Doublet Group distance statistics: 49644

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 9, 9, 14, 4, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.020 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.019, 0.040, 0.062, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.040 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.028, 0.064, 0.099, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.064 std_dev=0.036
O3'	A	0, 0.141, 0.279, 0.418, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.279 std_dev=0.138
N1	B	0, 0.225, 0.371, 0.518, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.371 std_dev=0.146
C2	B	0, 0.238, 0.389, 0.539, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.389 std_dev=0.150
O2	B	0, 0.285, 0.448, 0.612, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.448 std_dev=0.164
C1'	B	0, 0.184, 0.354, 0.524, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.354 std_dev=0.170
C3'	A	0, 0.124, 0.295, 0.466, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.295 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.279, 0.451, 0.622, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.451 std_dev=0.172
N3	B	0, 0.244, 0.416, 0.589, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.416 std_dev=0.172
O4'	B	0, 0.210, 0.388, 0.566, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.388 std_dev=0.178
C4	B	0, 0.271, 0.465, 0.659, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.465 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.308, 0.506, 0.703, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.506 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.073, 0.289, 0.504, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.289 std_dev=0.215
O4	B	0, 0.313, 0.544, 0.775, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.544 std_dev=0.231
O4'	A	0, 0.009, 0.251, 0.492, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.251 std_dev=0.242
C2'	A	0, 0.089, 0.339, 0.589, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.339 std_dev=0.250
C2'	B	0, 0.174, 0.443, 0.712, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.443 std_dev=0.269
C4'	B	0, 0.156, 0.497, 0.838, 2.476 max_d=2.476 avg_d=0.497 std_dev=0.341
O2'	B	0, 0.121, 0.479, 0.837, 2.549 max_d=2.549 avg_d=0.479 std_dev=0.358
C5'	A	0, 0.171, 0.564, 0.956, 2.547 max_d=2.547 avg_d=0.564 std_dev=0.393
C5'	B	0, 0.195, 0.610, 1.025, 2.983 max_d=2.983 avg_d=0.610 std_dev=0.415
C3'	B	0, 0.121, 0.569, 1.017, 3.285 max_d=3.285 avg_d=0.569 std_dev=0.448
O5'	A	0, 0.204, 0.666, 1.127, 2.928 max_d=2.928 avg_d=0.666 std_dev=0.462
O2'	A	0, 0.083, 0.559, 1.036, 3.170 max_d=3.170 avg_d=0.559 std_dev=0.477
O5'	B	0, 0.215, 0.703, 1.190, 3.508 max_d=3.508 avg_d=0.703 std_dev=0.487
P	B	0, 0.389, 0.908, 1.427, 3.495 max_d=3.495 avg_d=0.908 std_dev=0.519
P	A	0, 0.206, 0.813, 1.421, 3.192 max_d=3.192 avg_d=0.813 std_dev=0.608
OP1	B	0, 0.402, 1.016, 1.631, 4.277 max_d=4.277 avg_d=1.016 std_dev=0.615
OP2	B	0, 0.378, 1.053, 1.728, 4.628 max_d=4.628 avg_d=1.053 std_dev=0.675
O3'	B	0, 0.014, 0.691, 1.367, 4.917 max_d=4.917 avg_d=0.691 std_dev=0.676
