Doublet Group distance statistics: 49626

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C2	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N4	A	0, -0.002, 0.015, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.004, 0.024, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.009, 0.045, 0.080, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.045 std_dev=0.035
O4'	A	0, -0.017, 0.146, 0.310, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.146 std_dev=0.164
C2'	A	0, -0.017, 0.162, 0.341, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.162 std_dev=0.179
O2'	A	0, 0.022, 0.235, 0.448, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.235 std_dev=0.213
N3	B	0, 0.043, 0.264, 0.486, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.264 std_dev=0.221
C4'	A	0, -0.009, 0.226, 0.461, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.226 std_dev=0.235
C3'	A	0, -0.021, 0.263, 0.547, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.263 std_dev=0.284
C4	B	0, 0.018, 0.365, 0.712, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.365 std_dev=0.347
C2	B	0, 0.017, 0.382, 0.748, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.382 std_dev=0.365
C5'	A	0, -0.036, 0.388, 0.812, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.388 std_dev=0.424
O3'	A	0, 0.004, 0.430, 0.857, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.430 std_dev=0.427
N9	B	0, -0.006, 0.455, 0.917, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.455 std_dev=0.462
C5	B	0, -0.026, 0.500, 1.026, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.500 std_dev=0.526
C1'	B	0, -0.008, 0.536, 1.080, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.536 std_dev=0.544
N1	B	0, -0.026, 0.564, 1.153, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.564 std_dev=0.589
C8	B	0, -0.054, 0.566, 1.186, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.566 std_dev=0.620
O4'	B	0, -0.018, 0.623, 1.264, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.623 std_dev=0.641
C6	B	0, -0.047, 0.595, 1.238, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.595 std_dev=0.642
N7	B	0, -0.059, 0.603, 1.265, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.603 std_dev=0.662
O5'	A	0, -0.136, 0.593, 1.322, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.593 std_dev=0.729
C2'	B	0, -0.007, 0.723, 1.453, 1.723 max_d=1.723 avg_d=0.723 std_dev=0.730
O2'	B	0, 0.013, 0.794, 1.574, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.794 std_dev=0.781
C4'	B	0, -0.010, 0.775, 1.559, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.775 std_dev=0.785
C3'	B	0, -0.022, 0.806, 1.633, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.806 std_dev=0.828
C5'	B	0, 0.008, 0.850, 1.692, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.850 std_dev=0.842
N6	B	0, -0.096, 0.782, 1.661, 2.009 max_d=2.009 avg_d=0.782 std_dev=0.878
OP1	B	0, -0.016, 0.930, 1.876, 2.228 max_d=2.228 avg_d=0.930 std_dev=0.946
O3'	B	0, -0.030, 0.944, 1.919, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.944 std_dev=0.975
P	A	0, -0.274, 0.868, 2.010, 2.481 max_d=2.481 avg_d=0.868 std_dev=1.142
P	B	0, -0.218, 1.378, 2.973, 3.614 max_d=3.614 avg_d=1.378 std_dev=1.596
O5'	B	0, -0.221, 1.433, 3.087, 3.751 max_d=3.751 avg_d=1.433 std_dev=1.654
OP2	A	0, -0.426, 1.443, 3.311, 4.081 max_d=4.081 avg_d=1.443 std_dev=1.868
