Doublet Group distance statistics: 49631

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N4	A	0, 0.000, 0.044, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.044 std_dev=0.044
O2'	B	0, 0.000, 0.135, 0.270, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.135 std_dev=0.135
C1'	B	0, 0.000, 0.293, 0.586, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.293 std_dev=0.293
N9	B	0, 0.000, 0.353, 0.707, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.353 std_dev=0.353
O4'	B	0, 0.000, 0.391, 0.783, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.391 std_dev=0.391
C4	B	0, 0.000, 0.406, 0.812, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.406 std_dev=0.406
C8	B	0, 0.000, 0.440, 0.879, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.440 std_dev=0.440
C2'	B	0, 0.000, 0.442, 0.885, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.442 std_dev=0.442
O4'	A	0, 0.000, 0.463, 0.926, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.463 std_dev=0.463
C5	B	0, 0.000, 0.470, 0.940, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.470 std_dev=0.470
N3	B	0, 0.000, 0.476, 0.953, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.476 std_dev=0.476
C2'	A	0, 0.000, 0.518, 1.035, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.518 std_dev=0.518
N7	B	0, 0.000, 0.519, 1.039, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.519 std_dev=0.519
C6	B	0, 0.000, 0.539, 1.079, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.539 std_dev=0.539
C2	B	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
N1	B	0, 0.000, 0.563, 1.127, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.563 std_dev=0.563
N6	B	0, 0.000, 0.633, 1.267, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.633 std_dev=0.633
C4'	A	0, 0.000, 0.676, 1.351, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.676 std_dev=0.676
C4'	B	0, 0.000, 0.785, 1.570, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.785 std_dev=0.785
O2'	A	0, 0.000, 0.825, 1.649, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.825 std_dev=0.825
C3'	B	0, 0.000, 0.825, 1.651, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.825 std_dev=0.825
C3'	A	0, 0.000, 0.846, 1.693, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.846 std_dev=0.846
O5'	B	0, 0.000, 0.973, 1.946, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.973 std_dev=0.973
O3'	B	0, 0.000, 1.053, 2.106, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.053 std_dev=1.053
C5'	B	0, 0.000, 1.095, 2.190, 2.190 max_d=2.190 avg_d=1.095 std_dev=1.095
O5'	A	0, 0.000, 1.176, 2.351, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.176 std_dev=1.176
C5'	A	0, 0.000, 1.231, 2.463, 2.463 max_d=2.463 avg_d=1.231 std_dev=1.231
OP1	A	0, 0.000, 1.279, 2.557, 2.557 max_d=2.557 avg_d=1.279 std_dev=1.279
O3'	A	0, 0.000, 1.294, 2.587, 2.587 max_d=2.587 avg_d=1.294 std_dev=1.294
P	B	0, 0.000, 1.654, 3.308, 3.308 max_d=3.308 avg_d=1.654 std_dev=1.654
P	A	0, 0.000, 1.664, 3.329, 3.329 max_d=3.329 avg_d=1.664 std_dev=1.664
OP1	B	0, 0.000, 1.830, 3.660, 3.660 max_d=3.660 avg_d=1.830 std_dev=1.830
OP2	B	0, 0.000, 1.936, 3.872, 3.872 max_d=3.872 avg_d=1.936 std_dev=1.936
OP2	A	0, 0.000, 2.515, 5.030, 5.030 max_d=5.030 avg_d=2.515 std_dev=2.515

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.26	0.31	0.13	0.24
C2	0.01	0.00	0.14	0.01	0.00	0.04	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.09	0.05	0.27	0.29	0.13	0.27
