Doublet Group distance statistics: 49695

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 2, 6, 4, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.013, 0.029, 0.046, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.012, 0.031, 0.050, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.031 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.013, 0.036, 0.058, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.036 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.026, 0.144, 0.261, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.144 std_dev=0.118
C2'	A	0, 0.059, 0.186, 0.313, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.186 std_dev=0.127
N9	B	0, 0.233, 0.372, 0.511, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.372 std_dev=0.139
C8	B	0, 0.280, 0.433, 0.585, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.433 std_dev=0.152
C4	B	0, 0.189, 0.348, 0.507, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.348 std_dev=0.159
O2'	A	0, 0.123, 0.283, 0.442, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.283 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.065, 0.230, 0.395, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.230 std_dev=0.165
C1'	B	0, 0.223, 0.398, 0.572, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.398 std_dev=0.175
N3	B	0, 0.160, 0.347, 0.533, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.347 std_dev=0.186
O4'	B	0, 0.222, 0.414, 0.606, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.414 std_dev=0.192
C5	B	0, 0.235, 0.427, 0.619, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.427 std_dev=0.192
N7	B	0, 0.273, 0.469, 0.664, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.469 std_dev=0.195
C3'	A	0, 0.078, 0.275, 0.473, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.275 std_dev=0.197
C4'	B	0, 0.216, 0.430, 0.643, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.430 std_dev=0.214
C3'	B	0, 0.234, 0.458, 0.681, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.458 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.193, 0.418, 0.642, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.418 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.269, 0.516, 0.764, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.516 std_dev=0.248
C2'	B	0, 0.191, 0.440, 0.690, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.440 std_dev=0.250
C6	B	0, 0.271, 0.527, 0.783, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.527 std_dev=0.256
C5'	B	0, 0.278, 0.550, 0.822, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.550 std_dev=0.272
N2	B	0, 0.196, 0.475, 0.755, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.475 std_dev=0.279
O3'	B	0, 0.380, 0.664, 0.947, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.664 std_dev=0.284
O3'	A	0, 0.111, 0.395, 0.679, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.395 std_dev=0.284
C5'	A	0, 0.136, 0.427, 0.717, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.427 std_dev=0.291
O2'	B	0, 0.257, 0.552, 0.846, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.552 std_dev=0.294
O5'	B	0, 0.295, 0.594, 0.893, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.594 std_dev=0.299
O6	B	0, 0.329, 0.662, 0.995, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.662 std_dev=0.333
OP2	B	0, 0.425, 0.802, 1.179, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.802 std_dev=0.377
P	B	0, 0.242, 0.649, 1.056, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.649 std_dev=0.407
OP1	B	0, 0.420, 0.837, 1.255, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.837 std_dev=0.418
O5'	A	0, 0.067, 0.681, 1.296, 2.880 max_d=2.880 avg_d=0.681 std_dev=0.615
P	A	0, -0.057, 0.808, 1.673, 4.163 max_d=4.163 avg_d=0.808 std_dev=0.865
