Doublet Group distance statistics: 49623

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.019, 0.051, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.051 std_dev=0.032
C6	A	0, 0.009, 0.041, 0.073, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.041 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.018, 0.053, 0.087, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.053 std_dev=0.035
N1	A	0, 0.016, 0.056, 0.096, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.056 std_dev=0.040
C4	A	0, 0.015, 0.059, 0.104, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.059 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.023, 0.069, 0.115, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.069 std_dev=0.046
C2	A	0, 0.026, 0.073, 0.120, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.073 std_dev=0.047
O2	A	0, 0.030, 0.099, 0.168, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.099 std_dev=0.069
C3'	A	0, 0.021, 0.102, 0.184, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.102 std_dev=0.081
O3'	A	0, 0.027, 0.139, 0.251, 0.267 max_d=0.267 avg_d=0.139 std_dev=0.112
N4	A	0, 0.058, 0.191, 0.325, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.191 std_dev=0.133
O4'	A	0, 0.033, 0.184, 0.334, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.184 std_dev=0.150
O2'	A	0, 0.049, 0.214, 0.380, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.214 std_dev=0.165
C4'	A	0, 0.069, 0.281, 0.493, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.281 std_dev=0.212
N6	B	0, 0.147, 0.377, 0.606, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.377 std_dev=0.229
C5	B	0, 0.098, 0.334, 0.571, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.334 std_dev=0.237
C6	B	0, 0.120, 0.360, 0.601, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.360 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.031, 0.281, 0.532, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.281 std_dev=0.251
P	B	0, 0.010, 0.275, 0.540, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.275 std_dev=0.265
N7	B	0, 0.100, 0.367, 0.634, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.367 std_dev=0.267
C4	B	0, 0.081, 0.392, 0.703, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.392 std_dev=0.311
N1	B	0, 0.119, 0.433, 0.747, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.433 std_dev=0.314
N3	B	0, 0.101, 0.454, 0.807, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.454 std_dev=0.353
C5'	A	0, 0.113, 0.467, 0.821, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.467 std_dev=0.354
O5'	B	0, -0.015, 0.344, 0.704, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.344 std_dev=0.360
C2	B	0, 0.114, 0.479, 0.844, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.479 std_dev=0.365
OP1	B	0, 0.123, 0.490, 0.858, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.490 std_dev=0.368
O5'	A	0, 0.110, 0.490, 0.871, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.490 std_dev=0.381
N9	B	0, 0.059, 0.445, 0.831, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.445 std_dev=0.386
C8	B	0, 0.069, 0.456, 0.843, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.456 std_dev=0.387
OP2	B	0, 0.048, 0.459, 0.870, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.459 std_dev=0.411
C4'	B	0, 0.055, 0.520, 0.985, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.520 std_dev=0.465
P	A	0, 0.144, 0.641, 1.138, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.641 std_dev=0.497
C1'	B	0, 0.048, 0.598, 1.147, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.598 std_dev=0.550
C5'	B	0, -0.010, 0.579, 1.168, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.579 std_dev=0.589
O3'	B	0, 0.147, 0.877, 1.607, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.877 std_dev=0.730
C3'	B	0, 0.096, 0.852, 1.609, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.852 std_dev=0.756
