Doublet Group distance statistics: 49627

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.037 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.011, 0.050, 0.089, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.050 std_dev=0.039
N4	A	0, 0.021, 0.076, 0.131, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.076 std_dev=0.055
O4'	A	0, 0.007, 0.192, 0.377, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.192 std_dev=0.185
C2'	A	0, -0.054, 0.201, 0.456, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.201 std_dev=0.255
O2'	A	0, -0.061, 0.198, 0.458, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.198 std_dev=0.260
C4'	A	0, -0.044, 0.292, 0.627, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.292 std_dev=0.335
C3'	A	0, -0.080, 0.302, 0.684, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.302 std_dev=0.382
P	A	0, -0.010, 0.421, 0.852, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.421 std_dev=0.431
N3	B	0, 0.037, 0.491, 0.946, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.491 std_dev=0.454
C4	B	0, 0.014, 0.475, 0.936, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.475 std_dev=0.461
OP1	A	0, 0.162, 0.625, 1.088, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.625 std_dev=0.463
N9	B	0, 0.086, 0.559, 1.033, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.559 std_dev=0.474
C2'	B	0, 0.203, 0.693, 1.183, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.693 std_dev=0.490
C1'	B	0, 0.115, 0.608, 1.102, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.608 std_dev=0.494
O3'	A	0, -0.073, 0.425, 0.922, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.425 std_dev=0.497
C2	B	0, -0.005, 0.494, 0.992, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.494 std_dev=0.498
C5	B	0, -0.029, 0.473, 0.975, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.473 std_dev=0.502
C6	B	0, -0.043, 0.461, 0.965, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.461 std_dev=0.504
N1	B	0, -0.032, 0.473, 0.979, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.473 std_dev=0.506
O4'	B	0, 0.143, 0.667, 1.190, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.667 std_dev=0.523
N6	B	0, 0.061, 0.587, 1.113, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.587 std_dev=0.526
C4'	B	0, 0.223, 0.760, 1.297, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.760 std_dev=0.537
C8	B	0, 0.087, 0.632, 1.177, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.632 std_dev=0.545
N7	B	0, 0.045, 0.598, 1.150, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.598 std_dev=0.553
C5'	A	0, -0.065, 0.489, 1.044, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.489 std_dev=0.554
O2'	B	0, 0.235, 0.806, 1.377, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.806 std_dev=0.571
OP2	A	0, 0.215, 0.795, 1.375, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.795 std_dev=0.580
C3'	B	0, 0.233, 0.818, 1.402, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.818 std_dev=0.584
C5'	B	0, 0.275, 0.939, 1.604, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.939 std_dev=0.664
OP1	B	0, 0.281, 1.014, 1.747, 1.707 max_d=1.707 avg_d=1.014 std_dev=0.733
O5'	B	0, 0.301, 1.039, 1.776, 1.637 max_d=1.637 avg_d=1.039 std_dev=0.737
O3'	B	0, 0.283, 1.045, 1.806, 1.792 max_d=1.792 avg_d=1.045 std_dev=0.761
O5'	A	0, 0.048, 0.817, 1.585, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.817 std_dev=0.768
