Doublet Group distance statistics: 49700

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 1, 3, 1, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.019, 0.042, 0.065, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.022, 0.049, 0.076, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.049 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.011, 0.045, 0.078, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.045 std_dev=0.034
C4	B	0, 0.256, 0.458, 0.659, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.458 std_dev=0.201
N3	B	0, 0.219, 0.427, 0.635, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.427 std_dev=0.208
N9	B	0, 0.307, 0.527, 0.746, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.527 std_dev=0.220
O2'	B	0, 0.285, 0.509, 0.733, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.509 std_dev=0.224
O4'	A	0, 0.157, 0.397, 0.636, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.397 std_dev=0.240
C5	B	0, 0.243, 0.507, 0.770, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.507 std_dev=0.263
C2	B	0, 0.233, 0.497, 0.761, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.497 std_dev=0.264
C8	B	0, 0.319, 0.584, 0.849, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.584 std_dev=0.265
C1'	B	0, 0.327, 0.600, 0.874, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.600 std_dev=0.274
C2'	A	0, 0.143, 0.429, 0.714, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.429 std_dev=0.285
N7	B	0, 0.272, 0.570, 0.867, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.570 std_dev=0.297
N2	B	0, 0.289, 0.597, 0.904, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.597 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.254, 0.567, 0.880, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.567 std_dev=0.313
N1	B	0, 0.214, 0.552, 0.891, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.552 std_dev=0.339
C6	B	0, 0.199, 0.540, 0.880, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.540 std_dev=0.341
O6	B	0, 0.201, 0.609, 1.017, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.609 std_dev=0.408
O2'	A	0, 0.130, 0.556, 0.982, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.556 std_dev=0.426
C2'	B	0, 0.375, 0.815, 1.255, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.815 std_dev=0.440
C3'	A	0, 0.219, 0.662, 1.105, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.662 std_dev=0.443
O4'	B	0, 0.303, 0.799, 1.296, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.799 std_dev=0.497
C5'	A	0, 0.408, 0.997, 1.586, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.997 std_dev=0.589
O3'	A	0, 0.300, 0.963, 1.626, 2.197 max_d=2.197 avg_d=0.963 std_dev=0.663
OP2	B	0, 0.455, 1.234, 2.013, 2.562 max_d=2.562 avg_d=1.234 std_dev=0.779
O5'	B	0, 0.370, 1.156, 1.942, 2.638 max_d=2.638 avg_d=1.156 std_dev=0.786
P	B	0, 0.454, 1.253, 2.053, 2.755 max_d=2.755 avg_d=1.253 std_dev=0.800
O5'	A	0, 0.356, 1.168, 1.980, 2.559 max_d=2.559 avg_d=1.168 std_dev=0.812
C5'	B	0, 0.351, 1.257, 2.163, 3.092 max_d=3.092 avg_d=1.257 std_dev=0.906
C4'	B	0, 0.266, 1.173, 2.079, 3.064 max_d=3.064 avg_d=1.173 std_dev=0.906
OP1	B	0, 0.503, 1.412, 2.320, 3.308 max_d=3.308 avg_d=1.412 std_dev=0.908
P	A	0, 0.801, 1.782, 2.763, 3.310 max_d=3.310 avg_d=1.782 std_dev=0.981
OP2	A	0, 0.674, 1.694, 2.715, 3.518 max_d=3.518 avg_d=1.694 std_dev=1.020
C3'	B	0, 0.247, 1.342, 2.438, 3.533 max_d=3.533 avg_d=1.342 std_dev=1.096
OP1	A	0, 1.209, 2.337, 3.465, 3.796 max_d=3.796 avg_d=2.337 std_dev=1.128
O3'	B	0, 0.187, 1.816, 3.445, 4.962 max_d=4.962 avg_d=1.816 std_dev=1.629

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.19	0.27	0.28
C2	0.02	0.00	0.22	0.17	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.28	0.25	0.12	0.22	0.50	0.62	0.57
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.10	0.02	0.06	0.02	0.08	0.16	0.16	0.23	0.07	0.12	0.04	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.21	0.17
