Doublet Group distance statistics: 49701

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 3, 2, 1, 0, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.002, 0.024, 0.045, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.024 std_dev=0.021
C4	B	0, 0.179, 0.398, 0.617, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.398 std_dev=0.219
C2'	B	0, 0.260, 0.481, 0.703, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.481 std_dev=0.222
N3	B	0, 0.128, 0.358, 0.588, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.358 std_dev=0.230
C5	B	0, 0.207, 0.469, 0.732, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.469 std_dev=0.262
N7	B	0, 0.304, 0.571, 0.838, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.571 std_dev=0.267
C2	B	0, 0.153, 0.432, 0.712, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.432 std_dev=0.279
N9	B	0, 0.231, 0.521, 0.810, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.521 std_dev=0.289
C8	B	0, 0.283, 0.591, 0.899, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.591 std_dev=0.308
O2'	A	0, 0.073, 0.393, 0.712, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.393 std_dev=0.319
O4'	A	0, 0.068, 0.408, 0.747, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.408 std_dev=0.339
C2'	A	0, 0.053, 0.399, 0.744, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.399 std_dev=0.345
N2	B	0, 0.170, 0.518, 0.867, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.518 std_dev=0.349
C6	B	0, 0.222, 0.595, 0.969, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.595 std_dev=0.373
N1	B	0, 0.182, 0.566, 0.949, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.566 std_dev=0.383
C1'	B	0, 0.246, 0.638, 1.030, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.638 std_dev=0.392
O6	B	0, 0.304, 0.807, 1.311, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.807 std_dev=0.504
C4'	A	0, 0.100, 0.638, 1.176, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.638 std_dev=0.538
C3'	A	0, 0.100, 0.667, 1.235, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.667 std_dev=0.568
C3'	B	0, 0.291, 0.979, 1.668, 1.972 max_d=1.972 avg_d=0.979 std_dev=0.688
O4'	B	0, 0.269, 1.026, 1.782, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.026 std_dev=0.756
O3'	A	0, 0.158, 0.952, 1.747, 2.083 max_d=2.083 avg_d=0.952 std_dev=0.794
C4'	B	0, 0.316, 1.135, 1.953, 2.222 max_d=2.222 avg_d=1.135 std_dev=0.818
C5'	A	0, 0.139, 1.027, 1.915, 2.309 max_d=2.309 avg_d=1.027 std_dev=0.888
O2'	B	0, 0.255, 1.152, 2.048, 2.407 max_d=2.407 avg_d=1.152 std_dev=0.897
O5'	A	0, 0.157, 1.146, 2.136, 2.546 max_d=2.546 avg_d=1.146 std_dev=0.989
O5'	B	0, 0.344, 1.380, 2.416, 2.754 max_d=2.754 avg_d=1.380 std_dev=1.036
C5'	B	0, 0.347, 1.423, 2.498, 2.847 max_d=2.847 avg_d=1.423 std_dev=1.075
O3'	B	0, 0.277, 1.353, 2.430, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.353 std_dev=1.076
