Doublet Group distance statistics: 49698

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 3, 0, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.033 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.013, 0.035, 0.057, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C2	B	0, 0.134, 0.271, 0.408, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.271 std_dev=0.137
N2	B	0, 0.138, 0.310, 0.482, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.310 std_dev=0.172
N3	B	0, 0.155, 0.328, 0.501, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.328 std_dev=0.173
C5	B	0, 0.165, 0.343, 0.522, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.343 std_dev=0.179
C4	B	0, 0.162, 0.344, 0.527, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.344 std_dev=0.183
N1	B	0, 0.133, 0.326, 0.519, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.326 std_dev=0.193
C2'	A	0, -0.010, 0.196, 0.401, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.196 std_dev=0.206
O2'	A	0, 0.033, 0.243, 0.453, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.243 std_dev=0.210
O4'	A	0, -0.048, 0.169, 0.386, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.169 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.153, 0.376, 0.600, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.376 std_dev=0.223
N7	B	0, 0.177, 0.414, 0.652, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.414 std_dev=0.238
N9	B	0, 0.184, 0.442, 0.699, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.442 std_dev=0.257
C8	B	0, 0.187, 0.459, 0.732, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.459 std_dev=0.273
C4'	A	0, -0.056, 0.263, 0.582, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.263 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.188, 0.521, 0.853, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.521 std_dev=0.333
C3'	A	0, -0.015, 0.321, 0.656, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.321 std_dev=0.336
C2'	B	0, 0.224, 0.571, 0.918, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.571 std_dev=0.347
O6	B	0, 0.160, 0.514, 0.868, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.514 std_dev=0.354
O2'	B	0, 0.246, 0.681, 1.117, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.681 std_dev=0.435
O3'	A	0, 0.014, 0.499, 0.983, 1.972 max_d=1.972 avg_d=0.499 std_dev=0.485
O4'	B	0, 0.147, 0.667, 1.187, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.667 std_dev=0.520
C5'	A	0, -0.081, 0.453, 0.986, 2.197 max_d=2.197 avg_d=0.453 std_dev=0.534
O5'	A	0, -0.122, 0.470, 1.062, 2.434 max_d=2.434 avg_d=0.470 std_dev=0.592
C3'	B	0, 0.104, 0.719, 1.335, 2.419 max_d=2.419 avg_d=0.719 std_dev=0.615
C4'	B	0, 0.080, 0.728, 1.377, 2.479 max_d=2.479 avg_d=0.728 std_dev=0.649
O5'	B	0, -0.053, 0.694, 1.441, 3.049 max_d=3.049 avg_d=0.694 std_dev=0.747
P	A	0, -0.150, 0.623, 1.395, 3.171 max_d=3.171 avg_d=0.623 std_dev=0.772
OP2	A	0, -0.171, 0.613, 1.398, 3.289 max_d=3.289 avg_d=0.613 std_dev=0.784
O3'	B	0, 0.061, 0.863, 1.665, 3.244 max_d=3.244 avg_d=0.863 std_dev=0.802
C5'	B	0, -0.002, 0.800, 1.602, 3.146 max_d=3.146 avg_d=0.800 std_dev=0.802
OP1	A	0, -0.126, 0.798, 1.722, 3.737 max_d=3.737 avg_d=0.798 std_dev=0.924
OP2	B	0, -0.227, 0.733, 1.692, 3.987 max_d=3.987 avg_d=0.733 std_dev=0.959
P	B	0, -0.205, 0.782, 1.769, 4.134 max_d=4.134 avg_d=0.782 std_dev=0.987
OP1	B	0, -0.298, 0.864, 2.027, 4.911 max_d=4.911 avg_d=0.864 std_dev=1.163

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.07	0.05
C2	0.02	0.00	0.14	0.17	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.22	0.06	0.10	0.12	0.16	0.12
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.08	0.11	0.14	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.06	0.05
