Doublet Group distance statistics: 49693

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 0, 6, 4, 2, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.017, 0.033, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.033 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.021, 0.040, 0.059, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.040 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.020, 0.039, 0.059, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.039 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.030, 0.053, 0.077, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.053 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.026, 0.053, 0.080, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.053 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.031, 0.064, 0.096, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.064 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.054, 0.179, 0.303, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.179 std_dev=0.125
C2'	A	0, 0.081, 0.217, 0.354, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.217 std_dev=0.137
O2'	A	0, 0.110, 0.269, 0.429, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.269 std_dev=0.159
N3	B	0, 0.310, 0.510, 0.710, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.510 std_dev=0.200
C4'	A	0, 0.115, 0.318, 0.521, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.318 std_dev=0.203
C2	B	0, 0.334, 0.537, 0.741, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.537 std_dev=0.204
C4	B	0, 0.323, 0.530, 0.738, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.530 std_dev=0.207
C3'	A	0, 0.130, 0.339, 0.548, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.339 std_dev=0.209
N2	B	0, 0.346, 0.559, 0.772, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.559 std_dev=0.213
N9	B	0, 0.348, 0.573, 0.797, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.573 std_dev=0.225
N1	B	0, 0.361, 0.598, 0.835, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.598 std_dev=0.237
C5	B	0, 0.364, 0.604, 0.844, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.604 std_dev=0.240
C6	B	0, 0.398, 0.647, 0.896, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.647 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.397, 0.664, 0.931, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.664 std_dev=0.267
N7	B	0, 0.404, 0.688, 0.972, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.688 std_dev=0.284
O6	B	0, 0.471, 0.758, 1.045, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.758 std_dev=0.287
C8	B	0, 0.344, 0.638, 0.932, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.638 std_dev=0.294
C5'	A	0, 0.208, 0.528, 0.849, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.528 std_dev=0.320
O3'	A	0, 0.172, 0.513, 0.854, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.513 std_dev=0.341
O2'	B	0, 0.536, 1.028, 1.520, 1.716 max_d=1.716 avg_d=1.028 std_dev=0.492
C2'	B	0, 0.545, 1.048, 1.551, 1.695 max_d=1.695 avg_d=1.048 std_dev=0.503
O4'	B	0, 0.414, 0.926, 1.439, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.926 std_dev=0.513
OP2	A	0, 0.387, 0.996, 1.606, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.996 std_dev=0.609
C3'	B	0, 0.597, 1.414, 2.231, 2.493 max_d=2.493 avg_d=1.414 std_dev=0.817
O5'	A	0, 0.016, 0.842, 1.668, 2.816 max_d=2.816 avg_d=0.842 std_dev=0.826
C4'	B	0, 0.463, 1.301, 2.139, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.301 std_dev=0.838
P	A	0, 0.176, 1.049, 1.923, 3.067 max_d=3.067 avg_d=1.049 std_dev=0.874
OP2	B	0, 0.618, 1.665, 2.711, 3.795 max_d=3.795 avg_d=1.665 std_dev=1.046
C5'	B	0, 0.457, 1.517, 2.577, 2.872 max_d=2.872 avg_d=1.517 std_dev=1.060
O3'	B	0, 0.776, 1.930, 3.084, 3.562 max_d=3.562 avg_d=1.930 std_dev=1.154
P	B	0, 0.495, 1.800, 3.106, 4.497 max_d=4.497 avg_d=1.800 std_dev=1.305
O5'	B	0, 0.338, 1.668, 2.997, 4.440 max_d=4.440 avg_d=1.668 std_dev=1.330
