Doublet Group distance statistics: 49686

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 7, 13, 16, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, -0.002, 0.007, 0.015, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.013 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.003, 0.034, 0.065, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.034 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.015, 0.059, 0.103, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.059 std_dev=0.044
C2'	A	0, 0.029, 0.080, 0.131, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.080 std_dev=0.051
C4'	A	0, 0.045, 0.110, 0.175, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.110 std_dev=0.065
C3'	A	0, 0.069, 0.148, 0.227, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.148 std_dev=0.079
O2'	A	0, 0.085, 0.173, 0.261, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.173 std_dev=0.088
C5'	A	0, 0.078, 0.185, 0.291, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.185 std_dev=0.107
O2'	B	0, 0.168, 0.280, 0.391, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.280 std_dev=0.111
O3'	A	0, 0.126, 0.246, 0.366, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.246 std_dev=0.120
O5'	A	0, 0.130, 0.271, 0.413, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.271 std_dev=0.142
O4'	B	0, 0.177, 0.319, 0.461, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.319 std_dev=0.142
C4'	B	0, 0.202, 0.345, 0.488, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.345 std_dev=0.143
O3'	B	0, 0.200, 0.347, 0.494, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.347 std_dev=0.147
C2'	B	0, 0.166, 0.314, 0.462, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.314 std_dev=0.148
C1'	B	0, 0.176, 0.324, 0.473, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.324 std_dev=0.148
C3'	B	0, 0.209, 0.366, 0.522, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.366 std_dev=0.157
C5'	B	0, 0.200, 0.389, 0.578, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.389 std_dev=0.189
N1	B	0, 0.186, 0.377, 0.567, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.377 std_dev=0.191
P	A	0, 0.174, 0.367, 0.559, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.367 std_dev=0.192
C6	B	0, 0.224, 0.425, 0.626, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.425 std_dev=0.201
OP1	A	0, 0.216, 0.421, 0.627, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.421 std_dev=0.205
OP2	A	0, 0.243, 0.455, 0.667, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.455 std_dev=0.212
C2	B	0, 0.211, 0.439, 0.668, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.439 std_dev=0.229
O5'	B	0, 0.189, 0.418, 0.646, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.418 std_dev=0.229
O2	B	0, 0.274, 0.507, 0.740, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.507 std_dev=0.233
C5	B	0, 0.214, 0.457, 0.701, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.457 std_dev=0.244
N3	B	0, 0.209, 0.479, 0.748, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.479 std_dev=0.269
P	B	0, 0.189, 0.464, 0.740, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.464 std_dev=0.276
C4	B	0, 0.175, 0.457, 0.739, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.457 std_dev=0.282
OP2	B	0, 0.188, 0.476, 0.765, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.476 std_dev=0.288
OP1	B	0, 0.207, 0.509, 0.811, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.509 std_dev=0.302
N4	B	0, 0.176, 0.502, 0.827, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.502 std_dev=0.326

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.04	0.03
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.07	0.08	0.09	0.08
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.08	0.09	0.10	0.09
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.07	0.07	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.07	0.08	0.06
N4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.05	0.02	0.07	0.09	0.10	0.09
O2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.02	0.04	0.06	0.06	0.05
