Doublet Group distance statistics: 49696

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 4, 2, 1, 1, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.026, 0.040, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.040 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.019, 0.034, 0.050, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.023, 0.038, 0.054, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.038 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.016, 0.033, 0.049, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.023, 0.040, 0.056, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.040 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.040, 0.059, 0.078, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.059 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.028, 0.051, 0.074, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.011, 0.035, 0.059, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.035 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.038, 0.064, 0.091, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.064 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.049, 0.076, 0.104, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.076 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.075, 0.216, 0.358, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.216 std_dev=0.142
C2'	A	0, 0.047, 0.215, 0.382, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.215 std_dev=0.167
C2	B	0, 0.251, 0.423, 0.596, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.423 std_dev=0.172
N3	B	0, 0.201, 0.391, 0.581, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.391 std_dev=0.190
O2'	A	0, 0.148, 0.341, 0.535, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.341 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.118, 0.342, 0.567, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.342 std_dev=0.224
N2	B	0, 0.317, 0.549, 0.781, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.549 std_dev=0.232
N1	B	0, 0.270, 0.504, 0.737, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.504 std_dev=0.234
C2'	B	0, 0.291, 0.526, 0.761, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.526 std_dev=0.235
O2'	B	0, 0.249, 0.518, 0.787, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.518 std_dev=0.269
C1'	B	0, 0.348, 0.619, 0.890, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.619 std_dev=0.271
C3'	A	0, 0.027, 0.303, 0.579, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.303 std_dev=0.276
C4	B	0, 0.259, 0.551, 0.844, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.551 std_dev=0.292
N9	B	0, 0.362, 0.683, 1.005, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.683 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.380, 0.723, 1.066, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.723 std_dev=0.343
C3'	B	0, 0.333, 0.690, 1.047, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.690 std_dev=0.357
C5	B	0, 0.411, 0.769, 1.127, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.769 std_dev=0.358
O3'	A	0, 0.084, 0.446, 0.807, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.446 std_dev=0.361
C5'	A	0, 0.242, 0.609, 0.975, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.609 std_dev=0.367
O4'	B	0, 0.342, 0.721, 1.100, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.721 std_dev=0.379
O3'	B	0, 0.396, 0.778, 1.160, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.778 std_dev=0.382
O6	B	0, 0.500, 0.915, 1.330, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.915 std_dev=0.415
C8	B	0, 0.580, 1.007, 1.433, 1.873 max_d=1.873 avg_d=1.007 std_dev=0.427
C4'	B	0, 0.324, 0.756, 1.188, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.756 std_dev=0.432
N7	B	0, 0.609, 1.059, 1.510, 1.938 max_d=1.938 avg_d=1.059 std_dev=0.450
OP2	B	0, 0.847, 1.305, 1.764, 2.053 max_d=2.053 avg_d=1.305 std_dev=0.458
P	B	0, 0.583, 1.051, 1.519, 1.571 max_d=1.571 avg_d=1.051 std_dev=0.468
O5'	B	0, 0.271, 0.755, 1.239, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.755 std_dev=0.484