C2'	B	0, 0.034, 1.021, 2.007, 2.481 max_d=2.481 avg_d=1.021 std_dev=0.986
OP1	A	0, 0.152, 1.250, 2.348, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.250 std_dev=1.098
O2'	B	0, 0.083, 1.450, 2.817, 3.342 max_d=3.342 avg_d=1.450 std_dev=1.367
OP2	A	0, 0.163, 1.890, 3.617, 3.686 max_d=3.686 avg_d=1.890 std_dev=1.727

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.03	0.00	0.07	0.22	0.27	0.06
C2	0.04	0.00	0.03	0.05	0.04	0.10	0.05	0.15	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.10	0.20	0.31	0.80	0.19
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.07	0.12	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.07	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.16	0.07	0.02
C4	0.03	0.04	0.02	0.06	0.00	0.10	0.02	0.18	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.05	0.10	0.26	0.26	1.03	0.28
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.10	0.00	0.07	0.02	0.02	0.04	0.10	0.12	0.18	0.05	0.02	0.01	0.03	0.07	0.13	0.03
C5	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.00	0.13	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04	0.08	0.21	0.25	0.83	0.22
C5'	0.04	0.15	0.02	0.02	0.18	0.02	0.13	0.00	0.06	0.08	0.19	0.22	0.22	0.06	0.08	0.04	0.01	0.12	0.28	0.03
C6	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.13	0.29	0.59	0.12
N1	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.13	0.28	0.55	0.12
N3	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.10	0.02	0.19	0.06	0.03	0.00	0.05	0.01	0.03	0.06	0.10	0.26	0.28	1.05	0.28
N4	0.04	0.05	0.03	0.07	0.00	0.12	0.04	0.22	0.05	0.02	0.05	0.00	0.05	0.06	0.06	0.12	0.31	0.22	1.20	0.35
O2	0.09	0.01	0.08	0.10	0.03	0.18	0.05	0.22	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.09	0.10	0.17	0.25	0.30	0.79	0.20
O2'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.03	0.06	0.09	0.00	0.09	0.04	0.03	0.09	0.12	0.04
O3'	0.03	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.08	0.02	0.03	0.06	0.06	0.10	0.09	0.00	0.02	0.06	0.36	0.34	0.06
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.10	0.01	0.08	0.04	0.03	0.05	0.10	0.12	0.17	0.04	0.02	0.00	0.08	0.27	0.20	0.07
O5'	0.07	0.20	0.03	0.02	0.26	0.03	0.21	0.01	0.13	0.13	0.26	0.31	0.25	0.03	0.06	0.08	0.00	0.04	0.04	0.01
OP1	0.22	0.31	0.07	0.16	0.26	0.07	0.25	0.12	0.29	0.28	0.28	0.22	0.30	0.09	0.36	0.27	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.80	0.12	0.07	1.03	0.13	0.83	0.28	0.59	0.55	1.05	1.20	0.79	0.12	0.34	0.20	0.04	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.19	0.04	0.02	0.28	0.03	0.22	0.03	0.12	0.12	0.28	0.35	0.20	0.04	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.33	0.10	0.14	0.18	0.12	0.18	0.24	0.28	0.16	0.32	0.26	0.30	0.10	0.11	0.25	0.15	0.11	0.19	0.04	0.13	0.06
C2	0.19	0.28	0.12	0.26	0.12	0.08	0.14	0.06	0.24	0.24	0.29	0.20	0.28	0.16	0.13	0.12	0.04	0.10	0.10	0.09	0.24	0.11
C2'	0.13	0.33	0.17	0.18	0.22	0.16	0.20	0.27	0.27	0.12	0.31	0.29	0.28	0.10	0.14	0.19	0.18	0.13	0.21	0.04	0.14	0.07
C3'	0.15	0.33	0.33	0.21	0.25	0.17	0.23	0.26	0.28	0.11	0.31	0.30	0.30	0.14	0.18	0.14	0.19	0.12	0.09	0.04	0.04	0.02
C4	0.35	0.21	0.37	0.38	0.10	0.17	0.05	0.06	0.18	0.31	0.27	0.06	0.24	0.18	0.25	0.35	0.09	0.17	0.15	0.13	0.35	0.16
C4'	0.12	0.38	0.30	0.20	0.27	0.16	0.28	0.27	0.36	0.13	0.38	0.33	0.39	0.19	0.18	0.09	0.18	0.11	0.11	0.07	0.10	0.03
C5	0.39	0.25	0.43	0.32	0.06	0.14	0.02	0.02	0.18	0.31	0.27	0.09	0.22	0.17	0.26	0.54	0.14	0.17	0.21	0.11	0.36	0.17
C5'	0.18	0.44	0.41	0.20	0.34	0.15	0.36	0.23	0.43	0.22	0.45	0.39	0.48	0.28	0.26	0.26	0.18	0.12	0.07	0.04	0.22	0.06
C6	0.32	0.27	0.30	0.21	0.04	0.06	0.05	0.08	0.19	0.29	0.27	0.16	0.21	0.15	0.19	0.49	0.14	0.13	0.24	0.07	0.31	0.15
N1	0.20	0.30	0.13	0.18	0.12	0.05	0.12	0.13	0.24	0.23	0.30	0.22	0.26	0.12	0.12	0.27	0.09	0.09	0.17	0.06	0.24	0.11
N3	0.26	0.23	0.22	0.35	0.08	0.15	0.09	0.04	0.22	0.28	0.28	0.12	0.28	0.18	0.19	0.16	0.07	0.14	0.09	0.13	0.30	0.14