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.13	0.09	0.16	0.16	0.13	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.08	0.06
C4	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.08	0.09	0.11	0.10
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.06	0.04	0.07	0.05	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.01	0.09	0.11	0.13	0.12
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.05	0.08	0.06	0.09	0.07	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.17	0.02	0.11	0.13	0.17	0.14
C8	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.05	0.07	0.08	0.12	0.08
N1	0.02	0.00	0.11	0.16	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.21	0.04	0.11	0.13	0.17	0.14
N3	0.02	0.00	0.14	0.16	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.19	0.06	0.09	0.09	0.12	0.10
N6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.12	0.15	0.18	0.16
N7	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.04	0.07	0.10	0.12	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.07	0.09	0.07
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.06	0.05	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.08	0.06	0.05
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.12	0.01	0.12	0.03	0.17	0.11	0.21	0.19	0.17	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.09	0.10	0.13	0.09
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.08	0.05
O5'	0.05	0.10	0.05	0.06	0.08	0.02	0.09	0.01	0.11	0.07	0.11	0.09	0.12	0.07	0.06	0.05	0.09	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.12	0.07	0.08	0.09	0.05	0.11	0.05	0.13	0.08	0.13	0.09	0.15	0.10	0.07	0.08	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.16	0.06	0.08	0.11	0.03	0.13	0.02	0.17	0.12	0.17	0.12	0.18	0.12	0.09	0.06	0.13	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.12	0.05	0.06	0.10	0.02	0.12	0.01	0.14	0.08	0.14	0.10	0.16	0.11	0.07	0.05	0.09	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.11	0.31	0.26	0.15	0.39	0.13	0.42	0.11	0.17	0.11	0.10	0.14	0.14	0.17	0.46	0.54	0.40	0.38	0.11	0.38	0.48	0.49
C2	0.21	0.10	0.22	0.42	0.15	0.53	0.15	0.59	0.12	0.21	0.10	0.13	0.12	0.19	0.20	0.51	0.74	0.46	0.54	0.12	0.57	0.62	0.64
C2'	0.16	0.12	0.26	0.26	0.11	0.43	0.10	0.49	0.13	0.12	0.14	0.14	0.11	0.11	0.13	0.44	0.59	0.42	0.42	0.15	0.48	0.53	0.55
C3'	0.13	0.10	0.27	0.20	0.08	0.40	0.09	0.47	0.13	0.09	0.14	0.13	0.09	0.08	0.10	0.42	0.50	0.41	0.40	0.16	0.48	0.53	0.56
C4	0.20	0.10	0.26	0.30	0.15	0.44	0.14	0.48	0.11	0.18	0.10	0.11	0.13	0.16	0.18	0.47	0.61	0.43	0.44	0.11	0.46	0.54	0.55
C4'	0.17	0.10	0.34	0.19	0.12	0.32	0.10	0.37	0.10	0.13	0.10	0.09	0.13	0.11	0.14	0.46	0.39	0.37	0.33	0.12	0.36	0.45	0.46
C5	0.19	0.10	0.24	0.27	0.15	0.42	0.14	0.46	0.12	0.19	0.10	0.13	0.13	0.17	0.18	0.45	0.58	0.42	0.43	0.12	0.45	0.55	0.55
C5'	0.14	0.09	0.37	0.17	0.10	0.25	0.09	0.30	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.09	0.11	0.45	0.27	0.33	0.27	0.13	0.30	0.41	0.41
C6	0.20	0.11	0.21	0.35	0.16	0.48	0.16	0.53	0.13	0.21	0.10	0.14	0.13	0.19	0.19	0.48	0.66	0.45	0.50	0.13	0.53	0.61	0.61
C8	0.18	0.10	0.28	0.19	0.14	0.33	0.12	0.36	0.11	0.15	0.10	0.10	0.14	0.13	0.16	0.40	0.46	0.37	0.34	0.11	0.35	0.46	0.45
N1	0.21	0.11	0.21	0.43	0.16	0.54	0.16	0.60	0.13	0.22	0.10	0.14	0.12	0.20	0.20	0.51	0.74	0.47	0.56	0.14	0.59	0.64	0.66
N3	0.21	0.10	0.24	0.36	0.15	0.49	0.14	0.54	0.11	0.20	0.10	0.12	0.13	0.17	0.19	0.50	0.68	0.45	0.49	0.11	0.51	0.58	0.59
N6	0.19	0.11	0.20	0.34	0.16	0.48	0.17	0.53	0.14	0.22	0.11	0.15	0.13	0.21	0.19	0.46	0.62	0.46	0.51	0.15	0.55	0.63	0.63
N7	0.17	0.10	0.26	0.19	0.14	0.33	0.13	0.37	0.11	0.16	0.10	0.12	0.13	0.15	0.16	0.39	0.47	0.37	0.36	0.11	0.38	0.49	0.48
N9	0.19	0.10	0.28	0.25	0.14	0.38	0.13	0.42	0.11	0.17	0.10	0.10	0.13	0.14	0.17	0.45	0.54	0.40	0.39	0.11	0.40	0.49	0.50
