Doublet Group distance statistics: 49574

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N3	A	0, 0.000, 0.041, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C6	A	0, 0.000, 0.045, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.045 std_dev=0.045
N1	A	0, 0.000, 0.048, 0.095, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.048 std_dev=0.048
C1'	A	0, 0.000, 0.052, 0.103, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.052 std_dev=0.052
O2	A	0, 0.000, 0.063, 0.126, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.063 std_dev=0.063
N4	A	0, 0.000, 0.074, 0.148, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.074 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.000, 0.114, 0.229, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.114 std_dev=0.114
O4'	A	0, 0.000, 0.157, 0.313, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.157 std_dev=0.157
C3'	A	0, 0.000, 0.252, 0.503, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.252 std_dev=0.252
O3'	A	0, 0.000, 0.320, 0.639, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.320 std_dev=0.320
N3	B	0, 0.000, 0.385, 0.769, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.385 std_dev=0.385
O2'	A	0, 0.000, 0.389, 0.779, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.389 std_dev=0.389
C4'	A	0, 0.000, 0.457, 0.913, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.457 std_dev=0.457
C4	B	0, 0.000, 0.514, 1.028, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.514 std_dev=0.514
C2	B	0, 0.000, 0.548, 1.095, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.548 std_dev=0.548
C1'	B	0, 0.000, 0.553, 1.105, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.553 std_dev=0.553
N9	B	0, 0.000, 0.586, 1.172, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.586 std_dev=0.586
N2	B	0, 0.000, 0.599, 1.198, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.599 std_dev=0.599
C5	B	0, 0.000, 0.731, 1.461, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.731 std_dev=0.731
N1	B	0, 0.000, 0.762, 1.524, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.762 std_dev=0.762
C8	B	0, 0.000, 0.784, 1.568, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.784 std_dev=0.784
C6	B	0, 0.000, 0.853, 1.707, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.853 std_dev=0.853
N7	B	0, 0.000, 0.868, 1.736, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.868 std_dev=0.868
C5'	A	0, 0.000, 0.907, 1.814, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.907 std_dev=0.907
O3'	B	0, 0.000, 1.048, 2.096, 2.096 max_d=2.096 avg_d=1.048 std_dev=1.048
O6	B	0, 0.000, 1.087, 2.174, 2.174 max_d=2.174 avg_d=1.087 std_dev=1.087
O5'	A	0, 0.000, 1.113, 2.226, 2.226 max_d=2.226 avg_d=1.113 std_dev=1.113
C2'	B	0, 0.000, 1.326, 2.652, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.326 std_dev=1.326
C3'	B	0, 0.000, 1.587, 3.174, 3.174 max_d=3.174 avg_d=1.587 std_dev=1.587
OP2	A	0, 0.000, 1.617, 3.234, 3.234 max_d=3.234 avg_d=1.617 std_dev=1.617
O4'	B	0, 0.000, 1.711, 3.422, 3.422 max_d=3.422 avg_d=1.711 std_dev=1.711
P	A	0, 0.000, 1.784, 3.568, 3.568 max_d=3.568 avg_d=1.784 std_dev=1.784
C4'	B	0, 0.000, 2.004, 4.007, 4.007 max_d=4.007 avg_d=2.004 std_dev=2.004
O2'	B	0, 0.000, 2.078, 4.155, 4.155 max_d=4.155 avg_d=2.078 std_dev=2.078
OP1	A	0, 0.000, 2.924, 5.848, 5.848 max_d=5.848 avg_d=2.924 std_dev=2.924
C5'	B	0, 0.000, 3.412, 6.823, 6.823 max_d=6.823 avg_d=3.412 std_dev=3.412
O5'	B	0, 0.000, 3.724, 7.448, 7.448 max_d=7.448 avg_d=3.724 std_dev=3.724
P	B	0, 0.000, 5.264, 10.528, 10.528 max_d=10.528 avg_d=5.264 std_dev=5.264
OP2	B	0, 0.000, 5.733, 11.466, 11.466 max_d=11.466 avg_d=5.733 std_dev=5.733
OP1	B	0, 0.000, 5.877, 11.754, 11.754 max_d=11.754 avg_d=5.877 std_dev=5.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.05	0.03	0.08	0.00	0.01	0.00	0.13	0.03	0.25	0.13
