Doublet Group distance statistics: 49692

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 6, 9, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.015, 0.032, 0.048, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.002, 0.019, 0.037, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.012, 0.030, 0.047, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.022, 0.041, 0.060, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.041 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.025, 0.045, 0.064, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.045 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.023, 0.048, 0.074, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.048 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.040, 0.079, 0.118, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.079 std_dev=0.039
N9	B	0, 0.292, 0.439, 0.587, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.439 std_dev=0.148
N3	B	0, 0.206, 0.380, 0.555, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.380 std_dev=0.175
C4	B	0, 0.199, 0.375, 0.551, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.375 std_dev=0.176
C8	B	0, 0.316, 0.496, 0.677, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.496 std_dev=0.180
C2'	A	0, 0.088, 0.289, 0.490, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.289 std_dev=0.201
C5	B	0, 0.250, 0.452, 0.655, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.452 std_dev=0.202
C2	B	0, 0.259, 0.466, 0.673, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.466 std_dev=0.207
O2'	A	0, 0.263, 0.481, 0.699, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.481 std_dev=0.218
O4'	A	0, 0.051, 0.270, 0.489, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.270 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.327, 0.548, 0.769, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.548 std_dev=0.221
N7	B	0, 0.250, 0.492, 0.734, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.492 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.311, 0.561, 0.810, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.561 std_dev=0.250
N1	B	0, 0.308, 0.562, 0.816, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.562 std_dev=0.254
O4'	B	0, 0.423, 0.696, 0.968, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.696 std_dev=0.272
N2	B	0, 0.251, 0.540, 0.828, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.540 std_dev=0.288
C2'	B	0, 0.350, 0.643, 0.936, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.643 std_dev=0.293
C3'	A	0, 0.204, 0.506, 0.807, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.506 std_dev=0.302
C4'	A	0, 0.225, 0.529, 0.832, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.529 std_dev=0.303
O6	B	0, 0.361, 0.697, 1.033, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.697 std_dev=0.336
C3'	B	0, 0.434, 0.773, 1.112, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.773 std_dev=0.339
C4'	B	0, 0.463, 0.814, 1.164, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.814 std_dev=0.350
O3'	A	0, 0.322, 0.693, 1.063, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.693 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.324, 0.749, 1.174, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.749 std_dev=0.425
O5'	A	0, 0.427, 0.857, 1.286, 2.083 max_d=2.083 avg_d=0.857 std_dev=0.429
O3'	B	0, 0.532, 0.997, 1.463, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.997 std_dev=0.466
C5'	B	0, 0.446, 0.930, 1.414, 1.952 max_d=1.952 avg_d=0.930 std_dev=0.484
P	A	0, 0.649, 1.185, 1.720, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.185 std_dev=0.536
O5'	B	0, 0.345, 0.908, 1.472, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.908 std_dev=0.563
OP2	A	0, 0.813, 1.381, 1.948, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.381 std_dev=0.568
C5'	A	0, 0.355, 0.930, 1.505, 2.155 max_d=2.155 avg_d=0.930 std_dev=0.575
P	B	0, 0.481, 1.096, 1.711, 2.073 max_d=2.073 avg_d=1.096 std_dev=0.615
OP2	B	0, 0.404, 1.034, 1.665, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.034 std_dev=0.631
OP1	B	0, 0.616, 1.367, 2.119, 3.240 max_d=3.240 avg_d=1.367 std_dev=0.752