O2'	0.18	0.11	0.28	0.29	0.12	0.44	0.11	0.49	0.12	0.13	0.13	0.13	0.11	0.11	0.14	0.46	0.61	0.42	0.42	0.14	0.47	0.52	0.55
O3'	0.13	0.14	0.26	0.21	0.09	0.43	0.12	0.51	0.17	0.09	0.18	0.16	0.09	0.11	0.09	0.41	0.52	0.43	0.44	0.21	0.55	0.56	0.61
O4'	0.21	0.14	0.37	0.22	0.17	0.32	0.15	0.35	0.13	0.18	0.13	0.13	0.17	0.15	0.19	0.49	0.41	0.37	0.32	0.13	0.30	0.43	0.42
O5'	0.12	0.09	0.39	0.17	0.09	0.22	0.09	0.28	0.11	0.09	0.11	0.10	0.10	0.08	0.10	0.46	0.21	0.31	0.25	0.13	0.30	0.41	0.41
OP1	0.11	0.14	0.42	0.27	0.12	0.13	0.15	0.20	0.18	0.12	0.17	0.15	0.12	0.14	0.11	0.41	0.13	0.25	0.18	0.22	0.25	0.35	0.35
OP2	0.14	0.20	0.46	0.30	0.16	0.13	0.16	0.20	0.19	0.14	0.22	0.24	0.17	0.15	0.14	0.46	0.15	0.23	0.19	0.21	0.27	0.36	0.36
P	0.10	0.12	0.41	0.24	0.10	0.14	0.11	0.21	0.14	0.09	0.14	0.14	0.11	0.10	0.09	0.42	0.12	0.26	0.19	0.17	0.25	0.36	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.19	0.01	0.15	0.02	0.15	0.28	0.21
C2	0.03	0.00	0.25	0.20	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.16	0.16	0.16	0.01	0.21	0.34	0.29
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.09	0.13	0.14	0.10	0.20	0.29	0.23	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.27	0.12	0.24	0.37	0.30
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.19	0.00	0.24	0.02	0.26	0.20	0.24	0.18	0.16	0.24	0.15	0.02	0.01	0.01	0.05	0.29	0.16	0.10	0.09
C4	0.01	0.01	0.13	0.19	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.08	0.15	0.01	0.19	0.32	0.26
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.05	0.11	0.07	0.13	0.06	0.18	0.02	0.00	0.02	0.09	0.09	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.09	0.24	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.11	0.03	0.14	0.01	0.20	0.31	0.25
C5'	0.06	0.12	0.13	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.09	0.11	0.10	0.15	0.12	0.12	0.06	0.07	0.13	0.02	0.01	0.10	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.14	0.26	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.06	0.15	0.00	0.21	0.32	0.26
C8	0.01	0.01	0.10	0.20	0.00	0.13	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.10	0.10	0.13	0.01	0.18	0.29	0.21
N1	0.02	0.00	0.20	0.24	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.12	0.15	0.00	0.22	0.33	0.28
N2	0.04	0.00	0.29	0.18	0.01	0.11	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.20	0.19	0.18	0.01	0.22	0.35	0.31
N3	0.03	0.01	0.23	0.16	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.17	0.15	0.17	0.01	0.20	0.33	0.28
N7	0.01	0.00	0.06	0.24	0.00	0.13	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.15	0.05	0.15	0.01	0.20	0.30	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.05	0.01	0.13	0.01	0.17	0.30	0.23
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.05	0.18	0.15	0.07	0.12	0.26	0.06	0.21	0.12	0.26	0.12	0.00	0.06	0.12	0.19	0.17	0.16	0.39	0.23
O3'	0.19	0.16	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.13	0.14	0.10	0.13	0.20	0.17	0.15	0.05	0.06	0.00	0.14	0.18	0.19	0.43	0.27	0.27
O4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.02	0.06	0.10	0.12	0.19	0.15	0.05	0.01	0.12	0.14	0.00	0.08	0.04	0.10	0.16	0.13
O5'	0.15	0.16	0.27	0.05	0.15	0.02	0.14	0.01	0.15	0.13	0.15	0.18	0.17	0.15	0.13	0.19	0.18	0.08	0.00	0.16	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.12	0.29	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.19	0.04	0.16	0.00	0.22	0.31	0.25
OP1	0.15	0.21	0.24	0.16	0.19	0.09	0.20	0.07	0.21	0.18	0.22	0.22	0.20	0.20	0.17	0.16	0.43	0.10	0.02	0.22	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.34	0.37	0.10	0.32	0.04	0.31	0.02	0.32	0.29	0.33	0.35	0.33	0.30	0.30	0.39	0.27	0.16	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.29	0.30	0.09	0.26	0.03	0.25	0.02	0.26	0.21	0.28	0.31	0.28	0.23	0.23	0.23	0.27	0.13	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00