C2	0.06	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.06	0.03	0.39	0.60	0.43	0.47
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.05	0.00	0.01	0.00	0.06	0.20	0.03	0.03
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.09	0.09	0.10	0.12	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.33	0.14	0.11
C4	0.03	0.01	0.06	0.11	0.00	0.13	0.01	0.34	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.15	0.11	0.03	0.58	1.17	0.73	0.82
C4'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.15	0.06	0.07	0.15	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.33	0.14	0.04
C5	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.17	0.00	0.38	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.12	0.06	0.57	1.15	0.79	0.83
C5'	0.03	0.17	0.01	0.01	0.34	0.00	0.38	0.00	0.30	0.18	0.26	0.39	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.28	0.26	0.00
C6	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.30	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.45	0.79	0.63	0.61
N1	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.06	0.01	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.33	0.50	0.43	0.42
N3	0.05	0.01	0.07	0.10	0.00	0.07	0.02	0.26	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.09	0.01	0.51	0.92	0.58	0.67
N4	0.03	0.01	0.07	0.12	0.00	0.15	0.02	0.39	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.12	0.04	0.65	1.39	0.83	0.95
O2	0.08	0.00	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.02	0.07	0.28	0.35	0.29	0.31
O2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.15	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.20	0.17	0.24	0.00	0.01	0.06	0.03	0.43	0.02	0.11
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.10	0.08	0.09	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.67	0.34	0.29
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.07	0.06	0.00	0.00	0.03	0.07	0.29	0.07
O5'	0.13	0.39	0.06	0.01	0.58	0.00	0.57	0.00	0.45	0.33	0.51	0.65	0.28	0.03	0.06	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.03	0.60	0.20	0.33	1.17	0.33	1.15	0.28	0.79	0.50	0.92	1.39	0.35	0.43	0.67	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.43	0.03	0.14	0.73	0.14	0.79	0.26	0.63	0.43	0.58	0.83	0.29	0.02	0.34	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01
P	0.13	0.47	0.03	0.11	0.82	0.04	0.83	0.00	0.61	0.42	0.67	0.95	0.31	0.11	0.29	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.14	0.08	0.42	0.01	1.21	0.12	1.80	0.25	0.11	0.24	0.15	0.02	0.07	0.16	0.91	0.11	1.18	1.64	0.34	1.96	2.31	2.02
C2	0.39	0.13	0.04	0.34	0.12	1.01	0.05	1.41	0.16	0.37	0.22	0.19	0.02	0.20	0.32	0.68	0.17	1.09	1.27	0.24	1.75	1.67	1.57
C2'	0.29	0.07	0.14	0.36	0.05	1.22	0.06	1.81	0.17	0.14	0.16	0.07	0.04	0.02	0.19	1.01	0.05	1.21	1.60	0.26	1.91	2.35	2.01
C3'	0.25	0.14	0.29	0.26	0.02	1.20	0.12	1.74	0.24	0.07	0.23	0.15	0.03	0.08	0.12	1.20	0.02	1.19	1.41	0.32	1.50	2.05	1.73
C4	0.37	0.09	0.18	0.07	0.22	0.63	0.24	0.75	0.04	0.47	0.12	0.20	0.07	0.41	0.38	0.58	0.09	0.83	0.52	0.01	0.86	0.48	0.59
C4'	0.14	0.24	0.31	0.26	0.13	1.19	0.21	1.81	0.31	0.02	0.31	0.25	0.15	0.16	0.01	1.26	0.09	1.11	1.50	0.37	1.53	2.18	1.83
C5	0.36	0.06	0.27	0.02	0.21	0.61	0.17	0.70	0.00	0.38	0.10	0.13	0.08	0.28	0.36	0.71	0.06	0.86	0.42	0.04	0.61	0.35	0.44
C5'	0.01	0.42	0.51	0.09	0.28	1.05	0.35	1.56	0.45	0.14	0.47	0.43	0.32	0.27	0.13	1.45	0.21	0.94	1.14	0.50	0.96	1.62	1.35
C6	0.37	0.08	0.21	0.18	0.11	0.89	0.02	1.11	0.12	0.26	0.15	0.11	0.05	0.11	0.29	0.85	0.10	1.09	0.86	0.19	1.02	0.98	0.96
N1	0.38	0.10	0.08	0.34	0.09	1.08	0.01	1.48	0.17	0.28	0.20	0.13	0.04	0.09	0.29	0.79	0.16	1.17	1.30	0.26	1.61	1.68	1.54
N3	0.38	0.13	0.09	0.21	0.17	0.81	0.15	1.08	0.06	0.45	0.19	0.23	0.03	0.35	0.36	0.60	0.13	0.94	0.91	0.12	1.38	1.09	1.11
N4	0.33	0.08	0.22	0.05	0.26	0.42	0.36	0.43	0.22	0.50	0.04	0.24	0.07	0.51	0.38	0.47	0.05	0.64	0.17	0.25	0.51	0.05	0.16