OP1	A	0, 0.069, 1.445, 2.820, 4.651 max_d=4.651 avg_d=1.445 std_dev=1.376
OP1	B	0, 0.472, 2.440, 4.408, 6.730 max_d=6.730 avg_d=2.440 std_dev=1.968

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.06	0.31	0.17
C2	0.02	0.00	0.14	0.12	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.05	0.17	0.26	0.39	0.32
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.12	0.13	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.18	0.21	0.24	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.09	0.10	0.11	0.11	0.10	0.09	0.04	0.01	0.01	0.02	0.28	0.36	0.21	0.12
C4	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.10	0.03	0.19	0.20	0.36	0.27
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.02	0.08	0.09	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.13	0.32	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.02	0.26	0.27	0.38	0.30
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.16	0.17	0.12	0.07	0.19	0.19	0.10	0.04	0.03	0.02	0.00	0.18	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.26	0.31	0.40	0.33
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.31	0.21	0.32	0.23
N1	0.02	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.04	0.21	0.30	0.40	0.34
N3	0.02	0.00	0.13	0.11	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.17	0.05	0.14	0.20	0.37	0.29
N6	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.03	0.30	0.36	0.42	0.35
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.33	0.27	0.37	0.29
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.19	0.14	0.33	0.21
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.09	0.04	0.06	0.04	0.10	0.04	0.14	0.15	0.09	0.03	0.02	0.00	0.07	0.03	0.07	0.18	0.26	0.06
O3'	0.04	0.19	0.04	0.01	0.10	0.02	0.08	0.03	0.11	0.11	0.16	0.17	0.12	0.11	0.04	0.07	0.00	0.03	0.27	0.49	0.22	0.19
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.10	0.10	0.34	0.21
O5'	0.08	0.17	0.18	0.28	0.19	0.01	0.26	0.00	0.26	0.31	0.21	0.14	0.30	0.33	0.19	0.07	0.27	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.26	0.21	0.36	0.20	0.13	0.27	0.18	0.31	0.21	0.30	0.20	0.36	0.27	0.14	0.18	0.49	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.39	0.24	0.21	0.36	0.32	0.38	0.36	0.40	0.32	0.40	0.37	0.42	0.37	0.33	0.26	0.22	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.32	0.05	0.12	0.27	0.06	0.30	0.01	0.33	0.23	0.34	0.29	0.35	0.29	0.21	0.06	0.19	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.08	0.23	0.19	0.07	0.16	0.07	0.22	0.09	0.09	0.10	0.09	0.06	0.08	0.09	0.23	0.32	0.30	0.23	0.11	0.49	0.19	0.39
C2	0.20	0.13	0.23	0.23	0.13	0.18	0.13	0.19	0.12	0.17	0.13	0.16	0.12	0.14	0.16	0.23	0.34	0.29	0.17	0.12	0.21	0.14	0.20
C2'	0.14	0.10	0.23	0.15	0.10	0.21	0.11	0.30	0.12	0.12	0.12	0.10	0.09	0.12	0.12	0.24	0.27	0.33	0.37	0.14	0.70	0.34	0.56
C3'	0.18	0.14	0.24	0.17	0.16	0.26	0.16	0.35	0.16	0.17	0.15	0.14	0.15	0.17	0.17	0.26	0.28	0.36	0.40	0.17	0.78	0.40	0.62
C4	0.14	0.09	0.22	0.19	0.07	0.14	0.07	0.17	0.08	0.10	0.10	0.13	0.07	0.08	0.10	0.22	0.32	0.28	0.16	0.09	0.32	0.14	0.28
C4'	0.18	0.15	0.26	0.21	0.16	0.21	0.17	0.27	0.17	0.17	0.16	0.15	0.16	0.17	0.17	0.26	0.34	0.33	0.28	0.18	0.62	0.27	0.49
C5	0.14	0.10	0.23	0.20	0.08	0.12	0.07	0.15	0.08	0.10	0.10	0.14	0.07	0.08	0.10	0.23	0.33	0.26	0.12	0.09	0.25	0.12	0.23
C5'	0.29	0.28	0.33	0.28	0.29	0.29	0.29	0.33	0.29	0.29	0.28	0.28	0.28	0.29	0.29	0.34	0.39	0.39	0.32	0.29	0.67	0.32	0.54
C6	0.17	0.14	0.22	0.21	0.12	0.13	0.12	0.15	0.12	0.14	0.14	0.17	0.13	0.13	0.14	0.22	0.32	0.26	0.13	0.12	0.15	0.11	0.15
C8	0.13	0.08	0.26	0.21	0.08	0.15	0.08	0.20	0.10	0.09	0.10	0.09	0.08	0.08	0.10	0.24	0.34	0.29	0.17	0.11	0.42	0.18	0.34
N1	0.21	0.15	0.23	0.23	0.15	0.18	0.15	0.19	0.14	0.18	0.15	0.17	0.14	0.16	0.18	0.23	0.33	0.28	0.16	0.14	0.17	0.13	0.16
N3	0.17	0.10	0.22	0.20	0.10	0.16	0.09	0.18	0.09	0.13	0.10	0.14	0.09	0.10	0.13	0.23	0.33	0.29	0.18	0.09	0.29	0.15	0.26
N6	0.18	0.18	0.23	0.22	0.15	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.20	0.16	0.15	0.16	0.23	0.33	0.24	0.17	0.16	0.13	0.13	0.11
