Doublet Group distance statistics: 49589

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 10, 23, 4, 7, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.001, 0.007, 0.014, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.012 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.028 std_dev=0.015
O3'	A	0, 0.103, 0.162, 0.220, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.162 std_dev=0.059
C6	B	0, 0.185, 0.335, 0.484, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.335 std_dev=0.150
C3'	A	0, 0.024, 0.188, 0.352, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.188 std_dev=0.164
O4'	B	0, 0.179, 0.348, 0.517, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.348 std_dev=0.169
C5	B	0, 0.170, 0.345, 0.520, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.345 std_dev=0.175
N1	B	0, 0.119, 0.307, 0.495, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.307 std_dev=0.188
C2'	A	0, -0.041, 0.161, 0.363, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.161 std_dev=0.202
O4'	A	0, -0.059, 0.153, 0.364, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.153 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.051, 0.300, 0.548, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.300 std_dev=0.248
OP2	A	0, 0.346, 0.614, 0.881, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.614 std_dev=0.267
C4'	A	0, -0.024, 0.245, 0.515, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.245 std_dev=0.269
C2	B	0, 0.046, 0.320, 0.595, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.320 std_dev=0.274
N3	B	0, 0.033, 0.320, 0.608, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.320 std_dev=0.287
C1'	B	0, 0.061, 0.362, 0.662, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.362 std_dev=0.300
O2'	A	0, -0.099, 0.253, 0.605, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.253 std_dev=0.352
N4	B	0, -0.033, 0.341, 0.715, 2.100 max_d=2.100 avg_d=0.341 std_dev=0.374
C4'	B	0, 0.089, 0.468, 0.847, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.468 std_dev=0.379
O2	B	0, 0.029, 0.416, 0.803, 2.127 max_d=2.127 avg_d=0.416 std_dev=0.387
O5'	A	0, -0.040, 0.433, 0.906, 2.665 max_d=2.665 avg_d=0.433 std_dev=0.473
C5'	A	0, -0.074, 0.413, 0.899, 2.741 max_d=2.741 avg_d=0.413 std_dev=0.486
P	A	0, 0.036, 0.606, 1.175, 3.337 max_d=3.337 avg_d=0.606 std_dev=0.569
C5'	B	0, -0.018, 0.561, 1.140, 3.403 max_d=3.403 avg_d=0.561 std_dev=0.579
C2'	B	0, -0.092, 0.495, 1.082, 3.393 max_d=3.393 avg_d=0.495 std_dev=0.587
C3'	B	0, -0.073, 0.546, 1.164, 3.651 max_d=3.651 avg_d=0.546 std_dev=0.619
OP1	B	0, 0.136, 0.756, 1.376, 3.735 max_d=3.735 avg_d=0.756 std_dev=0.620
O5'	B	0, -0.278, 0.486, 1.250, 4.292 max_d=4.292 avg_d=0.486 std_dev=0.764
O2'	B	0, -0.212, 0.553, 1.317, 4.335 max_d=4.335 avg_d=0.553 std_dev=0.764
O3'	B	0, -0.179, 0.702, 1.583, 5.155 max_d=5.155 avg_d=0.702 std_dev=0.881
OP1	A	0, -0.135, 0.788, 1.712, 5.370 max_d=5.370 avg_d=0.788 std_dev=0.924
P	B	0, -0.368, 0.619, 1.607, 5.573 max_d=5.573 avg_d=0.619 std_dev=0.987
OP2	B	0, -0.550, 0.759, 2.068, 7.345 max_d=7.345 avg_d=0.759 std_dev=1.309

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.08	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.06	0.09	0.07	0.29	0.14	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.04	0.17	0.18	0.11
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.35	0.13	0.16
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.02	0.15	0.57	0.22	0.30
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.05	0.03	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.20	0.12	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.07	0.20	0.62	0.24	0.34
C5'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.15	0.04	0.05	0.07	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.16	0.16	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.10	0.19	0.46	0.20	0.28
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.09	0.27	0.14	0.16
N3	0.02	0.00	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.06	0.07	0.10	0.44	0.18	0.22
N4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.16	0.66	0.24	0.33
O2	0.02	0.00	0.09	0.02	0.01	0.13	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.06	0.16	0.06	0.18	0.12	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.10	0.07	0.21	0.00	0.03	0.01	0.05	0.22	0.27	0.16
O3'	0.04	0.06	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.03	0.00	0.03	0.05	0.40	0.10	0.16
O4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.16	0.01	0.03	0.00	0.05	0.06	0.21	0.09
