Doublet Group distance statistics: 49647

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 4, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.011, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.011, 0.017, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.018, 0.028, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.028 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.016, 0.030, 0.043, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.030 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.020, 0.034, 0.048, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.034 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.029, 0.045, 0.060, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.045 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.031, 0.052, 0.073, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.052 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.045, 0.078, 0.111, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.078 std_dev=0.033
N1	B	0, 0.253, 0.475, 0.698, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.475 std_dev=0.222
O4'	A	0, 0.152, 0.379, 0.607, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.379 std_dev=0.227
C2'	A	0, 0.161, 0.408, 0.654, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.408 std_dev=0.246
C2'	B	0, 0.387, 0.655, 0.923, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.655 std_dev=0.268
C2	B	0, 0.423, 0.707, 0.992, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.707 std_dev=0.285
C1'	B	0, 0.365, 0.658, 0.952, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.658 std_dev=0.294
C4'	A	0, 0.569, 0.891, 1.213, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.891 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.481, 0.821, 1.161, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.821 std_dev=0.340
O2	B	0, 0.608, 0.970, 1.331, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.970 std_dev=0.361
N3	B	0, 0.639, 1.030, 1.421, 1.452 max_d=1.452 avg_d=1.030 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.744, 1.208, 1.672, 1.755 max_d=1.755 avg_d=1.208 std_dev=0.464
C4	B	0, 0.794, 1.271, 1.748, 1.799 max_d=1.799 avg_d=1.271 std_dev=0.477
O2'	A	0, 0.855, 1.339, 1.822, 1.792 max_d=1.792 avg_d=1.339 std_dev=0.483
O4'	B	0, 0.735, 1.334, 1.934, 2.156 max_d=2.156 avg_d=1.334 std_dev=0.599
O4	B	0, 1.075, 1.682, 2.290, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.682 std_dev=0.607
C3'	A	0, 1.215, 1.883, 2.551, 2.385 max_d=2.385 avg_d=1.883 std_dev=0.668
O2'	B	0, 1.051, 1.738, 2.424, 2.471 max_d=2.471 avg_d=1.738 std_dev=0.687
O5'	A	0, 0.917, 1.647, 2.377, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.647 std_dev=0.730
OP1	A	0, 0.501, 1.236, 1.971, 2.828 max_d=2.828 avg_d=1.236 std_dev=0.735
C5'	A	0, 0.935, 1.678, 2.421, 2.609 max_d=2.609 avg_d=1.678 std_dev=0.743
C3'	B	0, 0.911, 1.669, 2.427, 2.798 max_d=2.798 avg_d=1.669 std_dev=0.758
O5'	B	0, 1.089, 1.893, 2.697, 2.938 max_d=2.938 avg_d=1.893 std_dev=0.804
C4'	B	0, 1.175, 2.013, 2.850, 3.095 max_d=3.095 avg_d=2.013 std_dev=0.837
P	A	0, 0.863, 1.767, 2.671, 3.375 max_d=3.375 avg_d=1.767 std_dev=0.904
O3'	B	0, 1.326, 2.331, 3.335, 3.687 max_d=3.687 avg_d=2.331 std_dev=1.005
O3'	A	0, 2.129, 3.253, 4.377, 3.970 max_d=3.970 avg_d=3.253 std_dev=1.124
