Doublet Group distance statistics: 49613

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.030, 0.052, 0.073, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.052 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.026, 0.051, 0.076, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.051 std_dev=0.025
C5	B	0, 0.230, 0.414, 0.598, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.414 std_dev=0.184
C6	B	0, 0.254, 0.446, 0.637, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.446 std_dev=0.191
N6	B	0, 0.150, 0.344, 0.537, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.344 std_dev=0.194
C2'	A	0, 0.102, 0.300, 0.497, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.300 std_dev=0.197
O4'	A	0, 0.101, 0.305, 0.509, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.305 std_dev=0.204
O2'	A	0, 0.093, 0.361, 0.628, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.361 std_dev=0.268
N7	B	0, 0.061, 0.331, 0.601, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.331 std_dev=0.270
C8	B	0, 0.155, 0.448, 0.740, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.448 std_dev=0.292
C3'	A	0, 0.177, 0.480, 0.782, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.480 std_dev=0.303
N9	B	0, 0.366, 0.686, 1.007, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.686 std_dev=0.320
C4'	A	0, 0.169, 0.495, 0.821, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.495 std_dev=0.326
C4	B	0, 0.318, 0.688, 1.059, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.688 std_dev=0.371
C2'	B	0, 0.358, 0.769, 1.181, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.769 std_dev=0.411
N1	B	0, 0.308, 0.742, 1.175, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.742 std_dev=0.434
C1'	B	0, 0.496, 0.945, 1.393, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.945 std_dev=0.449
O2'	B	0, 0.381, 0.850, 1.319, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.850 std_dev=0.469
O3'	A	0, 0.274, 0.751, 1.228, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.751 std_dev=0.477
OP1	A	0, 0.609, 1.101, 1.594, 1.634 max_d=1.634 avg_d=1.101 std_dev=0.493
O3'	B	0, 0.543, 1.057, 1.571, 1.674 max_d=1.674 avg_d=1.057 std_dev=0.514
P	A	0, 0.581, 1.097, 1.612, 1.698 max_d=1.698 avg_d=1.097 std_dev=0.516
C3'	B	0, 0.598, 1.126, 1.654, 1.699 max_d=1.699 avg_d=1.126 std_dev=0.528
O5'	A	0, 0.570, 1.102, 1.633, 1.706 max_d=1.706 avg_d=1.102 std_dev=0.531
C5'	A	0, 0.231, 0.809, 1.386, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.809 std_dev=0.578
OP2	A	0, 0.628, 1.220, 1.812, 1.795 max_d=1.795 avg_d=1.220 std_dev=0.592
N3	B	0, 0.348, 0.981, 1.615, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.981 std_dev=0.634
C2	B	0, 0.336, 0.977, 1.618, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.977 std_dev=0.641
O4'	B	0, 0.693, 1.368, 2.044, 2.105 max_d=2.105 avg_d=1.368 std_dev=0.675
C4'	B	0, 0.781, 1.486, 2.192, 2.285 max_d=2.285 avg_d=1.486 std_dev=0.705
C5'	B	0, 0.988, 1.984, 2.980, 3.097 max_d=3.097 avg_d=1.984 std_dev=0.996
O5'	B	0, 0.803, 2.154, 3.505, 3.675 max_d=3.675 avg_d=2.154 std_dev=1.351
OP1	B	0, 1.293, 3.166, 5.039, 5.056 max_d=5.056 avg_d=3.166 std_dev=1.873
P	B	0, 1.094, 3.112, 5.129, 5.180 max_d=5.180 avg_d=3.112 std_dev=2.018
OP2	B	0, 1.405, 3.913, 6.421, 6.360 max_d=6.360 avg_d=3.913 std_dev=2.508

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.09	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.26	0.27	0.08	0.19