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.02	0.12	0.00	0.11	0.03	0.26	0.00	0.02	0.01	0.13	0.13	0.17	0.13
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.00	0.31	0.00	0.31	0.12	0.06	0.19	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02
C4	0.00	0.00	0.02	0.18	0.00	0.18	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.15	0.04	0.16	0.17	0.03	0.20
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.18	0.00	0.24	0.00	0.22	0.10	0.10	0.20	0.06	0.05	0.00	0.00	0.00	0.17	0.12	0.02
C5	0.00	0.00	0.08	0.31	0.00	0.24	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.00	0.10	0.14	0.09	0.17
C5'	0.05	0.21	0.02	0.00	0.42	0.00	0.47	0.00	0.40	0.23	0.31	0.47	0.08	0.04	0.01	0.00	0.00	0.35	0.25	0.00
C6	0.00	0.00	0.12	0.31	0.00	0.22	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.30	0.04	0.14	0.19	0.03	0.20
N1	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.24	0.27	0.09	0.25
N3	0.01	0.00	0.11	0.06	0.00	0.10	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.02	0.06	0.23	0.24	0.07	0.25
N4	0.00	0.00	0.03	0.19	0.00	0.20	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.17	0.05	0.13	0.13	0.09	0.17
O2	0.02	0.00	0.26	0.16	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.40	0.29	0.06	0.32	0.34	0.21	0.31
O2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.05	0.01	0.04	0.05	0.07	0.24	0.16	0.40	0.00	0.05	0.11	0.03	0.04	0.03	0.05
O3'	0.03	0.09	0.02	0.00	0.15	0.00	0.31	0.01	0.30	0.07	0.02	0.17	0.29	0.05	0.00	0.00	0.28	0.27	0.12	0.27
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.05	0.06	0.11	0.00	0.00	0.30	0.41	0.08	0.26
O5'	0.26	0.27	0.13	0.01	0.16	0.00	0.10	0.00	0.14	0.24	0.23	0.13	0.32	0.03	0.28	0.30	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.31	0.29	0.13	0.05	0.17	0.17	0.14	0.35	0.19	0.27	0.24	0.13	0.34	0.04	0.27	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.13	0.17	0.06	0.03	0.12	0.09	0.25	0.03	0.09	0.07	0.09	0.21	0.03	0.12	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.27	0.13	0.02	0.20	0.02	0.17	0.00	0.20	0.25	0.25	0.17	0.31	0.05	0.27	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.11	0.12	0.15	0.13	0.04	0.25	0.12	0.23	0.30	0.03	0.05	0.33	0.35	0.18	0.03	0.03	0.02	0.44	0.54	0.73	0.56
C2	0.06	0.15	0.07	0.05	0.09	0.07	0.21	0.02	0.17	0.27	0.01	0.10	0.23	0.30	0.15	0.04	0.10	0.03	0.46	0.45	0.51	0.45
C2'	0.11	0.04	0.16	0.15	0.11	0.02	0.17	0.05	0.13	0.23	0.01	0.01	0.17	0.24	0.16	0.07	0.05	0.01	0.51	0.65	0.83	0.66
C3'	0.17	0.30	0.12	0.12	0.19	0.24	0.14	0.20	0.18	0.09	0.27	0.25	0.13	0.08	0.14	0.19	0.20	0.26	0.83	1.06	1.27	1.06
C4	0.02	0.32	0.02	0.04	0.08	0.11	0.04	0.07	0.04	0.19	0.21	0.28	0.03	0.19	0.04	0.06	0.14	0.08	0.53	0.54	0.53	0.54
C4'	0.22	0.39	0.19	0.12	0.24	0.22	0.17	0.12	0.21	0.10	0.36	0.34	0.12	0.07	0.18	0.30	0.20	0.26	0.79	1.01	1.27	1.02
C5	0.01	0.36	0.02	0.05	0.08	0.02	0.05	0.06	0.07	0.23	0.27	0.28	0.02	0.24	0.06	0.04	0.03	0.03	0.52	0.66	0.76	0.67
C5'	0.60	0.74	0.58	0.50	0.64	0.56	0.60	0.45	0.66	0.51	0.75	0.70	0.58	0.49	0.58	0.67	0.55	0.62	1.16	1.46	1.73	1.46
C6	0.05	0.30	0.07	0.11	0.01	0.03	0.15	0.11	0.04	0.28	0.21	0.20	0.14	0.31	0.12	0.03	0.02	0.00	0.49	0.65	0.81	0.66
N1	0.07	0.20	0.09	0.11	0.08	0.00	0.22	0.07	0.16	0.29	0.06	0.12	0.25	0.33	0.16	0.03	0.01	0.00	0.46	0.55	0.68	0.56
N3	0.02	0.22	0.02	0.03	0.02	0.13	0.13	0.09	0.07	0.22	0.09	0.18	0.13	0.23	0.10	0.06	0.17	0.07	0.48	0.43	0.42	0.43
N4	0.10	0.33	0.11	0.16	0.17	0.21	0.06	0.19	0.12	0.09	0.24	0.32	0.06	0.08	0.06	0.09	0.24	0.16	0.57	0.53	0.41	0.52