C5'	B	0, 1.825, 2.953, 4.081, 4.137 max_d=4.137 avg_d=2.953 std_dev=1.128
P	B	0, 1.563, 2.726, 3.888, 4.558 max_d=4.558 avg_d=2.726 std_dev=1.162
OP2	A	0, 1.962, 3.264, 4.567, 4.980 max_d=4.980 avg_d=3.264 std_dev=1.302
OP2	B	0, 1.432, 2.960, 4.489, 5.769 max_d=5.769 avg_d=2.960 std_dev=1.529
OP1	B	0, 2.347, 4.059, 5.770, 6.590 max_d=6.590 avg_d=4.059 std_dev=1.712

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.11	0.00	0.13	0.07	0.29	0.14
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.15	0.06	0.24	0.15	0.26	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.11	0.06	0.12	0.03	0.04	0.05	0.14	0.00	0.02	0.02	0.10	0.10	0.31	0.14
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.14	0.06	0.06	0.11	0.11	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.19	0.10
C4	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.10	0.03	0.35	0.16	0.16	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.05	0.05	0.09	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.11	0.21	0.09
C5	0.01	0.00	0.11	0.15	0.00	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.09	0.03	0.38	0.17	0.22	0.19
C5'	0.03	0.08	0.06	0.01	0.18	0.00	0.23	0.00	0.21	0.11	0.12	0.20	0.04	0.04	0.05	0.02	0.01	0.14	0.13	0.02
C6	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.04	0.35	0.14	0.19	0.15
N1	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.25	0.10	0.21	0.11
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.13	0.05	0.30	0.17	0.20	0.15
N4	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.10	0.03	0.37	0.18	0.18	0.19
O2	0.03	0.00	0.14	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.26	0.20	0.09	0.19	0.18	0.35	0.19
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.10	0.05	0.11	0.04	0.11	0.06	0.13	0.10	0.26	0.00	0.05	0.03	0.10	0.12	0.34	0.15
O3'	0.11	0.15	0.02	0.01	0.10	0.03	0.09	0.05	0.07	0.09	0.13	0.10	0.20	0.05	0.00	0.07	0.10	0.29	0.19	0.14
O4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.09	0.03	0.07	0.00	0.06	0.07	0.31	0.18
O5'	0.13	0.24	0.10	0.10	0.35	0.02	0.38	0.01	0.35	0.25	0.30	0.37	0.19	0.10	0.10	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.15	0.10	0.21	0.16	0.11	0.17	0.14	0.14	0.10	0.17	0.18	0.18	0.12	0.29	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.26	0.31	0.19	0.16	0.21	0.22	0.13	0.19	0.21	0.20	0.18	0.35	0.34	0.19	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.15	0.14	0.10	0.16	0.09	0.19	0.02	0.15	0.11	0.15	0.19	0.19	0.15	0.14	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.15	0.06	0.11	0.10	0.16	0.12	0.12	0.11	0.12	0.12	0.20	0.06	0.12	0.12	0.20	0.21	0.14	0.44	0.12
C2	0.18	0.16	0.16	0.21	0.15	0.24	0.10	0.26	0.12	0.15	0.16	0.18	0.17	0.19	0.19	0.25	0.25	0.13	0.78	0.31
C2'	0.20	0.12	0.11	0.15	0.09	0.21	0.14	0.14	0.16	0.14	0.09	0.16	0.10	0.18	0.12	0.24	0.12	0.17	0.51	0.20
C3'	0.20	0.11	0.16	0.19	0.10	0.22	0.13	0.21	0.16	0.14	0.10	0.16	0.13	0.22	0.13	0.24	0.20	0.40	0.34	0.31
C4	0.15	0.13	0.14	0.18	0.11	0.18	0.12	0.20	0.14	0.14	0.13	0.15	0.13	0.13	0.12	0.18	0.22	0.09	0.70	0.21
C4'	0.19	0.18	0.25	0.23	0.20	0.21	0.22	0.29	0.22	0.19	0.19	0.18	0.22	0.19	0.21	0.21	0.44	0.54	0.20	0.34
C5	0.16	0.15	0.12	0.15	0.10	0.14	0.13	0.14	0.15	0.15	0.14	0.17	0.14	0.12	0.07	0.14	0.22	0.23	0.54	0.10
C5'	0.34	0.41	0.35	0.34	0.40	0.34	0.35	0.39	0.33	0.36	0.43	0.43	0.35	0.32	0.41	0.34	0.47	0.65	0.24	0.39