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.10	0.00	0.15	0.02	0.15	0.26	0.14	0.16	0.18	0.24	0.11	0.02	0.01	0.02	0.06	0.13	0.12	0.08
C4	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.11	0.06	0.24	0.44	0.55	0.51
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.15	0.05	0.02	0.13	0.15	0.07	0.06	0.03	0.00	0.02	0.05	0.08	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.16	0.03	0.33	0.54	0.67	0.59
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.14	0.01	0.21	0.00	0.22	0.24	0.17	0.10	0.27	0.27	0.14	0.06	0.04	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.16	0.06	0.34	0.60	0.73	0.64
C8	0.02	0.01	0.16	0.26	0.01	0.15	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.29	0.09	0.34	0.43	0.52	0.46
N1	0.02	0.00	0.16	0.14	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.19	0.10	0.28	0.57	0.70	0.63
N3	0.03	0.00	0.23	0.16	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.24	0.12	0.19	0.42	0.54	0.51
N6	0.03	0.01	0.07	0.18	0.02	0.13	0.02	0.27	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.09	0.21	0.06	0.39	0.68	0.81	0.69
N7	0.01	0.02	0.12	0.24	0.01	0.15	0.00	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.07	0.28	0.05	0.38	0.54	0.67	0.57
N9	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.01	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.22	0.35	0.44	0.42
O2'	0.01	0.28	0.00	0.02	0.13	0.06	0.07	0.06	0.12	0.10	0.21	0.27	0.09	0.07	0.03	0.00	0.04	0.06	0.04	0.06	0.17	0.13
O3'	0.02	0.25	0.01	0.01	0.11	0.03	0.16	0.04	0.16	0.29	0.19	0.24	0.21	0.28	0.10	0.04	0.00	0.03	0.09	0.29	0.12	0.11
O4'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.09	0.10	0.12	0.06	0.05	0.01	0.06	0.03	0.00	0.08	0.21	0.19	0.24
O5'	0.09	0.22	0.06	0.06	0.24	0.02	0.33	0.01	0.34	0.34	0.28	0.19	0.39	0.38	0.22	0.04	0.09	0.08	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.19	0.50	0.06	0.13	0.44	0.05	0.54	0.06	0.60	0.43	0.57	0.42	0.68	0.54	0.35	0.06	0.29	0.21	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.62	0.21	0.12	0.55	0.08	0.67	0.02	0.73	0.52	0.70	0.54	0.81	0.67	0.44	0.17	0.12	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.57	0.17	0.08	0.51	0.08	0.59	0.02	0.64	0.46	0.63	0.51	0.69	0.57	0.42	0.13	0.11	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.18	0.20	0.48	0.19	0.40	0.19	0.39	0.18	0.21	0.18	0.18	0.19	0.19	0.21	0.21	1.07	0.32	0.40	0.18	0.40	0.49	0.42
C2	0.23	0.15	0.24	0.48	0.17	0.32	0.18	0.36	0.16	0.23	0.16	0.18	0.15	0.21	0.21	0.24	0.91	0.25	0.43	0.17	0.42	0.53	0.45
C2'	0.24	0.20	0.13	0.54	0.21	0.46	0.21	0.44	0.21	0.22	0.20	0.19	0.21	0.21	0.22	0.12	1.17	0.36	0.43	0.21	0.42	0.53	0.46
C3'	0.27	0.31	0.11	0.52	0.29	0.48	0.31	0.46	0.32	0.29	0.32	0.31	0.29	0.30	0.28	0.12	1.17	0.41	0.45	0.33	0.43	0.56	0.49
C4	0.23	0.15	0.20	0.46	0.18	0.34	0.17	0.35	0.15	0.21	0.15	0.16	0.17	0.19	0.21	0.21	1.01	0.27	0.39	0.15	0.39	0.50	0.42
C4'	0.22	0.22	0.13	0.44	0.22	0.39	0.23	0.38	0.24	0.23	0.23	0.22	0.22	0.23	0.22	0.18	1.07	0.33	0.37	0.24	0.37	0.49	0.41
C5	0.22	0.13	0.18	0.42	0.17	0.32	0.16	0.33	0.14	0.21	0.13	0.15	0.16	0.18	0.20	0.20	0.97	0.27	0.37	0.14	0.37	0.49	0.41
C5'	0.34	0.39	0.22	0.48	0.38	0.47	0.39	0.46	0.41	0.37	0.41	0.39	0.37	0.39	0.36	0.31	1.08	0.44	0.46	0.42	0.46	0.58	0.50
C6	0.22	0.14	0.19	0.41	0.17	0.28	0.17	0.31	0.15	0.21	0.14	0.17	0.14	0.20	0.20	0.21	0.89	0.24	0.38	0.15	0.38	0.51	0.42
C8	0.24	0.17	0.17	0.42	0.20	0.38	0.19	0.37	0.18	0.21	0.17	0.16	0.20	0.19	0.21	0.19	1.02	0.33	0.37	0.18	0.37	0.47	0.40
N1	0.23	0.15	0.23	0.45	0.17	0.30	0.18	0.33	0.17	0.23	0.16	0.18	0.14	0.22	0.21	0.24	0.86	0.24	0.42	0.17	0.41	0.54	0.45
N3	0.23	0.15	0.22	0.49	0.17	0.34	0.17	0.36	0.16	0.22	0.16	0.18	0.16	0.20	0.21	0.23	0.98	0.26	0.42	0.16	0.41	0.52	0.44
N6	0.21	0.15	0.16	0.32	0.17	0.23	0.18	0.26	0.16	0.22	0.16	0.18	0.14	0.20	0.20	0.18	0.77	0.22	0.35	0.16	0.35	0.51	0.39
N7	0.23	0.15	0.16	0.39	0.19	0.35	0.17	0.34	0.15	0.20	0.14	0.13	0.18	0.19	0.21	0.19	0.97	0.31	0.36	0.15	0.37	0.48	0.40
