Doublet Group distance statistics: 49624

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	B	0, 0.034, 0.185, 0.337, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.185 std_dev=0.151
C4	B	0, 0.078, 0.273, 0.468, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.273 std_dev=0.195
N7	B	0, 0.094, 0.369, 0.644, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.369 std_dev=0.275
C2'	A	0, 0.123, 0.421, 0.719, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.421 std_dev=0.298
N9	B	0, 0.096, 0.400, 0.704, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.400 std_dev=0.304
C8	B	0, 0.085, 0.437, 0.788, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.437 std_dev=0.352
C6	B	0, 0.117, 0.477, 0.837, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.477 std_dev=0.360
O4'	A	0, 0.156, 0.541, 0.927, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.541 std_dev=0.386
N3	B	0, 0.154, 0.558, 0.963, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.558 std_dev=0.404
O4'	B	0, 0.152, 0.646, 1.140, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.646 std_dev=0.494
N1	B	0, 0.184, 0.682, 1.180, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.682 std_dev=0.498
C2	B	0, 0.188, 0.689, 1.191, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.689 std_dev=0.502
N6	B	0, 0.202, 0.730, 1.257, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.730 std_dev=0.527
C1'	B	0, 0.207, 0.736, 1.265, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.736 std_dev=0.529
OP1	A	0, 0.234, 0.847, 1.460, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.847 std_dev=0.613
O2'	A	0, 0.223, 0.898, 1.572, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.898 std_dev=0.675
C4'	A	0, 0.318, 1.085, 1.852, 1.633 max_d=1.633 avg_d=1.085 std_dev=0.767
P	A	0, 0.269, 1.036, 1.803, 1.834 max_d=1.834 avg_d=1.036 std_dev=0.767
O5'	A	0, 0.324, 1.143, 1.962, 1.876 max_d=1.876 avg_d=1.143 std_dev=0.819
C5'	A	0, 0.337, 1.164, 1.992, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.164 std_dev=0.828
C3'	A	0, 0.374, 1.281, 2.188, 1.970 max_d=1.970 avg_d=1.281 std_dev=0.907
C4'	B	0, 0.380, 1.328, 2.276, 2.151 max_d=2.151 avg_d=1.328 std_dev=0.948
C3'	B	0, 0.352, 1.394, 2.435, 2.504 max_d=2.504 avg_d=1.394 std_dev=1.042
C2'	B	0, 0.287, 1.372, 2.457, 2.653 max_d=2.653 avg_d=1.372 std_dev=1.085
OP2	A	0, 0.384, 1.562, 2.740, 2.845 max_d=2.845 avg_d=1.562 std_dev=1.178
O3'	B	0, 0.456, 1.656, 2.856, 2.805 max_d=2.805 avg_d=1.656 std_dev=1.200
O5'	B	0, 0.466, 1.670, 2.873, 2.792 max_d=2.792 avg_d=1.670 std_dev=1.204
C5'	B	0, 0.467, 1.725, 2.983, 2.963 max_d=2.963 avg_d=1.725 std_dev=1.258
O3'	A	0, 0.613, 2.097, 3.580, 3.204 max_d=3.204 avg_d=2.097 std_dev=1.484
O2'	B	0, 0.358, 1.850, 3.341, 3.653 max_d=3.653 avg_d=1.850 std_dev=1.492
P	B	0, 0.521, 2.225, 3.929, 4.138 max_d=4.138 avg_d=2.225 std_dev=1.704
OP2	B	0, 0.600, 2.445, 4.291, 4.459 max_d=4.459 avg_d=2.445 std_dev=1.846
OP1	B	0, 0.593, 2.672, 4.751, 5.071 max_d=5.071 avg_d=2.672 std_dev=2.079

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.00	0.14	0.13	0.69	0.17
C2	0.01	0.00	0.09	0.17	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.13	0.06	0.20	0.07	0.47	0.02
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.03	0.05	0.13	0.05	0.03	0.08	0.07	0.13	0.00	0.03	0.03	0.31	0.35	0.75	0.37
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.29	0.01	0.31	0.02	0.27	0.18	0.23	0.31	0.08	0.01	0.01	0.01	0.20	0.14	0.51	0.16