P	A	0, 0.108, 1.571, 3.035, 3.614 max_d=3.614 avg_d=1.571 std_dev=1.463
OP2	B	0, 0.409, 1.935, 3.462, 4.031 max_d=4.031 avg_d=1.935 std_dev=1.526
P	B	0, 0.355, 1.894, 3.433, 4.011 max_d=4.011 avg_d=1.894 std_dev=1.539
OP2	A	0, 0.045, 1.631, 3.216, 3.962 max_d=3.962 avg_d=1.631 std_dev=1.586
OP1	A	0, 0.119, 1.868, 3.617, 4.259 max_d=4.259 avg_d=1.868 std_dev=1.749
OP1	B	0, 0.388, 2.147, 3.905, 4.611 max_d=4.611 avg_d=2.147 std_dev=1.758

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.14	0.13	0.22	0.15
C2	0.02	0.00	0.28	0.32	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.41	0.12	0.11	0.11	0.17	0.11
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.15	0.02	0.08	0.03	0.14	0.13	0.22	0.28	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.14	0.16	0.11
C3'	0.03	0.32	0.00	0.00	0.20	0.01	0.15	0.02	0.21	0.12	0.29	0.30	0.19	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.15	0.20	0.00	0.07	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.23	0.06	0.10	0.11	0.20	0.12
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.06	0.09	0.07	0.10	0.08	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.06	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.17	0.03	0.09	0.12	0.21	0.12
C5'	0.03	0.07	0.03	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.10	0.08	0.08	0.06	0.11	0.10	0.05	0.05	0.05	0.04	0.01	0.05	0.03	0.04
C6	0.01	0.00	0.14	0.21	0.00	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.26	0.05	0.11	0.12	0.19	0.12
C8	0.01	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.09	0.12	0.15	0.31	0.15
N1	0.02	0.00	0.22	0.29	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.37	0.09	0.11	0.12	0.17	0.11
N3	0.02	0.00	0.28	0.30	0.00	0.07	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.37	0.11	0.11	0.11	0.17	0.11
N6	0.01	0.01	0.10	0.19	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.24	0.04	0.11	0.13	0.19	0.12
N7	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.06	0.09	0.14	0.27	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.12	0.13	0.24	0.14
O2'	0.01	0.20	0.00	0.02	0.10	0.05	0.07	0.05	0.11	0.09	0.16	0.20	0.09	0.07	0.03	0.00	0.02	0.06	0.03	0.12	0.12	0.07
O3'	0.03	0.41	0.02	0.01	0.23	0.02	0.17	0.05	0.26	0.14	0.37	0.37	0.24	0.09	0.08	0.02	0.00	0.02	0.15	0.15	0.15	0.12
O4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.04	0.05	0.09	0.09	0.11	0.04	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.18	0.11	0.21	0.15
O5'	0.14	0.11	0.06	0.06	0.10	0.02	0.09	0.01	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.09	0.12	0.03	0.15	0.18	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.13	0.11	0.14	0.13	0.11	0.07	0.12	0.05	0.12	0.15	0.12	0.11	0.13	0.14	0.13	0.12	0.15	0.11	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.17	0.16	0.08	0.20	0.06	0.21	0.03	0.19	0.31	0.17	0.17	0.19	0.27	0.24	0.12	0.15	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.11	0.11	0.07	0.12	0.04	0.12	0.04	0.12	0.15	0.11	0.11	0.12	0.13	0.14	0.07	0.12	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.20	0.26	0.45	0.28	0.86	0.23	0.96	0.18	0.31	0.17	0.18	0.28	0.26	0.33	0.53	1.01	0.92	0.85	0.16	0.93	1.02	1.07