C2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.06	0.01	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.08	0.05	0.31	0.25	0.19	0.21
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.07	0.05	0.12	0.00	0.01	0.02	0.10	0.15	0.15	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.05	0.06	0.06	0.09	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.23	0.07
C4	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.11	0.01	0.34	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.35	0.28	0.25	0.24
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.12	0.08	0.09	0.11	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.18	0.19	0.01
C5	0.03	0.01	0.04	0.08	0.01	0.13	0.00	0.37	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.04	0.35	0.29	0.24	0.24
C5'	0.09	0.25	0.04	0.01	0.34	0.01	0.37	0.00	0.33	0.25	0.30	0.36	0.18	0.02	0.06	0.02	0.01	0.29	0.30	0.01
C6	0.03	0.02	0.05	0.09	0.01	0.12	0.00	0.33	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.05	0.35	0.27	0.19	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.25	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.31	0.25	0.16	0.20
N3	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.09	0.01	0.30	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.08	0.04	0.33	0.26	0.22	0.22
N4	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.11	0.01	0.36	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.35	0.30	0.28	0.26
O2	0.04	0.00	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.13	0.07	0.30	0.25	0.18	0.21
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.09	0.07	0.15	0.00	0.02	0.07	0.04	0.10	0.17	0.04
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.09	0.06	0.10	0.04	0.08	0.07	0.13	0.02	0.00	0.02	0.24	0.13	0.33	0.21
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.07	0.07	0.02	0.00	0.32	0.37	0.11	0.27
O5'	0.26	0.31	0.10	0.05	0.35	0.01	0.35	0.01	0.35	0.31	0.33	0.35	0.30	0.04	0.24	0.32	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.27	0.25	0.15	0.12	0.28	0.18	0.29	0.29	0.27	0.25	0.26	0.30	0.25	0.10	0.13	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.19	0.15	0.23	0.25	0.19	0.24	0.30	0.19	0.16	0.22	0.28	0.18	0.17	0.33	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.21	0.06	0.07	0.24	0.01	0.24	0.01	0.23	0.20	0.22	0.26	0.21	0.04	0.21	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.25	0.40	0.27	0.14	0.26	0.09	0.18	0.19	0.29	0.25	0.23	0.26	0.22	0.22	0.52	0.27	0.27	0.54	0.69	0.85	0.49
C2	0.27	0.30	0.33	0.21	0.14	0.17	0.06	0.17	0.17	0.32	0.30	0.24	0.22	0.26	0.21	0.42	0.21	0.19	0.65	0.57	1.22	0.72
C2'	0.23	0.30	0.29	0.15	0.12	0.15	0.10	0.16	0.20	0.26	0.29	0.24	0.24	0.21	0.14	0.42	0.14	0.16	0.49	0.61	0.82	0.39
C3'	0.11	0.34	0.16	0.09	0.17	0.09	0.21	0.21	0.29	0.26	0.35	0.27	0.32	0.27	0.09	0.31	0.08	0.07	0.46	0.56	0.69	0.26
C4	0.17	0.48	0.23	0.14	0.21	0.16	0.09	0.29	0.24	0.19	0.46	0.38	0.18	0.18	0.14	0.27	0.16	0.20	0.83	0.69	1.57	1.02
C4'	0.12	0.32	0.15	0.08	0.23	0.08	0.32	0.15	0.37	0.31	0.37	0.25	0.41	0.36	0.17	0.33	0.10	0.08	0.32	0.67	0.46	0.14
C5	0.18	0.54	0.21	0.15	0.26	0.21	0.13	0.33	0.27	0.13	0.48	0.46	0.21	0.12	0.13	0.24	0.16	0.25	0.87	0.67	1.49	0.99
C5'	0.27	0.56	0.18	0.22	0.51	0.20	0.59	0.29	0.63	0.52	0.61	0.50	0.65	0.59	0.44	0.26	0.10	0.27	0.35	0.68	0.37	0.11
C6	0.21	0.44	0.28	0.21	0.23	0.20	0.13	0.27	0.26	0.17	0.40	0.39	0.25	0.15	0.14	0.33	0.20	0.22	0.76	0.60	1.22	0.77
N1	0.27	0.33	0.34	0.23	0.17	0.20	0.08	0.19	0.21	0.27	0.32	0.29	0.24	0.21	0.19	0.42	0.22	0.21	0.65	0.60	1.11	0.65