OP2	A	0, 0.132, 0.905, 1.678, 3.631 max_d=3.631 avg_d=0.905 std_dev=0.773
OP1	A	0, 0.161, 0.944, 1.726, 3.461 max_d=3.461 avg_d=0.944 std_dev=0.783

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.00	0.16	0.14	0.25	0.18
C2	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.11	0.10	0.26	0.17	0.42	0.26
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.09	0.11	0.02	0.04	0.04	0.14	0.00	0.03	0.01	0.19	0.26	0.14	0.14
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.08	0.18	0.13	0.08
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.10	0.03	0.33	0.35	0.63	0.42
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.05	0.05	0.12	0.09	0.02	0.00	0.02	0.08	0.10	0.06
C5	0.01	0.01	0.10	0.03	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.10	0.09	0.34	0.44	0.67	0.48
C5'	0.05	0.13	0.09	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.14	0.09	0.14	0.14	0.18	0.03	0.06	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.03	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.10	0.11	0.31	0.39	0.58	0.43
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.25	0.23	0.42	0.29
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.11	0.07	0.29	0.23	0.52	0.33
N4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.10	0.03	0.34	0.39	0.69	0.46
O2	0.02	0.00	0.14	0.03	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.25	0.14	0.19	0.23	0.12	0.31	0.17
O2'	0.02	0.10	0.00	0.03	0.09	0.09	0.20	0.03	0.21	0.05	0.06	0.10	0.25	0.00	0.08	0.05	0.15	0.26	0.17	0.13
O3'	0.10	0.11	0.03	0.01	0.10	0.02	0.10	0.06	0.10	0.10	0.11	0.10	0.14	0.08	0.00	0.08	0.09	0.18	0.19	0.12
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.02	0.11	0.01	0.07	0.03	0.19	0.05	0.08	0.00	0.13	0.12	0.28	0.22
O5'	0.16	0.26	0.19	0.08	0.33	0.02	0.34	0.01	0.31	0.25	0.29	0.34	0.23	0.15	0.09	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.17	0.26	0.18	0.35	0.08	0.44	0.07	0.39	0.23	0.23	0.39	0.12	0.26	0.18	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.42	0.14	0.13	0.63	0.10	0.67	0.02	0.58	0.42	0.52	0.69	0.31	0.17	0.19	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.26	0.14	0.08	0.42	0.06	0.48	0.01	0.43	0.29	0.33	0.46	0.17	0.13	0.12	0.22	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.14	0.21	0.34	0.20	0.32	0.20	0.29	0.17	0.14	0.18	0.12	0.25	0.54	0.22	0.17	0.23	0.29	0.28	0.29
C2	0.11	0.11	0.13	0.14	0.16	0.17	0.18	0.15	0.14	0.09	0.13	0.15	0.20	0.28	0.18	0.11	0.18	0.19	0.29	0.20
C2'	0.18	0.26	0.20	0.38	0.29	0.39	0.26	0.41	0.23	0.22	0.30	0.27	0.17	0.59	0.30	0.23	0.33	0.42	0.34	0.39
C3'	0.18	0.24	0.17	0.33	0.26	0.30	0.24	0.32	0.22	0.22	0.26	0.25	0.14	0.55	0.27	0.20	0.28	0.31	0.30	0.31
C4	0.16	0.15	0.17	0.14	0.14	0.15	0.18	0.12	0.14	0.13	0.12	0.22	0.26	0.23	0.17	0.13	0.21	0.16	0.35	0.19
C4'	0.18	0.19	0.13	0.27	0.22	0.24	0.23	0.26	0.22	0.20	0.20	0.17	0.12	0.48	0.22	0.24	0.26	0.21	0.29	0.26
C5	0.15	0.10	0.19	0.17	0.20	0.18	0.22	0.14	0.17	0.12	0.12	0.18	0.30	0.31	0.25	0.13	0.17	0.17	0.31	0.19
C5'	0.34	0.27	0.24	0.27	0.28	0.32	0.31	0.33	0.32	0.31	0.26	0.25	0.23	0.37	0.26	0.38	0.33	0.28	0.33	0.31
C6	0.14	0.11	0.19	0.23	0.23	0.23	0.22	0.19	0.18	0.13	0.17	0.11	0.31	0.39	0.26	0.14	0.17	0.18	0.28	0.21
