Doublet Group distance statistics: 49600

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 13, 11, 2, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.008, 0.012, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.010, 0.014, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.022, 0.035, 0.047, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.035 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.022, 0.037, 0.053, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.015
O4'	A	0, 0.045, 0.123, 0.202, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.123 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.036, 0.124, 0.211, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.124 std_dev=0.088
C4'	A	0, 0.079, 0.190, 0.300, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.190 std_dev=0.110
O2'	A	0, 0.022, 0.136, 0.249, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.136 std_dev=0.113
C3'	A	0, 0.066, 0.207, 0.348, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.207 std_dev=0.141
N9	B	0, 0.211, 0.361, 0.510, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.361 std_dev=0.150
C5	B	0, 0.122, 0.274, 0.425, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.274 std_dev=0.152
C4	B	0, 0.128, 0.281, 0.434, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.281 std_dev=0.153
C1'	B	0, 0.261, 0.418, 0.575, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.418 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.071, 0.244, 0.417, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.244 std_dev=0.173
N6	B	0, 0.078, 0.254, 0.430, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.254 std_dev=0.176
N7	B	0, 0.201, 0.381, 0.561, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.381 std_dev=0.180
C8	B	0, 0.252, 0.433, 0.614, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.433 std_dev=0.181
N3	B	0, 0.115, 0.314, 0.514, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.314 std_dev=0.200
C5'	A	0, 0.110, 0.319, 0.527, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.319 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.090, 0.308, 0.526, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.308 std_dev=0.218
O3'	A	0, 0.082, 0.307, 0.531, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.307 std_dev=0.224
C2	B	0, 0.110, 0.346, 0.583, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.346 std_dev=0.237
O5'	A	0, 0.095, 0.357, 0.620, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.357 std_dev=0.263
O4'	B	0, 0.196, 0.522, 0.847, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.522 std_dev=0.326
C2'	B	0, 0.174, 0.528, 0.882, 2.177 max_d=2.177 avg_d=0.528 std_dev=0.354
O2'	B	0, 0.243, 0.650, 1.057, 2.688 max_d=2.688 avg_d=0.650 std_dev=0.407
P	A	0, 0.111, 0.522, 0.933, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.522 std_dev=0.411
C4'	B	0, 0.189, 0.658, 1.126, 2.580 max_d=2.580 avg_d=0.658 std_dev=0.468
C3'	B	0, 0.110, 0.635, 1.160, 3.081 max_d=3.081 avg_d=0.635 std_dev=0.525
OP2	A	0, 0.185, 0.807, 1.429, 2.585 max_d=2.585 avg_d=0.807 std_dev=0.622
O3'	B	0, 0.111, 0.839, 1.568, 4.277 max_d=4.277 avg_d=0.839 std_dev=0.729
C5'	B	0, -0.058, 0.786, 1.630, 4.762 max_d=4.762 avg_d=0.786 std_dev=0.844
OP1	A	0, -0.057, 0.924, 1.904, 3.832 max_d=3.832 avg_d=0.924 std_dev=0.980