N3	0.21	0.36	0.28	0.17	0.16	0.14	0.08	0.22	0.19	0.27	0.36	0.28	0.18	0.25	0.18	0.34	0.18	0.16	0.73	0.61	1.44	0.89
N4	0.15	0.51	0.20	0.11	0.21	0.18	0.11	0.33	0.23	0.17	0.49	0.39	0.13	0.17	0.13	0.22	0.14	0.22	0.88	0.81	1.76	1.18
O2	0.33	0.22	0.38	0.23	0.13	0.20	0.08	0.15	0.14	0.37	0.24	0.18	0.22	0.30	0.26	0.48	0.23	0.23	0.59	0.58	1.13	0.63
O2'	0.28	0.25	0.29	0.16	0.13	0.18	0.11	0.15	0.18	0.27	0.26	0.21	0.21	0.20	0.18	0.44	0.15	0.21	0.40	0.69	0.69	0.32
O3'	0.10	0.36	0.10	0.15	0.20	0.14	0.23	0.27	0.29	0.26	0.36	0.29	0.31	0.27	0.13	0.22	0.16	0.11	0.46	0.56	0.60	0.15
O4'	0.28	0.18	0.39	0.30	0.06	0.28	0.18	0.20	0.24	0.27	0.22	0.16	0.34	0.30	0.13	0.51	0.33	0.25	0.47	0.79	0.65	0.42
O5'	0.17	0.14	0.19	0.07	0.13	0.06	0.20	0.06	0.16	0.32	0.10	0.14	0.22	0.32	0.19	0.21	0.01	0.11	0.42	0.59	0.46	0.21
OP1	0.05	0.12	0.10	0.01	0.09	0.06	0.18	0.15	0.18	0.22	0.14	0.10	0.24	0.25	0.10	0.16	0.01	0.02	0.47	0.65	0.32	0.20
OP2	0.11	0.20	0.05	0.08	0.22	0.16	0.31	0.25	0.31	0.33	0.24	0.18	0.36	0.37	0.21	0.02	0.01	0.15	0.62	0.51	0.65	0.46
P	0.05	0.10	0.08	0.01	0.11	0.05	0.20	0.13	0.18	0.25	0.12	0.09	0.24	0.28	0.13	0.11	0.01	0.03	0.45	0.56	0.34	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.19	0.36	0.32	0.11
C2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.02	0.06	0.03	0.14	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.06	0.63	0.70	1.37	0.95
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.06	0.09	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.16	0.56	0.22	0.12
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.06	0.13	0.03	0.07	0.08	0.12	0.06	0.02	0.01	0.00	0.24	0.53	0.22	0.10
C4	0.02	0.02	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04	0.46	0.34	0.92	0.57
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.47	0.07	0.14
C5	0.01	0.03	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.03	0.48	0.37	1.05	0.63
C5'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.14	0.09	0.15	0.11	0.15	0.11	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.31	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.05	0.56	0.53	1.28	0.82
C8	0.02	0.04	0.07	0.13	0.01	0.05	0.02	0.09	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.15	0.01	0.31	0.32	0.67	0.32
N1	0.03	0.00	0.06	0.03	0.01	0.06	0.02	0.15	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.06	0.61	0.69	1.43	0.96
N3	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.06	0.56	0.50	1.07	0.74
N6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.14	0.05	0.55	0.54	1.34	0.84
N7	0.01	0.03	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.16	0.02	0.40	0.31	0.89	0.48
N9	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.32	0.28	0.62	0.32
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.07	0.10	0.82	0.16	0.40
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.10	0.15	0.05	0.06	0.14	0.16	0.07	0.03	0.00	0.01	0.24	0.71	0.06	0.17
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.19	0.26	0.22	0.08
O5'	0.19	0.63	0.16	0.24	0.46	0.01	0.48	0.00	0.56	0.31	0.61	0.56	0.55	0.40	0.32	0.10	0.24	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.36	0.70	0.56	0.53	0.34	0.47	0.37	0.31	0.53	0.32	0.69	0.50	0.54	0.31	0.28	0.82	0.71	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	1.37	0.22	0.22	0.92	0.07	1.05	0.17	1.28	0.67	1.43	1.07	1.34	0.89	0.62	0.16	0.06	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.95	0.12	0.10	0.57	0.14	0.63	0.01	0.82	0.32	0.96	0.74	0.84	0.48	0.32	0.40	0.17	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00