OP1	B	0, 0.701, 1.310, 1.919, 2.272 max_d=2.272 avg_d=1.310 std_dev=0.609
C5'	B	0, 0.332, 0.974, 1.615, 2.338 max_d=2.338 avg_d=0.974 std_dev=0.642
O5'	A	0, 0.256, 0.962, 1.668, 2.748 max_d=2.748 avg_d=0.962 std_dev=0.706
P	A	0, 0.219, 1.380, 2.542, 4.800 max_d=4.800 avg_d=1.380 std_dev=1.161
OP1	A	0, 0.186, 1.592, 2.999, 5.843 max_d=5.843 avg_d=1.592 std_dev=1.407
OP2	A	0, -0.111, 1.914, 3.940, 6.780 max_d=6.780 avg_d=1.914 std_dev=2.026

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.35	0.39	0.38	0.19
C2	0.03	0.00	0.15	0.17	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.22	0.08	0.60	0.23	1.04	0.56
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.08	0.12	0.15	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.35	0.16	0.11
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.02	0.12	0.09	0.16	0.15	0.12	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.15	0.20	0.14	0.13
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.11	0.04	0.64	0.17	1.07	0.60
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.07	0.05	0.04	0.07	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.40	0.17	0.16
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.03	0.77	0.30	1.46	0.85
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.05	0.14	0.14	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.16	0.04	0.79	0.34	1.55	0.89
C8	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.10	0.05	0.79	0.31	1.35	0.84
N1	0.03	0.00	0.12	0.16	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.06	0.71	0.24	1.34	0.75
N3	0.03	0.00	0.15	0.15	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.08	0.54	0.27	0.85	0.45
N6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.16	0.03	0.85	0.50	1.80	1.05
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.85	0.46	1.66	1.01
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.61	0.14	0.92	0.53
O2'	0.03	0.14	0.01	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.11	0.14	0.06	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.10	0.66	0.40	0.33
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.04	0.16	0.10	0.21	0.18	0.16	0.09	0.04	0.06	0.00	0.01	0.16	0.30	0.33	0.22
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.28	0.47	0.24	0.11
O5'	0.35	0.60	0.19	0.15	0.64	0.02	0.77	0.01	0.79	0.79	0.71	0.54	0.85	0.85	0.61	0.10	0.16	0.28	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.39	0.23	0.35	0.20	0.17	0.40	0.30	0.09	0.34	0.31	0.24	0.27	0.50	0.46	0.14	0.66	0.30	0.47	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.38	1.04	0.16	0.14	1.07	0.17	1.46	0.04	1.55	1.35	1.34	0.85	1.80	1.66	0.92	0.40	0.33	0.24	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.56	0.11	0.13	0.60	0.16	0.85	0.01	0.89	0.84	0.75	0.45	1.05	1.01	0.53	0.33	0.22	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.21	0.30	0.14	0.12	0.15	0.14	0.18	0.14	0.19	0.18	0.14	0.15	0.14	0.15	0.47	0.21	0.15	0.21	0.15	0.37	0.17
C2	0.22	0.09	0.21	0.27	0.13	0.19	0.13	0.20	0.11	0.18	0.10	0.11	0.11	0.16	0.18	0.20	0.44	0.29	0.19	0.11	0.23	0.34	0.20
C2'	0.16	0.15	0.25	0.31	0.11	0.16	0.13	0.17	0.17	0.12	0.19	0.19	0.11	0.12	0.12	0.22	0.48	0.24	0.19	0.21	0.19	0.37	0.19
C3'	0.14	0.19	0.27	0.32	0.13	0.16	0.16	0.16	0.22	0.12	0.24	0.22	0.13	0.15	0.12	0.24	0.49	0.21	0.19	0.27	0.18	0.35	0.18
C4	0.17	0.12	0.21	0.29	0.12	0.13	0.12	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.11	0.13	0.14	0.17	0.46	0.23	0.16	0.14	0.16	0.36	0.17
C4'	0.12	0.22	0.23	0.32	0.18	0.11	0.21	0.14	0.26	0.16	0.27	0.24	0.18	0.20	0.15	0.15	0.48	0.17	0.16	0.30	0.14	0.37	0.17
C5	0.16	0.10	0.22	0.27	0.12	0.11	0.12	0.12	0.11	0.14	0.11	0.11	0.11	0.13	0.14	0.17	0.42	0.21	0.16	0.12	0.16	0.36	0.18
C5'	0.18	0.29	0.27	0.35	0.25	0.17	0.28	0.20	0.33	0.24	0.33	0.29	0.24	0.27	0.22	0.18	0.50	0.20	0.24	0.37	0.21	0.39	0.24
C6	0.19	0.09	0.21	0.24	0.13	0.13	0.13	0.13	0.11	0.16	0.09	0.10	0.11	0.15	0.16	0.19	0.39	0.25	0.17	0.11	0.18	0.35	0.18
C8	0.13	0.16	0.22	0.30	0.15	0.11	0.16	0.14	0.18	0.15	0.18	0.17	0.14	0.16	0.14	0.15	0.45	0.18	0.18	0.20	0.16	0.39	0.20