O5'	0.04	0.07	0.04	0.05	0.15	0.01	0.20	0.00	0.19	0.09	0.10	0.16	0.06	0.05	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.29	0.17	0.35	0.57	0.20	0.62	0.16	0.46	0.27	0.44	0.66	0.18	0.22	0.40	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.14	0.18	0.13	0.22	0.12	0.24	0.16	0.20	0.14	0.18	0.24	0.12	0.27	0.10	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.15	0.11	0.16	0.30	0.04	0.34	0.01	0.28	0.16	0.22	0.33	0.09	0.16	0.16	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.25	0.30	0.12	0.14	0.09	0.16	0.22	0.09	0.18	0.17	0.28	0.41	0.44	0.16	0.10	0.38	0.25	0.95	0.52
C2	0.30	0.23	0.36	0.17	0.18	0.11	0.16	0.22	0.11	0.19	0.16	0.31	0.37	0.50	0.22	0.12	0.38	0.23	0.83	0.48
C2'	0.21	0.20	0.22	0.07	0.20	0.10	0.25	0.29	0.13	0.12	0.13	0.36	0.37	0.38	0.07	0.08	0.48	0.37	1.14	0.66
C3'	0.20	0.20	0.23	0.07	0.17	0.08	0.21	0.24	0.11	0.13	0.14	0.32	0.35	0.36	0.09	0.08	0.41	0.28	1.05	0.56
C4	0.22	0.17	0.20	0.09	0.11	0.11	0.13	0.27	0.12	0.15	0.11	0.18	0.25	0.31	0.10	0.09	0.45	0.25	0.85	0.53
C4'	0.18	0.19	0.21	0.09	0.14	0.08	0.16	0.17	0.09	0.12	0.13	0.26	0.30	0.31	0.11	0.08	0.29	0.15	0.87	0.40
C5	0.18	0.21	0.13	0.12	0.11	0.13	0.16	0.29	0.13	0.15	0.17	0.14	0.29	0.22	0.11	0.07	0.47	0.29	1.02	0.60
C5'	0.12	0.13	0.11	0.09	0.16	0.09	0.18	0.15	0.11	0.09	0.11	0.27	0.21	0.18	0.08	0.07	0.26	0.11	0.84	0.34
C6	0.21	0.25	0.18	0.08	0.11	0.10	0.16	0.26	0.11	0.17	0.19	0.19	0.35	0.29	0.08	0.08	0.43	0.28	1.03	0.57
N1	0.26	0.25	0.28	0.11	0.14	0.09	0.16	0.23	0.10	0.18	0.16	0.27	0.39	0.41	0.14	0.10	0.40	0.25	0.94	0.52
N3	0.29	0.19	0.33	0.16	0.16	0.11	0.14	0.23	0.12	0.18	0.15	0.26	0.30	0.47	0.19	0.12	0.39	0.22	0.77	0.47
N4	0.17	0.12	0.14	0.13	0.09	0.15	0.11	0.30	0.12	0.12	0.11	0.13	0.17	0.23	0.12	0.09	0.48	0.25	0.75	0.51
O2	0.34	0.23	0.44	0.24	0.21	0.14	0.17	0.20	0.12	0.21	0.19	0.35	0.38	0.60	0.31	0.15	0.34	0.21	0.76	0.44
O2'	0.26	0.23	0.27	0.07	0.20	0.10	0.26	0.34	0.14	0.15	0.14	0.36	0.42	0.47	0.08	0.09	0.56	0.48	1.24	0.78
O3'	0.24	0.23	0.30	0.11	0.15	0.08	0.19	0.26	0.10	0.15	0.15	0.29	0.39	0.45	0.15	0.08	0.41	0.30	1.04	0.57
O4'	0.21	0.22	0.26	0.13	0.13	0.09	0.15	0.17	0.09	0.15	0.16	0.25	0.33	0.35	0.16	0.09	0.28	0.15	0.82	0.38
O5'	0.15	0.16	0.10	0.08	0.13	0.07	0.17	0.12	0.09	0.10	0.12	0.26	0.25	0.18	0.07	0.09	0.25	0.11	0.88	0.36
OP1	0.61	0.55	0.51	0.44	0.40	0.53	0.41	0.49	0.50	0.56	0.48	0.27	0.59	0.59	0.42	0.61	0.33	0.55	0.37	0.24
OP2	0.28	0.38	0.20	0.11	0.27	0.15	0.14	0.12	0.17	0.28	0.39	0.26	0.45	0.25	0.10	0.23	0.12	0.14	0.75	0.22
P	0.29	0.31	0.21	0.12	0.16	0.19	0.11	0.15	0.17	0.26	0.27	0.11	0.38	0.28	0.11	0.27	0.08	0.19	0.68	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.09	0.13	0.06
C2	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.09	0.09	0.14	0.28	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.07	0.03	0.16	0.00	0.02	0.01	0.04	0.21	0.08	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.11	0.01	0.01	0.01	0.06	0.28	0.10	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.10	0.24	0.37	0.13
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.04	0.05	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.09	0.03
C5	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.06	0.11	0.25	0.33	0.13
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.13	0.05	0.08	0.10	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.06	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.09	0.11	0.17	0.25	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.11	0.22	0.08
N3	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.07	0.11	0.19	0.35	0.14
N4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.11	0.28	0.41	0.15
O2	0.02	0.00	0.16	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.14	0.13	0.11	0.12	0.25	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.04	0.14	0.00	0.04	0.03	0.04	0.22	0.08	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.05	0.14	0.04	0.00	0.01	0.06	0.38	0.19	0.07
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.07	0.03	0.13	0.03	0.01	0.00	0.05	0.06	0.09	0.05
O5'	0.03	0.09	0.04	0.06	0.10	0.01	0.11	0.01	0.11	0.06	0.11	0.11	0.11	0.04	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.14	0.21	0.28	0.24	0.13	0.25	0.05	0.17	0.11	0.19	0.28	0.12	0.22	0.38	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.28	0.08	0.10	0.37	0.09	0.33	0.15	0.25	0.22	0.35	0.41	0.25	0.08	0.19	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.06	0.06	0.13	0.03	0.13	0.01	0.10	0.08	0.14	0.15	0.12	0.05	0.07	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00