Doublet Group distance statistics: 49668

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 7, 12, 16, 12, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.011 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.005, 0.028, 0.052, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.028 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.004, 0.033, 0.062, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.033 std_dev=0.029
P	B	0, 0.286, 0.415, 0.544, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.415 std_dev=0.129
OP1	B	0, 0.256, 0.400, 0.543, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.400 std_dev=0.144
O4'	A	0, -0.039, 0.110, 0.259, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.110 std_dev=0.149
C2'	A	0, -0.042, 0.115, 0.273, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.115 std_dev=0.157
OP2	B	0, 0.317, 0.480, 0.643, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.480 std_dev=0.163
C4'	A	0, -0.032, 0.175, 0.381, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.175 std_dev=0.207
C3'	B	0, 0.216, 0.426, 0.637, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.426 std_dev=0.211
C3'	A	0, -0.073, 0.142, 0.358, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.142 std_dev=0.215
O5'	B	0, 0.162, 0.386, 0.611, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.386 std_dev=0.224
O3'	B	0, 0.214, 0.444, 0.674, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.444 std_dev=0.230
O2'	A	0, -0.045, 0.220, 0.485, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.220 std_dev=0.265
C5'	A	0, 0.034, 0.319, 0.604, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.319 std_dev=0.285
P	A	0, 0.014, 0.300, 0.586, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.300 std_dev=0.286
C4'	B	0, 0.209, 0.504, 0.799, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.504 std_dev=0.295
OP2	A	0, 0.093, 0.388, 0.684, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.388 std_dev=0.296
C5'	B	0, 0.162, 0.471, 0.780, 2.385 max_d=2.385 avg_d=0.471 std_dev=0.309
O3'	A	0, -0.118, 0.202, 0.523, 2.445 max_d=2.445 avg_d=0.202 std_dev=0.320
C2'	B	0, 0.236, 0.557, 0.877, 2.076 max_d=2.076 avg_d=0.557 std_dev=0.321
O5'	A	0, -0.019, 0.343, 0.704, 2.323 max_d=2.323 avg_d=0.343 std_dev=0.362
O4'	B	0, 0.217, 0.594, 0.971, 2.864 max_d=2.864 avg_d=0.594 std_dev=0.377
O2'	B	0, 0.280, 0.678, 1.076, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.678 std_dev=0.398
C1'	B	0, 0.181, 0.585, 0.989, 2.998 max_d=2.998 avg_d=0.585 std_dev=0.404
OP1	A	0, 0.071, 0.481, 0.891, 2.773 max_d=2.773 avg_d=0.481 std_dev=0.410
N9	B	0, 0.165, 0.620, 1.076, 3.296 max_d=3.296 avg_d=0.620 std_dev=0.455
C4	B	0, 0.118, 0.628, 1.138, 3.873 max_d=3.873 avg_d=0.628 std_dev=0.510
C5	B	0, 0.137, 0.667, 1.197, 4.064 max_d=4.064 avg_d=0.667 std_dev=0.530
C6	B	0, 0.106, 0.715, 1.324, 4.749 max_d=4.749 avg_d=0.715 std_dev=0.609
N6	B	0, 0.131, 0.786, 1.442, 5.121 max_d=5.121 avg_d=0.786 std_dev=0.656
C8	B	0, -0.017, 0.766, 1.550, 3.926 max_d=3.926 avg_d=0.766 std_dev=0.784
N7	B	0, -0.008, 0.795, 1.598, 3.928 max_d=3.928 avg_d=0.795 std_dev=0.803
N3	B	0, -0.032, 0.794, 1.621, 4.245 max_d=4.245 avg_d=0.794 std_dev=0.826
N1	B	0, -0.010, 0.862, 1.734, 5.115 max_d=5.115 avg_d=0.862 std_dev=0.872
C2	B	0, -0.140, 0.903, 1.947, 4.830 max_d=4.830 avg_d=0.903 std_dev=1.044