N1	0.11	0.09	0.16	0.23	0.19	0.23	0.20	0.20	0.16	0.10	0.15	0.10	0.24	0.40	0.22	0.13	0.17	0.21	0.27	0.23
N3	0.16	0.16	0.16	0.12	0.15	0.14	0.17	0.12	0.14	0.13	0.15	0.21	0.22	0.21	0.17	0.13	0.22	0.15	0.35	0.19
N4	0.20	0.22	0.20	0.17	0.15	0.16	0.19	0.15	0.17	0.18	0.20	0.27	0.27	0.21	0.15	0.17	0.26	0.20	0.41	0.22
O2	0.13	0.14	0.14	0.16	0.17	0.19	0.19	0.19	0.17	0.14	0.15	0.16	0.18	0.28	0.18	0.14	0.21	0.25	0.30	0.24
O2'	0.29	0.23	0.37	0.62	0.27	0.64	0.25	0.69	0.26	0.23	0.28	0.23	0.31	0.84	0.31	0.39	0.55	0.71	0.51	0.62
O3'	0.10	0.19	0.17	0.38	0.22	0.30	0.19	0.33	0.15	0.15	0.23	0.20	0.15	0.64	0.24	0.11	0.26	0.36	0.26	0.30
O4'	0.12	0.15	0.11	0.20	0.20	0.16	0.22	0.19	0.21	0.17	0.17	0.13	0.19	0.39	0.20	0.20	0.22	0.16	0.28	0.22
O5'	0.33	0.33	0.28	0.23	0.32	0.26	0.32	0.26	0.32	0.33	0.32	0.34	0.29	0.31	0.31	0.33	0.27	0.26	0.28	0.25
OP1	0.29	0.09	0.32	0.39	0.08	0.44	0.12	0.44	0.18	0.17	0.09	0.09	0.43	0.49	0.10	0.38	0.38	0.40	0.31	0.36
OP2	0.14	0.30	0.16	0.14	0.36	0.14	0.30	0.13	0.24	0.22	0.37	0.31	0.24	0.25	0.40	0.12	0.13	0.15	0.16	0.10
P	0.18	0.15	0.21	0.22	0.16	0.24	0.14	0.24	0.13	0.14	0.18	0.17	0.30	0.32	0.18	0.21	0.20	0.22	0.16	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.08	0.09	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.01	0.01	0.11	0.16	0.14	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.15	0.12	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.13	0.00	0.15	0.02	0.13	0.08	0.10	0.06	0.02	0.00	0.15	0.01	0.04	0.21	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.00	0.03	0.21	0.21	0.25	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.04	0.03	0.08	0.03	0.06	0.00	0.01	0.09	0.05	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.15	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.03	0.23	0.19	0.26	0.14
C5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.11	0.00	0.14	0.00	0.12	0.06	0.08	0.03	0.06	0.02	0.12	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.03	0.19	0.15	0.18	0.09
N1	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.01	0.12	0.13	0.12	0.06
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.07	0.01	0.02	0.16	0.19	0.20	0.10
O2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.10	0.01	0.02	0.08	0.14	0.11	0.06
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.09	0.08	0.05	0.06	0.04	0.06	0.12	0.17	0.00	0.03	0.10	0.06	0.03	0.19	0.10	0.07
O3'	0.05	0.05	0.01	0.00	0.10	0.03	0.12	0.02	0.10	0.04	0.07	0.10	0.03	0.00	0.12	0.04	0.04	0.30	0.14	0.14
O4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.00	0.04	0.23	0.23	0.30	0.16
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.04	0.00	0.04	0.08	0.09	0.10
O5'	0.04	0.11	0.06	0.04	0.21	0.01	0.23	0.01	0.19	0.12	0.16	0.08	0.03	0.04	0.23	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.16	0.15	0.21	0.21	0.09	0.19	0.05	0.15	0.13	0.19	0.14	0.19	0.30	0.23	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.14	0.12	0.10	0.25	0.05	0.26	0.01	0.18	0.12	0.20	0.11	0.10	0.14	0.30	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.06	0.07	0.08	0.13	0.04	0.14	0.01	0.09	0.06	0.10	0.06	0.07	0.14	0.16	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00