C2	0.30	0.16	0.21	0.68	0.25	1.03	0.25	1.20	0.21	0.32	0.17	0.15	0.20	0.30	0.30	0.87	1.19	0.95	1.08	0.21	1.21	1.24	1.30
C2'	0.32	0.11	0.27	0.49	0.18	0.93	0.13	1.07	0.12	0.21	0.13	0.12	0.18	0.15	0.24	0.56	1.07	0.93	0.91	0.16	1.08	1.07	1.17
C3'	0.30	0.11	0.30	0.33	0.18	0.86	0.12	1.01	0.11	0.20	0.11	0.10	0.19	0.14	0.24	0.53	0.88	0.92	0.85	0.15	1.04	1.05	1.14
C4	0.34	0.17	0.25	0.51	0.27	0.92	0.25	1.04	0.20	0.31	0.17	0.14	0.24	0.28	0.32	0.68	1.06	0.94	0.94	0.18	1.04	1.12	1.17
C4'	0.32	0.22	0.35	0.22	0.26	0.72	0.22	0.84	0.17	0.27	0.17	0.21	0.27	0.23	0.29	0.52	0.72	0.87	0.73	0.15	0.83	0.95	0.99
C5	0.32	0.17	0.26	0.45	0.27	0.87	0.25	1.00	0.20	0.31	0.17	0.14	0.23	0.28	0.31	0.68	0.97	0.93	0.92	0.20	1.02	1.12	1.15
C5'	0.26	0.23	0.45	0.10	0.24	0.56	0.21	0.69	0.19	0.24	0.19	0.24	0.26	0.22	0.25	0.53	0.47	0.78	0.59	0.17	0.68	0.85	0.88
C6	0.27	0.15	0.25	0.53	0.25	0.94	0.26	1.10	0.22	0.31	0.17	0.16	0.18	0.30	0.29	0.84	1.02	0.94	1.02	0.22	1.13	1.21	1.25
C8	0.35	0.21	0.28	0.33	0.28	0.75	0.23	0.85	0.18	0.29	0.17	0.18	0.28	0.25	0.31	0.46	0.86	0.86	0.77	0.16	0.85	0.98	1.00
N1	0.26	0.15	0.21	0.66	0.24	1.03	0.26	1.20	0.22	0.32	0.18	0.16	0.17	0.30	0.28	0.93	1.14	0.94	1.10	0.23	1.23	1.26	1.32
N3	0.34	0.17	0.23	0.62	0.26	0.99	0.25	1.13	0.20	0.32	0.17	0.14	0.22	0.29	0.32	0.77	1.16	0.96	1.02	0.19	1.13	1.18	1.24
N6	0.20	0.14	0.27	0.46	0.23	0.89	0.26	1.07	0.23	0.31	0.18	0.17	0.15	0.30	0.26	0.88	0.89	0.92	1.02	0.24	1.13	1.23	1.25
N7	0.32	0.19	0.28	0.31	0.28	0.74	0.24	0.86	0.19	0.29	0.17	0.15	0.27	0.26	0.31	0.51	0.82	0.86	0.79	0.18	0.89	1.02	1.03
N9	0.36	0.19	0.27	0.44	0.28	0.84	0.24	0.96	0.18	0.31	0.16	0.16	0.27	0.26	0.32	0.56	0.99	0.92	0.86	0.16	0.94	1.04	1.08
O2'	0.34	0.13	0.26	0.54	0.20	0.94	0.14	1.07	0.11	0.23	0.12	0.13	0.20	0.17	0.26	0.56	1.14	0.93	0.92	0.14	1.07	1.07	1.16
O3'	0.29	0.11	0.29	0.35	0.16	0.89	0.12	1.07	0.16	0.19	0.15	0.10	0.18	0.14	0.22	0.53	0.90	0.94	0.88	0.22	1.12	1.09	1.20
O4'	0.35	0.27	0.35	0.27	0.31	0.70	0.28	0.80	0.24	0.32	0.24	0.26	0.31	0.29	0.34	0.53	0.77	0.85	0.71	0.22	0.75	0.91	0.94
O5'	0.14	0.16	0.59	0.21	0.16	0.45	0.15	0.60	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.15	0.67	0.32	0.68	0.50	0.17	0.63	0.78	0.81
OP1	0.15	0.19	0.78	0.54	0.19	0.18	0.23	0.31	0.26	0.21	0.24	0.18	0.17	0.23	0.18	0.71	0.20	0.46	0.20	0.29	0.33	0.48	0.52
OP2	0.31	0.32	0.93	0.67	0.32	0.19	0.33	0.30	0.34	0.32	0.34	0.31	0.30	0.33	0.31	0.91	0.36	0.38	0.21	0.33	0.37	0.52	0.54
P	0.14	0.19	0.75	0.47	0.18	0.23	0.20	0.37	0.22	0.18	0.21	0.19	0.17	0.20	0.16	0.72	0.17	0.51	0.28	0.23	0.41	0.60	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.09	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.32	0.01	0.24	0.03	0.21	0.45	0.33