P	B	0, 0.260, 1.181, 2.102, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.181 std_dev=0.921
OP2	B	0, 0.111, 1.786, 3.461, 4.027 max_d=4.027 avg_d=1.786 std_dev=1.675

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.23	0.30	0.01
C2	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.01	0.21	0.32	0.17	0.17
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.49	0.16
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.02	0.02	0.02	0.07	0.17	0.10	0.23	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.51	0.20
C4	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.01	0.22	0.33	0.24	0.23
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.14	0.33	0.07
C5	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.19	0.32	0.20	0.21
C5'	0.03	0.12	0.03	0.02	0.13	0.01	0.10	0.00	0.08	0.09	0.14	0.14	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.17	0.14	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.16	0.31	0.15	0.14
N1	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.16	0.30	0.19	0.11
N3	0.02	0.00	0.07	0.17	0.00	0.07	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.00	0.23	0.33	0.21	0.21
N4	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.02	0.23	0.32	0.30	0.26
O2	0.04	0.00	0.19	0.23	0.01	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.25	0.02	0.21	0.32	0.18	0.15
O2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.07	0.06	0.07	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.05	0.06	0.10	0.53	0.15
O3'	0.02	0.19	0.02	0.00	0.13	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.20	0.15	0.25	0.08	0.00	0.01	0.12	0.11	0.58	0.25
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.10	0.29	0.22	0.06
O5'	0.09	0.21	0.04	0.05	0.22	0.02	0.19	0.00	0.16	0.16	0.23	0.23	0.21	0.06	0.12	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.23	0.32	0.06	0.02	0.33	0.14	0.32	0.17	0.31	0.30	0.33	0.32	0.32	0.10	0.11	0.29	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.17	0.49	0.51	0.24	0.33	0.20	0.14	0.15	0.19	0.21	0.30	0.18	0.53	0.58	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.17	0.16	0.20	0.23	0.07	0.21	0.02	0.14	0.11	0.21	0.26	0.15	0.15	0.25	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.45	0.23	0.33	0.11	0.44	0.11	0.43	0.30	0.37	0.45	0.31	0.28	0.20	0.19	0.27	0.31	0.47	0.37	0.52	0.66	0.38
C2	0.32	0.24	0.27	0.33	0.08	0.36	0.10	0.31	0.14	0.45	0.28	0.09	0.16	0.37	0.29	0.30	0.32	0.42	0.29	0.48	0.56	0.29
C2'	0.21	0.55	0.15	0.29	0.16	0.44	0.09	0.48	0.29	0.35	0.50	0.41	0.24	0.23	0.13	0.17	0.26	0.43	0.43	0.61	0.82	0.48
C3'	0.13	0.66	0.06	0.15	0.26	0.32	0.15	0.36	0.32	0.24	0.56	0.54	0.24	0.14	0.07	0.05	0.10	0.33	0.28	0.44	0.56	0.29
C4	0.44	0.04	0.39	0.38	0.30	0.38	0.33	0.26	0.13	0.53	0.08	0.14	0.11	0.51	0.43	0.42	0.38	0.47	0.20	0.40	0.27	0.13
C4'	0.11	0.70	0.10	0.11	0.39	0.26	0.30	0.28	0.43	0.07	0.62	0.62	0.36	0.05	0.14	0.03	0.06	0.26	0.19	0.27	0.39	0.18
C5	0.50	0.08	0.43	0.40	0.32	0.43	0.33	0.29	0.08	0.54	0.16	0.15	0.02	0.49	0.47	0.48	0.40	0.51	0.19	0.39	0.20	0.09
C5'	0.19	0.76	0.24	0.19	0.45	0.20	0.33	0.20	0.45	0.09	0.64	0.71	0.37	0.13	0.23	0.14	0.18	0.21	0.18	0.13	0.24	0.20
C6	0.48	0.28	0.39	0.39	0.19	0.45	0.18	0.34	0.13	0.53	0.35	0.03	0.15	0.41	0.43	0.44	0.39	0.53	0.24	0.42	0.30	0.16
N1	0.37	0.34	0.30	0.35	0.05	0.41	0.07	0.35	0.21	0.47	0.37	0.15	0.22	0.34	0.32	0.34	0.34	0.48	0.29	0.47	0.49	0.27
N3	0.37	0.11	0.32	0.35	0.19	0.35	0.22	0.27	0.05	0.49	0.16	0.03	0.08	0.45	0.35	0.35	0.34	0.42	0.25	0.44	0.43	0.22