N4	0.38	0.13	0.46	0.45	0.17	0.22	0.09	0.11	0.13	0.31	0.23	0.07	0.22	0.19	0.29	0.37	0.15	0.19	0.13	0.15	0.37	0.17
O2	0.12	0.26	0.13	0.23	0.16	0.07	0.17	0.12	0.24	0.19	0.26	0.21	0.27	0.17	0.12	0.09	0.11	0.07	0.08	0.10	0.15	0.09
O2'	0.19	0.30	0.19	0.24	0.20	0.24	0.18	0.39	0.25	0.13	0.28	0.27	0.26	0.10	0.16	0.37	0.25	0.20	0.25	0.12	0.07	0.02
O3'	0.20	0.28	0.44	0.26	0.23	0.21	0.20	0.30	0.24	0.13	0.26	0.28	0.26	0.14	0.20	0.22	0.24	0.15	0.07	0.04	0.01	0.00
O4'	0.11	0.38	0.17	0.16	0.24	0.13	0.25	0.25	0.35	0.12	0.39	0.31	0.39	0.15	0.14	0.09	0.15	0.11	0.14	0.05	0.04	0.03
O5'	0.25	0.48	0.48	0.25	0.39	0.17	0.41	0.21	0.48	0.28	0.49	0.44	0.53	0.34	0.32	0.43	0.25	0.15	0.12	0.07	0.25	0.10
OP1	0.37	0.26	0.77	0.43	0.32	0.41	0.30	0.55	0.26	0.39	0.23	0.31	0.26	0.35	0.37	0.78	0.36	0.29	0.56	0.70	0.81	0.63
OP2	0.65	1.29	0.86	0.27	1.07	0.18	1.20	0.09	1.39	0.81	1.39	1.14	1.54	1.07	0.85	0.96	0.23	0.35	0.12	0.51	0.32	0.24
P	0.29	0.50	0.55	0.26	0.42	0.17	0.44	0.18	0.51	0.32	0.52	0.46	0.57	0.39	0.35	0.58	0.27	0.16	0.18	0.05	0.31	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.10	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.26	0.00	0.28	0.23	0.28	0.20
C2	0.01	0.00	0.30	0.33	0.01	0.05	0.02	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.13	0.13	0.27	0.20	0.35	0.22
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.15	0.02	0.03	0.19	0.08	0.19	0.21	0.31	0.01	0.14	0.01	0.00	0.03	0.01	0.55	0.52	0.42	0.48
C3'	0.03	0.33	0.00	0.00	0.31	0.00	0.34	0.02	0.36	0.25	0.37	0.30	0.36	0.31	0.25	0.00	0.01	0.03	0.30	0.19	0.20	0.12
C4	0.01	0.01	0.15	0.31	0.00	0.08	0.02	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.17	0.09	0.07	0.27	0.19	0.34	0.20
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.09	0.14	0.09	0.04	0.10	0.14	0.09	0.29	0.02	0.00	0.03	0.09	0.27	0.02
C5	0.02	0.02	0.03	0.34	0.02	0.11	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.33	0.14	0.05	0.26	0.21	0.35	0.20
C5'	0.10	0.12	0.19	0.02	0.11	0.02	0.14	0.00	0.15	0.13	0.13	0.10	0.17	0.16	0.09	0.09	0.23	0.05	0.01	0.08	0.27	0.02
C6	0.03	0.02	0.08	0.36	0.03	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.32	0.15	0.08	0.27	0.22	0.35	0.21
C8	0.02	0.01	0.19	0.25	0.01	0.14	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.37	0.12	0.09	0.25	0.20	0.33	0.19
N1	0.01	0.01	0.21	0.37	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.14	0.10	0.26	0.20	0.35	0.20
N3	0.02	0.01	0.31	0.30	0.01	0.04	0.04	0.10	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.14	0.13	0.28	0.20	0.34	0.21
N6	0.05	0.02	0.01	0.36	0.04	0.10	0.03	0.17	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.05	0.40	0.19	0.08	0.28	0.26	0.35	0.23
N7	0.03	0.02	0.14	0.31	0.01	0.14	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.42	0.18	0.05	0.23	0.21	0.35	0.19
N9	0.01	0.01	0.01	0.25	0.00	0.09	0.03	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.20	0.06	0.02	0.27	0.19	0.32	0.19
O2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.17	0.29	0.33	0.09	0.32	0.37	0.18	0.04	0.40	0.42	0.20	0.00	0.06	0.20	0.31	0.34	0.44	0.32
O3'	0.26	0.13	0.03	0.01	0.09	0.02	0.14	0.23	0.15	0.12	0.14	0.14	0.19	0.18	0.06	0.06	0.00	0.17	0.29	0.27	0.41	0.24
O4'	0.00	0.13	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.05	0.08	0.09	0.10	0.13	0.08	0.05	0.02	0.20	0.17	0.00	0.11	0.08	0.29	0.07
O5'	0.28	0.27	0.55	0.30	0.27	0.03	0.26	0.01	0.27	0.25	0.26	0.28	0.28	0.23	0.27	0.31	0.29	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.20	0.52	0.19	0.19	0.09	0.21	0.08	0.22	0.20	0.20	0.20	0.26	0.21	0.19	0.34	0.27	0.08	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.28	0.35	0.42	0.20	0.34	0.27	0.35	0.27	0.35	0.33	0.35	0.34	0.35	0.35	0.32	0.44	0.41	0.29	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.22	0.48	0.12	0.20	0.02	0.20	0.02	0.21	0.19	0.20	0.21	0.23	0.19	0.19	0.32	0.24	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00