Doublet Group distance statistics: 49653

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.004, 0.007, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C5	A	0, -0.002, 0.006, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2'	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.005, 0.027, 0.050, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.027 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.014, 0.053, 0.093, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.053 std_dev=0.039
O2'	A	0, 0.027, 0.151, 0.276, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.151 std_dev=0.125
C3'	A	0, 0.015, 0.149, 0.283, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.149 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.007, 0.176, 0.346, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.176 std_dev=0.170
O3'	A	0, 0.023, 0.235, 0.447, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.235 std_dev=0.212
C6	B	0, 0.060, 0.289, 0.519, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.289 std_dev=0.229
P	A	0, 0.055, 0.320, 0.585, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.320 std_dev=0.265
C5'	A	0, 0.008, 0.331, 0.654, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.331 std_dev=0.323
C5	B	0, 0.083, 0.413, 0.744, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.413 std_dev=0.331
O5'	A	0, 0.089, 0.430, 0.771, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.430 std_dev=0.341
OP1	A	0, 0.067, 0.426, 0.785, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.426 std_dev=0.359
N1	B	0, 0.033, 0.415, 0.797, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.415 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.091, 0.475, 0.858, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.475 std_dev=0.384
O2'	B	0, 0.063, 0.464, 0.866, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.464 std_dev=0.402
C1'	B	0, 0.050, 0.490, 0.930, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.490 std_dev=0.440
OP2	A	0, -0.097, 0.359, 0.815, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.359 std_dev=0.456
OP2	B	0, 0.024, 0.554, 1.083, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.554 std_dev=0.529
C4	B	0, 0.099, 0.630, 1.161, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.630 std_dev=0.531
C3'	B	0, 0.089, 0.644, 1.200, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.644 std_dev=0.555
C2	B	0, 0.112, 0.693, 1.274, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.693 std_dev=0.581
O5'	B	0, 0.089, 0.677, 1.265, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.677 std_dev=0.588
O3'	B	0, 0.083, 0.701, 1.320, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.701 std_dev=0.618
O4'	B	0, 0.014, 0.644, 1.274, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.644 std_dev=0.630
N3	B	0, 0.115, 0.753, 1.392, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.753 std_dev=0.638
C4'	B	0, 0.041, 0.723, 1.406, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.723 std_dev=0.682
P	B	0, -0.039, 0.646, 1.331, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.646 std_dev=0.685
O4	B	0, 0.130, 0.835, 1.540, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.835 std_dev=0.705
O2	B	0, 0.173, 0.911, 1.648, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.911 std_dev=0.738
C5'	B	0, 0.043, 0.833, 1.623, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.833 std_dev=0.790
OP1	B	0, -0.067, 0.792, 1.651, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.792 std_dev=0.859

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.17	0.36	0.15
C2	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.03	0.16	0.09	0.42	0.21
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.12	0.25	0.28	0.09
C3'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.26	0.06
C4	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.03	0.27	0.05	0.38	0.23
C4'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.16	0.29	0.09
C5	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02	0.32	0.04	0.34	0.22
C5'	0.03	0.07	0.04	0.01	0.15	0.00	0.18	0.00	0.16	0.10	0.10	0.17	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.23	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.29	0.09	0.34	0.20
N1	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.21	0.10	0.39	0.20
N3	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.20	0.08	0.42	0.23
N4	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.04	0.03	0.29	0.07	0.38	0.25
O2	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.08	0.12	0.45	0.21
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.01	0.08	0.04	0.08	0.04	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.26	0.29	0.07
O3'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.02	0.00	0.06	0.07	0.20	0.33	0.11