O2	0.39	0.15	0.03	0.44	0.10	1.12	0.01	1.63	0.20	0.34	0.25	0.21	0.01	0.15	0.30	0.66	0.20	1.13	1.54	0.30	2.15	2.15	1.96
O2'	0.20	0.09	0.13	0.37	0.01	1.19	0.08	1.92	0.17	0.08	0.17	0.09	0.00	0.05	0.12	1.03	0.03	1.12	1.80	0.25	2.28	2.82	2.37
O3'	0.21	0.15	0.33	0.22	0.03	1.18	0.12	1.76	0.23	0.06	0.23	0.15	0.04	0.08	0.10	1.26	0.10	1.16	1.44	0.30	1.53	2.18	1.80
O4'	0.21	0.18	0.16	0.39	0.08	1.24	0.19	1.84	0.28	0.00	0.26	0.17	0.08	0.15	0.07	1.05	0.06	1.18	1.60	0.35	1.70	2.18	1.89
O5'	0.01	0.52	0.65	0.05	0.36	0.91	0.45	1.22	0.57	0.21	0.60	0.54	0.39	0.36	0.18	1.50	0.16	0.89	0.70	0.63	0.42	0.96	0.79
OP1	0.51	1.38	1.25	0.68	1.00	0.30	1.01	0.55	1.22	0.59	1.39	1.52	1.19	0.77	0.70	1.95	0.66	0.30	0.07	1.23	0.49	0.10	0.05
OP2	0.83	1.00	1.65	1.23	0.96	0.29	0.95	0.18	0.97	0.84	0.99	0.98	0.99	0.88	0.88	2.29	1.18	0.15	0.70	0.96	1.18	0.53	0.73
P	0.37	0.92	1.11	0.57	0.72	0.39	0.75	0.62	0.87	0.49	0.95	0.96	0.80	0.62	0.53	1.86	0.59	0.41	0.05	0.90	0.38	0.23	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.15	0.01	0.04
C2	0.01	0.00	0.36	0.41	0.01	0.38	0.00	0.75	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.22	1.11	0.01	0.92	1.75	1.35
C2'	0.01	0.36	0.00	0.00	0.17	0.02	0.06	0.06	0.13	0.20	0.26	0.44	0.36	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.12	0.17	0.04
C3'	0.02	0.41	0.00	0.00	0.17	0.01	0.05	0.01	0.14	0.21	0.29	0.53	0.39	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.27	0.15	0.10
C4	0.01	0.01	0.17	0.17	0.00	0.15	0.01	0.28	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.09	0.41	0.00	0.03	0.64	0.43
C4'	0.00	0.38	0.02	0.01	0.15	0.00	0.03	0.01	0.11	0.24	0.27	0.50	0.37	0.18	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.25	0.14	0.04
C5	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.47	0.25	0.03
C5'	0.01	0.75	0.06	0.01	0.28	0.01	0.05	0.00	0.21	0.46	0.53	1.01	0.69	0.35	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.10	0.31	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.13	0.14	0.00	0.11	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.33	0.01	0.21	0.64	0.34
C8	0.01	0.01	0.20	0.21	0.00	0.24	0.01	0.46	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.16	0.65	0.03	1.23	0.71	0.82
N1	0.01	0.01	0.26	0.29	0.01	0.27	0.01	0.53	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.79	0.00	0.45	1.33	0.95
N2	0.01	0.00	0.44	0.53	0.01	0.50	0.00	1.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.27	1.48	0.02	1.51	2.41	1.89
N3	0.01	0.00	0.36	0.39	0.00	0.37	0.01	0.69	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.22	1.02	0.01	0.80	1.45	1.16
N7	0.02	0.00	0.13	0.15	0.02	0.18	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.11	0.12	0.48	0.03	1.19	0.52	0.67
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.09	0.01	0.07	0.01	0.43	0.00	0.12
O2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.16	0.22	0.05
O3'	0.10	0.02	0.01	0.01	0.07	0.03	0.08	0.02	0.06	0.11	0.04	0.00	0.03	0.11	0.09	0.03	0.00	0.10	0.04	0.05	0.42	0.13	0.14
O4'	0.00	0.22	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.02	0.06	0.16	0.15	0.27	0.22	0.12	0.01	0.00	0.10	0.00	0.03	0.03	0.00	0.14	0.00
O5'	0.02	1.11	0.08	0.02	0.41	0.02	0.09	0.01	0.33	0.65	0.79	1.48	1.02	0.48	0.07	0.09	0.04	0.03	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01
O6	0.00	0.01	0.09	0.10	0.00	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.17	0.00	0.49	0.41	0.13
OP1	0.15	0.92	0.12	0.27	0.03	0.25	0.47	0.31	0.21	1.23	0.45	1.51	0.80	1.19	0.43	0.16	0.42	0.00	0.01	0.49	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	1.75	0.17	0.15	0.64	0.14	0.25	0.27	0.64	0.71	1.33	2.41	1.45	0.52	0.00	0.22	0.13	0.14	0.01	0.41	0.00	0.00	0.00
P	0.04	1.35	0.04	0.10	0.43	0.04	0.03	0.02	0.34	0.82	0.95	1.89	1.16	0.67	0.12	0.05	0.14	0.00	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00