O5'	B	0, -0.238, 0.836, 1.909, 4.657 max_d=4.657 avg_d=0.836 std_dev=1.074
OP2	B	0, -0.442, 1.085, 2.612, 8.491 max_d=8.491 avg_d=1.085 std_dev=1.527
P	B	0, -0.514, 1.079, 2.672, 6.426 max_d=6.426 avg_d=1.079 std_dev=1.593
OP1	B	0, -0.845, 1.265, 3.375, 7.232 max_d=7.232 avg_d=1.265 std_dev=2.110

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.11	0.20	0.06
C2	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.09	0.12	0.39	0.10
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.13	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.05	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.10	0.14	0.52	0.12
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.10	0.16	0.48	0.11
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.07	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.09	0.16	0.38	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.13	0.33	0.08
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.10	0.12	0.48	0.12
N4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.10	0.14	0.56	0.13
O2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.03	0.08	0.10	0.36	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.00	0.05	0.02	0.04	0.08	0.08	0.05
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.09	0.03	0.12	0.03	0.10	0.04	0.06	0.11	0.07	0.05	0.00	0.03	0.08	0.27	0.19	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.06	0.18	0.13	0.05
O5'	0.06	0.09	0.04	0.05	0.10	0.02	0.10	0.01	0.09	0.08	0.10	0.10	0.08	0.04	0.08	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.11	0.12	0.09	0.16	0.14	0.04	0.16	0.05	0.16	0.13	0.12	0.14	0.10	0.08	0.27	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.39	0.13	0.07	0.52	0.05	0.48	0.12	0.38	0.33	0.48	0.56	0.36	0.08	0.19	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.10	0.06	0.06	0.12	0.02	0.11	0.02	0.09	0.08	0.12	0.13	0.09	0.05	0.07	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.15	0.28	0.23	0.07	0.29	0.09	0.40	0.13	0.08	0.16	0.11	0.14	0.08	0.05	0.33	0.30	0.32	0.38	0.44	0.44	0.54
C2	0.16	0.10	0.23	0.22	0.08	0.29	0.07	0.39	0.09	0.16	0.11	0.08	0.11	0.12	0.13	0.26	0.25	0.27	0.36	0.66	0.48	0.49
C2'	0.10	0.18	0.29	0.26	0.08	0.35	0.08	0.51	0.13	0.10	0.18	0.14	0.13	0.08	0.06	0.36	0.35	0.35	0.53	0.67	0.63	0.79
C3'	0.07	0.28	0.27	0.22	0.16	0.26	0.14	0.40	0.19	0.08	0.26	0.24	0.17	0.09	0.08	0.34	0.34	0.31	0.47	0.67	0.52	0.72
C4	0.15	0.08	0.20	0.21	0.10	0.23	0.09	0.31	0.06	0.17	0.09	0.08	0.08	0.14	0.14	0.19	0.23	0.23	0.27	0.71	0.24	0.30
C4'	0.11	0.27	0.28	0.22	0.19	0.19	0.17	0.29	0.20	0.12	0.25	0.24	0.18	0.13	0.13	0.34	0.34	0.29	0.39	0.55	0.35	0.57
C5	0.14	0.12	0.22	0.25	0.07	0.22	0.07	0.30	0.09	0.14	0.14	0.08	0.11	0.11	0.12	0.19	0.29	0.22	0.22	0.54	0.14	0.19
C5'	0.21	0.33	0.33	0.29	0.25	0.12	0.21	0.16	0.23	0.16	0.29	0.32	0.20	0.16	0.20	0.35	0.41	0.26	0.25	0.42	0.23	0.40
C6	0.12	0.16	0.24	0.25	0.06	0.22	0.08	0.28	0.13	0.12	0.17	0.10	0.13	0.09	0.09	0.22	0.30	0.23	0.20	0.41	0.18	0.23
N1	0.13	0.13	0.24	0.22	0.05	0.26	0.06	0.34	0.11	0.12	0.15	0.09	0.13	0.08	0.09	0.26	0.27	0.27	0.29	0.47	0.35	0.40
N3	0.16	0.09	0.21	0.21	0.10	0.26	0.10	0.34	0.08	0.18	0.10	0.09	0.10	0.16	0.15	0.23	0.22	0.24	0.33	0.77	0.40	0.42
N4	0.16	0.09	0.19	0.21	0.12	0.23	0.13	0.32	0.09	0.18	0.08	0.10	0.09	0.16	0.16	0.17	0.22	0.22	0.30	0.81	0.20	0.30
O2	0.16	0.10	0.24	0.26	0.09	0.34	0.09	0.49	0.10	0.17	0.11	0.09	0.12	0.13	0.13	0.29	0.29	0.29	0.47	0.73	0.66	0.64