C6	0.17	0.15	0.11	0.14	0.08	0.14	0.12	0.13	0.14	0.15	0.12	0.17	0.14	0.12	0.06	0.15	0.23	0.26	0.46	0.08
N1	0.16	0.14	0.08	0.14	0.09	0.17	0.07	0.16	0.09	0.13	0.12	0.17	0.07	0.12	0.12	0.19	0.21	0.10	0.58	0.16
N3	0.18	0.15	0.17	0.22	0.14	0.24	0.12	0.26	0.14	0.15	0.15	0.16	0.18	0.19	0.19	0.24	0.25	0.12	0.81	0.31
N4	0.15	0.13	0.15	0.19	0.12	0.19	0.15	0.21	0.16	0.14	0.14	0.15	0.15	0.14	0.13	0.18	0.23	0.09	0.74	0.23
O2	0.23	0.20	0.24	0.28	0.20	0.32	0.16	0.35	0.16	0.20	0.19	0.21	0.27	0.27	0.23	0.32	0.32	0.30	0.92	0.43
O2'	0.33	0.21	0.25	0.31	0.17	0.38	0.24	0.32	0.29	0.27	0.16	0.23	0.24	0.34	0.16	0.41	0.27	0.32	0.77	0.37
O3'	0.48	0.36	0.42	0.44	0.25	0.49	0.32	0.41	0.39	0.41	0.28	0.38	0.37	0.46	0.20	0.56	0.30	0.44	0.41	0.43
O4'	0.21	0.18	0.28	0.24	0.23	0.19	0.28	0.24	0.29	0.23	0.18	0.16	0.26	0.17	0.21	0.20	0.42	0.40	0.18	0.19
O5'	0.41	0.52	0.43	0.40	0.55	0.39	0.50	0.42	0.46	0.46	0.56	0.52	0.41	0.37	0.57	0.42	0.50	0.62	0.17	0.34
OP1	0.48	0.54	0.47	0.50	0.42	0.51	0.36	0.51	0.38	0.45	0.51	0.64	0.47	0.53	0.42	0.49	0.56	0.74	0.28	0.42
OP2	0.19	0.25	0.20	0.23	0.26	0.26	0.19	0.32	0.17	0.17	0.29	0.31	0.18	0.22	0.34	0.23	0.32	0.53	0.52	0.38
P	0.30	0.40	0.30	0.31	0.36	0.32	0.28	0.36	0.26	0.30	0.42	0.46	0.29	0.31	0.40	0.31	0.40	0.58	0.30	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.09	0.26	0.28	0.15
C2	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.08	0.00	0.09	0.21	0.40	0.33	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.07	0.03	0.02	0.05	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01	0.17	0.19	0.29	0.18
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.11	0.13	0.15	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.02	0.19	0.31	0.50	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.20	0.09	0.09
C5	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.00	0.05	0.14	0.22	0.58	0.20
C5'	0.02	0.10	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.06	0.05	0.10	0.14	0.04	0.06	0.09	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01
C6	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.04	0.00	0.07	0.11	0.21	0.53	0.22
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.01	0.14	0.29	0.39	0.16
N3	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.00	0.07	0.22	0.39	0.40	0.15
O2	0.02	0.00	0.09	0.03	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.11	0.00	0.15	0.23	0.48	0.25	0.17
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.04	0.11	0.04	0.13	0.05	0.12	0.23	0.00	0.03	0.08	0.02	0.16	0.17	0.31	0.16
O3'	0.07	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.06	0.04	0.06	0.07	0.11	0.03	0.00	0.05	0.04	0.08	0.20	0.13	0.08
O4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.03	0.20	0.31	0.52	0.15
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.15	0.02	0.04	0.03	0.00	0.07	0.27	0.26	0.18
O5'	0.09	0.21	0.17	0.11	0.19	0.01	0.14	0.00	0.11	0.14	0.22	0.23	0.16	0.08	0.20	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.26	0.40	0.19	0.13	0.31	0.20	0.22	0.07	0.21	0.29	0.39	0.48	0.17	0.20	0.31	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.28	0.33	0.29	0.15	0.50	0.09	0.58	0.18	0.53	0.39	0.40	0.25	0.31	0.13	0.52	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.15	0.18	0.10	0.16	0.09	0.20	0.01	0.22	0.16	0.15	0.17	0.16	0.08	0.15	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00