C4	0.00	0.00	0.06	0.29	0.00	0.15	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.21	0.07	0.36	0.01	0.19	0.19
C4'	0.00	0.05	0.03	0.01	0.15	0.00	0.20	0.01	0.19	0.09	0.09	0.16	0.01	0.19	0.01	0.00	0.03	0.21	0.52	0.09
C5	0.00	0.00	0.05	0.31	0.00	0.20	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.25	0.26	0.09	0.41	0.03	0.18	0.22
C5'	0.06	0.08	0.13	0.02	0.20	0.01	0.24	0.00	0.21	0.10	0.13	0.22	0.04	0.07	0.12	0.02	0.00	0.30	0.37	0.04
C6	0.00	0.00	0.05	0.27	0.00	0.19	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.20	0.20	0.09	0.35	0.04	0.40	0.11
N1	0.00	0.00	0.03	0.18	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.09	0.04	0.22	0.08	0.53	0.03
N3	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.15	0.06	0.27	0.04	0.32	0.10
N4	0.00	0.00	0.07	0.31	0.00	0.16	0.01	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.25	0.07	0.40	0.04	0.07	0.25
O2	0.01	0.00	0.13	0.08	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.21	0.08	0.13	0.10	0.53	0.05
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.27	0.19	0.25	0.07	0.20	0.16	0.25	0.29	0.13	0.00	0.02	0.12	0.26	0.26	0.74	0.33
O3'	0.12	0.13	0.03	0.01	0.21	0.01	0.26	0.12	0.20	0.09	0.15	0.25	0.21	0.02	0.00	0.08	0.25	0.24	0.54	0.21
O4'	0.00	0.06	0.03	0.01	0.07	0.00	0.09	0.02	0.09	0.04	0.06	0.07	0.08	0.12	0.08	0.00	0.10	0.11	0.67	0.11
O5'	0.14	0.20	0.31	0.20	0.36	0.03	0.41	0.00	0.35	0.22	0.27	0.40	0.13	0.26	0.25	0.10	0.00	0.06	0.15	0.01
OP1	0.13	0.07	0.35	0.14	0.01	0.21	0.03	0.30	0.04	0.08	0.04	0.04	0.10	0.26	0.24	0.11	0.06	0.00	0.02	0.00
OP2	0.69	0.47	0.75	0.51	0.19	0.52	0.18	0.37	0.40	0.53	0.32	0.07	0.53	0.74	0.54	0.67	0.15	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.02	0.37	0.16	0.19	0.09	0.22	0.04	0.11	0.03	0.10	0.25	0.05	0.33	0.21	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.03	0.24	0.19	0.10	0.12	0.07	0.47	0.11	0.11	0.09	0.11	0.20	0.10	0.13	0.39	0.17	0.07	0.31	0.41	0.51	0.51
C2	0.23	0.12	0.26	0.17	0.11	0.13	0.10	0.45	0.12	0.17	0.16	0.08	0.13	0.13	0.17	0.47	0.13	0.08	0.25	0.34	0.37	0.44
C2'	0.27	0.06	0.32	0.23	0.12	0.19	0.05	0.51	0.12	0.12	0.09	0.16	0.24	0.07	0.17	0.52	0.24	0.14	0.32	0.46	0.56	0.59
C3'	0.28	0.06	0.29	0.26	0.13	0.20	0.11	0.43	0.14	0.21	0.17	0.09	0.23	0.16	0.21	0.42	0.24	0.19	0.21	0.29	0.40	0.41
C4	0.19	0.08	0.05	0.06	0.08	0.21	0.07	0.58	0.02	0.18	0.07	0.08	0.02	0.15	0.14	0.26	0.07	0.08	0.38	0.59	0.50	0.63
C4'	0.16	0.10	0.14	0.20	0.12	0.04	0.18	0.39	0.24	0.17	0.21	0.06	0.35	0.20	0.14	0.22	0.15	0.01	0.29	0.49	0.59	0.48
C5	0.13	0.05	0.07	0.08	0.04	0.24	0.04	0.63	0.05	0.11	0.08	0.00	0.07	0.09	0.08	0.11	0.09	0.09	0.47	0.71	0.68	0.76
C5'	0.19	0.05	0.11	0.23	0.14	0.06	0.19	0.36	0.20	0.23	0.14	0.07	0.30	0.24	0.18	0.15	0.18	0.10	0.32	0.55	0.65	0.52
C6	0.13	0.06	0.06	0.02	0.05	0.19	0.03	0.58	0.05	0.09	0.09	0.05	0.08	0.07	0.08	0.17	0.02	0.05	0.43	0.62	0.65	0.69
N1	0.18	0.03	0.17	0.12	0.08	0.14	0.06	0.51	0.08	0.12	0.10	0.06	0.14	0.09	0.12	0.32	0.10	0.06	0.34	0.46	0.51	0.55
N3	0.24	0.14	0.21	0.10	0.13	0.13	0.11	0.48	0.08	0.21	0.14	0.12	0.07	0.16	0.18	0.45	0.05	0.03	0.25	0.38	0.35	0.46
N4	0.23	0.10	0.12	0.16	0.09	0.28	0.07	0.64	0.01	0.19	0.06	0.11	0.06	0.17	0.15	0.27	0.17	0.17	0.40	0.69	0.48	0.67
O2	0.27	0.18	0.39	0.26	0.13	0.17	0.12	0.40	0.16	0.18	0.22	0.12	0.18	0.13	0.19	0.62	0.23	0.14	0.18	0.21	0.28	0.33