N9	0.23	0.17	0.19	0.46	0.19	0.38	0.18	0.37	0.17	0.21	0.17	0.17	0.19	0.19	0.21	0.21	1.04	0.31	0.39	0.17	0.39	0.49	0.42
O2'	0.27	0.19	0.24	0.58	0.22	0.48	0.21	0.47	0.19	0.24	0.19	0.18	0.21	0.22	0.24	0.23	1.19	0.37	0.46	0.19	0.45	0.53	0.48
O3'	0.33	0.38	0.14	0.56	0.36	0.54	0.38	0.53	0.40	0.36	0.40	0.37	0.35	0.38	0.35	0.12	1.21	0.48	0.51	0.42	0.49	0.62	0.55
O4'	0.22	0.19	0.21	0.42	0.20	0.35	0.19	0.34	0.19	0.21	0.19	0.19	0.19	0.20	0.21	0.24	1.00	0.29	0.35	0.20	0.36	0.45	0.38
O5'	0.47	0.55	0.36	0.57	0.52	0.58	0.54	0.57	0.55	0.51	0.56	0.57	0.52	0.53	0.50	0.43	1.14	0.56	0.57	0.56	0.58	0.68	0.61
OP1	0.78	0.96	0.67	0.84	0.89	0.84	0.94	0.85	0.99	0.88	1.01	0.98	0.88	0.92	0.84	0.82	1.36	0.84	0.88	1.02	0.91	1.05	0.95
OP2	0.87	1.02	0.79	0.94	0.94	0.94	0.94	0.93	0.96	0.90	1.00	1.09	0.96	0.91	0.90	0.93	1.46	0.92	0.93	0.93	0.96	1.06	0.98
P	0.73	0.84	0.64	0.83	0.79	0.82	0.79	0.81	0.81	0.77	0.83	0.88	0.80	0.78	0.76	0.81	1.38	0.79	0.82	0.80	0.84	0.94	0.86

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.30	0.01	0.18	0.04	0.17	0.35	0.23
C2	0.04	0.00	0.16	0.14	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.35	0.11	0.11	0.01	0.14	0.30	0.18
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.19	0.09	0.09	0.13	0.19	0.15	0.06	0.02	0.00	0.04	0.02	0.37	0.09	0.36	0.49	0.41
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.20	0.00	0.30	0.01	0.30	0.34	0.22	0.11	0.11	0.37	0.21	0.02	0.01	0.02	0.07	0.36	0.16	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.08	0.20	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.18	0.06	0.11	0.02	0.14	0.31	0.18
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.09	0.18	0.04	0.08	0.05	0.17	0.08	0.26	0.02	0.00	0.01	0.14	0.11	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.30	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.09	0.03	0.16	0.03	0.15	0.29	0.16
C5'	0.07	0.05	0.19	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.10	0.14	0.05	0.08	0.06	0.16	0.04	0.07	0.20	0.02	0.01	0.16	0.11	0.03	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.30	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.30	0.11	0.05	0.17	0.01	0.16	0.27	0.16
C8	0.02	0.01	0.09	0.34	0.01	0.18	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.19	0.07	0.16	0.03	0.15	0.32	0.16
N1	0.03	0.00	0.13	0.22	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.22	0.09	0.12	0.01	0.15	0.28	0.16
N2	0.04	0.00	0.19	0.11	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.47	0.13	0.12	0.02	0.14	0.30	0.18
N3	0.04	0.00	0.15	0.11	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.38	0.10	0.12	0.02	0.15	0.32	0.19
N7	0.01	0.01	0.06	0.37	0.00	0.17	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.20	0.04	0.21	0.04	0.17	0.28	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.21	0.00	0.08	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.10	0.01	0.11	0.04	0.15	0.34	0.19
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.23	0.26	0.29	0.07	0.30	0.25	0.28	0.21	0.19	0.30	0.19	0.00	0.07	0.19	0.26	0.31	0.24	0.52	0.32
O3'	0.30	0.35	0.04	0.01	0.18	0.02	0.09	0.20	0.11	0.19	0.22	0.47	0.38	0.20	0.10	0.07	0.00	0.20	0.26	0.14	0.56	0.36	0.36
O4'	0.01	0.11	0.02	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.07	0.09	0.13	0.10	0.04	0.01	0.19	0.20	0.00	0.10	0.06	0.08	0.25	0.14
O5'	0.18	0.11	0.37	0.07	0.11	0.01	0.16	0.01	0.17	0.16	0.12	0.12	0.12	0.21	0.11	0.26	0.26	0.10	0.00	0.23	0.03	0.02	0.00
O6	0.04	0.01	0.09	0.36	0.02	0.14	0.03	0.16	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.31	0.14	0.06	0.23	0.00	0.19	0.26	0.19
OP1	0.17	0.14	0.36	0.16	0.14	0.11	0.15	0.11	0.16	0.15	0.15	0.14	0.15	0.17	0.15	0.24	0.56	0.08	0.03	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.30	0.49	0.12	0.31	0.07	0.29	0.03	0.27	0.32	0.28	0.30	0.32	0.28	0.34	0.52	0.36	0.25	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.18	0.41	0.08	0.18	0.03	0.16	0.02	0.16	0.16	0.16	0.18	0.19	0.16	0.19	0.32	0.36	0.14	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00