C2	0.05	0.00	0.50	0.40	0.02	0.10	0.02	0.22	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.30	0.08	0.31	0.24	0.01	0.36	0.58	0.51
C2'	0.01	0.50	0.00	0.01	0.27	0.02	0.16	0.22	0.25	0.22	0.40	0.60	0.48	0.11	0.05	0.00	0.03	0.01	0.47	0.20	0.38	0.64	0.52
C3'	0.01	0.40	0.01	0.00	0.37	0.00	0.46	0.01	0.50	0.36	0.47	0.37	0.33	0.45	0.29	0.03	0.01	0.02	0.06	0.54	0.16	0.13	0.09
C4	0.02	0.02	0.27	0.37	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.17	0.19	0.02	0.29	0.52	0.41
C4'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.11	0.26	0.06	0.15	0.10	0.24	0.11	0.33	0.03	0.01	0.01	0.15	0.10	0.05	0.04
C5	0.02	0.02	0.16	0.46	0.01	0.13	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.25	0.21	0.07	0.14	0.01	0.26	0.47	0.34
C5'	0.09	0.22	0.22	0.01	0.12	0.00	0.09	0.00	0.10	0.20	0.16	0.28	0.22	0.18	0.07	0.11	0.22	0.02	0.02	0.11	0.10	0.03	0.04
C6	0.03	0.01	0.25	0.50	0.01	0.11	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.18	0.25	0.13	0.16	0.00	0.29	0.48	0.37
C8	0.01	0.03	0.22	0.36	0.02	0.26	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.50	0.19	0.21	0.14	0.02	0.17	0.37	0.20
N1	0.04	0.01	0.40	0.47	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.16	0.24	0.19	0.00	0.34	0.55	0.46
N2	0.06	0.01	0.60	0.37	0.02	0.15	0.02	0.28	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.49	0.11	0.38	0.28	0.01	0.39	0.62	0.56
N3	0.04	0.01	0.48	0.33	0.01	0.10	0.02	0.22	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.30	0.11	0.31	0.26	0.01	0.34	0.57	0.49
N7	0.02	0.03	0.11	0.45	0.02	0.24	0.01	0.18	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.48	0.28	0.12	0.17	0.02	0.20	0.37	0.21
N9	0.01	0.03	0.05	0.29	0.01	0.11	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.21	0.04	0.02	0.16	0.02	0.23	0.47	0.33
O2'	0.02	0.30	0.00	0.03	0.06	0.33	0.25	0.11	0.18	0.50	0.13	0.49	0.30	0.48	0.21	0.00	0.09	0.22	0.32	0.27	0.18	0.66	0.38
O3'	0.32	0.08	0.03	0.01	0.07	0.03	0.21	0.22	0.25	0.19	0.16	0.11	0.11	0.28	0.04	0.09	0.00	0.24	0.30	0.33	0.67	0.44	0.43
O4'	0.01	0.31	0.01	0.02	0.17	0.01	0.07	0.02	0.13	0.21	0.24	0.38	0.31	0.12	0.02	0.22	0.24	0.00	0.09	0.08	0.10	0.25	0.18
O5'	0.24	0.24	0.47	0.06	0.19	0.01	0.14	0.02	0.16	0.14	0.19	0.28	0.26	0.17	0.16	0.32	0.30	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.20	0.54	0.02	0.15	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.27	0.33	0.08	0.16	0.00	0.27	0.42	0.32
OP1	0.21	0.36	0.38	0.16	0.29	0.10	0.26	0.10	0.29	0.17	0.34	0.39	0.34	0.20	0.23	0.18	0.67	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.45	0.58	0.64	0.13	0.52	0.05	0.47	0.03	0.48	0.37	0.55	0.62	0.57	0.37	0.47	0.66	0.44	0.25	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00
P	0.33	0.51	0.52	0.09	0.41	0.04	0.34	0.04	0.37	0.20	0.46	0.56	0.49	0.21	0.33	0.38	0.43	0.18	0.00	0.32	0.01	0.00	0.00