OP1	A	0, -0.495, 1.563, 3.621, 4.470 max_d=4.470 avg_d=1.563 std_dev=2.058
OP2	B	0, -0.432, 1.921, 4.275, 5.236 max_d=5.236 avg_d=1.921 std_dev=2.354

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.19	0.04	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.02	0.46	0.32	0.06
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.07	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.11	0.12	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.05	0.03	0.10	0.01	0.01	0.00	0.07	0.34	0.13	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.10	0.91	0.46	0.18
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.24	0.21	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.10	0.01	0.17	1.05	0.36	0.27
C5'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.01	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.31	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.11	0.02	0.18	0.81	0.19	0.24
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.49	0.18	0.12
N3	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.04	0.66	0.44	0.09
N4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.02	0.11	1.04	0.54	0.20
O2	0.05	0.01	0.08	0.10	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.05	0.13	0.07	0.02	0.28	0.28	0.03
O2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.03	0.02	0.03	0.24	0.02	0.06
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.06	0.04	0.13	0.03	0.00	0.01	0.10	0.67	0.12	0.20
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.05	0.14	0.21	0.08
O5'	0.03	0.02	0.03	0.07	0.10	0.01	0.17	0.00	0.18	0.07	0.04	0.11	0.02	0.03	0.10	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.19	0.46	0.11	0.34	0.91	0.24	1.05	0.31	0.81	0.49	0.66	1.04	0.28	0.24	0.67	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.32	0.12	0.13	0.46	0.21	0.36	0.34	0.19	0.18	0.44	0.54	0.28	0.02	0.12	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.06	0.05	0.12	0.18	0.02	0.27	0.01	0.24	0.12	0.09	0.20	0.03	0.06	0.20	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.34	0.30	0.27	0.08	0.20	0.16	0.19	0.31	0.06	0.40	0.14	0.35	0.09	0.09	0.32	0.30	0.17	0.34	0.64	0.98	0.45
C2	0.22	0.25	0.24	0.22	0.05	0.18	0.06	0.18	0.16	0.16	0.24	0.16	0.15	0.07	0.14	0.22	0.21	0.18	0.48	0.68	1.22	0.59
C2'	0.37	0.33	0.49	0.45	0.04	0.38	0.15	0.35	0.34	0.13	0.43	0.09	0.42	0.06	0.18	0.57	0.52	0.33	0.61	0.74	1.24	0.66
C3'	0.27	0.48	0.37	0.34	0.16	0.30	0.32	0.26	0.55	0.03	0.64	0.21	0.66	0.22	0.05	0.48	0.41	0.25	0.51	0.68	1.16	0.57
C4	0.05	0.19	0.03	0.06	0.14	0.11	0.12	0.09	0.15	0.03	0.18	0.18	0.12	0.06	0.06	0.04	0.07	0.11	0.19	0.54	1.08	0.37
C4'	0.13	0.55	0.21	0.18	0.26	0.15	0.42	0.12	0.64	0.16	0.73	0.28	0.75	0.33	0.08	0.29	0.24	0.11	0.24	0.55	0.85	0.34
C5	0.06	0.25	0.04	0.07	0.21	0.12	0.27	0.11	0.31	0.16	0.30	0.20	0.31	0.23	0.13	0.03	0.06	0.13	0.04	0.48	0.82	0.21
C5'	0.02	0.67	0.05	0.02	0.41	0.02	0.61	0.03	0.86	0.33	0.92	0.39	1.01	0.53	0.23	0.16	0.08	0.04	0.06	0.42	0.67	0.17
C6	0.03	0.32	0.07	0.04	0.19	0.03	0.28	0.03	0.38	0.12	0.40	0.20	0.40	0.21	0.08	0.09	0.06	0.04	0.11	0.53	0.84	0.26
N1	0.15	0.32	0.20	0.18	0.11	0.12	0.17	0.12	0.29	0.05	0.36	0.18	0.30	0.09	0.06	0.21	0.19	0.11	0.30	0.62	1.01	0.43
N3	0.10	0.20	0.10	0.09	0.06	0.06	0.03	0.09	0.09	0.14	0.17	0.16	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.08	0.44	0.65	1.29	0.58
N4	0.13	0.14	0.13	0.17	0.13	0.22	0.08	0.20	0.07	0.05	0.10	0.16	0.03	0.03	0.11	0.13	0.19	0.21	0.12	0.49	1.11	0.33