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.05	0.08	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.04	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03
O5'	0.03	0.05	0.03	0.03	0.07	0.01	0.08	0.01	0.07	0.05	0.05	0.07	0.04	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.09	0.03	0.07	0.05	0.07	0.09	0.06	0.06	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.06	0.04	0.04	0.09	0.02	0.10	0.01	0.07	0.06	0.08	0.10	0.06	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.05	0.03	0.03	0.08	0.01	0.09	0.01	0.07	0.05	0.06	0.09	0.05	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.08	0.07	0.06	0.08	0.06	0.10	0.07	0.10	0.06	0.08	0.09	0.11	0.12	0.06	0.06	0.08	0.09	0.10	0.08
C2	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.06	0.11	0.08	0.11	0.07	0.08	0.09	0.11	0.10	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.08
C2'	0.07	0.08	0.08	0.06	0.07	0.06	0.09	0.07	0.08	0.06	0.08	0.08	0.11	0.13	0.07	0.05	0.08	0.11	0.11	0.09
C3'	0.06	0.07	0.07	0.05	0.07	0.05	0.08	0.06	0.08	0.05	0.07	0.08	0.10	0.12	0.06	0.05	0.08	0.12	0.11	0.09
C4	0.07	0.08	0.06	0.07	0.09	0.08	0.11	0.10	0.11	0.08	0.08	0.09	0.10	0.11	0.07	0.09	0.09	0.08	0.10	0.09
C4'	0.06	0.07	0.06	0.05	0.07	0.05	0.10	0.06	0.09	0.06	0.08	0.09	0.10	0.11	0.06	0.05	0.07	0.11	0.10	0.08
C5	0.06	0.08	0.07	0.07	0.07	0.08	0.10	0.11	0.10	0.06	0.08	0.08	0.11	0.12	0.07	0.07	0.10	0.08	0.12	0.10
C5'	0.05	0.07	0.06	0.05	0.07	0.06	0.10	0.07	0.09	0.05	0.08	0.09	0.10	0.10	0.06	0.05	0.07	0.11	0.10	0.08
C6	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.10	0.10	0.06	0.08	0.08	0.12	0.12	0.07	0.06	0.09	0.08	0.11	0.08
N1	0.06	0.08	0.07	0.06	0.07	0.06	0.10	0.08	0.10	0.06	0.08	0.08	0.11	0.12	0.06	0.06	0.08	0.08	0.09	0.07
N3	0.07	0.09	0.06	0.07	0.09	0.07	0.11	0.09	0.11	0.08	0.09	0.10	0.10	0.10	0.08	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08
N4	0.09	0.09	0.07	0.08	0.11	0.10	0.12	0.11	0.12	0.10	0.10	0.11	0.10	0.10	0.08	0.12	0.10	0.09	0.11	0.10
O2	0.06	0.09	0.06	0.06	0.09	0.07	0.11	0.08	0.11	0.08	0.09	0.10	0.11	0.10	0.08	0.07	0.08	0.08	0.10	0.08
O2'	0.06	0.08	0.08	0.06	0.07	0.06	0.09	0.07	0.09	0.06	0.08	0.08	0.11	0.14	0.07	0.05	0.08	0.11	0.12	0.09
O3'	0.06	0.07	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.05	0.07	0.08	0.10	0.12	0.07	0.06	0.08	0.13	0.12	0.10
O4'	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08	0.06	0.11	0.07	0.11	0.07	0.09	0.10	0.12	0.12	0.07	0.06	0.08	0.10	0.10	0.08
O5'	0.05	0.07	0.05	0.06	0.07	0.06	0.09	0.08	0.08	0.05	0.07	0.09	0.09	0.09	0.07	0.05	0.07	0.11	0.10	0.08
OP1	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.08	0.09	0.08	0.05	0.06	0.08	0.07	0.09	0.09	0.07	0.08	0.14	0.11	0.10
OP2	0.07	0.07	0.06	0.07	0.07	0.07	0.07	0.09	0.07	0.06	0.08	0.09	0.09	0.08	0.08	0.07	0.07	0.11	0.10	0.08
P	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.08	0.09	0.08	0.04	0.06	0.08	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07	0.11	0.10	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.09	0.04	0.06
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.05	0.09	0.07	0.06
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.09	0.07	0.07
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.05	0.08	0.06	0.06
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.07	0.03	0.04
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.10	0.06	0.06
N4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.06	0.10	0.08	0.08
O2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.05	0.09	0.05	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.00	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.05	0.05	0.08	0.03	0.00	0.01	0.05	0.06	0.07	0.06
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.06	0.04	0.04
O5'	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.03	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.09	0.06	0.05	0.09	0.02	0.09	0.02	0.08	0.07	0.10	0.10	0.09	0.05	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.04	0.03	0.05	0.07	0.04	0.07	0.04	0.06	0.03	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.04	0.04	0.06	0.02	0.07	0.01	0.06	0.04	0.06	0.08	0.07	0.03	0.06	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00