Doublet Group distance statistics: 49671

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	max_d=0.035 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C2	A	max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.016
O2	A	max_d=0.100 avg_d=0.049 std_dev=0.031
N4	A	max_d=0.123 avg_d=0.055 std_dev=0.040
C2'	A	max_d=1.229 avg_d=0.260 std_dev=0.309
P	B	max_d=1.259 avg_d=0.544 std_dev=0.310
O4'	A	max_d=1.244 avg_d=0.264 std_dev=0.316
OP2	B	max_d=1.308 avg_d=0.575 std_dev=0.328
O2'	A	max_d=1.460 avg_d=0.316 std_dev=0.367
C4'	A	max_d=1.716 avg_d=0.397 std_dev=0.430
OP1	B	max_d=1.619 avg_d=0.605 std_dev=0.486
C3'	A	max_d=1.962 avg_d=0.441 std_dev=0.488
O3'	A	max_d=2.776 avg_d=0.640 std_dev=0.691
O5'	A	max_d=2.903 avg_d=0.634 std_dev=0.732
O5'	B	max_d=3.071 avg_d=0.848 std_dev=0.748
C5'	A	max_d=3.009 avg_d=0.661 std_dev=0.752
OP2	A	max_d=3.089 avg_d=0.675 std_dev=0.778
P	A	max_d=3.521 avg_d=0.699 std_dev=0.879
OP1	A	max_d=4.443 avg_d=0.876 std_dev=1.108
C5'	B	max_d=4.636 avg_d=1.011 std_dev=1.135
N7	B	max_d=5.675 avg_d=1.271 std_dev=1.433
C8	B	max_d=5.901 avg_d=1.225 std_dev=1.485
C4'	B	max_d=7.132 avg_d=1.237 std_dev=1.808
C5	B	max_d=7.541 avg_d=1.478 std_dev=1.915
N6	B	max_d=7.608 avg_d=1.610 std_dev=1.956
O4'	B	max_d=7.859 avg_d=1.356 std_dev=1.992
N9	B	max_d=8.035 avg_d=1.424 std_dev=2.041
C3'	B	max_d=8.094 avg_d=1.279 std_dev=2.085
C6	B	max_d=8.343 avg_d=1.631 std_dev=2.134
C4	B	max_d=9.018 avg_d=1.594 std_dev=2.298
C1'	B	max_d=9.196 avg_d=1.500 std_dev=2.354
O3'	B	max_d=9.442 avg_d=1.408 std_dev=2.449
C2'	B	max_d=9.834 avg_d=1.514 std_dev=2.541
N1	B	max_d=10.268 avg_d=1.866 std_dev=2.640
N3	B	max_d=11.143 avg_d=1.863 std_dev=2.859
C2	B	max_d=11.507 avg_d=1.973 std_dev=2.958
O2'	B	max_d=11.972 avg_d=1.772 std_dev=3.110

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.22	0.06
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.04	0.06	0.07	0.28	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.08	0.05	0.19	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.16	0.04
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.19	0.05	0.09	0.11	0.20	0.01	0.00	0.01	0.18	0.15	0.17	0.10
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.03	0.09	0.18	0.33	0.17
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.12	0.04	0.04	0.08	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.19	0.02	0.15	0.21	0.34	0.20
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.12	0.01	0.18	0.00	0.17	0.06	0.08	0.14	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.19	0.01	0.12	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.20	0.03	0.15	0.16	0.30	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.07	0.26	0.09
N3	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.04	0.07	0.12	0.31	0.13
N4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.10	0.22	0.34	0.20
O2	0.04	0.01	0.19	0.20	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.24	0.06	0.09	0.06	0.27	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.01	0.06	0.03	0.15	0.00	0.03	0.04	0.06	0.12	0.16	0.03
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.11	0.02	0.19	0.02	0.20	0.05	0.11	0.13	0.24	0.03	0.00	0.01	0.21	0.22	0.21	0.15
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04	0.01	0.00	0.10	0.04	0.23	0.11
O5'	0.03	0.06	0.10	0.18	0.09	0.01	0.15	0.01	0.15	0.06	0.07	0.10	0.09	0.06	0.21	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.03	0.07	0.10	0.15	0.18	0.08	0.21	0.08	0.16	0.07	0.12	0.22	0.06	0.12	0.22	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.28	0.16	0.17	0.33	0.16	0.34	0.15	0.30	0.26	0.31	0.34	0.27	0.16	0.21	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.04	0.10	0.17	0.02	0.20	0.01	0.16	0.09	0.13	0.20	0.10	0.03	0.15	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.70	0.49	1.05	0.98	0.47	0.68	0.27	0.46	0.24	0.33	0.30	0.60	0.43	0.24	0.52	1.17	1.17	0.53	0.37	0.19	0.21	0.11
C2	0.40	0.28	0.68	0.66	0.28	0.41	0.31	0.27	0.40	0.26	0.32	0.32	0.61	0.36	0.30	0.73	0.79	0.28	0.26	0.17	0.20	0.15
C2'	0.38	0.34	0.74	0.74	0.27	0.45	0.42	0.29	0.60	0.27	0.49	0.31	0.91	0.48	0.25	0.86	0.99	0.25	0.25	0.20	0.26	0.18
C3'	0.55	0.29	1.01	1.02	0.26	0.67	0.31	0.47	0.48	0.22	0.35	0.37	0.83	0.39	0.32	1.17	1.34	0.40	0.36	0.22	0.22	0.11
