Doublet Group distance statistics: 49591

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.014, 0.038, 0.061, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.038 std_dev=0.024
C6	A	0, 0.016, 0.040, 0.064, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.040 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.009, 0.035, 0.061, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.035 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.040 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.030, 0.076, 0.122, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.076 std_dev=0.046
O2	A	0, 0.018, 0.105, 0.192, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.105 std_dev=0.087
P	B	0, 0.194, 0.479, 0.763, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.479 std_dev=0.285
O2'	A	0, 0.039, 0.349, 0.659, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.349 std_dev=0.310
N1	B	0, 0.201, 0.535, 0.870, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.535 std_dev=0.335
C6	B	0, 0.184, 0.520, 0.856, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.520 std_dev=0.336
C2'	A	0, -0.069, 0.271, 0.611, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.271 std_dev=0.340
C1'	B	0, 0.203, 0.544, 0.884, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.544 std_dev=0.340
C5	B	0, 0.199, 0.551, 0.904, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.551 std_dev=0.353
O4'	A	0, 0.020, 0.375, 0.731, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.375 std_dev=0.356
C2	B	0, 0.220, 0.578, 0.936, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.578 std_dev=0.358
O2'	B	0, 0.261, 0.622, 0.983, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.622 std_dev=0.361
C4	B	0, 0.222, 0.587, 0.951, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.587 std_dev=0.365
O2	B	0, 0.242, 0.613, 0.984, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.613 std_dev=0.371
OP2	B	0, 0.085, 0.456, 0.827, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.456 std_dev=0.371
N3	B	0, 0.226, 0.598, 0.970, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.598 std_dev=0.372
N4	B	0, 0.235, 0.617, 1.000, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.617 std_dev=0.382
O4'	B	0, 0.134, 0.558, 0.982, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.558 std_dev=0.424
O5'	B	0, 0.147, 0.572, 0.997, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.572 std_dev=0.425
OP1	B	0, 0.250, 0.690, 1.131, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.690 std_dev=0.441
C2'	B	0, 0.248, 0.753, 1.258, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.753 std_dev=0.505
C4'	A	0, 0.044, 0.563, 1.081, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.563 std_dev=0.518
C3'	A	0, 0.008, 0.553, 1.098, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.553 std_dev=0.545
C4'	B	0, 0.086, 0.779, 1.471, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.779 std_dev=0.692
C3'	B	0, 0.188, 0.938, 1.688, 2.094 max_d=2.094 avg_d=0.938 std_dev=0.750
O3'	A	0, 0.041, 0.811, 1.581, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.811 std_dev=0.770
O5'	A	0, 0.101, 0.895, 1.688, 2.158 max_d=2.158 avg_d=0.895 std_dev=0.793
C5'	B	0, 0.080, 0.950, 1.819, 2.331 max_d=2.331 avg_d=0.950 std_dev=0.869
C5'	A	0, -0.016, 0.863, 1.741, 2.317 max_d=2.317 avg_d=0.863 std_dev=0.878