O2	0.08	0.03	0.10	0.05	0.15	0.08	0.25	0.04	0.23	0.27	0.11	0.01	0.29	0.31	0.18	0.03	0.11	0.02	0.43	0.37	0.43	0.38
O2'	0.32	0.21	0.39	0.36	0.31	0.21	0.33	0.22	0.28	0.38	0.22	0.25	0.28	0.37	0.35	0.29	0.26	0.20	0.32	0.42	0.63	0.43
O3'	0.09	0.15	0.03	0.05	0.11	0.19	0.11	0.18	0.13	0.07	0.16	0.12	0.14	0.08	0.09	0.08	0.11	0.21	0.83	1.09	1.33	1.08
O4'	0.09	0.40	0.08	0.02	0.09	0.05	0.06	0.09	0.01	0.14	0.29	0.29	0.19	0.20	0.01	0.24	0.09	0.09	0.53	0.68	0.91	0.69
O5'	0.10	0.38	0.12	0.03	0.21	0.04	0.21	0.07	0.33	0.06	0.43	0.29	0.36	0.10	0.12	0.19	0.08	0.09	0.68	1.03	1.27	1.00
OP1	0.07	0.27	0.09	0.03	0.15	0.02	0.14	0.14	0.23	0.03	0.29	0.20	0.25	0.06	0.08	0.15	0.00	0.05	0.66	1.14	1.41	1.10
OP2	0.68	0.91	0.77	0.66	0.85	0.56	0.94	0.43	1.06	0.77	1.02	0.84	1.20	0.88	0.76	0.76	0.68	0.59	1.24	1.67	1.83	1.60
P	0.20	0.50	0.25	0.12	0.34	0.07	0.36	0.07	0.50	0.19	0.57	0.40	0.58	0.25	0.24	0.30	0.15	0.13	0.71	1.13	1.35	1.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.34	0.20	0.21	0.15
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.11	0.50	0.51	0.81	0.54
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.10	0.03	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.18	0.00	0.05	0.07
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.15	0.09	0.15	0.11	0.15	0.12	0.08	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.10	0.16
C4	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.05	0.49	0.52	0.76	0.52
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.06	0.16	0.01	0.04	0.08	0.14	0.06	0.05	0.01	0.00	0.00	0.10	0.31	0.23
C5	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.53	0.70	1.01	0.70
C5'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.14	0.26	0.07	0.00	0.18	0.25	0.11	0.04	0.02	0.01	0.00	0.16	0.26	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.11	0.04	0.55	0.75	1.10	0.76
C8	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.16	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.09	0.48	0.64	0.83	0.60
N1	0.02	0.00	0.08	0.15	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.09	0.54	0.65	1.00	0.68
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.11	0.47	0.42	0.66	0.44
N6	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.03	0.57	0.87	1.25	0.86
N7	0.00	0.00	0.03	0.12	0.00	0.14	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.05	0.52	0.78	1.07	0.75
N9	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.46	0.46	0.61	0.44
O2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.05	0.06	0.04	0.06	0.07	0.05	0.02	0.07	0.08	0.05	0.00	0.08	0.07	0.03	0.36	0.32	0.41
O3'	0.05	0.06	0.03	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.11	0.08	0.09	0.04	0.13	0.11	0.04	0.08	0.00	0.02	0.30	0.53	0.49	0.59
O4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.09	0.11	0.03	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.32	0.19	0.06	0.12
O5'	0.34	0.50	0.18	0.05	0.49	0.00	0.53	0.00	0.55	0.48	0.54	0.47	0.57	0.52	0.46	0.03	0.30	0.32	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.20	0.51	0.00	0.05	0.52	0.10	0.70	0.16	0.75	0.64	0.65	0.42	0.87	0.78	0.46	0.36	0.53	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.81	0.05	0.10	0.76	0.31	1.01	0.26	1.10	0.83	1.00	0.66	1.25	1.07	0.61	0.32	0.49	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.54	0.07	0.16	0.52	0.23	0.70	0.01	0.76	0.60	0.68	0.44	0.86	0.75	0.44	0.41	0.59	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00