Doublet Group distance statistics: 49690

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 8, 9, 10, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.013, 0.030, 0.046, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.023, 0.049, 0.075, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.049 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.029, 0.056, 0.082, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.056 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.026, 0.056, 0.087, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.056 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.074, 0.222, 0.370, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.222 std_dev=0.148
C2'	A	0, 0.096, 0.245, 0.394, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.245 std_dev=0.149
C6	B	0, 0.219, 0.381, 0.543, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.381 std_dev=0.162
C5	B	0, 0.196, 0.358, 0.519, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.358 std_dev=0.162
C4	B	0, 0.276, 0.449, 0.621, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.449 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.136, 0.310, 0.484, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.310 std_dev=0.174
O6	B	0, 0.234, 0.430, 0.626, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.430 std_dev=0.196
N9	B	0, 0.218, 0.425, 0.631, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.425 std_dev=0.206
C4'	A	0, 0.137, 0.350, 0.563, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.350 std_dev=0.213
C3'	A	0, 0.143, 0.375, 0.607, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.375 std_dev=0.232
C2'	B	0, 0.397, 0.629, 0.862, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.629 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.490, 0.724, 0.958, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.724 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.350, 0.595, 0.840, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.595 std_dev=0.245
C1'	B	0, 0.231, 0.479, 0.727, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.479 std_dev=0.248
C2	B	0, 0.531, 0.807, 1.083, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.807 std_dev=0.276
N7	B	0, 0.213, 0.497, 0.782, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.497 std_dev=0.285
C8	B	0, 0.215, 0.509, 0.804, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.509 std_dev=0.294
O2'	B	0, 0.340, 0.670, 0.999, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.670 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.189, 0.521, 0.854, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.521 std_dev=0.333
C5'	A	0, 0.295, 0.649, 1.003, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.649 std_dev=0.354
N2	B	0, 0.785, 1.165, 1.545, 1.823 max_d=1.823 avg_d=1.165 std_dev=0.380
O4'	B	0, 0.408, 0.795, 1.182, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.795 std_dev=0.387
C3'	B	0, 0.508, 0.934, 1.360, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.934 std_dev=0.426
O5'	B	0, 1.018, 1.506, 1.994, 2.353 max_d=2.353 avg_d=1.506 std_dev=0.488
C4'	B	0, 0.452, 0.974, 1.496, 2.239 max_d=2.239 avg_d=0.974 std_dev=0.522
O3'	B	0, 0.722, 1.257, 1.792, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.257 std_dev=0.535
P	B	0, 0.848, 1.388, 1.928, 2.613 max_d=2.613 avg_d=1.388 std_dev=0.540
OP2	B	0, 0.690, 1.266, 1.843, 2.796 max_d=2.796 avg_d=1.266 std_dev=0.576
OP1	B	0, 0.779, 1.390, 2.001, 3.125 max_d=3.125 avg_d=1.390 std_dev=0.611
O5'	A	0, 0.307, 0.997, 1.687, 3.230 max_d=3.230 avg_d=0.997 std_dev=0.690
C5'	B	0, 0.793, 1.568, 2.342, 3.025 max_d=3.025 avg_d=1.568 std_dev=0.774
P	A	0, 0.312, 1.174, 2.035, 4.244 max_d=4.244 avg_d=1.174 std_dev=0.861
OP1	A	0, 0.424, 1.426, 2.428, 5.362 max_d=5.362 avg_d=1.426 std_dev=1.002
