Doublet Group distance statistics: 49652

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.033 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.036, 0.073, 0.110, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.073 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.013, 0.082, 0.151, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.082 std_dev=0.069
O4'	A	0, 0.029, 0.118, 0.207, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.118 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.050, 0.154, 0.257, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.154 std_dev=0.103
C3'	A	0, 0.085, 0.210, 0.336, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.210 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.043, 0.170, 0.297, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.170 std_dev=0.127
C5'	A	0, 0.106, 0.296, 0.486, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.296 std_dev=0.190
O3'	A	0, 0.167, 0.378, 0.589, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.378 std_dev=0.211
O5'	A	0, 0.101, 0.371, 0.640, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.371 std_dev=0.270
P	A	0, 0.090, 0.395, 0.699, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.395 std_dev=0.305
OP2	A	0, 0.134, 0.446, 0.759, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.446 std_dev=0.313
C6	B	0, 0.248, 0.597, 0.947, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.597 std_dev=0.349
OP1	A	0, 0.109, 0.466, 0.823, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.466 std_dev=0.357
C5	B	0, 0.264, 0.631, 0.997, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.631 std_dev=0.367
C4	B	0, 0.235, 0.604, 0.973, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.604 std_dev=0.369
N1	B	0, 0.164, 0.548, 0.933, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.548 std_dev=0.384
O4	B	0, 0.271, 0.675, 1.078, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.675 std_dev=0.403
C3'	B	0, 0.199, 0.605, 1.012, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.605 std_dev=0.406
N3	B	0, 0.219, 0.627, 1.035, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.627 std_dev=0.408
C1'	B	0, 0.177, 0.605, 1.033, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.605 std_dev=0.428
C4'	B	0, 0.189, 0.617, 1.046, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.617 std_dev=0.429
C2	B	0, 0.185, 0.617, 1.049, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.617 std_dev=0.432
C2'	B	0, 0.170, 0.606, 1.042, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.606 std_dev=0.436
O4'	B	0, 0.243, 0.711, 1.178, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.711 std_dev=0.467
O2	B	0, 0.250, 0.766, 1.281, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.766 std_dev=0.516
O3'	B	0, 0.124, 0.695, 1.267, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.695 std_dev=0.571
C5'	B	0, 0.089, 0.665, 1.242, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.665 std_dev=0.576
O2'	B	0, 0.137, 0.766, 1.394, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.766 std_dev=0.628
O5'	B	0, 0.205, 0.897, 1.589, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.897 std_dev=0.692
P	B	0, 0.304, 1.217, 2.129, 2.828 max_d=2.828 avg_d=1.217 std_dev=0.913
OP2	B	0, 0.630, 1.592, 2.554, 3.005 max_d=3.005 avg_d=1.592 std_dev=0.962
OP1	B	0, 0.695, 1.658, 2.621, 2.857 max_d=2.857 avg_d=1.658 std_dev=0.963

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.08	0.24	0.10
C2	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.14	0.10	0.25	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.23	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.06	0.05	0.09	0.08	0.07	0.03	0.00	0.01	0.10	0.05	0.18	0.07
C4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.18	0.15	0.26	0.19
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.06	0.06	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.04	0.15	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.18	0.17	0.28	0.20
C5'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.12	0.01	0.12	0.00	0.11	0.08	0.11	0.13	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.15	0.15	0.28	0.18
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.12	0.10	0.26	0.14
N3	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.06	0.02	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.10	0.02	0.18	0.13	0.26	0.17
N4	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.02	0.19	0.17	0.26	0.20
O2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.03	0.12	0.07	0.24	0.12
O2'	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.00	0.04	0.02	0.08	0.06	0.20	0.07
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.06	0.05	0.10	0.10	0.08	0.04	0.00	0.01	0.12	0.05	0.14	0.07
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.21	0.10
