Doublet Group distance statistics: 49588

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 4, 12, 12, 13, 9, 8, 6, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, -0.002, 0.008, 0.018, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.008 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, -0.001, 0.011, 0.023, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.015 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.010, 0.029, 0.047, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.029 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.016, 0.039, 0.063, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.039 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.025, 0.102, 0.179, 0.340 max_d=0.340 avg_d=0.102 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.017, 0.099, 0.180, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.099 std_dev=0.081
O2'	A	0, 0.018, 0.128, 0.237, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.128 std_dev=0.110
C3'	A	0, 0.042, 0.168, 0.294, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.168 std_dev=0.126
C4'	A	0, 0.036, 0.165, 0.294, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.165 std_dev=0.129
O3'	A	0, 0.068, 0.249, 0.429, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.249 std_dev=0.180
C6	B	0, 0.320, 0.511, 0.701, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.511 std_dev=0.191
O4'	B	0, 0.335, 0.536, 0.736, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.536 std_dev=0.201
N4	B	0, 0.380, 0.586, 0.793, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.586 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.293, 0.500, 0.708, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.500 std_dev=0.207
C4	B	0, 0.324, 0.533, 0.742, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.533 std_dev=0.209
N1	B	0, 0.317, 0.532, 0.747, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.532 std_dev=0.215
P	B	0, 0.320, 0.536, 0.751, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.536 std_dev=0.215
O5'	A	0, 0.142, 0.359, 0.576, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.359 std_dev=0.217
C1'	B	0, 0.359, 0.578, 0.798, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.578 std_dev=0.220
OP2	B	0, 0.315, 0.538, 0.760, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.538 std_dev=0.223
C5'	A	0, 0.060, 0.285, 0.510, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.285 std_dev=0.225
C4'	B	0, 0.400, 0.633, 0.867, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.633 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.336, 0.573, 0.809, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.573 std_dev=0.236
OP1	B	0, 0.298, 0.539, 0.780, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.539 std_dev=0.241
C3'	B	0, 0.480, 0.727, 0.974, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.727 std_dev=0.247
C2'	B	0, 0.460, 0.708, 0.956, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.708 std_dev=0.248
C2	B	0, 0.319, 0.569, 0.819, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.569 std_dev=0.250
O5'	B	0, 0.435, 0.689, 0.942, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.689 std_dev=0.254
P	A	0, 0.121, 0.379, 0.637, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.379 std_dev=0.258
O2'	B	0, 0.475, 0.755, 1.034, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.755 std_dev=0.279
O3'	B	0, 0.552, 0.835, 1.118, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.835 std_dev=0.283
OP2	A	0, 0.282, 0.571, 0.860, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.571 std_dev=0.289
O2	B	0, 0.356, 0.645, 0.934, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.645 std_dev=0.289
C5'	B	0, 0.381, 0.687, 0.993, 2.149 max_d=2.149 avg_d=0.687 std_dev=0.306
OP1	A	0, 0.151, 0.565, 0.980, 3.004 max_d=3.004 avg_d=0.565 std_dev=0.414

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.13	0.21	0.23	0.13
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.17	0.22	0.29	0.19
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.07	0.00	0.02	0.01	0.09	0.17	0.26	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.07	0.09	0.02	0.01	0.01	0.13	0.18	0.28	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.18	0.25	0.31	0.23
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.16	0.22	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.04	0.18	0.28	0.30	0.25
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.16	0.10	0.13	0.17	0.08	0.04	0.05	0.01	0.01	0.14	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.03	0.18	0.28	0.26	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.17	0.24	0.26	0.19
N3	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.18	0.23	0.31	0.21
N4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.18	0.26	0.33	0.24