O4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.06	0.00	0.09	0.17	0.36	0.16
O5'	0.11	0.16	0.12	0.01	0.27	0.01	0.32	0.01	0.29	0.21	0.20	0.29	0.08	0.10	0.07	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.09	0.25	0.24	0.05	0.16	0.04	0.23	0.09	0.10	0.08	0.07	0.12	0.26	0.20	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.42	0.28	0.26	0.38	0.29	0.34	0.10	0.34	0.39	0.42	0.38	0.45	0.29	0.33	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.21	0.09	0.06	0.23	0.09	0.22	0.01	0.20	0.20	0.23	0.25	0.21	0.07	0.11	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.03	0.17	0.16	0.21	0.11	0.26	0.10	0.16	0.04	0.10	0.03	0.28	0.17	0.26	0.14	0.12	0.20	0.21	0.18
C2	0.08	0.06	0.16	0.13	0.19	0.12	0.24	0.18	0.12	0.06	0.07	0.11	0.24	0.15	0.26	0.06	0.16	0.10	0.07	0.11
C2'	0.14	0.08	0.22	0.22	0.21	0.22	0.28	0.23	0.19	0.10	0.11	0.10	0.31	0.23	0.26	0.25	0.22	0.32	0.31	0.29
C3'	0.07	0.05	0.15	0.17	0.22	0.18	0.26	0.22	0.17	0.05	0.12	0.01	0.27	0.17	0.28	0.20	0.22	0.34	0.30	0.29
C4	0.11	0.11	0.22	0.23	0.32	0.25	0.30	0.38	0.14	0.04	0.20	0.17	0.24	0.22	0.44	0.15	0.37	0.31	0.22	0.30
C4'	0.01	0.12	0.10	0.12	0.25	0.12	0.26	0.17	0.16	0.09	0.18	0.09	0.25	0.13	0.31	0.13	0.18	0.27	0.23	0.22
C5	0.10	0.19	0.23	0.20	0.34	0.15	0.35	0.26	0.22	0.11	0.26	0.21	0.28	0.19	0.41	0.06	0.30	0.27	0.22	0.26
C5'	0.11	0.20	0.09	0.06	0.30	0.05	0.29	0.13	0.22	0.18	0.25	0.19	0.27	0.11	0.34	0.08	0.14	0.21	0.13	0.14
C6	0.10	0.13	0.21	0.17	0.27	0.08	0.33	0.09	0.22	0.10	0.18	0.16	0.30	0.18	0.32	0.13	0.13	0.10	0.07	0.10
N1	0.06	0.03	0.19	0.14	0.21	0.06	0.28	0.07	0.16	0.03	0.09	0.07	0.28	0.16	0.27	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08
N3	0.12	0.07	0.18	0.18	0.20	0.22	0.23	0.32	0.10	0.07	0.04	0.14	0.22	0.19	0.33	0.16	0.29	0.22	0.14	0.21
N4	0.17	0.16	0.25	0.31	0.39	0.39	0.28	0.55	0.11	0.06	0.29	0.23	0.21	0.29	0.55	0.28	0.50	0.44	0.30	0.41
O2	0.09	0.14	0.14	0.11	0.20	0.11	0.20	0.16	0.10	0.10	0.15	0.16	0.22	0.14	0.26	0.08	0.13	0.08	0.09	0.08
O2'	0.20	0.15	0.27	0.27	0.24	0.26	0.30	0.27	0.21	0.15	0.16	0.19	0.35	0.28	0.29	0.29	0.26	0.33	0.33	0.32
O3'	0.04	0.06	0.13	0.15	0.23	0.15	0.25	0.20	0.16	0.05	0.13	0.03	0.25	0.15	0.29	0.17	0.20	0.34	0.30	0.29
O4'	0.05	0.08	0.16	0.18	0.24	0.16	0.25	0.18	0.15	0.06	0.16	0.05	0.26	0.18	0.30	0.16	0.20	0.28	0.26	0.24
O5'	0.33	0.33	0.33	0.30	0.31	0.23	0.28	0.18	0.30	0.34	0.32	0.34	0.50	0.36	0.34	0.22	0.15	0.24	0.34	0.27
OP1	0.11	0.12	0.13	0.25	0.16	0.29	0.15	0.46	0.14	0.12	0.14	0.10	0.33	0.24	0.20	0.20	0.49	0.54	0.36	0.46
OP2	0.17	0.23	0.20	0.29	0.35	0.24	0.37	0.28	0.32	0.24	0.29	0.19	0.26	0.29	0.40	0.17	0.27	0.37	0.28	0.29
P	0.18	0.23	0.17	0.20	0.27	0.17	0.26	0.23	0.25	0.23	0.25	0.21	0.35	0.25	0.30	0.12	0.23	0.33	0.23	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.23	0.19	0.14
C2	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.01	0.13	0.12	0.24	0.17	0.16
C2'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.04	0.06	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.02	0.06	0.31	0.34	0.26
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.03	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.33	0.29	0.23
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.02
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.20	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.19	0.12	0.09
C5	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.01	0.07	0.17	0.06	0.11	0.12
C5'	0.02	0.17	0.04	0.02	0.04	0.00	0.12	0.00	0.14	0.05	0.14	0.29	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.09	0.01	0.10	0.19	0.06	0.05	0.09
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.01	0.02	0.18	0.13	0.09
N3	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.01	0.10	0.08	0.17	0.09	0.10
O2	0.03	0.00	0.03	0.08	0.01	0.20	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.06	0.02	0.24	0.23	0.35	0.25	0.26
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.04	0.15	0.03	0.08	0.15	0.00	0.01	0.05	0.01	0.09	0.40	0.49	0.34
O3'	0.06	0.07	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.04	0.09	0.07	0.07	0.06	0.01	0.00	0.07	0.04	0.04	0.33	0.30	0.22
O4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.07	0.00	0.03	0.03	0.03	0.08	0.05
O4'	0.00	0.13	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.24	0.01	0.04	0.03	0.00	0.06	0.13	0.07	0.05
O5'	0.01	0.12	0.06	0.03	0.04	0.02	0.17	0.01	0.19	0.02	0.08	0.23	0.09	0.04	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.23	0.24	0.31	0.33	0.06	0.19	0.06	0.04	0.06	0.18	0.17	0.35	0.40	0.33	0.03	0.13	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.17	0.34	0.29	0.03	0.12	0.11	0.01	0.05	0.13	0.09	0.25	0.49	0.30	0.08	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.16	0.26	0.23	0.02	0.09	0.12	0.02	0.09	0.09	0.10	0.26	0.34	0.22	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00