OP1	A	0, 0.709, 1.476, 2.242, 3.186 max_d=3.186 avg_d=1.476 std_dev=0.767

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.17	0.08	0.29	0.13
C2	0.05	0.00	0.17	0.21	0.01	0.09	0.02	0.13	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.25	0.06	0.35	0.25	0.57	0.32
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.03	0.09	0.08	0.13	0.17	0.08	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.19	0.13	0.23	0.12
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.11	0.00	0.08	0.04	0.12	0.11	0.17	0.19	0.11	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.24	0.23	0.21	0.16
C4	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.03	0.35	0.24	0.53	0.31
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.19	0.05
C5	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.02	0.42	0.35	0.64	0.40
C5'	0.03	0.13	0.03	0.04	0.11	0.01	0.14	0.00	0.16	0.14	0.15	0.11	0.18	0.16	0.09	0.05	0.06	0.02	0.01	0.16	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.12	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.03	0.43	0.38	0.68	0.43
C8	0.01	0.02	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.42	0.31	0.54	0.36
N1	0.04	0.00	0.13	0.17	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.21	0.04	0.40	0.33	0.64	0.39
N3	0.05	0.00	0.17	0.19	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.22	0.06	0.31	0.19	0.50	0.28
N6	0.02	0.02	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.12	0.13	0.04	0.46	0.45	0.74	0.48
N7	0.01	0.02	0.07	0.08	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.46	0.40	0.66	0.44
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.32	0.19	0.45	0.26
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.09	0.05	0.09	0.05	0.12	0.05	0.16	0.16	0.12	0.06	0.03	0.00	0.05	0.05	0.08	0.18	0.16	0.10
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.12	0.02	0.09	0.06	0.14	0.13	0.21	0.22	0.13	0.10	0.04	0.05	0.00	0.01	0.19	0.30	0.21	0.17
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.11	0.12	0.27	0.12
O5'	0.17	0.35	0.19	0.24	0.35	0.02	0.42	0.01	0.43	0.42	0.40	0.31	0.46	0.46	0.32	0.08	0.19	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.25	0.13	0.23	0.24	0.07	0.35	0.16	0.38	0.31	0.33	0.19	0.45	0.40	0.19	0.18	0.30	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.57	0.23	0.21	0.53	0.19	0.64	0.23	0.68	0.54	0.64	0.50	0.74	0.66	0.45	0.16	0.21	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.32	0.12	0.16	0.31	0.05	0.40	0.02	0.43	0.36	0.39	0.28	0.48	0.44	0.26	0.10	0.17	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.18	0.22	0.22	0.18	0.18	0.18	0.21	0.19	0.18	0.20	0.20	0.18	0.17	0.19	0.21	0.26	0.21	0.22	0.21	0.23	0.24	0.21
C2	0.22	0.16	0.29	0.29	0.18	0.23	0.17	0.22	0.16	0.21	0.16	0.20	0.16	0.19	0.21	0.31	0.38	0.25	0.25	0.16	0.31	0.24	0.24
C2'	0.21	0.23	0.24	0.24	0.22	0.20	0.23	0.22	0.24	0.22	0.25	0.24	0.22	0.23	0.22	0.25	0.29	0.22	0.23	0.26	0.25	0.25	0.22
C3'	0.19	0.26	0.23	0.22	0.23	0.19	0.25	0.22	0.28	0.23	0.29	0.28	0.24	0.24	0.22	0.24	0.26	0.21	0.23	0.31	0.24	0.26	0.22
C4	0.20	0.17	0.24	0.24	0.18	0.19	0.17	0.20	0.17	0.19	0.18	0.20	0.17	0.18	0.20	0.25	0.29	0.22	0.23	0.18	0.25	0.24	0.22
C4'	0.17	0.22	0.21	0.21	0.20	0.16	0.22	0.20	0.25	0.20	0.25	0.23	0.21	0.21	0.19	0.21	0.24	0.19	0.21	0.28	0.20	0.26	0.21
C5	0.19	0.16	0.24	0.23	0.18	0.18	0.17	0.20	0.16	0.19	0.17	0.20	0.17	0.18	0.19	0.25	0.28	0.21	0.22	0.17	0.24	0.23	0.21
C5'	0.22	0.28	0.24	0.23	0.26	0.21	0.27	0.26	0.30	0.25	0.31	0.28	0.26	0.27	0.24	0.23	0.25	0.23	0.24	0.33	0.23	0.31	0.26
C6	0.21	0.15	0.29	0.27	0.17	0.20	0.16	0.20	0.15	0.20	0.15	0.20	0.15	0.18	0.20	0.32	0.34	0.22	0.24	0.15	0.27	0.23	0.23
C8	0.17	0.18	0.20	0.20	0.18	0.16	0.18	0.21	0.19	0.18	0.20	0.20	0.18	0.18	0.18	0.20	0.24	0.18	0.20	0.20	0.20	0.24	0.20
N1	0.22	0.15	0.31	0.30	0.17	0.23	0.17	0.22	0.15	0.21	0.15	0.20	0.15	0.19	0.20	0.35	0.40	0.24	0.25	0.15	0.30	0.24	0.24
N3	0.21	0.17	0.26	0.26	0.18	0.21	0.17	0.21	0.17	0.20	0.18	0.20	0.17	0.18	0.20	0.27	0.33	0.24	0.24	0.17	0.28	0.24	0.23
N6	0.21	0.15	0.32	0.29	0.17	0.20	0.16	0.20	0.15	0.20	0.15	0.20	0.14	0.18	0.20	0.36	0.36	0.22	0.24	0.15	0.26	0.24	0.23