OP2	A	0, 0.043, 1.305, 2.567, 6.630 max_d=6.630 avg_d=1.305 std_dev=1.262

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.21	0.16	0.41	0.25
C2	0.03	0.00	0.15	0.19	0.01	0.08	0.02	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.23	0.04	0.47	0.40	0.76	0.53
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.06	0.12	0.15	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.26	0.24	0.21
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.11	0.01	0.08	0.02	0.11	0.11	0.16	0.18	0.10	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.31	0.37	0.16	0.24
C4	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.48	0.38	0.73	0.51
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.15	0.27	0.06
C5	0.01	0.02	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.59	0.49	0.92	0.65
C5'	0.02	0.14	0.02	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.15	0.16	0.11	0.20	0.18	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.19	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.13	0.03	0.61	0.53	0.99	0.69
C8	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.56	0.43	0.81	0.59
N1	0.03	0.00	0.12	0.16	0.02	0.07	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.19	0.04	0.56	0.49	0.90	0.63
N3	0.03	0.01	0.15	0.18	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.21	0.04	0.41	0.33	0.65	0.45
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.12	0.03	0.66	0.61	1.11	0.76
N7	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.63	0.53	0.99	0.70
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.42	0.31	0.63	0.44
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.08	0.04	0.06	0.05	0.10	0.04	0.13	0.14	0.09	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.09	0.21	0.22	0.11
O3'	0.02	0.23	0.02	0.01	0.11	0.01	0.09	0.03	0.13	0.11	0.19	0.21	0.12	0.09	0.04	0.04	0.00	0.01	0.28	0.46	0.24	0.26
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.15	0.13	0.43	0.22
O5'	0.21	0.47	0.24	0.31	0.48	0.02	0.59	0.01	0.61	0.56	0.56	0.41	0.66	0.63	0.42	0.09	0.28	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.16	0.40	0.26	0.37	0.38	0.15	0.49	0.19	0.53	0.43	0.49	0.33	0.61	0.53	0.31	0.21	0.46	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.76	0.24	0.16	0.73	0.27	0.92	0.30	0.99	0.81	0.90	0.65	1.11	0.99	0.63	0.22	0.24	0.43	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.53	0.21	0.24	0.51	0.06	0.65	0.02	0.69	0.59	0.63	0.45	0.76	0.70	0.44	0.11	0.26	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.12	0.23	0.24	0.13	0.17	0.12	0.17	0.12	0.14	0.12	0.12	0.14	0.12	0.15	0.23	0.34	0.22	0.24	0.14	0.25	0.28	0.23
C2	0.22	0.13	0.27	0.28	0.16	0.23	0.15	0.23	0.14	0.19	0.13	0.14	0.14	0.17	0.19	0.28	0.36	0.26	0.24	0.14	0.27	0.30	0.24
C2'	0.20	0.17	0.23	0.23	0.16	0.19	0.15	0.20	0.17	0.16	0.18	0.18	0.16	0.15	0.17	0.24	0.32	0.25	0.24	0.18	0.26	0.29	0.25
C3'	0.18	0.19	0.20	0.19	0.16	0.19	0.17	0.20	0.20	0.16	0.21	0.22	0.16	0.16	0.16	0.21	0.27	0.26	0.26	0.22	0.28	0.28	0.25
C4	0.19	0.12	0.24	0.24	0.14	0.18	0.13	0.18	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.14	0.16	0.24	0.33	0.23	0.23	0.13	0.25	0.28	0.23
C4'	0.18	0.15	0.19	0.20	0.15	0.16	0.15	0.17	0.17	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.16	0.20	0.29	0.24	0.27	0.19	0.27	0.28	0.25
C5	0.18	0.13	0.22	0.23	0.14	0.16	0.13	0.17	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.14	0.16	0.21	0.30	0.22	0.24	0.13	0.25	0.28	0.23
C5'	0.26	0.23	0.22	0.23	0.24	0.24	0.25	0.26	0.26	0.25	0.25	0.22	0.23	0.26	0.25	0.22	0.28	0.33	0.36	0.28	0.36	0.34	0.33
C6	0.20	0.13	0.24	0.24	0.15	0.18	0.15	0.18	0.14	0.17	0.14	0.14	0.14	0.16	0.18	0.24	0.31	0.23	0.23	0.14	0.26	0.28	0.23
C8	0.16	0.12	0.20	0.22	0.13	0.14	0.12	0.15	0.12	0.13	0.12	0.13	0.13	0.12	0.14	0.19	0.30	0.20	0.26	0.13	0.26	0.28	0.24
N1	0.22	0.13	0.27	0.27	0.16	0.22	0.15	0.22	0.14	0.19	0.13	0.14	0.14	0.17	0.19	0.29	0.35	0.25	0.24	0.14	0.27	0.30	0.24