O2	0.35	0.24	0.39	0.38	0.07	0.34	0.06	0.34	0.12	0.26	0.22	0.13	0.11	0.16	0.24	0.38	0.37	0.35	0.68	0.77	1.35	0.75
O2'	0.45	0.22	0.61	0.58	0.09	0.49	0.05	0.45	0.22	0.22	0.32	0.04	0.30	0.07	0.27	0.69	0.66	0.41	0.68	0.80	1.25	0.72
O3'	0.34	0.47	0.47	0.44	0.14	0.39	0.32	0.35	0.57	0.02	0.66	0.18	0.70	0.21	0.10	0.60	0.53	0.33	0.64	0.73	1.27	0.67
O4'	0.06	0.52	0.12	0.10	0.25	0.06	0.36	0.06	0.53	0.15	0.63	0.28	0.59	0.28	0.10	0.16	0.14	0.04	0.12	0.52	0.74	0.25
O5'	0.14	0.82	0.10	0.14	0.57	0.13	0.80	0.16	1.06	0.49	1.10	0.54	1.23	0.72	0.37	0.07	0.09	0.15	0.06	0.31	0.60	0.07
OP1	0.92	1.48	0.84	0.99	1.47	0.97	1.88	1.10	2.14	1.58	1.93	1.24	2.48	1.91	1.30	0.55	0.88	0.98	1.02	0.80	0.53	1.02
OP2	0.07	1.05	0.19	0.18	0.63	0.02	0.88	0.04	1.29	0.42	1.41	0.67	1.55	0.71	0.34	0.06	0.19	0.05	0.11	0.62	0.79	0.32
P	0.33	1.01	0.32	0.38	0.81	0.33	1.10	0.38	1.39	0.77	1.37	0.73	1.65	1.04	0.61	0.14	0.33	0.33	0.30	0.07	0.31	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.38	0.43	0.10
C2	0.02	0.00	0.10	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.21	0.03	0.16	0.60	0.26	0.05
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.10	0.10	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.24	0.21	0.06	0.11
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.14	0.01	0.15	0.01	0.18	0.06	0.19	0.15	0.18	0.11	0.07	0.01	0.00	0.01	0.41	0.09	0.19	0.25
C4	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.01	0.16	0.59	0.25	0.03
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.10	0.10	0.05	0.13	0.11	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.19	0.27	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.02	0.21	0.69	0.13	0.03
C5'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.13	0.00	0.18	0.00	0.20	0.18	0.18	0.10	0.23	0.21	0.11	0.02	0.04	0.02	0.00	0.13	0.14	0.00
C6	0.02	0.01	0.07	0.18	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.20	0.02	0.21	0.72	0.11	0.04
C8	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.19	0.65	0.16	0.02
N1	0.02	0.00	0.10	0.19	0.02	0.10	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.22	0.02	0.19	0.68	0.18	0.04
N3	0.02	0.00	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.17	0.04	0.14	0.54	0.31	0.05
N6	0.03	0.01	0.07	0.18	0.01	0.13	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.21	0.04	0.23	0.78	0.03	0.05
N7	0.02	0.01	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.11	0.05	0.22	0.73	0.05	0.03
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.14	0.53	0.29	0.04
O2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.19	0.28	0.04
O3'	0.00	0.21	0.01	0.00	0.14	0.02	0.16	0.04	0.20	0.06	0.22	0.17	0.21	0.11	0.07	0.01	0.00	0.01	0.43	0.09	0.35	0.33
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.04	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.17	0.38	0.62	0.23
O5'	0.03	0.16	0.24	0.41	0.16	0.02	0.21	0.00	0.21	0.19	0.19	0.14	0.23	0.22	0.14	0.04	0.43	0.17	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.38	0.60	0.21	0.09	0.59	0.19	0.69	0.13	0.72	0.65	0.68	0.54	0.78	0.73	0.53	0.19	0.09	0.38	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.43	0.26	0.06	0.19	0.25	0.27	0.13	0.14	0.11	0.16	0.18	0.31	0.03	0.05	0.29	0.28	0.35	0.62	0.03	0.00	0.00	0.01
P	0.10	0.05	0.11	0.25	0.03	0.05	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.03	0.04	0.04	0.33	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00