0, 0.396, 1.505, 2.614, 2.639 max_d=2.639 avg_d=1.505 std_dev=1.109
O5'	B	0, 0.642, 2.198, 3.754, 3.384 max_d=3.384 avg_d=2.198 std_dev=1.556
C5'	B	0, 0.713, 2.541, 4.369, 4.224 max_d=4.224 avg_d=2.541 std_dev=1.828
P	B	0, 0.859, 2.965, 5.071, 4.691 max_d=4.691 avg_d=2.965 std_dev=2.106
OP2	B	0, 0.892, 3.098, 5.303, 4.959 max_d=4.959 avg_d=3.098 std_dev=2.205
OP1	B	0, 0.973, 3.353, 5.732, 5.281 max_d=5.281 avg_d=3.353 std_dev=2.380
OP2	A	0, 1.004, 3.429, 5.855, 5.222 max_d=5.222 avg_d=3.429 std_dev=2.426

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.13	0.00	0.08	0.10	0.07	0.07
C2	0.03	0.00	0.08	0.18	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.10	0.02	0.22	0.17	0.48	0.26
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.09	0.08	0.01	0.04	0.04	0.18	0.00	0.00	0.01	0.19	0.15	0.26	0.23
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.20	0.00	0.20	0.01	0.17	0.14	0.20	0.22	0.19	0.02	0.00	0.02	0.06	0.06	0.27	0.11
C4	0.01	0.01	0.03	0.20	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.13	0.01	0.28	0.16	0.86	0.41
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.06	0.07	0.08	0.10	0.20	0.01	0.00	0.01	0.09	0.21	0.02
C5	0.01	0.02	0.07	0.20	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.15	0.03	0.28	0.13	0.89	0.43
C5'	0.03	0.08	0.09	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.05	0.06	0.08	0.09	0.11	0.11	0.13	0.01	0.01	0.11	0.19	0.01
C6	0.01	0.02	0.08	0.17	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.11	0.03	0.24	0.12	0.65	0.34
N1	0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.13	0.04	0.01	0.19	0.14	0.41	0.23
N3	0.01	0.00	0.04	0.20	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.11	0.00	0.25	0.17	0.68	0.34
N4	0.02	0.01	0.04	0.22	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.17	0.02	0.29	0.17	0.99	0.46
O2	0.06	0.01	0.18	0.19	0.00	0.10	0.02	0.11	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.14	0.18	0.05	0.21	0.20	0.33	0.22
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.25	0.20	0.20	0.11	0.14	0.13	0.23	0.27	0.14	0.00	0.03	0.15	0.11	0.08	0.30	0.18
O3'	0.13	0.10	0.00	0.00	0.13	0.01	0.15	0.13	0.11	0.04	0.11	0.17	0.18	0.03	0.00	0.08	0.14	0.29	0.28	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.15	0.08	0.00	0.12	0.12	0.09	0.14
O5'	0.08	0.22	0.19	0.06	0.28	0.01	0.28	0.01	0.24	0.19	0.25	0.29	0.21	0.11	0.14	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.10	0.17	0.15	0.06	0.16	0.09	0.13	0.11	0.12	0.14	0.17	0.17	0.20	0.08	0.29	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.48	0.26	0.27	0.86	0.21	0.89	0.19	0.65	0.41	0.68	0.99	0.33	0.30	0.28	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.26	0.23	0.11	0.41	0.02	0.43	0.01	0.34	0.23	0.34	0.46	0.22	0.18	0.06	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.08	0.08	0.19	0.08	0.05	0.10	0.16	0.06	0.16	0.05	0.11	0.08	0.16	0.11	0.14	0.17	0.09	0.07	0.08	0.11	0.04	0.05
C2	0.06	0.06	0.03	0.21	0.05	0.20	0.10	0.40	0.06	0.13	0.03	0.12	0.02	0.15	0.09	0.25	0.15	0.11	0.20	0.08	0.34	0.26	0.30
C2'	0.07	0.04	0.19	0.34	0.06	0.15	0.14	0.27	0.14	0.14	0.06	0.08	0.05	0.20	0.07	0.08	0.35	0.06	0.08	0.21	0.13	0.15	0.13
C3'	0.14	0.07	0.12	0.20	0.07	0.10	0.05	0.14	0.05	0.05	0.05	0.08	0.08	0.04	0.08	0.13	0.19	0.14	0.11	0.07	0.17	0.01	0.07
C4	0.13	0.13	0.12	0.30	0.16	0.39	0.17	0.65	0.14	0.18	0.11	0.14	0.14	0.18	0.16	0.34	0.20	0.30	0.40	0.13	0.57	0.49	0.55
C4'	0.15	0.13	0.22	0.26	0.11	0.14	0.08	0.17	0.08	0.09	0.10	0.14	0.13	0.07	0.12	0.10	0.24	0.17	0.12	0.06	0.22	0.05	0.12
C5	0.16	0.12	0.13	0.36	0.17	0.38	0.18	0.59	0.13	0.20	0.10	0.12	0.14	0.20	0.19	0.34	0.25	0.29	0.35	0.11	0.46	0.43	0.46
C5'	0.16	0.13	0.29	0.30	0.12	0.17	0.10	0.20	0.09	0.12	0.10	0.14	0.14	0.09	0.14	0.15	0.29	0.19	0.14	0.08	0.26	0.08	0.14
C6	0.10	0.07	0.08	0.31	0.10	0.24	0.13	0.40	0.08	0.18	0.05	0.11	0.06	0.17	0.13	0.25	0.23	0.16	0.19	0.07	0.28	0.27	0.29
N1	0.06	0.08	0.03	0.24	0.03	0.16	0.09	0.32	0.04	0.13	0.04	0.12	0.04	0.14	0.08	0.21	0.18	0.06	0.13	0.05	0.24	0.19	0.22