OP1	A	0, 0.059, 0.947, 1.834, 4.405 max_d=4.405 avg_d=0.947 std_dev=0.888
OP2	A	0, -0.659, 0.879, 2.416, 6.966 max_d=6.966 avg_d=0.879 std_dev=1.538

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.21	0.13	0.29	0.19
C2	0.01	0.00	0.10	0.12	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.04	0.37	0.16	0.66	0.39
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.08	0.11	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.07	0.17	0.11
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.08	0.11	0.11	0.09	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.10	0.11	0.15	0.11
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.39	0.15	0.68	0.42
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.05	0.03	0.06	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.14	0.06	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.49	0.23	0.92	0.55
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.10	0.09	0.06	0.13	0.12	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.11	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.49	0.24	0.97	0.57
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.09	0.05	0.50	0.24	0.87	0.55
N1	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.44	0.20	0.84	0.49
N3	0.01	0.00	0.11	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.04	0.33	0.14	0.55	0.33
N6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.11	0.04	0.54	0.32	1.12	0.65
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.10	0.05	0.54	0.30	1.05	0.64
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.38	0.13	0.61	0.38
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.08	0.10	0.06	0.05	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.15	0.13	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.00	0.08	0.02	0.08	0.02	0.11	0.09	0.13	0.14	0.11	0.10	0.04	0.05	0.00	0.02	0.13	0.19	0.18	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.18	0.20	0.20	0.15
O5'	0.21	0.37	0.12	0.10	0.39	0.01	0.49	0.01	0.49	0.50	0.44	0.33	0.54	0.54	0.38	0.05	0.13	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.13	0.16	0.07	0.11	0.15	0.14	0.23	0.11	0.24	0.24	0.20	0.14	0.32	0.30	0.13	0.15	0.19	0.20	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.66	0.17	0.15	0.68	0.06	0.92	0.03	0.97	0.87	0.84	0.55	1.12	1.05	0.61	0.13	0.18	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.39	0.11	0.11	0.42	0.03	0.55	0.01	0.57	0.55	0.49	0.33	0.65	0.64	0.38	0.07	0.12	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.24	0.15	0.16	0.14	0.13	0.18	0.13	0.25	0.11	0.28	0.30	0.16	0.15	0.11	0.16	0.23	0.15	0.12	0.28	0.14	0.10	0.10
C2	0.12	0.26	0.17	0.19	0.15	0.14	0.17	0.14	0.22	0.12	0.26	0.32	0.20	0.14	0.12	0.15	0.27	0.16	0.13	0.23	0.20	0.12	0.12
C2'	0.11	0.28	0.17	0.18	0.17	0.14	0.21	0.13	0.29	0.13	0.32	0.34	0.19	0.18	0.12	0.18	0.25	0.14	0.12	0.33	0.14	0.11	0.11
C3'	0.12	0.28	0.15	0.15	0.18	0.15	0.23	0.15	0.31	0.14	0.34	0.33	0.19	0.20	0.13	0.18	0.23	0.17	0.14	0.36	0.13	0.17	0.16
C4	0.11	0.26	0.16	0.16	0.15	0.13	0.18	0.13	0.24	0.11	0.28	0.32	0.18	0.14	0.11	0.15	0.23	0.15	0.12	0.26	0.15	0.08	0.10
C4'	0.13	0.20	0.14	0.14	0.13	0.14	0.17	0.14	0.24	0.11	0.26	0.23	0.13	0.14	0.11	0.15	0.20	0.18	0.13	0.29	0.11	0.15	0.14
C5	0.11	0.26	0.15	0.16	0.15	0.13	0.18	0.13	0.24	0.11	0.27	0.32	0.18	0.14	0.11	0.15	0.21	0.15	0.12	0.26	0.14	0.09	0.10
C5'	0.19	0.17	0.15	0.16	0.15	0.19	0.17	0.20	0.22	0.15	0.23	0.19	0.15	0.16	0.16	0.16	0.19	0.25	0.19	0.27	0.17	0.24	0.22
C6	0.12	0.25	0.16	0.16	0.15	0.13	0.17	0.13	0.22	0.11	0.25	0.30	0.19	0.14	0.11	0.15	0.22	0.15	0.12	0.23	0.15	0.09	0.10
C8	0.12	0.24	0.15	0.15	0.14	0.13	0.18	0.12	0.26	0.12	0.29	0.30	0.15	0.16	0.11	0.16	0.20	0.15	0.12	0.29	0.12	0.13	0.12
N1	0.12	0.25	0.17	0.18	0.15	0.14	0.17	0.14	0.21	0.12	0.25	0.30	0.20	0.14	0.12	0.15	0.26	0.16	0.13	0.22	0.19	0.11	0.11