O2'	0.14	0.09	0.25	0.10	0.07	0.22	0.09	0.65	0.12	0.06	0.09	0.11	0.18	0.10	0.07	0.52	0.12	0.19	0.47	0.63	0.68	0.75
O3'	0.04	0.33	0.09	0.06	0.13	0.21	0.17	0.53	0.31	0.05	0.41	0.20	0.37	0.11	0.03	0.22	0.01	0.20	0.34	0.41	0.50	0.50
O4'	0.15	0.06	0.13	0.19	0.12	0.07	0.17	0.42	0.22	0.16	0.17	0.08	0.30	0.19	0.14	0.20	0.14	0.05	0.34	0.52	0.60	0.52
O5'	0.46	0.22	0.35	0.46	0.39	0.26	0.43	0.23	0.37	0.51	0.24	0.29	0.40	0.52	0.45	0.40	0.43	0.36	0.35	0.56	0.67	0.47
OP1	0.17	0.18	0.09	0.06	0.15	0.16	0.15	0.56	0.16	0.14	0.18	0.16	0.15	0.14	0.14	0.12	0.06	0.06	0.43	0.73	0.74	0.75
OP2	0.29	0.59	0.45	0.37	0.42	0.45	0.43	0.72	0.56	0.32	0.65	0.49	0.60	0.36	0.34	0.38	0.38	0.33	0.68	0.87	0.95	0.87
P	0.24	0.05	0.06	0.21	0.14	0.07	0.16	0.35	0.06	0.27	0.04	0.08	0.07	0.25	0.21	0.12	0.20	0.19	0.31	0.54	0.63	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.41	0.32	0.15
C2	0.00	0.00	0.18	0.21	0.00	0.07	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.16	0.16	0.22	0.44	0.31	0.23
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.03	0.02	0.12	0.14	0.06	0.34	0.09	0.20	0.12	0.29	0.13	0.00	0.01	0.01	0.33	0.41	0.15	0.17
C3'	0.03	0.21	0.00	0.00	0.14	0.01	0.10	0.02	0.14	0.04	0.19	0.20	0.12	0.03	0.06	0.08	0.00	0.03	0.10	0.53	0.30	0.22
C4	0.00	0.00	0.03	0.14	0.00	0.06	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.08	0.21	0.44	0.33	0.22
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.08	0.06	0.09	0.07	0.06	0.21	0.08	0.00	0.02	0.23	0.21	0.10
C5	0.01	0.00	0.12	0.10	0.00	0.07	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.06	0.02	0.25	0.44	0.36	0.28
C5'	0.10	0.33	0.14	0.02	0.29	0.00	0.33	0.00	0.36	0.25	0.36	0.29	0.37	0.30	0.24	0.09	0.25	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04
C6	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.11	0.05	0.26	0.44	0.35	0.30
C8	0.01	0.00	0.34	0.04	0.00	0.06	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.06	0.13	0.23	0.43	0.38	0.25
N1	0.00	0.00	0.09	0.19	0.00	0.08	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.15	0.12	0.25	0.44	0.33	0.27
N3	0.00	0.00	0.20	0.20	0.00	0.06	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.13	0.16	0.18	0.44	0.30	0.19
N6	0.01	0.00	0.12	0.12	0.00	0.09	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.11	0.02	0.28	0.43	0.37	0.33
N7	0.01	0.00	0.29	0.03	0.00	0.07	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.02	0.09	0.26	0.44	0.39	0.30
N9	0.01	0.00	0.13	0.06	0.00	0.06	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.01	0.01	0.17	0.43	0.33	0.20
O2'	0.03	0.14	0.00	0.08	0.06	0.21	0.20	0.09	0.15	0.36	0.04	0.17	0.22	0.36	0.14	0.00	0.18	0.15	0.21	0.39	0.12	0.10
O3'	0.09	0.16	0.01	0.00	0.07	0.08	0.06	0.25	0.11	0.06	0.15	0.13	0.11	0.02	0.01	0.18	0.00	0.05	0.14	0.75	0.45	0.42
O4'	0.01	0.16	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.02	0.05	0.13	0.12	0.16	0.02	0.09	0.01	0.15	0.05	0.00	0.17	0.30	0.37	0.18
O5'	0.05	0.22	0.33	0.10	0.21	0.02	0.25	0.01	0.26	0.23	0.25	0.18	0.28	0.26	0.17	0.21	0.14	0.17	0.00	0.02	0.08	0.00
OP1	0.41	0.44	0.41	0.53	0.44	0.23	0.44	0.01	0.44	0.43	0.44	0.44	0.43	0.44	0.43	0.39	0.75	0.30	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.32	0.31	0.15	0.30	0.33	0.21	0.36	0.03	0.35	0.38	0.33	0.30	0.37	0.39	0.33	0.12	0.45	0.37	0.08	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.23	0.17	0.22	0.22	0.10	0.28	0.04	0.30	0.25	0.27	0.19	0.33	0.30	0.20	0.10	0.42	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00