P	A	0, 0.003, 0.946, 1.889, 2.516 max_d=2.516 avg_d=0.946 std_dev=0.943
O3'	B	0, 0.206, 1.166, 2.125, 2.665 max_d=2.665 avg_d=1.166 std_dev=0.959
OP1	A	0, -0.035, 1.057, 2.149, 2.888 max_d=2.888 avg_d=1.057 std_dev=1.092
OP2	A	0, -0.051, 1.110, 2.270, 3.056 max_d=3.056 avg_d=1.110 std_dev=1.161

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.09	0.02	0.03	0.00	0.06	0.13	0.11	0.06
C2	0.03	0.00	0.16	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.14	0.04	0.04	0.17	0.12	0.14
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.12	0.02	0.13	0.04	0.30	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.18	0.04
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.19	0.04	0.09	0.06	0.25	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.24	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.15	0.19	0.10	0.11
C4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.03	0.04	0.07	0.12	0.06	0.05	0.00	0.01	0.09	0.20	0.02
C5	0.02	0.01	0.08	0.17	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.04	0.21	0.18	0.06	0.10
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.07	0.03	0.06	0.10	0.11	0.06	0.06	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01
C6	0.03	0.01	0.12	0.19	0.01	0.09	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.21	0.04	0.19	0.16	0.05	0.07
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.07	0.16	0.05	0.10
N3	0.02	0.01	0.13	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.15	0.12	0.05	0.08	0.18	0.14	0.13
N4	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.07	0.06	0.18	0.22	0.14	0.12
O2	0.09	0.00	0.30	0.25	0.02	0.12	0.01	0.11	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.31	0.29	0.07	0.08	0.19	0.17	0.18
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.09	0.03	0.15	0.08	0.31	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.25	0.03
O3'	0.03	0.14	0.02	0.01	0.06	0.05	0.18	0.06	0.21	0.04	0.12	0.07	0.29	0.04	0.00	0.04	0.10	0.06	0.33	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.07	0.04	0.04	0.00	0.09	0.14	0.11	0.07
O5'	0.06	0.04	0.03	0.06	0.15	0.01	0.21	0.01	0.19	0.07	0.08	0.18	0.08	0.01	0.10	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.13	0.17	0.09	0.06	0.19	0.09	0.18	0.08	0.16	0.16	0.18	0.22	0.19	0.05	0.06	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.12	0.18	0.24	0.10	0.20	0.06	0.19	0.05	0.05	0.14	0.14	0.17	0.25	0.33	0.11	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.06	0.14	0.04	0.05	0.11	0.02	0.10	0.01	0.07	0.10	0.13	0.12	0.18	0.03	0.10	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.14	0.33	0.32	0.11	0.21	0.17	0.16	0.24	0.22	0.15	0.19	0.15	0.29	0.29	0.19	0.32	0.23	0.20	0.25
C2	0.09	0.27	0.12	0.09	0.28	0.04	0.12	0.04	0.06	0.08	0.37	0.34	0.30	0.14	0.06	0.04	0.31	0.20	0.11	0.18
C2'	0.34	0.17	0.40	0.35	0.13	0.22	0.11	0.13	0.21	0.24	0.14	0.25	0.19	0.42	0.32	0.21	0.35	0.18	0.14	0.21
C3'	0.21	0.12	0.25	0.21	0.23	0.10	0.08	0.04	0.07	0.12	0.23	0.40	0.15	0.28	0.19	0.10	0.22	0.12	0.06	0.10
C4	0.07	0.36	0.08	0.09	0.42	0.11	0.29	0.14	0.17	0.21	0.45	0.46	0.33	0.07	0.11	0.09	0.34	0.17	0.09	0.17
C4'	0.17	0.15	0.20	0.20	0.20	0.12	0.07	0.08	0.10	0.12	0.24	0.35	0.17	0.18	0.20	0.10	0.17	0.11	0.14	0.12
C5	0.11	0.20	0.10	0.13	0.31	0.12	0.12	0.10	0.04	0.04	0.33	0.40	0.19	0.15	0.11	0.12	0.35	0.18	0.22	0.25
C5'	0.12	0.24	0.14	0.11	0.34	0.08	0.17	0.08	0.09	0.13	0.36	0.54	0.25	0.15	0.12	0.08	0.10	0.16	0.14	0.09