N3	0.11	0.26	0.16	0.18	0.15	0.13	0.17	0.14	0.23	0.11	0.27	0.32	0.19	0.14	0.11	0.15	0.25	0.15	0.12	0.25	0.18	0.10	0.11
N6	0.12	0.23	0.16	0.16	0.15	0.13	0.16	0.13	0.20	0.11	0.23	0.26	0.19	0.13	0.11	0.16	0.19	0.15	0.12	0.21	0.14	0.09	0.10
N7	0.12	0.25	0.15	0.15	0.14	0.13	0.18	0.12	0.25	0.11	0.28	0.32	0.16	0.15	0.11	0.16	0.19	0.15	0.12	0.28	0.12	0.13	0.12
N9	0.11	0.25	0.15	0.16	0.14	0.13	0.18	0.13	0.25	0.11	0.29	0.31	0.17	0.15	0.11	0.15	0.22	0.15	0.12	0.28	0.13	0.10	0.10
O2'	0.12	0.28	0.20	0.21	0.18	0.15	0.21	0.15	0.28	0.14	0.31	0.33	0.20	0.18	0.13	0.21	0.28	0.14	0.14	0.32	0.18	0.11	0.12
O3'	0.13	0.32	0.17	0.17	0.21	0.17	0.27	0.18	0.35	0.18	0.38	0.36	0.22	0.24	0.16	0.21	0.25	0.18	0.16	0.41	0.16	0.20	0.19
O4'	0.13	0.20	0.15	0.16	0.12	0.14	0.15	0.13	0.22	0.10	0.24	0.24	0.13	0.13	0.10	0.15	0.22	0.17	0.13	0.26	0.13	0.12	0.12
O5'	0.58	0.55	0.52	0.52	0.56	0.57	0.55	0.59	0.55	0.56	0.55	0.55	0.56	0.55	0.57	0.50	0.49	0.62	0.59	0.56	0.58	0.62	0.63
OP1	0.45	0.42	0.32	0.33	0.43	0.43	0.42	0.47	0.42	0.43	0.42	0.42	0.44	0.42	0.44	0.29	0.29	0.52	0.48	0.44	0.46	0.56	0.54
OP2	1.30	1.36	1.18	1.20	1.36	1.26	1.38	1.31	1.39	1.36	1.38	1.35	1.34	1.38	1.34	1.09	1.11	1.33	1.36	1.39	1.35	1.42	1.41
P	0.75	0.75	0.67	0.68	0.76	0.74	0.76	0.76	0.75	0.76	0.75	0.75	0.76	0.76	0.76	0.62	0.62	0.79	0.78	0.75	0.77	0.83	0.82

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.08	0.06
C2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.18	0.05	0.10	0.01	0.12	0.24	0.16
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.04	0.12	0.15	0.13	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.08	0.07	0.09	0.04
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.02	0.14	0.12	0.14	0.15	0.12	0.13	0.08	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.08	0.15	0.06
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.03	0.10	0.01	0.12	0.21	0.14
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.06	0.04	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.08	0.08	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.15	0.02	0.15	0.01	0.19	0.28	0.20
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.05	0.05	0.14	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.14	0.09	0.05	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.03	0.16	0.00	0.22	0.33	0.23
C8	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.04	0.14	0.01	0.15	0.20	0.16
N1	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.04	0.13	0.01	0.18	0.30	0.20
N2	0.05	0.00	0.15	0.15	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.20	0.06	0.09	0.02	0.11	0.23	0.14
N3	0.04	0.00	0.13	0.12	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.14	0.05	0.08	0.01	0.09	0.19	0.12
N7	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.16	0.03	0.17	0.02	0.22	0.30	0.22
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.15	0.11
O2'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.09	0.06	0.07	0.05	0.10	0.03	0.15	0.21	0.16	0.02	0.03	0.00	0.05	0.06	0.03	0.09	0.09	0.10	0.03
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.12	0.03	0.15	0.03	0.18	0.14	0.18	0.20	0.14	0.16	0.07	0.05	0.00	0.02	0.07	0.20	0.11	0.26	0.11
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.03	0.08	0.09	0.08
O5'	0.05	0.10	0.05	0.06	0.10	0.02	0.15	0.01	0.16	0.14	0.13	0.09	0.08	0.17	0.08	0.03	0.07	0.08	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.20	0.03	0.19	0.00	0.28	0.39	0.27
OP1	0.06	0.12	0.07	0.08	0.12	0.08	0.19	0.09	0.22	0.15	0.18	0.11	0.09	0.22	0.09	0.09	0.11	0.08	0.02	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.24	0.09	0.15	0.21	0.07	0.28	0.05	0.33	0.20	0.30	0.23	0.19	0.30	0.15	0.10	0.26	0.09	0.02	0.39	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.04	0.06	0.14	0.03	0.20	0.02	0.23	0.16	0.20	0.14	0.12	0.22	0.11	0.03	0.11	0.08	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00