O2	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.02	0.17	0.21	0.30	0.17
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.05	0.04	0.06	0.19	0.27	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.05	0.07	0.03	0.07	0.07	0.11	0.05	0.00	0.02	0.19	0.26	0.33	0.16
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.17	0.24	0.23	0.16
O5'	0.13	0.17	0.09	0.13	0.18	0.01	0.18	0.01	0.18	0.17	0.18	0.18	0.17	0.06	0.19	0.17	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.21	0.22	0.17	0.18	0.25	0.16	0.28	0.14	0.28	0.24	0.23	0.26	0.21	0.19	0.26	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.29	0.26	0.28	0.31	0.22	0.30	0.19	0.26	0.26	0.31	0.33	0.30	0.27	0.33	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.19	0.07	0.09	0.23	0.03	0.25	0.02	0.23	0.19	0.21	0.24	0.17	0.05	0.16	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.12	0.22	0.21	0.16	0.23	0.13	0.22	0.13	0.14	0.13	0.23	0.21	0.26	0.22	0.23	0.24	0.14	0.18	0.15
C2	0.13	0.19	0.15	0.14	0.23	0.18	0.17	0.20	0.13	0.12	0.24	0.26	0.23	0.20	0.16	0.16	0.17	0.15	0.16	0.12
C2'	0.20	0.12	0.21	0.20	0.14	0.21	0.13	0.21	0.12	0.12	0.12	0.22	0.21	0.27	0.21	0.21	0.22	0.12	0.16	0.13
C3'	0.19	0.14	0.20	0.18	0.12	0.20	0.14	0.20	0.13	0.14	0.10	0.19	0.22	0.25	0.19	0.20	0.24	0.13	0.17	0.15
C4	0.09	0.19	0.08	0.10	0.22	0.14	0.19	0.19	0.15	0.13	0.22	0.24	0.20	0.13	0.11	0.10	0.15	0.14	0.15	0.10
C4'	0.24	0.20	0.23	0.22	0.14	0.23	0.17	0.23	0.18	0.19	0.14	0.19	0.27	0.27	0.23	0.23	0.28	0.15	0.19	0.18
C5	0.13	0.13	0.13	0.15	0.18	0.18	0.16	0.21	0.13	0.10	0.17	0.22	0.15	0.15	0.16	0.17	0.22	0.10	0.18	0.14
C5'	0.27	0.25	0.26	0.26	0.22	0.27	0.26	0.28	0.26	0.25	0.22	0.23	0.30	0.27	0.26	0.27	0.34	0.22	0.25	0.25
C6	0.17	0.11	0.16	0.17	0.16	0.21	0.14	0.22	0.13	0.11	0.15	0.22	0.16	0.19	0.18	0.21	0.25	0.12	0.19	0.15
N1	0.16	0.11	0.16	0.16	0.18	0.20	0.14	0.21	0.10	0.08	0.18	0.24	0.17	0.20	0.17	0.20	0.21	0.13	0.17	0.13
N3	0.12	0.23	0.12	0.12	0.24	0.16	0.20	0.20	0.16	0.16	0.26	0.26	0.25	0.17	0.13	0.13	0.14	0.16	0.16	0.12
N4	0.14	0.21	0.12	0.13	0.22	0.14	0.21	0.21	0.18	0.17	0.23	0.24	0.22	0.14	0.13	0.12	0.13	0.17	0.16	0.12
O2	0.16	0.22	0.20	0.18	0.24	0.19	0.18	0.20	0.15	0.15	0.26	0.27	0.26	0.25	0.19	0.17	0.17	0.16	0.16	0.12
O2'	0.25	0.15	0.28	0.25	0.16	0.25	0.14	0.23	0.14	0.16	0.14	0.24	0.24	0.34	0.27	0.24	0.23	0.14	0.18	0.15
O3'	0.20	0.14	0.21	0.19	0.12	0.20	0.15	0.20	0.14	0.14	0.10	0.19	0.23	0.26	0.20	0.20	0.23	0.14	0.16	0.15
O4'	0.25	0.20	0.25	0.23	0.12	0.24	0.15	0.24	0.17	0.20	0.12	0.20	0.28	0.28	0.24	0.25	0.28	0.16	0.21	0.19
O5'	0.35	0.34	0.34	0.34	0.30	0.34	0.32	0.34	0.33	0.34	0.31	0.28	0.36	0.35	0.34	0.34	0.38	0.29	0.29	0.30
OP1	0.35	0.37	0.34	0.34	0.38	0.33	0.38	0.30	0.36	0.36	0.38	0.38	0.38	0.35	0.33	0.34	0.33	0.30	0.28	0.28
OP2	0.34	0.31	0.32	0.32	0.20	0.35	0.21	0.35	0.26	0.30	0.26	0.17	0.36	0.36	0.32	0.35	0.31	0.26	0.39	0.31
P	0.30	0.30	0.28	0.28	0.23	0.29	0.23	0.28	0.26	0.28	0.27	0.20	0.33	0.31	0.28	0.30	0.27	0.21	0.28	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.18	0.11	0.07
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.14	0.18	0.12	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.02	0.01	0.08	0.18	0.10	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.04	0.07	0.07	0.10	0.02	0.01	0.01	0.11	0.18	0.12	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.18	0.17	0.13	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.15	0.09	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.19	0.17	0.13	0.11
C5'	0.03	0.07	0.03	0.03	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.09	0.12	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.12	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.03	0.17	0.17	0.13	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.13	0.18	0.11	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.16	0.18	0.12	0.09
N4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.02	0.19	0.17	0.14	0.12
O2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.11	0.05	0.12	0.18	0.13	0.09
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.04	0.04	0.09	0.00	0.06	0.04	0.05	0.17	0.11	0.07
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.04	0.08	0.08	0.11	0.06	0.00	0.02	0.13	0.18	0.12	0.10
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.00	0.09	0.18	0.12	0.09
O5'	0.08	0.14	0.08	0.11	0.18	0.02	0.19	0.01	0.17	0.13	0.16	0.19	0.12	0.05	0.13	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.18	0.18	0.18	0.18	0.17	0.15	0.17	0.12	0.17	0.18	0.18	0.17	0.18	0.17	0.18	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.12	0.10	0.12	0.13	0.09	0.13	0.12	0.13	0.11	0.12	0.14	0.13	0.11	0.12	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.06	0.09	0.11	0.04	0.11	0.02	0.09	0.08	0.09	0.12	0.09	0.07	0.10	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00