C6	0.21	0.10	0.21	0.24	0.18	0.18	0.09	0.14	0.20	0.14	0.22	0.30	0.12	0.22	0.21	0.18	0.36	0.23	0.25	0.28
N1	0.20	0.12	0.22	0.22	0.18	0.14	0.08	0.10	0.16	0.13	0.25	0.28	0.15	0.22	0.18	0.14	0.32	0.22	0.19	0.23
N3	0.09	0.40	0.07	0.08	0.39	0.12	0.25	0.14	0.16	0.23	0.46	0.42	0.40	0.05	0.14	0.12	0.32	0.19	0.07	0.15
N4	0.23	0.43	0.25	0.29	0.49	0.28	0.41	0.33	0.35	0.35	0.49	0.50	0.39	0.10	0.29	0.25	0.38	0.22	0.07	0.16
O2	0.09	0.24	0.14	0.10	0.23	0.02	0.10	0.04	0.08	0.09	0.32	0.28	0.31	0.15	0.09	0.02	0.27	0.21	0.10	0.16
O2'	0.45	0.27	0.55	0.49	0.13	0.33	0.20	0.24	0.31	0.35	0.15	0.15	0.31	0.56	0.46	0.30	0.40	0.24	0.19	0.26
O3'	0.24	0.11	0.29	0.23	0.21	0.11	0.08	0.04	0.07	0.13	0.19	0.39	0.15	0.33	0.23	0.11	0.22	0.14	0.05	0.09
O4'	0.17	0.15	0.19	0.23	0.14	0.15	0.11	0.13	0.16	0.13	0.23	0.25	0.19	0.16	0.21	0.13	0.21	0.16	0.20	0.19
O5'	0.13	0.35	0.18	0.16	0.56	0.18	0.40	0.23	0.26	0.24	0.51	0.79	0.32	0.15	0.16	0.16	0.11	0.34	0.09	0.18
OP1	0.25	0.38	0.33	0.25	0.51	0.21	0.38	0.23	0.29	0.30	0.48	0.70	0.37	0.33	0.25	0.19	0.23	0.34	0.30	0.24
OP2	0.05	0.28	0.10	0.05	0.49	0.03	0.30	0.05	0.14	0.14	0.45	0.73	0.26	0.07	0.05	0.04	0.19	0.21	0.29	0.13
P	0.12	0.30	0.18	0.11	0.49	0.09	0.33	0.12	0.19	0.19	0.44	0.72	0.29	0.16	0.11	0.07	0.14	0.26	0.21	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.00	0.05	0.22	0.20	0.06
C2	0.01	0.00	0.13	0.20	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.19	0.05	0.10	0.20	0.15	0.08
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.12	0.08	0.21	0.01	0.01	0.02	0.26	0.22	0.31	0.17
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.18	0.00	0.11	0.02	0.07	0.11	0.21	0.20	0.22	0.02	0.01	0.02	0.35	0.17	0.37	0.16
C4	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.22	0.03	0.17	0.14	0.12	0.10
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.06	0.07	0.07	0.13	0.02	0.00	0.00	0.27	0.32	0.01
C5	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.02	0.18	0.15	0.10	0.10
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.08	0.00	0.07	0.06	0.09	0.10	0.09	0.11	0.03	0.01	0.01	0.31	0.40	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.04	0.13	0.20	0.12	0.08
N1	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.08	0.22	0.15	0.07
N3	0.01	0.00	0.12	0.21	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.23	0.05	0.14	0.16	0.15	0.09
N4	0.02	0.02	0.08	0.20	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.26	0.03	0.19	0.13	0.13	0.11
O2	0.04	0.00	0.21	0.22	0.01	0.07	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.21	0.07	0.06	0.22	0.16	0.08
O2'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.13	0.05	0.11	0.04	0.02	0.03	0.03	0.08	0.00	0.05	0.10	0.10	0.20	0.26	0.05
O3'	0.03	0.19	0.01	0.01	0.22	0.02	0.15	0.03	0.08	0.10	0.23	0.26	0.21	0.05	0.00	0.03	0.33	0.19	0.37	0.13
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.10	0.03	0.00	0.17	0.26	0.22	0.09
O5'	0.05	0.10	0.26	0.35	0.17	0.00	0.18	0.01	0.13	0.08	0.14	0.19	0.06	0.10	0.33	0.17	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.22	0.20	0.22	0.17	0.14	0.27	0.15	0.31	0.20	0.22	0.16	0.13	0.22	0.20	0.19	0.26	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.15	0.31	0.37	0.12	0.32	0.10	0.40	0.12	0.15	0.15	0.13	0.16	0.26	0.37	0.22	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.06	0.08	0.17	0.16	0.10	0.01	0.10	0.01	0.08	0.07	0.09	0.11	0.08	0.05	0.13	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00