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.00	0.08	0.14	0.24	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.07	0.05	0.15	0.14	0.20	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.11	0.06	0.02	0.06	0.03	0.13	0.00	0.02	0.01	0.10	0.30	0.38	0.24
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.09	0.06	0.09	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.07	0.25	0.21	0.15
C4	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.04	0.02	0.22	0.19	0.16	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.03	0.06	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.14	0.14	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.05	0.06	0.23	0.20	0.16	0.19
C5'	0.07	0.12	0.11	0.02	0.17	0.01	0.18	0.00	0.17	0.13	0.15	0.17	0.09	0.07	0.08	0.01	0.01	0.13	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.04	0.07	0.21	0.16	0.19	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.15	0.14	0.21	0.12
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.04	0.18	0.16	0.18	0.15
N4	0.02	0.01	0.03	0.11	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.03	0.24	0.21	0.15	0.20
O2	0.02	0.00	0.13	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.10	0.08	0.12	0.15	0.21	0.12
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.10	0.09	0.12	0.07	0.12	0.06	0.08	0.11	0.15	0.00	0.05	0.06	0.10	0.35	0.43	0.27
O3'	0.11	0.07	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.08	0.04	0.05	0.05	0.05	0.10	0.05	0.00	0.09	0.08	0.24	0.15	0.11
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.08	0.06	0.09	0.00	0.12	0.17	0.18	0.13
O5'	0.08	0.15	0.10	0.07	0.22	0.01	0.23	0.01	0.21	0.15	0.18	0.24	0.12	0.10	0.08	0.12	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.14	0.14	0.30	0.25	0.19	0.14	0.20	0.13	0.16	0.14	0.16	0.21	0.15	0.35	0.24	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.20	0.38	0.21	0.16	0.14	0.16	0.12	0.19	0.21	0.18	0.15	0.21	0.43	0.15	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.13	0.24	0.15	0.18	0.05	0.19	0.01	0.15	0.12	0.15	0.20	0.12	0.27	0.11	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.66	0.29	0.15	0.43	0.15	0.54	0.11	0.55	0.61	0.57	0.58	0.70	0.72	0.40	0.31	0.09	0.27	0.11	0.09	0.09	0.08
C2	0.26	0.69	0.23	0.14	0.32	0.14	0.45	0.11	0.40	0.67	0.47	0.58	0.57	0.77	0.35	0.25	0.10	0.23	0.11	0.10	0.10	0.09
C2'	0.29	0.63	0.23	0.10	0.40	0.10	0.53	0.11	0.55	0.63	0.55	0.54	0.71	0.73	0.39	0.24	0.09	0.23	0.11	0.09	0.09	0.08
C3'	0.34	0.58	0.31	0.16	0.43	0.16	0.54	0.11	0.55	0.61	0.52	0.52	0.69	0.70	0.42	0.33	0.07	0.28	0.11	0.10	0.10	0.11
C4	0.20	0.58	0.20	0.11	0.24	0.09	0.40	0.12	0.32	0.66	0.35	0.50	0.48	0.73	0.31	0.20	0.09	0.16	0.12	0.09	0.08	0.07
C4'	0.30	0.51	0.25	0.12	0.39	0.13	0.50	0.12	0.53	0.53	0.49	0.45	0.68	0.63	0.37	0.29	0.09	0.24	0.12	0.09	0.10	0.08
C5	0.25	0.51	0.23	0.10	0.32	0.09	0.45	0.13	0.41	0.60	0.39	0.46	0.54	0.67	0.35	0.25	0.09	0.17	0.13	0.09	0.09	0.08
C5'	0.25	0.45	0.20	0.14	0.38	0.15	0.50	0.21	0.54	0.49	0.49	0.39	0.68	0.59	0.35	0.23	0.18	0.20	0.23	0.20	0.21	0.19
C6	0.28	0.56	0.26	0.12	0.38	0.11	0.50	0.12	0.49	0.59	0.47	0.50	0.61	0.68	0.37	0.28	0.09	0.21	0.12	0.09	0.09	0.07
N1	0.29	0.63	0.26	0.13	0.37	0.13	0.50	0.11	0.48	0.62	0.49	0.55	0.63	0.72	0.37	0.28	0.09	0.24	0.11	0.09	0.09	0.08
N3	0.22	0.68	0.20	0.13	0.25	0.12	0.40	0.12	0.31	0.70	0.42	0.57	0.49	0.78	0.32	0.21	0.10	0.20	0.12	0.09	0.10	0.09
N4	0.15	0.56	0.17	0.10	0.16	0.08	0.36	0.13	0.25	0.68	0.31	0.49	0.42	0.72	0.29	0.16	0.11	0.11	0.15	0.11	0.09	0.08