N3	0.06	0.07	0.08	0.23	0.10	0.30	0.13	0.54	0.11	0.14	0.06	0.12	0.06	0.15	0.10	0.31	0.15	0.21	0.32	0.11	0.51	0.40	0.46
N4	0.16	0.18	0.16	0.30	0.19	0.46	0.19	0.78	0.16	0.19	0.15	0.17	0.19	0.19	0.18	0.37	0.20	0.38	0.52	0.15	0.73	0.65	0.70
O2	0.07	0.09	0.04	0.18	0.05	0.15	0.09	0.34	0.06	0.13	0.07	0.13	0.05	0.14	0.08	0.22	0.13	0.06	0.16	0.09	0.30	0.20	0.25
O2'	0.18	0.10	0.10	0.27	0.10	0.04	0.19	0.17	0.13	0.32	0.03	0.20	0.06	0.35	0.19	0.11	0.28	0.15	0.06	0.20	0.08	0.10	0.04
O3'	0.12	0.12	0.16	0.23	0.12	0.13	0.17	0.19	0.19	0.14	0.16	0.11	0.10	0.19	0.11	0.12	0.18	0.14	0.11	0.22	0.21	0.08	0.13
O4'	0.14	0.16	0.16	0.21	0.12	0.10	0.08	0.14	0.10	0.05	0.13	0.18	0.15	0.02	0.10	0.10	0.18	0.14	0.11	0.09	0.18	0.03	0.09
O5'	0.20	0.14	0.09	0.13	0.16	0.11	0.16	0.04	0.15	0.15	0.14	0.13	0.15	0.15	0.16	0.19	0.12	0.18	0.14	0.14	0.16	0.15	0.11
OP1	0.08	0.08	0.32	0.36	0.10	0.14	0.12	0.18	0.11	0.14	0.10	0.06	0.09	0.14	0.11	0.18	0.39	0.06	0.11	0.11	0.12	0.17	0.13
OP2	0.63	0.66	0.58	0.60	0.54	0.71	0.38	0.67	0.39	0.27	0.53	0.75	0.69	0.22	0.49	0.76	0.66	0.66	0.74	0.29	0.73	0.80	0.73
P	0.41	0.31	0.22	0.17	0.31	0.38	0.25	0.32	0.23	0.24	0.26	0.32	0.34	0.21	0.32	0.43	0.18	0.42	0.40	0.19	0.44	0.39	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.10	0.11	0.03
C2	0.06	0.00	0.15	0.07	0.02	0.25	0.02	0.44	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.22	0.05	0.24	0.31	0.01	0.50	0.24	0.37
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.04	0.11	0.19	0.16	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.17	0.07	0.18	0.18	0.14
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.07	0.23	0.20	0.17
C4	0.03	0.02	0.09	0.04	0.00	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.12	0.03	0.11	0.10	0.02	0.21	0.04	0.10
C4'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.11	0.00	0.06	0.01	0.11	0.09	0.19	0.31	0.24	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.16	0.11	0.01
C5	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.05	0.08	0.02	0.16	0.03	0.05
C5'	0.01	0.44	0.01	0.01	0.20	0.01	0.14	0.00	0.23	0.11	0.35	0.57	0.40	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.20	0.22	0.13	0.01
C6	0.03	0.02	0.08	0.06	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.12	0.04	0.10	0.12	0.01	0.27	0.05	0.14
C8	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.13	0.18	0.04	0.16	0.19	0.16
N1	0.04	0.01	0.11	0.07	0.01	0.19	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.04	0.18	0.22	0.01	0.42	0.17	0.28
N2	0.08	0.01	0.19	0.10	0.03	0.31	0.03	0.57	0.02	0.04	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.28	0.09	0.29	0.43	0.00	0.65	0.39	0.53
N3	0.05	0.01	0.16	0.06	0.01	0.24	0.02	0.40	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.21	0.04	0.24	0.26	0.02	0.40	0.17	0.29
N7	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.14	0.04	0.11	0.15	0.12
N9	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.04	0.11	0.11	0.04
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.12	0.00	0.08	0.01	0.12	0.07	0.18	0.28	0.21	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.10	0.11	0.15	0.12	0.08
O3'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.09	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.18	0.05	0.24	0.19	0.16
O4'	0.01	0.24	0.01	0.01	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.13	0.18	0.29	0.24	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.08	0.08	0.15	0.06
O5'	0.04	0.31	0.17	0.21	0.10	0.01	0.08	0.01	0.12	0.18	0.22	0.43	0.26	0.14	0.08	0.10	0.18	0.08	0.00	0.11	0.00	0.02	0.00
O6	0.04	0.01	0.07	0.07	0.02	0.10	0.02	0.20	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.11	0.05	0.08	0.11	0.00	0.24	0.04	0.12
OP1	0.10	0.50	0.18	0.23	0.21	0.16	0.16	0.22	0.27	0.16	0.42	0.65	0.40	0.11	0.11	0.15	0.24	0.08	0.00	0.24	0.00	0.03	0.00
OP2	0.11	0.24	0.18	0.20	0.04	0.11	0.03	0.13	0.05	0.19	0.17	0.39	0.17	0.15	0.11	0.12	0.19	0.15	0.02	0.04	0.03	0.00	0.03
P	0.03	0.37	0.14	0.17	0.10	0.01	0.05	0.01	0.14	0.16	0.28	0.53	0.29	0.12	0.04	0.08	0.16	0.06	0.00	0.12	0.00	0.03	0.00