N3	0.21	0.13	0.25	0.26	0.15	0.21	0.14	0.21	0.13	0.17	0.13	0.13	0.14	0.15	0.17	0.26	0.35	0.25	0.23	0.13	0.26	0.28	0.23
N6	0.20	0.14	0.23	0.22	0.16	0.17	0.16	0.17	0.15	0.18	0.14	0.15	0.14	0.17	0.18	0.20	0.27	0.22	0.24	0.15	0.26	0.28	0.23
N7	0.16	0.12	0.20	0.21	0.13	0.14	0.12	0.15	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.14	0.18	0.28	0.20	0.26	0.13	0.26	0.28	0.24
N9	0.18	0.12	0.22	0.23	0.13	0.16	0.12	0.17	0.12	0.14	0.12	0.13	0.13	0.12	0.15	0.22	0.32	0.22	0.24	0.13	0.25	0.28	0.23
O2'	0.22	0.15	0.26	0.27	0.16	0.22	0.15	0.22	0.15	0.18	0.15	0.15	0.16	0.16	0.19	0.28	0.36	0.27	0.25	0.16	0.26	0.30	0.26
O3'	0.19	0.23	0.20	0.19	0.17	0.21	0.19	0.23	0.24	0.17	0.26	0.26	0.18	0.18	0.17	0.22	0.27	0.28	0.26	0.27	0.29	0.29	0.27
O4'	0.17	0.12	0.21	0.24	0.13	0.15	0.12	0.16	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.14	0.22	0.34	0.21	0.25	0.15	0.26	0.28	0.24
O5'	0.71	0.68	0.64	0.65	0.70	0.71	0.70	0.74	0.68	0.71	0.67	0.66	0.69	0.70	0.71	0.62	0.63	0.77	0.77	0.67	0.77	0.78	0.78
OP1	0.73	0.71	0.62	0.64	0.75	0.74	0.78	0.79	0.78	0.79	0.75	0.66	0.71	0.80	0.76	0.57	0.59	0.82	0.82	0.79	0.82	0.83	0.84
OP2	1.27	1.31	1.20	1.23	1.33	1.27	1.35	1.31	1.34	1.34	1.33	1.27	1.30	1.35	1.32	1.13	1.18	1.32	1.34	1.33	1.35	1.39	1.38
P	0.86	0.85	0.77	0.79	0.88	0.85	0.89	0.89	0.88	0.89	0.86	0.82	0.85	0.90	0.88	0.73	0.75	0.91	0.92	0.87	0.92	0.94	0.94

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.02	0.14	0.22	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.17	0.06	0.31	0.01	0.25	0.26	0.25
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.14	0.12	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.08	0.25	0.13	0.12
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.01	0.09	0.02	0.11	0.08	0.12	0.15	0.12	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.24	0.11	0.34	0.14	0.19
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.32	0.01	0.25	0.24	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.15	0.23	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.40	0.01	0.31	0.29	0.32
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.08	0.07	0.11	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.12	0.16	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.03	0.41	0.01	0.33	0.32	0.34
C8	0.01	0.02	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.41	0.02	0.29	0.23	0.29
N1	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.16	0.05	0.37	0.01	0.30	0.30	0.30
N2	0.05	0.00	0.14	0.15	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.20	0.08	0.28	0.02	0.24	0.25	0.23
N3	0.04	0.00	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.15	0.06	0.27	0.01	0.22	0.23	0.21
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.45	0.02	0.34	0.30	0.36
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.30	0.02	0.22	0.21	0.20
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.10	0.14	0.11	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.07	0.19	0.18	0.07
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.14	0.10	0.16	0.20	0.15	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.19	0.15	0.41	0.21	0.23
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.03	0.09	0.32	0.14
O5'	0.14	0.31	0.18	0.24	0.32	0.02	0.40	0.01	0.41	0.41	0.37	0.28	0.27	0.45	0.30	0.05	0.19	0.08	0.00	0.45	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.15	0.03	0.45	0.00	0.36	0.36	0.38
OP1	0.14	0.25	0.25	0.34	0.25	0.15	0.31	0.16	0.33	0.29	0.30	0.24	0.22	0.34	0.22	0.19	0.41	0.09	0.02	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.26	0.13	0.14	0.24	0.23	0.29	0.26	0.32	0.23	0.30	0.25	0.23	0.30	0.21	0.18	0.21	0.32	0.02	0.36	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.25	0.12	0.19	0.24	0.05	0.32	0.02	0.34	0.29	0.30	0.23	0.21	0.36	0.20	0.07	0.23	0.14	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00