N7	0.13	0.07	0.26	0.22	0.07	0.14	0.06	0.17	0.08	0.09	0.09	0.11	0.06	0.07	0.10	0.25	0.34	0.27	0.13	0.09	0.33	0.15	0.27
N9	0.13	0.08	0.23	0.19	0.07	0.14	0.07	0.20	0.08	0.08	0.10	0.10	0.06	0.07	0.09	0.23	0.33	0.29	0.19	0.10	0.42	0.17	0.34
O2'	0.12	0.09	0.23	0.16	0.09	0.19	0.10	0.28	0.11	0.11	0.11	0.09	0.08	0.11	0.11	0.24	0.28	0.31	0.37	0.13	0.70	0.33	0.55
O3'	0.20	0.19	0.24	0.16	0.19	0.31	0.19	0.42	0.19	0.19	0.19	0.20	0.19	0.19	0.19	0.27	0.25	0.40	0.52	0.20	0.95	0.52	0.76
O4'	0.13	0.09	0.25	0.22	0.09	0.14	0.09	0.19	0.11	0.10	0.12	0.09	0.08	0.09	0.10	0.23	0.36	0.28	0.16	0.14	0.43	0.15	0.33
O5'	0.44	0.40	0.48	0.45	0.44	0.41	0.44	0.46	0.42	0.46	0.40	0.37	0.42	0.46	0.45	0.42	0.49	0.49	0.45	0.42	0.31	0.56	0.41
OP1	0.46	0.47	0.51	0.47	0.49	0.42	0.51	0.44	0.51	0.51	0.49	0.45	0.47	0.53	0.49	0.50	0.53	0.48	0.46	0.52	0.50	0.57	0.52
OP2	0.50	0.48	0.56	0.52	0.50	0.47	0.49	0.46	0.47	0.51	0.46	0.47	0.50	0.50	0.51	0.55	0.58	0.52	0.47	0.45	0.50	0.54	0.50
P	0.43	0.42	0.47	0.44	0.43	0.40	0.44	0.40	0.42	0.44	0.41	0.41	0.43	0.44	0.44	0.48	0.51	0.46	0.40	0.42	0.45	0.49	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.18	0.01	0.08	0.08	0.06
C2	0.01	0.00	0.28	0.28	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.38	0.13	0.28	0.01	0.11	0.29	0.14
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.16	0.01	0.11	0.01	0.17	0.10	0.24	0.33	0.27	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.26	0.15	0.30	0.10	0.13
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.17	0.00	0.15	0.02	0.21	0.11	0.26	0.32	0.25	0.10	0.06	0.02	0.00	0.01	0.32	0.20	0.46	0.09	0.22
C4	0.01	0.01	0.16	0.17	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.21	0.07	0.38	0.01	0.14	0.30	0.17
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.05	0.06	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.23	0.05
C5	0.01	0.01	0.11	0.15	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.19	0.04	0.52	0.01	0.26	0.47	0.30
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.12	0.09	0.09	0.07	0.12	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.12	0.28	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.17	0.21	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.28	0.07	0.50	0.00	0.22	0.51	0.29
C8	0.01	0.01	0.10	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.13	0.08	0.64	0.01	0.44	0.44	0.40
N1	0.01	0.00	0.24	0.26	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.36	0.11	0.39	0.00	0.13	0.41	0.19
N2	0.02	0.00	0.33	0.32	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.44	0.16	0.21	0.01	0.18	0.25	0.14
N3	0.01	0.00	0.27	0.25	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.32	0.13	0.25	0.01	0.09	0.22	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.04	0.66	0.01	0.45	0.58	0.45
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.40	0.01	0.21	0.24	0.18
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.11	0.05	0.07	0.06	0.12	0.07	0.18	0.28	0.21	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.10	0.10	0.18	0.08	0.04
O3'	0.02	0.38	0.03	0.00	0.21	0.02	0.19	0.03	0.28	0.13	0.36	0.44	0.32	0.12	0.07	0.05	0.00	0.02	0.24	0.28	0.56	0.13	0.25
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.11	0.16	0.13	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.06	0.09	0.22	0.17
O5'	0.18	0.28	0.26	0.32	0.38	0.01	0.52	0.01	0.50	0.64	0.39	0.21	0.25	0.66	0.40	0.10	0.24	0.05	0.00	0.56	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.15	0.20	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.28	0.06	0.56	0.00	0.29	0.60	0.36
OP1	0.08	0.11	0.30	0.46	0.14	0.16	0.26	0.28	0.22	0.44	0.13	0.18	0.09	0.45	0.21	0.18	0.56	0.09	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.29	0.10	0.09	0.30	0.23	0.47	0.34	0.51	0.44	0.41	0.25	0.22	0.58	0.24	0.08	0.13	0.22	0.02	0.60	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.13	0.22	0.17	0.05	0.30	0.01	0.29	0.40	0.19	0.14	0.11	0.45	0.18	0.04	0.25	0.17	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00