O2'	0.14	0.15	0.32	0.33	0.07	0.44	0.07	0.63	0.10	0.12	0.14	0.12	0.11	0.09	0.09	0.43	0.43	0.39	0.72	0.94	0.82	1.03
O3'	0.06	0.29	0.28	0.26	0.14	0.32	0.13	0.49	0.19	0.08	0.27	0.24	0.17	0.08	0.06	0.36	0.40	0.35	0.63	0.97	0.68	0.95
O4'	0.08	0.21	0.27	0.20	0.17	0.19	0.17	0.26	0.19	0.12	0.21	0.19	0.18	0.15	0.11	0.31	0.30	0.27	0.30	0.33	0.26	0.40
O5'	0.22	0.39	0.33	0.31	0.27	0.14	0.22	0.18	0.25	0.16	0.33	0.37	0.21	0.16	0.21	0.34	0.42	0.24	0.20	0.29	0.20	0.32
OP1	0.71	0.89	0.89	0.79	0.75	0.54	0.64	0.41	0.65	0.55	0.77	0.91	0.57	0.53	0.67	0.96	0.87	0.52	0.41	0.21	0.30	0.18
OP2	0.13	0.15	0.33	0.40	0.13	0.18	0.21	0.30	0.24	0.20	0.19	0.14	0.31	0.25	0.13	0.37	0.51	0.17	0.13	0.23	0.35	0.32
P	0.28	0.47	0.45	0.45	0.32	0.19	0.26	0.20	0.30	0.18	0.39	0.45	0.25	0.19	0.26	0.47	0.56	0.18	0.13	0.14	0.25	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.23	0.28	0.10	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.23	0.01	0.26	0.00	0.46	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.22	0.14	0.53	0.83	0.39	0.48
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.09	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.28	0.12	0.18
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.02	0.08	0.17	0.16	0.24	0.06	0.13	0.05	0.01	0.01	0.01	0.21	0.27	0.13	0.21
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.12	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.08	0.46	0.78	0.20	0.40
C4'	0.01	0.26	0.01	0.00	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.14	0.19	0.25	0.07	0.09	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.18	0.13	0.09
C5	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.04	0.56	1.05	0.27	0.55
C5'	0.02	0.46	0.02	0.02	0.22	0.00	0.12	0.00	0.22	0.20	0.37	0.42	0.16	0.13	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.10	0.07	0.58	1.13	0.26	0.57
C8	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.08	0.63	0.94	0.45	0.59
N1	0.02	0.00	0.08	0.16	0.01	0.19	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.17	0.11	0.56	1.01	0.30	0.52
N3	0.02	0.00	0.09	0.24	0.00	0.25	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.21	0.14	0.47	0.69	0.36	0.41
N6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.05	0.62	1.30	0.33	0.66
N7	0.01	0.00	0.03	0.13	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.04	0.66	1.18	0.47	0.68
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.44	0.65	0.20	0.36
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.03	0.06	0.05	0.11	0.13	0.05	0.03	0.01	0.00	0.05	0.03	0.06	0.19	0.19	0.08
O3'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.03	0.10	0.15	0.17	0.21	0.10	0.14	0.04	0.05	0.00	0.02	0.09	0.15	0.24	0.15
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.11	0.14	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.12	0.15	0.09	0.04
O5'	0.23	0.53	0.20	0.21	0.46	0.02	0.56	0.02	0.58	0.63	0.56	0.47	0.62	0.66	0.44	0.06	0.09	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.28	0.83	0.28	0.27	0.78	0.18	1.05	0.04	1.13	0.94	1.01	0.69	1.30	1.18	0.65	0.19	0.15	0.15	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.10	0.39	0.12	0.13	0.20	0.13	0.27	0.04	0.26	0.45	0.30	0.36	0.33	0.47	0.20	0.19	0.24	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.48	0.18	0.21	0.40	0.09	0.55	0.02	0.57	0.59	0.52	0.41	0.66	0.68	0.36	0.08	0.15	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00