O5'	0.05	0.14	0.08	0.10	0.18	0.02	0.18	0.00	0.15	0.12	0.18	0.19	0.12	0.08	0.12	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.10	0.06	0.05	0.15	0.04	0.17	0.03	0.15	0.10	0.13	0.17	0.07	0.06	0.05	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.24	0.25	0.23	0.18	0.26	0.15	0.28	0.06	0.28	0.26	0.26	0.26	0.24	0.20	0.14	0.21	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.10	0.14	0.08	0.07	0.19	0.05	0.20	0.01	0.18	0.14	0.17	0.20	0.12	0.07	0.07	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.23	0.11	0.08	0.11	0.18	0.26	0.52	0.25	0.17	0.18	0.33	0.28	0.22	0.11	0.14	0.27	0.45	0.51	0.17
C2	0.14	0.20	0.12	0.16	0.12	0.34	0.22	0.57	0.25	0.11	0.23	0.31	0.25	0.12	0.15	0.41	0.30	0.63	0.33	0.19
C2'	0.19	0.22	0.12	0.09	0.11	0.16	0.28	0.50	0.26	0.16	0.16	0.33	0.29	0.24	0.10	0.12	0.30	0.42	0.67	0.24
C3'	0.22	0.25	0.14	0.11	0.10	0.15	0.28	0.48	0.26	0.17	0.19	0.39	0.33	0.31	0.10	0.11	0.46	0.34	0.96	0.47
C4	0.19	0.28	0.07	0.17	0.18	0.41	0.13	0.55	0.18	0.05	0.34	0.48	0.31	0.16	0.25	0.56	0.36	0.61	0.32	0.12
C4'	0.29	0.25	0.16	0.13	0.14	0.09	0.29	0.44	0.27	0.21	0.17	0.37	0.32	0.35	0.15	0.07	0.49	0.37	1.01	0.55
C5	0.07	0.35	0.08	0.11	0.19	0.39	0.14	0.53	0.17	0.06	0.35	0.56	0.40	0.15	0.22	0.54	0.41	0.52	0.46	0.20
C5'	0.28	0.27	0.16	0.14	0.11	0.08	0.26	0.40	0.24	0.18	0.18	0.41	0.33	0.39	0.12	0.06	0.71	0.53	1.33	0.86
C6	0.06	0.35	0.12	0.08	0.16	0.33	0.17	0.54	0.20	0.12	0.32	0.52	0.39	0.20	0.17	0.44	0.39	0.47	0.52	0.23
N1	0.09	0.28	0.09	0.09	0.13	0.30	0.22	0.56	0.24	0.11	0.25	0.40	0.30	0.16	0.13	0.36	0.30	0.52	0.42	0.15
N3	0.22	0.22	0.12	0.19	0.16	0.39	0.16	0.57	0.22	0.12	0.28	0.37	0.26	0.16	0.22	0.51	0.32	0.66	0.28	0.18
N4	0.25	0.26	0.07	0.20	0.20	0.43	0.09	0.53	0.16	0.08	0.34	0.46	0.29	0.21	0.29	0.58	0.37	0.64	0.30	0.11
O2	0.16	0.13	0.16	0.17	0.11	0.30	0.27	0.56	0.28	0.15	0.14	0.20	0.23	0.11	0.11	0.33	0.32	0.68	0.36	0.29
O2'	0.25	0.19	0.14	0.11	0.20	0.11	0.34	0.42	0.30	0.22	0.13	0.25	0.28	0.26	0.21	0.11	0.29	0.47	0.65	0.22
O3'	0.23	0.24	0.14	0.11	0.12	0.12	0.30	0.44	0.27	0.17	0.16	0.38	0.32	0.33	0.13	0.08	0.49	0.32	1.09	0.54
O4'	0.28	0.26	0.15	0.11	0.12	0.13	0.26	0.51	0.25	0.20	0.18	0.36	0.31	0.31	0.12	0.08	0.37	0.34	0.70	0.34
O5'	0.19	0.25	0.14	0.10	0.08	0.23	0.27	0.54	0.27	0.13	0.18	0.42	0.32	0.30	0.07	0.20	0.95	0.64	1.41	1.01
OP1	0.16	0.21	0.11	0.07	0.13	0.20	0.31	0.44	0.30	0.12	0.15	0.39	0.30	0.28	0.13	0.21	0.94	0.69	1.57	1.11
OP2	0.17	0.14	0.16	0.12	0.21	0.36	0.42	0.53	0.42	0.18	0.11	0.33	0.33	0.22	0.20	0.46	0.93	0.61	1.31	0.95
P	0.13	0.19	0.12	0.07	0.12	0.25	0.31	0.47	0.31	0.11	0.13	0.38	0.30	0.27	0.12	0.28	0.95	0.66	1.43	1.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.35	0.86	0.47	0.53
C2	0.02	0.00	0.12	0.05	0.00	0.04	0.01	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.10	0.00	0.08	0.40	1.02	0.55	0.63
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.10	0.11	0.02	0.09	0.21	0.00	0.03	0.04	0.02	0.42	0.65	0.54	0.44
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.03	0.12	0.03	0.03	0.12	0.01	0.00	0.05	0.03	0.26	0.47	0.45	0.11
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.12	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.00	0.05	0.44	1.00	0.63	0.69
C4'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.12	0.00	0.16	0.00	0.15	0.07	0.08	0.02	0.01	0.01	0.13	0.00	0.02	0.41	0.28	0.16
C5	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.16	0.00	0.45	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.44	0.97	0.60	0.67
C5'	0.09	0.23	0.10	0.03	0.40	0.00	0.45	0.00	0.41	0.26	0.31	0.14	0.08	0.07	0.42	0.02	0.01	0.33	0.34	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.15	0.00	0.41	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.05	0.44	0.97	0.54	0.64
N1	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.07	0.01	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.41	0.98	0.52	0.62
N3	0.02	0.00	0.09	0.03	0.00	0.08	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.09	0.00	0.08	0.43	1.03	0.60	0.67
O2	0.03	0.00	0.21	0.12	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.37	0.14	0.01	0.11	0.36	0.99	0.54	0.60
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.11	0.01	0.08	0.08	0.09	0.07	0.20	0.37	0.00	0.02	0.13	0.01	0.45	0.65	0.61	0.43
O3'	0.09	0.10	0.03	0.00	0.07	0.01	0.09	0.07	0.11	0.08	0.09	0.14	0.02	0.00	0.07	0.12	0.20	0.50	0.40	0.07
O4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.13	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.07	0.00	0.05	0.44	0.98	0.66	0.69
O4'	0.00	0.08	0.02	0.03	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.08	0.11	0.01	0.12	0.05	0.00	0.39	0.82	0.51	0.57
O5'	0.35	0.40	0.42	0.26	0.44	0.02	0.44	0.01	0.44	0.41	0.43	0.36	0.45	0.20	0.44	0.39	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.86	1.02	0.65	0.47	1.00	0.41	0.97	0.33	0.97	0.98	1.03	0.99	0.65	0.50	0.98	0.82	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.47	0.55	0.54	0.45	0.63	0.28	0.60	0.34	0.54	0.52	0.60	0.54	0.61	0.40	0.66	0.51	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.53	0.63	0.44	0.11	0.69	0.16	0.67	0.02	0.64	0.62	0.67	0.60	0.43	0.07	0.69	0.57	0.01	0.00	0.00	0.00