N4	0.46	0.13	0.41	0.38	0.36	0.37	0.40	0.23	0.27	0.52	0.11	0.24	0.27	0.52	0.45	0.45	0.40	0.46	0.17	0.36	0.19	0.10
O2	0.23	0.28	0.20	0.29	0.02	0.32	0.03	0.32	0.18	0.35	0.30	0.16	0.20	0.26	0.19	0.22	0.28	0.35	0.33	0.51	0.72	0.38
O2'	0.20	0.51	0.18	0.35	0.17	0.50	0.14	0.60	0.29	0.33	0.47	0.38	0.26	0.22	0.12	0.20	0.33	0.44	0.55	0.71	1.08	0.67
O3'	0.11	0.67	0.13	0.11	0.30	0.26	0.16	0.33	0.31	0.18	0.55	0.58	0.21	0.11	0.09	0.10	0.07	0.25	0.27	0.42	0.61	0.30
O4'	0.19	0.58	0.11	0.19	0.31	0.33	0.28	0.30	0.42	0.13	0.55	0.47	0.38	0.04	0.05	0.20	0.18	0.36	0.20	0.28	0.37	0.17
O5'	0.29	0.76	0.25	0.26	0.37	0.32	0.28	0.31	0.38	0.26	0.61	0.65	0.29	0.22	0.26	0.19	0.23	0.35	0.28	0.28	0.35	0.30
OP1	0.34	0.46	0.27	0.28	0.23	0.41	0.23	0.37	0.26	0.34	0.40	0.32	0.24	0.28	0.28	0.36	0.29	0.42	0.27	0.37	0.17	0.22
OP2	0.18	0.43	0.08	0.08	0.19	0.19	0.15	0.19	0.17	0.22	0.31	0.36	0.13	0.20	0.16	0.01	0.08	0.25	0.16	0.20	0.20	0.20
P	0.23	0.42	0.10	0.11	0.05	0.28	0.03	0.22	0.11	0.25	0.32	0.27	0.06	0.19	0.15	0.19	0.09	0.32	0.07	0.24	0.09	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.12	0.15	0.08
C2	0.04	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.24	0.10	0.48	0.34
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.08	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.37	0.15
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.08	0.13	0.02	0.07	0.12	0.13	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.43	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.23	0.09	0.36	0.29
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.13	0.18	0.07	0.01	0.17	0.19	0.08	0.06	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04
C5	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.33	0.04	0.42	0.40
C5'	0.04	0.14	0.02	0.01	0.16	0.00	0.27	0.00	0.28	0.30	0.21	0.09	0.35	0.34	0.16	0.05	0.03	0.01	0.01	0.15	0.04	0.00
C6	0.03	0.01	0.03	0.08	0.01	0.13	0.01	0.28	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.36	0.07	0.52	0.47
C8	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.18	0.01	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.12	0.05	0.32	0.01	0.23	0.29
N1	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.31	0.07	0.54	0.43
N3	0.04	0.00	0.08	0.07	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.18	0.13	0.39	0.26
N6	0.03	0.02	0.04	0.12	0.02	0.17	0.02	0.35	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.10	0.06	0.43	0.14	0.58	0.56
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.19	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.06	0.39	0.06	0.34	0.42
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.18	0.09	0.24	0.21
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.05	0.03	0.03	0.06	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.08	0.33	0.10
O3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.12	0.07	0.13	0.10	0.13	0.03	0.05	0.00	0.03	0.03	0.10	0.55	0.14
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.14	0.08	0.05
O5'	0.05	0.24	0.06	0.02	0.23	0.01	0.33	0.01	0.36	0.32	0.31	0.18	0.43	0.39	0.18	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.12	0.10	0.08	0.07	0.09	0.04	0.04	0.15	0.07	0.01	0.07	0.13	0.14	0.06	0.09	0.08	0.10	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.48	0.37	0.43	0.36	0.14	0.42	0.04	0.52	0.23	0.54	0.39	0.58	0.34	0.24	0.33	0.55	0.08	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.34	0.15	0.14	0.29	0.04	0.40	0.00	0.47	0.29	0.43	0.26	0.56	0.42	0.21	0.10	0.14	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00