N1	0.23	0.09	0.21	0.24	0.15	0.18	0.14	0.19	0.12	0.20	0.10	0.10	0.11	0.17	0.19	0.20	0.40	0.29	0.19	0.12	0.22	0.34	0.20
N3	0.20	0.11	0.21	0.29	0.12	0.17	0.12	0.17	0.12	0.16	0.12	0.13	0.11	0.14	0.16	0.18	0.47	0.26	0.17	0.13	0.20	0.35	0.18
N6	0.18	0.11	0.20	0.19	0.16	0.11	0.15	0.13	0.13	0.18	0.11	0.11	0.13	0.17	0.18	0.20	0.31	0.24	0.19	0.13	0.18	0.35	0.19
N7	0.13	0.13	0.22	0.28	0.13	0.10	0.14	0.13	0.15	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.13	0.16	0.42	0.18	0.18	0.15	0.16	0.38	0.20
N9	0.15	0.15	0.22	0.30	0.13	0.12	0.14	0.14	0.17	0.14	0.17	0.16	0.13	0.14	0.14	0.16	0.47	0.20	0.16	0.18	0.15	0.38	0.18
O2'	0.20	0.15	0.24	0.30	0.12	0.19	0.13	0.20	0.17	0.14	0.19	0.18	0.12	0.13	0.15	0.23	0.47	0.27	0.21	0.20	0.22	0.39	0.22
O3'	0.16	0.20	0.30	0.34	0.13	0.19	0.17	0.19	0.24	0.13	0.26	0.23	0.14	0.15	0.13	0.29	0.51	0.23	0.20	0.29	0.21	0.34	0.20
O4'	0.13	0.20	0.20	0.31	0.16	0.11	0.19	0.15	0.23	0.15	0.24	0.21	0.16	0.18	0.14	0.12	0.48	0.16	0.14	0.26	0.12	0.39	0.16
O5'	0.97	1.00	0.72	0.63	1.00	0.84	1.00	0.83	0.99	0.99	0.99	1.00	1.00	1.00	0.99	0.77	0.48	1.02	1.06	0.98	1.01	1.05	1.06
OP1	0.72	0.97	0.42	0.39	0.90	0.51	1.00	0.54	1.10	0.89	1.09	0.95	0.86	0.99	0.83	0.37	0.44	0.76	0.81	1.18	0.77	0.91	0.87
OP2	2.15	2.34	1.79	1.70	2.32	1.95	2.39	1.99	2.43	2.33	2.42	2.30	2.27	2.40	2.27	1.72	1.43	2.21	2.31	2.45	2.28	2.39	2.37
P	1.28	1.44	0.96	0.86	1.40	1.08	1.46	1.09	1.50	1.40	1.50	1.42	1.37	1.45	1.36	0.95	0.65	1.32	1.39	1.53	1.35	1.44	1.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.11	0.02	0.09	0.33	0.10
C2	0.04	0.00	0.15	0.17	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.22	0.05	0.26	0.02	0.20	0.37	0.22
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.11	0.10	0.19	0.15	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01	0.21	0.07	0.18	0.27	0.13
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.10	0.17	0.13	0.22	0.17	0.15	0.06	0.03	0.01	0.02	0.31	0.11	0.27	0.23	0.21
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.27	0.02	0.19	0.36	0.21
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.09	0.07	0.08	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.06	0.11	0.30	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.34	0.01	0.27	0.39	0.28
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.11	0.10	0.16	0.10	0.03	0.05	0.02	0.01	0.16	0.13	0.31	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.12	0.03	0.36	0.00	0.29	0.40	0.30
C8	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.20	0.05	0.35	0.02	0.24	0.36	0.24
N1	0.03	0.01	0.10	0.13	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.10	0.17	0.04	0.31	0.01	0.25	0.39	0.27
N2	0.05	0.00	0.19	0.22	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.30	0.07	0.24	0.03	0.18	0.37	0.21
N3	0.04	0.01	0.15	0.17	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.21	0.05	0.23	0.02	0.16	0.36	0.19
N7	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.19	0.05	0.39	0.02	0.31	0.39	0.31
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.25	0.02	0.17	0.34	0.17
O2'	0.03	0.13	0.00	0.03	0.07	0.04	0.06	0.03	0.08	0.07	0.10	0.16	0.13	0.07	0.04	0.00	0.06	0.04	0.06	0.09	0.13	0.27	0.04
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.09	0.03	0.11	0.05	0.12	0.20	0.17	0.30	0.21	0.19	0.06	0.06	0.00	0.02	0.29	0.15	0.35	0.26	0.25
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.12	0.03	0.12	0.39	0.16
O5'	0.11	0.26	0.21	0.31	0.27	0.02	0.34	0.01	0.36	0.35	0.31	0.24	0.23	0.39	0.25	0.06	0.29	0.12	0.00	0.39	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.11	0.02	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.09	0.15	0.03	0.39	0.00	0.33	0.41	0.33
OP1	0.09	0.20	0.18	0.27	0.19	0.11	0.27	0.13	0.29	0.24	0.25	0.18	0.16	0.31	0.17	0.13	0.35	0.12	0.02	0.33	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.37	0.27	0.23	0.36	0.30	0.39	0.31	0.40	0.36	0.39	0.37	0.36	0.39	0.34	0.27	0.26	0.39	0.02	0.41	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.22	0.13	0.21	0.21	0.04	0.28	0.02	0.30	0.24	0.27	0.21	0.19	0.31	0.17	0.04	0.25	0.16	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00