C4	0.68	0.45	0.97	0.97	0.48	0.68	0.38	0.49	0.35	0.44	0.34	0.54	0.45	0.40	0.55	1.01	1.10	0.53	0.48	0.20	0.20	0.14
C4'	0.93	0.69	1.38	1.30	0.63	0.93	0.32	0.65	0.24	0.40	0.40	0.82	0.39	0.24	0.68	1.56	1.59	0.72	0.50	0.21	0.19	0.08
C5	0.98	0.71	1.35	1.32	0.72	0.97	0.47	0.70	0.38	0.56	0.49	0.85	0.34	0.40	0.78	1.44	1.52	0.80	0.61	0.22	0.22	0.15
C5'	1.20	0.97	1.71	1.61	0.88	1.19	0.50	0.86	0.39	0.57	0.63	1.12	0.30	0.34	0.92	1.94	1.96	0.96	0.65	0.26	0.19	0.13
C6	0.96	0.72	1.34	1.28	0.70	0.93	0.43	0.65	0.35	0.51	0.48	0.85	0.33	0.35	0.75	1.45	1.49	0.76	0.54	0.21	0.22	0.12
N1	0.69	0.47	1.04	0.98	0.47	0.68	0.28	0.47	0.26	0.35	0.30	0.58	0.43	0.28	0.52	1.13	1.16	0.53	0.40	0.19	0.21	0.12
N3	0.38	0.30	0.63	0.62	0.30	0.38	0.37	0.25	0.43	0.32	0.35	0.31	0.61	0.43	0.32	0.66	0.73	0.26	0.28	0.18	0.19	0.15
N4	0.66	0.45	0.91	0.93	0.50	0.68	0.44	0.51	0.41	0.51	0.39	0.53	0.48	0.48	0.57	0.92	1.02	0.54	0.56	0.22	0.18	0.19
O2	0.23	0.40	0.42	0.39	0.32	0.20	0.46	0.14	0.60	0.30	0.53	0.32	0.83	0.48	0.24	0.47	0.51	0.15	0.15	0.16	0.20	0.18
O2'	0.31	0.42	0.60	0.58	0.32	0.33	0.48	0.20	0.66	0.30	0.58	0.34	0.95	0.50	0.25	0.72	0.79	0.20	0.21	0.21	0.29	0.23
O3'	0.40	0.36	0.86	0.91	0.25	0.56	0.48	0.40	0.70	0.28	0.58	0.29	1.07	0.54	0.22	1.04	1.26	0.27	0.30	0.23	0.25	0.14
O4'	1.04	0.89	1.44	1.32	0.81	0.97	0.51	0.67	0.41	0.55	0.61	1.00	0.27	0.35	0.83	1.60	1.54	0.82	0.53	0.19	0.18	0.09
O5'	1.28	1.07	1.81	1.73	0.96	1.29	0.61	0.93	0.55	0.64	0.77	1.21	0.47	0.43	0.99	2.04	2.10	1.03	0.72	0.29	0.18	0.16
OP1	1.64	1.45	2.22	2.08	1.28	1.61	0.84	1.18	0.74	0.84	1.06	1.60	0.45	0.56	1.29	2.54	2.52	1.35	0.88	0.36	0.26	0.27
OP2	1.57	1.31	2.14	2.07	1.19	1.60	0.77	1.19	0.67	0.80	0.95	1.47	0.42	0.52	1.23	2.42	2.52	1.32	0.90	0.39	0.36	0.32
P	1.63	1.42	2.18	2.06	1.27	1.59	0.85	1.17	0.75	0.86	1.05	1.57	0.46	0.58	1.29	2.47	2.47	1.34	0.89	0.35	0.25	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.06	0.14	0.07
C2	0.05	0.00	0.14	0.13	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.16	0.04	0.09	0.11	0.25	0.17
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.05	0.12	0.14	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.08	0.11	0.09
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.11	0.12	0.10	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.14	0.10	0.10	0.11
C4	0.03	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.01	0.09	0.12	0.24	0.17
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.09	0.04	0.06	0.07	0.09	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.14	0.21	0.32	0.24
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.11	0.14	0.07	0.04	0.14	0.16	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.11	0.06	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01	0.15	0.24	0.34	0.27
C8	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.14	0.20	0.29	0.21
N1	0.04	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.14	0.03	0.12	0.18	0.31	0.23
N3	0.05	0.00	0.14	0.12	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.15	0.04	0.07	0.07	0.21	0.13
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.01	0.19	0.31	0.39	0.32
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.03	0.17	0.27	0.36	0.28
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.08	0.10	0.22	0.14
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.10	0.04	0.07	0.04	0.11	0.03	0.17	0.19	0.10	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.06
O3'	0.02	0.16	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.02	0.11	0.14	0.14	0.15	0.13	0.14	0.05	0.04	0.00	0.02	0.17	0.14	0.17	0.14
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.00	0.11	0.11	0.15	0.09
O5'	0.04	0.09	0.09	0.14	0.09	0.01	0.14	0.01	0.15	0.14	0.12	0.07	0.19	0.17	0.08	0.06	0.17	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.11	0.08	0.10	0.12	0.09	0.21	0.11	0.24	0.20	0.18	0.07	0.31	0.27	0.10	0.07	0.14	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.25	0.11	0.10	0.24	0.04	0.32	0.06	0.34	0.29	0.31	0.21	0.39	0.36	0.22	0.09	0.17	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.09	0.11	0.17	0.02	0.24	0.01	0.27	0.21	0.23	0.13	0.32	0.28	0.14	0.06	0.14	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00