N7	0.17	0.17	0.21	0.21	0.18	0.16	0.17	0.20	0.17	0.18	0.18	0.20	0.18	0.18	0.18	0.21	0.24	0.18	0.21	0.18	0.20	0.24	0.20
N9	0.19	0.18	0.22	0.22	0.18	0.18	0.18	0.20	0.18	0.19	0.19	0.20	0.18	0.18	0.19	0.21	0.26	0.20	0.22	0.20	0.22	0.24	0.21
O2'	0.22	0.21	0.25	0.26	0.21	0.23	0.21	0.24	0.22	0.22	0.23	0.23	0.21	0.21	0.22	0.27	0.31	0.24	0.24	0.24	0.27	0.25	0.23
O3'	0.22	0.29	0.25	0.25	0.26	0.23	0.28	0.25	0.31	0.26	0.32	0.31	0.27	0.28	0.25	0.28	0.29	0.24	0.26	0.35	0.27	0.29	0.25
O4'	0.18	0.18	0.22	0.23	0.17	0.18	0.17	0.21	0.20	0.17	0.21	0.20	0.17	0.17	0.17	0.21	0.27	0.19	0.21	0.22	0.22	0.25	0.21
O5'	0.51	0.52	0.44	0.45	0.51	0.50	0.52	0.57	0.53	0.52	0.52	0.51	0.51	0.52	0.51	0.42	0.41	0.55	0.56	0.53	0.56	0.55	0.55
OP1	0.55	0.59	0.43	0.45	0.59	0.54	0.64	0.64	0.67	0.62	0.65	0.57	0.57	0.65	0.58	0.40	0.39	0.61	0.62	0.70	0.63	0.65	0.64
OP2	0.80	0.79	0.73	0.74	0.79	0.80	0.79	0.87	0.78	0.79	0.78	0.77	0.78	0.79	0.79	0.72	0.70	0.84	0.84	0.77	0.84	0.80	0.82
P	0.55	0.57	0.46	0.48	0.56	0.54	0.58	0.62	0.60	0.57	0.59	0.56	0.55	0.59	0.56	0.44	0.43	0.59	0.60	0.61	0.60	0.60	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.04	0.03	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.16	0.03	0.17	0.09	0.12
C2	0.07	0.00	0.15	0.16	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.19	0.07	0.20	0.01	0.18	0.24	0.18
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.03	0.09	0.06	0.13	0.18	0.14	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.12	0.09	0.19	0.14	0.10
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.12	0.01	0.13	0.02	0.14	0.11	0.16	0.19	0.15	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.10	0.15	0.21	0.20	0.12
C4	0.03	0.01	0.09	0.12	0.00	0.08	0.01	0.22	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.04	0.20	0.02	0.18	0.21	0.17
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.13	0.10	0.10	0.08	0.15	0.08	0.07	0.03	0.00	0.02	0.14	0.13	0.11	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.12	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.04	0.22	0.01	0.22	0.27	0.22
C5'	0.07	0.21	0.03	0.02	0.22	0.01	0.28	0.00	0.29	0.29	0.25	0.19	0.18	0.32	0.19	0.06	0.06	0.02	0.01	0.34	0.19	0.17	0.02
C6	0.04	0.01	0.09	0.14	0.02	0.12	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.17	0.04	0.22	0.01	0.24	0.31	0.24
C8	0.03	0.01	0.06	0.11	0.01	0.13	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.06	0.23	0.03	0.21	0.21	0.20
N1	0.06	0.00	0.13	0.16	0.02	0.10	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.14	0.19	0.06	0.21	0.01	0.21	0.28	0.21
N2	0.10	0.00	0.18	0.19	0.02	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.21	0.23	0.09	0.19	0.02	0.17	0.23	0.17
N3	0.07	0.01	0.14	0.15	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.15	0.17	0.07	0.19	0.02	0.17	0.19	0.16
N7	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.15	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.05	0.23	0.03	0.25	0.29	0.24
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.08	0.01	0.19	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.19	0.02	0.18	0.16	0.15
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.07	0.06	0.06	0.09	0.05	0.14	0.21	0.15	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.08	0.09	0.19	0.13	0.08
O3'	0.03	0.19	0.02	0.01	0.12	0.03	0.14	0.06	0.17	0.13	0.19	0.23	0.17	0.14	0.07	0.05	0.00	0.04	0.10	0.18	0.26	0.29	0.16
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.06	0.06	0.09	0.07	0.05	0.02	0.05	0.04	0.00	0.15	0.05	0.20	0.12	0.15
O5'	0.16	0.20	0.12	0.10	0.20	0.02	0.22	0.01	0.22	0.23	0.21	0.19	0.19	0.23	0.19	0.08	0.10	0.15	0.00	0.23	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.15	0.02	0.14	0.01	0.34	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.09	0.18	0.05	0.23	0.00	0.29	0.36	0.28
OP1	0.17	0.18	0.19	0.21	0.18	0.13	0.22	0.19	0.24	0.21	0.21	0.17	0.17	0.25	0.18	0.19	0.26	0.20	0.02	0.29	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.24	0.14	0.20	0.21	0.11	0.27	0.17	0.31	0.21	0.28	0.23	0.19	0.29	0.16	0.13	0.29	0.12	0.02	0.36	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.18	0.10	0.12	0.17	0.02	0.22	0.02	0.24	0.20	0.21	0.17	0.16	0.24	0.15	0.08	0.16	0.15	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00