O2	0.26	0.75	0.23	0.15	0.32	0.15	0.44	0.12	0.39	0.67	0.52	0.61	0.57	0.77	0.34	0.24	0.11	0.25	0.12	0.13	0.13	0.12
O2'	0.26	0.76	0.20	0.09	0.41	0.09	0.53	0.17	0.58	0.63	0.66	0.62	0.74	0.74	0.37	0.21	0.16	0.19	0.17	0.15	0.14	0.14
O3'	0.26	0.57	0.25	0.12	0.33	0.10	0.42	0.09	0.42	0.54	0.46	0.49	0.57	0.62	0.32	0.28	0.06	0.21	0.10	0.09	0.09	0.07
O4'	0.32	0.55	0.29	0.17	0.41	0.16	0.51	0.12	0.53	0.54	0.50	0.50	0.67	0.64	0.38	0.34	0.13	0.27	0.12	0.10	0.11	0.08
O5'	0.47	0.62	0.43	0.27	0.57	0.26	0.65	0.17	0.68	0.63	0.64	0.58	0.78	0.72	0.54	0.47	0.17	0.39	0.16	0.19	0.19	0.21
OP1	0.60	0.85	0.57	0.36	0.72	0.34	0.76	0.22	0.82	0.70	0.85	0.79	0.88	0.77	0.65	0.65	0.27	0.48	0.17	0.18	0.18	0.20
OP2	0.32	0.46	0.33	0.20	0.37	0.18	0.43	0.19	0.45	0.45	0.43	0.43	0.55	0.52	0.35	0.41	0.18	0.23	0.19	0.16	0.14	0.13
P	0.51	0.68	0.49	0.30	0.60	0.28	0.66	0.16	0.69	0.63	0.68	0.64	0.77	0.70	0.56	0.55	0.20	0.41	0.13	0.17	0.17	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.14	0.31	0.14
C2	0.02	0.00	0.14	0.22	0.01	0.33	0.01	0.54	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.19	0.31	0.68	0.86	0.84	0.81
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.06	0.11	0.14	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.19	0.06
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.22	0.15	0.22	0.12	0.20	0.09	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.10	0.06
C4	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.10	0.16	0.19	0.18	0.39	0.22
C4'	0.01	0.33	0.01	0.00	0.12	0.00	0.05	0.00	0.09	0.25	0.22	0.33	0.06	0.20	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.17	0.30	0.39	0.25
C5'	0.02	0.54	0.01	0.01	0.17	0.00	0.10	0.00	0.14	0.44	0.36	0.51	0.11	0.37	0.11	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.12	0.16	0.20	0.40	0.22
C8	0.01	0.01	0.06	0.22	0.00	0.25	0.00	0.44	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.17	0.19	0.60	0.82	0.79	0.75
N1	0.02	0.01	0.11	0.15	0.01	0.22	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.16	0.23	0.45	0.56	0.65	0.54
N3	0.02	0.00	0.14	0.22	0.00	0.33	0.01	0.51	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.18	0.32	0.64	0.70	0.73	0.69
N6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.17	0.07	0.17	0.30	0.38	0.25
N7	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.20	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.11	0.18	0.11	0.52	0.81	0.71	0.69
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.18	0.29	0.41	0.27
O2'	0.02	0.24	0.00	0.02	0.10	0.05	0.04	0.05	0.08	0.15	0.17	0.24	0.06	0.11	0.03	0.00	0.07	0.06	0.04	0.07	0.21	0.07
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.13	0.03	0.15	0.17	0.16	0.18	0.17	0.18	0.07	0.07	0.00	0.02	0.04	0.10	0.10	0.11
O4'	0.00	0.31	0.01	0.01	0.16	0.00	0.05	0.01	0.12	0.19	0.23	0.32	0.07	0.11	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.11	0.30	0.13
O5'	0.06	0.68	0.03	0.03	0.19	0.01	0.17	0.01	0.16	0.60	0.45	0.64	0.17	0.52	0.18	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.14	0.86	0.08	0.06	0.18	0.04	0.30	0.01	0.20	0.82	0.56	0.70	0.30	0.81	0.29	0.07	0.10	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.84	0.19	0.10	0.39	0.14	0.39	0.05	0.40	0.79	0.65	0.73	0.38	0.71	0.41	0.21	0.10	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.81	0.06	0.06	0.22	0.04	0.25	0.02	0.22	0.75	0.54	0.69	0.25	0.69	0.27	0.07	0.11	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00